FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2424, 829 aa 1>>>pF1KE2424 829 - 829 aa - 829 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3667+/-0.000506; mu= 19.8794+/- 0.031 mean_var=65.6517+/-13.790, 0's: 0 Z-trim(107.2): 35 B-trim: 650 in 1/51 Lambda= 0.158289 statistics sampled from 15248 (15265) to 15248 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.513), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16 Scan time: 10.740 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001309228 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 580) 2314 538.3 3.7e-152 XP_016862153 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 804) 2314 538.4 4.9e-152 NP_060169 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family ( 827) 2314 538.4 5.1e-152 XP_011511241 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 828) 2302 535.6 3.4e-151 XP_016862156 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 585) 2295 533.9 7.6e-151 XP_016862155 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 625) 2295 534.0 8.1e-151 NP_001309227 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 651) 2295 534.0 8.4e-151 XP_016862154 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 653) 2295 534.0 8.4e-151 NP_001309226 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 681) 2295 534.0 8.7e-151 NP_001309225 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 770) 2295 534.0 9.6e-151 NP_001309224 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 804) 2295 534.0 1e-150 NP_001295279 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 832) 2295 534.0 1e-150 NP_001309223 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 833) 2293 533.6 1.4e-150 NP_001309229 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 405) 2041 475.9 1.6e-133 XP_016862157 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 405) 2041 475.9 1.6e-133 XP_011511243 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 794) 1973 460.5 1.4e-128 >>NP_001309228 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (580 aa) initn: 2510 init1: 2283 opt: 2314 Z-score: 2852.6 bits: 538.3 E(85289): 3.7e-152 Smith-Waterman score: 2509; 63.5% identity (83.1% similar) in 597 aa overlap (233-829:1-580) 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 QDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPF .:.::::...:.:: :.: :: :::::. : NP_001 MQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-F 10 20 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 YPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQ :.. . .:.:.: : . .. .::.. :: . ::::::: .:.. . : NP_001 IQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRF 30 40 50 60 70 80 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 KKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGT ..:.. .. . . .:: .: : : :: :::.... :.:. : :.. 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XP_011 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP .. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: :::: XP_011 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL . ::. :...:::....:... :.: :... : :::. : :... .::::: :.. XP_011 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKF 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF :. :::::.::.:. :.::::.:.:...:::::::.:: : :.::.::::::::.:.::: XP_011 PKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDF 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML :...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. : XP_011 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY : . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : : XP_011 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP----- 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN :: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::::.:.::. ::.:::: XP_011 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ .::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.:::::::::::::::: XP_011 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC :::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.: XP_011 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD ::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::: XP_011 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKL- :::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:. XP_011 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIA 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 DSGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLA : ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:. XP_011 DLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLG 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 IGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAES : :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. ::::: XP_011 IFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAES 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 REHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF ::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:.::.: :: XP_011 REKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF 780 790 800 810 820 >>XP_016862156 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (585 aa) initn: 2498 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2829.1 bits: 533.9 E(85289): 7.6e-151 Smith-Waterman score: 2490; 63.0% identity (82.4% similar) in 602 aa overlap (233-829:1-585) 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 QDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPF .:.::::...:.:: :.: :: :::::. : XP_016 MQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-F 10 20 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 YPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQ :.. . .:.:.: : . .. .::.. :: . ::::::: .:.. . : XP_016 IQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRF 30 40 50 60 70 80 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 KKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGT ..:.. .. . . .:: .: : : :: :::.... :.:. : :.. XP_016 QRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSD 90 100 110 120 130 140 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 GDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKK : : . :. :::::.:.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :: XP_016 G-------GPPGQSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKK 150 160 170 180 190 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 YQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILS :.:::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::: XP_016 YKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILS 200 210 220 230 240 250 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 NLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSA :::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.::: XP_016 NLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSA 260 270 280 290 300 310 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 CYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVV ::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::: XP_016 CYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVV 320 330 340 350 360 370 630 640 650 660 670 pF1KE2 FGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQC :::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.: ::::: :.:::::.:: XP_016 FGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQC 380 390 400 410 420 430 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 SGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRS : :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:.: :::::::.:::::::::: XP_016 SRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRS 440 450 460 470 480 490 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 GERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWH .:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::: XP_016 SEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWH 500 510 520 530 540 550 800 810 820 pF1KE2 FLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF :::. :.: :::::::::::::.:.::.: :: XP_016 FLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF 560 570 580 >>XP_016862155 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (625 aa) initn: 2724 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.7 bits: 534.0 E(85289): 8.1e-151 Smith-Waterman score: 2705; 63.7% identity (83.3% similar) in 641 aa overlap (194-829:2-625) 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 FNTTAAQPQYFKYELPEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQ :.::::.:.:...:::::::.:: : :.:: XP_016 MAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQ 10 20 30 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 TMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVL .::::::::.:.::::...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : XP_016 SMTKKAAITLQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVT 40 50 60 70 80 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 VSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLG . .. .::.. :: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . . XP_016 IVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVAS 90 100 110 120 130 140 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 HPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVE :: .: : : :: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::: XP_016 HP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVE 150 160 170 180 190 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 EDDYDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQ :.:.