FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5560, 378 aa 1>>>pF1KE5560 378 - 378 aa - 378 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1563+/-0.000943; mu= -7.7612+/- 0.057 mean_var=322.5108+/-66.911, 0's: 0 Z-trim(115.0): 10 B-trim: 111 in 1/54 Lambda= 0.071417 statistics sampled from 15508 (15518) to 15508 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16 Scan time: 2.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32391.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1049) 2060 225.6 1.6e-58 CCDS76823.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1099) 2060 225.6 1.7e-58 CCDS82720.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 966) 1339 151.2 3.5e-36 CCDS74866.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 798) 1235 140.5 5.1e-33 CCDS14003.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 931) 1235 140.5 5.8e-33 CCDS11163.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 ( 938) 992 115.5 2e-25 CCDS54091.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 ( 986) 992 115.5 2.1e-25 CCDS74865.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 881) 776 93.2 9.5e-19 >>CCDS32391.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1049 aa) initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1164.0 bits: 225.6 E(32554): 1.6e-58 Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:52-360) 10 20 30 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF .::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SPQSEAVAHEFQELSLQSSQNLPPLNERKNVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDL 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 NEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 NEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPA 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SQESQGSAASPSEPKVSESPSPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SQESQGSAASPSEPKVSESPSPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVL 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 PTNTVSSAKPGPALVKQSHPKNPNDKHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PTNTVSSAKPGPALVKQSHPKNPNDKHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQ 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 MDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQKQHYNYQTILPAPFKAYHTVSEVHMVRVACIPFQFL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQKQHYNYQTILPAPFKPLNDKNSNSGNSALNNATPNT 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 pF1KE5 SSKIGSEFLQVRNAFSQLFIQICLLLEHQNSTRCSEKSVSSIIPGINS CCDS32 PRQNTSTPVRKPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVNSSGL 390 400 410 420 430 440 >>CCDS76823.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1099 aa) initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1163.7 bits: 225.6 E(32554): 1.7e-58 Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:52-360) 10 20 30 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF .::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SPQSEAVAHEFQELSLQSSQNLPPLNERKNVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDL 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 NEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 NEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPA 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SQESQGSAASPSEPKVSESPSPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SQESQGSAASPSEPKVSESPSPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVL 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 PTNTVSSAKPGPALVKQSHPKNPNDKHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 PTNTVSSAKPGPALVKQSHPKNPNDKHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQ 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 MDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQKQHYNYQTILPAPFKAYHTVSEVHMVRVACIPFQFL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 MDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQKQHYNYQTILPAPFKPLNDKNSNSGNSALNNATPNT 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 pF1KE5 SSKIGSEFLQVRNAFSQLFIQICLLLEHQNSTRCSEKSVSSIIPGINS CCDS76 PRQNTSTPVRKPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVNSSGL 390 400 410 420 430 440 >>CCDS82720.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 (966 aa) initn: 1081 init1: 675 opt: 1339 Z-score: 763.0 bits: 151.2 E(32554): 3.5e-36 Smith-Waterman score: 1339; 68.1% identity (84.5% similar) in 317 aa overlap (1-310:16-330) 10 20 30 40 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERARTENF .:::.::::::::.::.:::::::::::::::: .::::::::.. 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CCDS82 QQQQLFLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAP 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KE5 LQVRNAFSQLFIQICLLLEHQNSTRCSEKSVSSIIPGINS CCDS82 GPCGLARQNSTSLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQ 360 370 380 390 400 410 >>CCDS74866.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 (798 aa) initn: 977 init1: 571 opt: 1235 Z-score: 706.3 bits: 140.5 E(32554): 5.1e-33 Smith-Waterman score: 1235; 67.3% identity (83.5% similar) in 297 aa overlap (21-310:1-295) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELV ::::::::::::: .::::::::..::.::::::.::::: CCDS74 MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAII :::::::: ::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::: CCDS74 RMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAII 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSESPSPVTTNTPAQ ::. .::.. . ::::::::::::.::::.:::::. :: : .::: .:. .:.: CCDS74 -VGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLLSATSASPTQ 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE5 FASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVLP---TN--TVSSAKPGPALVKQSHPKNPND .: : . . :.::: : :.:: :: :. .:: :.:.:::.::. .. CCDS74 VVSQLPMGRDSREMLFLAEQPP-LPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIKQSQPKSASE 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 K-HRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQ : .:::: :. ::.::::::::::::::: ... : :::.::..:::::::::::::.:: CCDS74 KSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQ 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 KQ-HYNYQTILPAPFKAYHTVSEVHMVRVACIPFQFLSSKIGSEFLQVRNAFSQLFIQIC .: :.:::.::::: :. CCDS74 QQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTG 280 290 300 310 320 330 >>CCDS14003.