FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0406, 809 aa 1>>>pF1KB0406 809 - 809 aa - 809 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9407+/-0.000965; mu= 18.3356+/- 0.058 mean_var=100.0695+/-19.455, 0's: 0 Z-trim(106.6): 86 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.128210 statistics sampled from 8987 (9076) to 8987 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16 Scan time: 2.960 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4648.1 PGBD1 gene_id:84547|Hs108|chr6 ( 809) 5523 1032.8 0 CCDS31128.1 PGBD2 gene_id:267002|Hs108|chr1 ( 592) 1784 341.1 3.2e-93 CCDS7230.1 PGBD3 gene_id:267004|Hs108|chr10 ( 593) 1134 220.9 5e-57 CCDS60529.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1061) 1134 221.1 7.8e-57 CCDS31129.1 PGBD2 gene_id:267002|Hs108|chr1 ( 341) 1087 212.0 1.4e-54 CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 617 125.2 2.9e-28 CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 581 118.6 2.8e-26 CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 559 114.5 5.1e-25 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 535 110.2 1.4e-23 CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325) 537 110.7 1.6e-23 CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 ( 348) 509 105.1 2.1e-22 CCDS5667.1 ZKSCAN5 gene_id:23660|Hs108|chr7 ( 839) 510 105.6 3.6e-22 CCDS2714.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 276) 501 103.5 4.9e-22 CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16 ( 683) 502 104.0 8.6e-22 CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 504 104.6 9.1e-22 CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 497 102.9 1.1e-21 CCDS32814.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 275) 486 100.8 3.4e-21 CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 ( 389) 484 100.5 5.6e-21 CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 482 100.3 9.3e-21 CCDS33743.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 ( 267) 474 98.5 1.5e-20 CCDS4643.1 ZNF165 gene_id:7718|Hs108|chr6 ( 485) 459 96.0 1.6e-19 CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 452 94.7 4.4e-19 CCDS77175.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 193) 443 92.7 6.3e-19 CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 449 94.2 6.5e-19 CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 445 93.4 1e-18 CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 443 92.9 1e-18 CCDS11068.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 444) 437 91.9 2.6e-18 CCDS82043.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 435) 428 90.2 8.1e-18 CCDS10504.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 407) 425 89.6 1.1e-17 CCDS10495.1 ZNF213 gene_id:7760|Hs108|chr16 ( 459) 423 89.3 1.6e-17 CCDS32380.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 234) 411 86.8 4.4e-17 CCDS78119.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 ( 478) 407 86.3 1.3e-16 CCDS82246.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 210) 398 84.4 2.2e-16 CCDS8443.1 ZNF202 gene_id:7753|Hs108|chr11 ( 648) 403 85.7 2.7e-16 CCDS59427.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 290) 398 84.5 2.8e-16 CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7 ( 561) 399 84.9 4e-16 CCDS41300.1 ZSCAN20 gene_id:7579|Hs108|chr1 (1043) 402 85.7 4.4e-16 CCDS11913.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 333) 394 83.8 5.1e-16 CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 335) 394 83.8 5.2e-16 CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 398 84.8 5.6e-16 CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 394) 390 83.1 9.8e-16 CCDS66921.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16 ( 697) 391 83.5 1.3e-15 CCDS1631.1 ZNF496 gene_id:84838|Hs108|chr1 ( 587) 388 82.9 1.7e-15 CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 445) 386 82.4 1.8e-15 CCDS5681.1 ZSCAN21 gene_id:7589|Hs108|chr7 ( 473) 385 82.3 2.1e-15 CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16 ( 967) 387 82.9 2.8e-15 CCDS10095.2 ZSCAN29 gene_id:146050|Hs108|chr15 ( 852) 386 82.7 2.9e-15 CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 382 81.7 3.2e-15 CCDS76814.