FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6649, 238 aa 1>>>pF1KE6649 238 - 238 aa - 238 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1843+/-0.000755; mu= 14.8657+/- 0.045 mean_var=65.1609+/-13.275, 0's: 0 Z-trim(108.3): 39 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.158884 statistics sampled from 10072 (10111) to 10072 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 2.000 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8043.1 SLC22A9 gene_id:114571|Hs108|chr11 ( 553) 1167 276.1 3.3e-74 CCDS31592.1 SLC22A25 gene_id:387601|Hs108|chr11 ( 547) 902 215.4 6.2e-56 CCDS76422.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 ( 322) 819 196.2 2.2e-50 CCDS41661.1 SLC22A10 gene_id:387775|Hs108|chr11 ( 541) 819 196.3 3.3e-50 CCDS73308.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 ( 552) 819 196.3 3.4e-50 CCDS8075.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 553) 615 149.6 4e-36 CCDS60836.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 445) 601 146.3 3.1e-35 CCDS60835.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 519) 601 146.4 3.5e-35 CCDS76425.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 ( 442) 563 137.6 1.3e-32 CCDS8074.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 ( 550) 563 137.7 1.5e-32 CCDS44632.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 506) 375 94.5 1.4e-19 CCDS44631.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 519) 375 94.6 1.4e-19 CCDS8041.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 550) 375 94.6 1.4e-19 CCDS31591.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 563) 375 94.6 1.5e-19 CCDS4892.1 SLC22A7 gene_id:10864|Hs108|chr6 ( 546) 333 84.9 1.1e-16 CCDS8042.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 542) 329 84.0 2.1e-16 CCDS4893.2 SLC22A7 gene_id:10864|Hs108|chr6 ( 548) 312 80.1 3.2e-15 CCDS5084.1 SLC22A16 gene_id:85413|Hs108|chr6 ( 577) 249 65.7 7.5e-11 >>CCDS8043.1 SLC22A9 gene_id:114571|Hs108|chr11 (553 aa) initn: 1190 init1: 1167 opt: 1167 Z-score: 1445.8 bits: 276.1 E(32554): 3.3e-74 Smith-Waterman score: 1167; 100.0% identity (100.0% similar) in 168 aa overlap (1-168:1-168) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAFQDLLGHAGDLWRFQILQTVFLSIFAVATYLHFMLENFTAFIPGHRCWVHILDNDTVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 MAFQDLLGHAGDLWRFQILQTVFLSIFAVATYLHFMLENFTAFIPGHRCWVHILDNDTVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 DNDTGALSQDALLRISIPLDSNMRPEKCRRFVHPQWQLLHLNGTFPNTSDADMEPCVDGW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 DNDTGALSQDALLRISIPLDSNMRPEKCRRFVHPQWQLLHLNGTFPNTSDADMEPCVDGW 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VYDRISFSSTIVTEWDLVCDSQSLTSVAKFVFMAGMMVGGILGGHLSDSSRVGNTQIPGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 VYDRISFSSTIVTEWDLVCDSQSLTSVAKFVFMAGMMVGGILGGHLSDRFGRRFVLRWCY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GNYIGNVPFWYCIYDPGRPGFCHSRLAYPPAGGVCTILCDLSDLKLAARVCSVAHYQQ CCDS80 LQVAIVGTCAALAPTFLIYCSLRFLSGIAAMSLITNTIMLIAEWATHRFQAMGITLGMCP 190 200 210 220 230 240 >>CCDS31592.1 SLC22A25 gene_id:387601|Hs108|chr11 (547 aa) initn: 928 init1: 902 opt: 902 Z-score: 1117.6 bits: 215.4 E(32554): 6.2e-56 Smith-Waterman score: 902; 76.8% identity (88.1% similar) in 168 aa overlap (1-168:1-168) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAFQDLLGHAGDLWRFQILQTVFLSIFAVATYLHFMLENFTAFIPGHRCWVHILDNDTVS ::::::: ..: : :::::: ::: .: : .: . .::::.::: ::::::::::::. 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