FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6293, 244 aa 1>>>pF1KE6293 244 - 244 aa - 244 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4403+/-0.000843; mu= 12.8938+/- 0.050 mean_var=64.8159+/-14.015, 0's: 0 Z-trim(105.6): 51 B-trim: 51 in 1/49 Lambda= 0.159306 statistics sampled from 8465 (8515) to 8465 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 2.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44054.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 244) 1613 379.5 1.1e-105 CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 501) 1225 290.5 1.4e-78 CCDS98.2 SLC2A7 gene_id:155184|Hs108|chr1 ( 512) 742 179.5 3.8e-45 CCDS33616.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 499) 600 146.8 2.5e-35 CCDS46673.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 496) 596 145.9 4.7e-35 CCDS13818.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 503) 596 145.9 4.8e-35 CCDS74828.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 535) 596 145.9 5e-35 CCDS477.1 SLC2A1 gene_id:6513|Hs108|chr1 ( 492) 561 137.9 1.2e-32 CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 511) 550 135.3 7.4e-32 CCDS3407.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 540) 538 132.6 5.2e-31 CCDS11097.1 SLC2A4 gene_id:6517|Hs108|chr17 ( 509) 532 131.2 1.3e-30 CCDS8586.1 SLC2A3 gene_id:6515|Hs108|chr12 ( 496) 500 123.8 2.1e-28 CCDS66302.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 535) 496 122.9 4.2e-28 CCDS66301.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 497) 495 122.7 4.6e-28 CCDS8585.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 520) 495 122.7 4.8e-28 CCDS3215.1 SLC2A2 gene_id:6514|Hs108|chr3 ( 524) 365 92.8 4.7e-19 CCDS66300.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 411) 277 72.6 4.7e-13 >>CCDS44054.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 (244 aa) initn: 1613 init1: 1613 opt: 1613 Z-score: 2010.8 bits: 379.5 E(32554): 1.1e-105 Smith-Waterman score: 1613; 100.0% identity (100.0% similar) in 244 aa overlap (1-244:1-244) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 PEPT :::: CCDS44 PEPT >>CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 (501 aa) initn: 1225 init1: 1225 opt: 1225 Z-score: 1524.0 bits: 290.5 E(32554): 1.4e-78 Smith-Waterman score: 1225; 100.0% identity (100.0% similar) in 191 aa overlap (1-191:1-191) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC ::::::::::: CCDS99 GLRNLLANVDGWPILLGLTGVPAALQLLLLPFFPESPRYLLIQKKDEAAAKKALQTLRGW 190 200 210 220 230 240 >>CCDS98.2 SLC2A7 gene_id:155184|Hs108|chr1 (512 aa) initn: 736 init1: 736 opt: 742 Z-score: 923.9 bits: 179.5 E(32554): 3.8e-45 Smith-Waterman score: 742; 59.6% identity (86.3% similar) in 183 aa overlap (9-191:15-197) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY .:::: .: :::: :::::.::::::...::.: ....:::::: CCDS98 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI . : . ::. . :::: ::::::.::..:::::: ::.. ::::.::.::::.:.::: CCDS98 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI ::: :.:: .::::..::...:.:::.: ...:::::::::::::: .:.. ..:. ::. CCDS98 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMS ..::::.:. .:.: : CCDS98 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL 190 200 210 220 230 240 >>CCDS33616.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (499 aa) initn: 595 init1: 595 opt: 600 Z-score: 747.7 bits: 146.8 E(32554): 2.5e-35 Smith-Waterman score: 600; 50.8% identity (79.3% similar) in 179 aa overlap (8-186:10-185) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRT : .:: .: :. :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::. .:: CCDS33 MLHALLRSRMIQGR---ILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQART 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 GEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGC :: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :::.: CCDS33 GEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQ :: : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..::...: CCDS33 SRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 IFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGP . :::.:: CCDS33 VVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLR 180 190 200 210 220 230 >>CCDS46673.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (496 aa) initn: 595 init1: 595 opt: 596 Z-score: 742.8 bits: 145.9 E(32554): 4.7e-35 Smith-Waterman score: 596; 50.8% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (10-186:9-182) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE .::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::. .:::: CCDS46 MRALRRLIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :::.: :: CCDS46 PLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..::...:. CCDS46 KAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC :::.:: CCDS46 GLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGS 180 190 200 210 220 230 >>CCDS13818.