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 (931 aa) initn: 977 init1: 571 opt: 1235 Z-score: 705.3 bits: 140.5 E(32554): 5.8e-33 Smith-Waterman score: 1235; 67.3% identity (83.5% similar) in 297 aa overlap (21-310:1-295) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELV ::::::::::::: .::::::::..::.::::::.::::: CCDS14 MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAII :::::::: ::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::: CCDS14 RMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAII 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSESPSPVTTNTPAQ ::. .::.. . ::::::::::::.::::.:::::. :: : .::: .:. .:.: CCDS14 -VGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLLSATSASPTQ 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE5 FASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVLP---TN--TVSSAKPGPALVKQSHPKNPND .: : . . :.::: : :.:: :: :. .:: :.:.:::.::. .. CCDS14 VVSQLPMGRDSREMLFLAEQPP-LPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIKQSQPKSASE 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 K-HRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQ : .:::: :. ::.::::::::::::::: ... : :::.::..:::::::::::::.:: CCDS14 KSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQ 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 KQ-HYNYQTILPAPFKAYHTVSEVHMVRVACIPFQFLSSKIGSEFLQVRNAFSQLFIQIC .: :.:::.::::: :. CCDS14 QQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTG 280 290 300 310 320 330 >>CCDS11163.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 (938 aa) initn: 971 init1: 635 opt: 992 Z-score: 570.0 bits: 115.5 E(32554): 2e-25 Smith-Waterman score: 996; 51.7% identity (71.6% similar) in 348 aa overlap (1-346:19-354) 10 20 30 40 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERART .::::::::::.:::..:::.:::: :: :::: : :. .. CCDS11 MTLLGSEHSLLIRSKFRSVLQLRLQQRRTQEQLANQGIIPPLKRPAEFHEQRKHLDSDKA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 ENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGPME .: ::.: :.: . ..:: ::::. . :: :. ..:::::::::::::::::: ::::.: CCDS11 KNSLKRKARNRCNSADLVNMHILQASTAERSIPTAQMKLKRARLADDLNEKIALRPGPLE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 LVEKNILPVDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSS-DALSPDQPASQESQGSAASP :::::::::::.::::: : .. .. .. :.:.:::: :.::::: :.. :.::.:: CCDS11 LVEKNILPVDSAVKEAIKG-NQVSFSKSTDAFAFEEDSSSDGLSPDQTRSEDPQNSAGSP 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 SEPKVSESPSPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVLPTNTVSSAKPG . :.:..:: . .: ..:: : . .:.:: . : . :. CCDS11 PDAKASDTPSTGSLGTNQDLASGSEN-----DRNDSASQPSHQSDAGKQGLGPPSTPIAV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 PALVKQSHPKNPND-KHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQ : ::. :. .: :.: :: :::::.:::::::::::::::.::. : ::: :::::: CCDS11 HAAVKS---KSLGDSKNRHKKPKDPKPKVKKLKYHQYIPPDQKAEKSPPPMDSAYARLLQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 QQQLFLQLQILSQQKQHYNYQTILPAPFKAYHTVSEVHMVRVACIPFQFLSSKIGSEFLQ ::::::::::::::.:. ... . .: . .::: ::. . . CCDS11 QQQLFLQLQILSQQQQQQQHRFSYLGMHQAQLKEPNEQMVRNPNSSSTPLSN---TPLSP 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VRNAFSQLFIQICLLLEHQNSTRCSEKSVSSIIPGINS :.:.:: CCDS11 VKNSFSGQTGVSSFKPGPLPPNLDDLKVSELRQQLRIRGLPVSGTKTALMDRLRPFQDCS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS54091.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 (986 aa) initn: 971 init1: 635 opt: 992 Z-score: 569.7 bits: 115.5 E(32554): 2.1e-25 Smith-Waterman score: 996; 51.7% identity (71.6% similar) in 348 aa overlap (1-346:19-354) 10 20 30 40 pF1KE5 MLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERART .::::::::::.:::..:::.:::: :: :::: : :. .. CCDS54 MTLLGSEHSLLIRSKFRSVLQLRLQQRRTQEQLANQGIIPPLKRPAEFHEQRKHLDSDKA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 ENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGPME .: ::.: :.: . ..:: ::::. . :: :. ..:::::::::::::::::: ::::.: CCDS54 KNSLKRKARNRCNSADLVNMHILQASTAERSIPTAQMKLKRARLADDLNEKIALRPGPLE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 LVEKNILPVDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSS-DALSPDQPASQESQGSAASP :::::::::::.::::: : .. .. .. :.:.:::: :.::::: :.. :.::.:: CCDS54 LVEKNILPVDSAVKEAIKG-NQVSFSKSTDAFAFEEDSSSDGLSPDQTRSEDPQNSAGSP 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 SEPKVSESPSPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVLPTNTVSSAKPG . :.:..:: . .: ..:: : . .:.:: . : . :. CCDS54 PDAKASDTPSTGSLGTNQDLASGSEN-----DRNDSASQPSHQSDAGKQGLGPPSTPIAV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 PALVKQSHPKNPND-KHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQ : ::. :. .: :.: :: :::::.:::::::::::::::.::. : ::: :::::: CCDS54 HAAVKS---KSLGDSKNRHKKPKDPKPKVKKLKYHQYIPPDQKAEKSPPPMDSAYARLLQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 QQQLFLQLQILSQQKQHYNYQTILPAPFKAYHTVSEVHMVRVACIPFQFLSSKIGSEFLQ ::::::::::::::.:. ... . .: . .::: ::. . . 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