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.: XP_016 ESDFDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQ 200 210 220 230 240 250 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 LVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREIN ::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: XP_016 LVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDIL 260 270 280 290 300 310 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 HNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMI : ::: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::: XP_016 HRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMI 320 330 340 350 360 370 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 AGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATL :::::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: XP_016 AGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASL 380 390 400 410 420 430 650 660 670 680 690 pF1KE2 LLSTQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWS ::::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..::: XP_016 ALSTQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWS 440 450 460 470 480 490 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 LAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGF .: .:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. XP_016 FALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAA 500 510 520 530 540 550 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 ALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDL ::.::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::: XP_016 ALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDL 560 570 580 590 600 610 820 pF1KE2 DTVQRDKIYVF :.:.::.: :: XP_016 DVVRRDQIPVF 620 >>NP_001309227 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (651 aa) initn: 2498 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.4 bits: 534.0 E(85289): 8.4e-151 Smith-Waterman score: 2490; 63.0% identity (82.4% similar) in 602 aa overlap (233-829:67-651) 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 QDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPF .:.::::...:.:: :.: :: :::::. : NP_001 IHVLLSQSRISWDFLPSTSFLPPIIRLLCLMQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-F 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 YPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQ :.. . .:.:.: : . .. .::.. :: . ::::::: .:.. . : NP_001 IQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRF 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 KKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGT ..:.. .. . . .:: .: : : :: :::.... :.:. : :.. NP_001 QRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSD 160 170 180 190 200 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 GDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKK : : . :. :::::.:.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :: NP_001 G-------GPPGQSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKK 210 220 230 240 250 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 YQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILS :.:::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::: NP_001 YKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILS 260 270 280 290 300 310 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 NLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSA :::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.::: NP_001 NLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSA 320 330 340 350 360 370 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 CYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVV ::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::: NP_001 CYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVV 380 390 400 410 420 430 630 640 650 660 670 pF1KE2 FGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQC :::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.: ::::: :.:::::.:: NP_001 FGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQC 440 450 460 470 480 490 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 SGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRS : :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:.: :::::::.:::::::::: NP_001 SRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRS 500 510 520 530 540 550 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 GERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWH .:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::: NP_001 SEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWH 560 570 580 590 600 610 800 810 820 pF1KE2 FLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF :::. :.: :::::::::::::.:.::.: :: NP_001 FLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF 620 630 640 650 >>XP_016862154 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (653 aa) initn: 2730 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.4 bits: 534.0 E(85289): 8.4e-151 Smith-Waterman score: 2662; 58.7% identity (79.1% similar) in 698 aa overlap (137-829:1-653) 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 YLYQKVERTLCQPPTKNESEIQFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNT ..:... :.: :... : :::. : :.. XP_016 MAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTA 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 TAAQPQYFKYELPEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMT . .::::: :..:. :::::.::.:. :.::::.:.:... XP_016 SPSQPQYFLYKFPKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIM-------------------- 40 50 60 70 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 KKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQ .::::...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . XP_016 --------KKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVP 80 90 100 110 120 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 AVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPR .. .::.. :: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: XP_016 SIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP- 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 VLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDD .: : : :: :::.... :.:. : :.. : : . :. :::::.: XP_016 -IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG-------GPPGQSDTDSSVEESD 180 190 200 210 220 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 YDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVI .::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.:::: XP_016 FDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVI 230 240 250 260 270 280 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 TYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNR :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : : XP_016 TYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRR 290 300 310 320 330 340 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 ALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGL :: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::::::::::.::::::::::::::: XP_016 ALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGL 350 360 370 380 390 400 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 CMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLS ::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: :: XP_016 CMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALS 410 420 430 440 450 460 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 TQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAA ::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.: XP_016 TQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFAL 470 480 490 500 510 520 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 YGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALF .:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::. XP_016 FGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALY 530 540 550 560 570 580 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 FFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTV ::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.: XP_016 FFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVV 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 QRDKIYVF .::.: :: XP_016 RRDQIPVF 650 >>NP_001309226 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (681 aa) initn: 2899 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.1 bits: 534.0 E(85289): 8.7e-151 Smith-Waterman score: 2880; 61.9% identity (82.8% similar) in 698 aa overlap (137-829:1-681) 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 YLYQKVERTLCQPPTKNESEIQFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNT ..:... :.: :... : :::. : :.. NP_001 MAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTA 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 TAAQPQYFKYELPEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMT . .::::: :..:. :::::.::.:. :.::::.:.:...:::::::.:: : :.::.:: NP_001 SPSQPQYFLYKFPKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMT 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 KKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQ ::::::.:.::::...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . 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NP_001 FGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALY 560 570 580 590 600 610 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 FFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTV ::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.: NP_001 FFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVV 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 QRDKIYVF .::.: :: NP_001 RRDQIPVF 680 >>NP_001309225 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (770 aa) initn: 2840 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2827.3 bits: 534.0 E(85289): 9.6e-151 Smith-Waterman score: 2719; 54.2% identity (74.6% similar) in 806 aa overlap (31-829:44-770) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN . :.:...: :: :::.::.: . 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