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (503 aa) initn: 595 init1: 595 opt: 596 Z-score: 742.7 bits: 145.9 E(32554): 4.8e-35 Smith-Waterman score: 596; 50.8% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (10-186:16-189) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY .::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::. CCDS13 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI .:::: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :: CCDS13 QARTGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI :.: :: : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..:: CCDS13 LFGFSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMS ...:. :::.:: CCDS13 VMGQVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAAL 180 190 200 210 220 230 >>CCDS74828.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (535 aa) initn: 619 init1: 595 opt: 596 Z-score: 742.3 bits: 145.9 E(32554): 5e-35 Smith-Waterman score: 596; 50.8% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (10-186:16-189) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY .::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::. CCDS74 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI .:::: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :: CCDS74 QARTGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI :.: :: : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..:: CCDS74 LFGFSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMS ...:. :::.:: CCDS74 VMGQVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAAL 180 190 200 210 220 230 >>CCDS477.1 SLC2A1 gene_id:6513|Hs108|chr1 (492 aa) initn: 551 init1: 529 opt: 561 Z-score: 699.4 bits: 137.9 E(32554): 1.2e-32 Smith-Waterman score: 561; 43.7% identity (80.0% similar) in 190 aa overlap (1-190:1-184) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE :: ..... ::: :... :.: .:.:.:::....:.: ....:::.:. : :: CCDS47 MEPSSKKLT-GRLMLAVGGAVL-----GSLQFGYNTGVINAPQKVIEEFYNQTWVHRYGE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR . :: :::..:..: ::.:::. :: .::.:::....:. :....: :.::: :. CCDS47 SILPTTLTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLMMNLLAFVSAVLMGFSK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF .. :::..:..:...:. :.... ::::.::..: ::::::.. :: :.::::.::.: CCDS47 LGKSFEMLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTALRGALGTLHQLGIVVGILIAQVF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC :: ....: : CCDS47 GLDSIMGNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINRNEENRAKSVLKKLRGT 180 190 200 210 220 230 >>CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 (511 aa) initn: 538 init1: 538 opt: 550 Z-score: 685.5 bits: 135.3 E(32554): 7.4e-32 Smith-Waterman score: 550; 45.9% identity (78.9% similar) in 185 aa overlap (2-186:12-196) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFY :..:.. :. . : .:.: .:::::: ::::...::.:. .. :: CCDS34 MKLSKKDRGEDEESDSAKKKLDWSCSLLVASLAGAFGSSFLYGYNLSVVNAPTPYIKAFY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 NETYYGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSI ::.. : :. .. ::::::::::.: .::..:.:.: . . .::: .:: :: :.: CCDS34 NESWERRHGRPIDPDTLTLLWSVTVSIFAIGGLVGTLIVKMIGKVLGRKHTLLANNGFAI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VPAILMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFI :.::.:: : .::..:..:...:: .::. .:.::::.:..::..::.:: : .:: CCDS34 SAALLMACSLQAGAFEMLIVGRFIMGIDGGVALSVLPMYLSEISPKEIRGSLGQVTAIFI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 TVGILVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLT .:....:..:: .:: CCDS34 CIGVFTGQLLGLPELLGKESTWPYLFGVIVVPAVVQLLSLPFLPDSPRYLLLEKHNEARA 190 200 210 220 230 240 >>CCDS3407.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 (540 aa) initn: 538 init1: 538 opt: 538 Z-score: 670.2 bits: 132.6 E(32554): 5.2e-31 Smith-Waterman score: 538; 48.2% identity (80.6% similar) in 170 aa overlap (17-186:56-225) 10 20 30 40 pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLM : .:.: .:::::: ::::...::.:. . CCDS34 PPGPGRALLECDHLRSGVPGGRRRKDWSCSLLVASLAGAFGSSFLYGYNLSVVNAPTPYI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QQFYNETYYGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNN . ::::.. : :. .. ::::::::::.: .::..:.:.: . . .::: .:: :: CCDS34 KAFYNESWERRHGRPIDPDTLTLLWSVTVSIFAIGGLVGTLIVKMIGKVLGRKHTLLANN 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IFSIVPAILMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVP :.: :.::.:: : .::..:..:...:: .::. .:.::::.:..::..::.:: : CCDS34 GFAISAALLMACSLQAGAFEMLIVGRFIMGIDGGVALSVLPMYLSEISPKEIRGSLGQVT 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 QLFITVGILVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADW .:: .:....:..:: .:: CCDS34 AIFICIGVFTGQLLGLPELLGKESTWPYLFGVIVVPAVVQLLSLPFLPDSPRYLLLEKHN 210 220 230 240 250 260 244 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 11:51:31 2016 done: Tue Nov 8 11:51:31 2016 Total Scan time: 2.100 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]