FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9444, 1469 aa 1>>>pF1KE9444 1469 - 1469 aa - 1469 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7122+/-0.000428; mu= 16.3768+/- 0.027 mean_var=102.1091+/-20.050, 0's: 0 Z-trim(112.9): 326 B-trim: 16 in 3/50 Lambda= 0.126923 statistics sampled from 21661 (22000) to 21661 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16 Scan time: 10.550 The best scores are: opt bits E(85289) NP_056051 (OMIM: 616417) adhesion G protein-couple (1469) 9855 1816.4 0 NP_001309331 (OMIM: 616417) adhesion G protein-cou (1537) 9730 1793.6 0 XP_016863421 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1537) 9730 1793.6 0 XP_011530090 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1543) 9708 1789.5 0 XP_016863423 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1532) 9682 1784.8 0 XP_016863422 (OMIM: 616417) PREDICTED: 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_056 KELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLEL 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE9 IHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_056 IHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYT 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE9 SMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_056 SMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGS 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE9 SDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL ::::::::::::::::::::::::::::: NP_056 SDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL 1450 1460 >>NP_001309331 (OMIM: 616417) adhesion G protein-coupled (1537 aa) initn: 9730 init1: 9730 opt: 9730 Z-score: 9624.6 bits: 1793.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 9730; 99.9% identity (100.0% similar) 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