Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2424, 829 aa
1>>>pF1KE2424 829 - 829 aa - 829 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3011+/-0.0012; mu= 20.3285+/- 0.071
mean_var=60.9802+/-12.347, 0's: 0 Z-trim(100.6): 40 B-trim: 2 in 1/48
Lambda= 0.164240
statistics sampled from 6160 (6166) to 6160 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 2.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31682.1 SIDT2 gene_id:51092|Hs108|chr11 ( 832) 5441 1298.6 0
CCDS2974.1 SIDT1 gene_id:54847|Hs108|chr3 ( 827) 2314 557.7 3e-158
CCDS77790.1 SIDT1 gene_id:54847|Hs108|chr3 ( 832) 2295 553.2 6.8e-157
>>CCDS31682.1 SIDT2 gene_id:51092|Hs108|chr11 (832 aa)
initn: 5143 init1: 2958 opt: 5441 Z-score: 6958.9 bits: 1298.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5441; 98.6% identity (98.7% similar) in 836 aa overlap (1-829:1-832)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
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CCDS31 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TKNESEIQFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYELPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS31 TKNESEIQFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEFPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS31 LGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPES----GHPRVLADSFPGSSPYEG
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE2 YNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQG-------TRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDI
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS31 YNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGRSFEPVGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 VTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 CALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQ
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 KRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 RWKLDSGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RWKLDSGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFAS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 YLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKT
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KE2 PAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
780 790 800 810 820 830
>>CCDS2974.1 SIDT1 gene_id:54847|Hs108|chr3 (827 aa)
initn: 3071 init1: 2283 opt: 2314 Z-score: 2954.6 bits: 557.7 E(32554): 3e-158
Smith-Waterman score: 3174; 59.7% identity (82.1% similar) in 801 aa overlap (31-829:44-827)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
. :.:...: :: :::.::.: .
CCDS29 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
.. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: ::::
CCDS29 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL
. ::. :...:::....:... :.: :... : :::. : :... .::::: :..
CCDS29 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF
:. :::::.::.:. :.::::.:.:...:::::::.:: : :.::.::::::::.:.:::
CCDS29 PKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDF
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML
:...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. :
CCDS29 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY
: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : :
CCDS29 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN
:: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::::.:.::. ::.::::
CCDS29 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ
.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::::::::::::::
CCDS29 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC
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CCDS29 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD
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CCDS29 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLD
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CCDS29 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKID
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAI
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CCDS29 LGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 GICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESR
:::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. ::::::
CCDS29 FICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESR
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KE2 EHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
:.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:.::.: ::
CCDS29 EKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
780 790 800 810 820
>>CCDS77790.1 SIDT1 gene_id:54847|Hs108|chr3 (832 aa)
initn: 3071 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2930.2 bits: 553.2 E(32554): 6.8e-157
Smith-Waterman score: 3155; 59.3% identity (81.6% similar) in 806 aa overlap (31-829:44-832)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
. :.:...: :: :::.::.: .
CCDS77 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
.. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: ::::
CCDS77 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL
. ::. :...:::....:... :.: :... : :::. : :... .::::: :..
CCDS77 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF
:. :::::.::.:. :.::::.:.:...:::::::.:: : :.::.::::::::.:.:::
CCDS77 PKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDF
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML
:...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. :
CCDS77 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY
: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : :
CCDS77 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN
:: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::::.:.::. ::.::::
CCDS77 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ
.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::::::::::::::
CCDS77 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC
:::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.:
CCDS77 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD
::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::
CCDS77 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLD
:::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.:
CCDS77 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKID
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 S-----GIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFAS
::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: ::::
CCDS77 VSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFAS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 YLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKT
:.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :
CCDS77 YMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGT
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KE2 PAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
::::::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:.::.: ::
CCDS77 PAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
780 790 800 810 820 830
829 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 19:47:59 2016 done: Mon Nov 7 19:47:59 2016
Total Scan time: 2.610 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]