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 441) 368 79.1 1.8e-14 CCDS76957.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 ( 548) 369 79.4 1.9e-14 >>CCDS4648.1 PGBD1 gene_id:84547|Hs108|chr6 (809 aa) initn: 5523 init1: 5523 opt: 5523 Z-score: 5522.9 bits: 1032.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5523; 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CCDS31 SYLHFADNNELDASDRFAKVRPLIIRMNCNFQKHAPLEEFYSFGESMCEYFGHRGSKQLH 230 240 250 260 270 280 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 NGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDLGLGGNLVMNFADVLLERGQ :::.:.:::::::::..:::::::: : .:. . : .: :::..:..:.:.: ::: CCDS31 RGKPVRLGYKIWCGTTSRGYLVWFEPSQ--GTLFTKPDRSLDLGGSMVIKFVDALQERGF 290 300 310 320 330 340 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 YPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPLMNVEHMKKMKRGYFDFRIE :::. ::. ::::::.: :.::::.::::.:: :::.::: . ...:::::: ::.... CCDS31 LPYHIFFDKVFTSVKLMSILRKKGVKATGTVREYRTERCPLKDPKELKKMKRGSFDYKVD 350 360 370 380 390 400 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 ENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQISQPSIVKVYDECKEGV :..:::.:::. ......:::::::::: .: .. . :. :::.::.:.: :: CCDS31 ESEEIIVCRWHDSSVVNICSNAVGIEPVRLTSRHSGAAKTRTQVHQPSLVKLYQEKVGGV 410 420 430 440 450 460 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 AKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACNPGASLDPLDFRRFVAHF ..::: :.::.:.::. :::: ...:.::.:.:::::::: : :..: : :::..: CCDS31 GRMDQNIAKYKVKIRGMKWYSSFIGYVIDAALNNAWQLHRICCQDAQVDLLAFRRYIACV 470 480 490 500 510 520 800 pF1KB0 YLEHNAHLSD ::: :: CCDS31 YLESNADTTSQGRRSRRLETESRFDMIGHWIIHQDKRTRCALCHSQTNTRCEKCQKGVHA 530 540 550 560 570 580 >>CCDS7230.1 PGBD3 gene_id:267004|Hs108|chr10 (593 aa) initn: 628 init1: 369 opt: 1134 Z-score: 1137.3 bits: 220.9 E(32554): 5e-57 Smith-Waterman score: 1135; 39.5% identity (69.6% similar) in 474 aa overlap (353-806:64-529) 330 340 350 360 370 pF1KB0 WARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSELLQ-GLSFSGDSD----VEKDNEPE----- :.: : . .::: . ::. :. 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CCDS72 DEFMVPYFGRHGCKQFIRGKPIRFGYKFWCGATCLGYICWFQPYQGKNPNTKHE--EYGV 270 280 290 300 310 320 610 620 630 640 650 660 pF1KB0 GGNLVMNFADVLLERGQYPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPLMN :..::..:...: : ::. :..::::. ::. :.. : .::::.:... .. :: . CCDS72 GASLVLQFSEALTEAHPGQYHFVFNNFFTSIALLDKLSSMGHQATGTVRKDHIDRVPLES 330 340 350 360 370 380 670 680 690 700 710 720 pF1KB0 VEHMKKMKRGYFDFRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQ .:: .:: ::.::. ...:. ::: ...... :...::.:. :: . .. : CCDS72 DVALKKKERGTFDYRIDGKGNIV-CRWNDNSVVTVASSGAGIHPLCLVSRYSQKLKKKIQ 390 400 410 420 430 440 730 740 750 760 770 780 pF1KB0 ISQPSIVKVYDECKEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACN ..::...:::.. :: . :. :.:::. ::.::::: . . ......::::::.. . CCDS72 VQQPNMIKVYNQFMGGVDRADENIDKYRASIRGKKWYSSPLLFCFELVLQNAWQLHKTYD 450 460 470 480 490 500 790 800 pF1KB0 PGASLDPLDFRRFVAHFYLEHNAHLSD .: :.::: :. ::: ..: CCDS72 E-KPVDFLEFRRRVVCHYLETHGHPPEPGQKGRPQKRNIDSRYDGINHVIVKQGKQTRCA 510 520 530 540 550 560 >>CCDS60529.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1061 aa) initn: 628 init1: 369 opt: 1134 Z-score: 1133.9 bits: 221.1 E(32554): 7.8e-57 Smith-Waterman score: 1137; 30.3% identity (59.1% similar) in 821 aa overlap (3-806:216-997) 10 20 30 pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGLVKVKEEDPTWEQVCNS .: :::. . . :. :.: .::.. . CCDS60 KKITAKQKHLQAILGGAEVKIELDHASLEEDAEPGPSSLG-SMLMPVQE--TAWEELIRT 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 pF1KB0 QE----GSSHTQEICRLRFRHFCYQEAHGPQEALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLV . :.. :. . . :.. .:: : .. ::. .: . . . . CCDS60 GQMTPFGTQIPQKQEK-KPRKIMLNEASGFEKYLADQAKLSFERKKQGCNKRAARKAPAP 250 260 270 280 290 300 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 LEQFLTILPKELQPCVKTYPLESGEEAVTV-LENLETGS----GDTGQQASVYIQGQDMH . . :. .: :. : . :: . ...:. . : .: . .::. CCDS60 VTPPAPVQNKN-KPNKKARVLSKKEERLKKHIKKLQKRALQFQGKVGLPKARRPWESDMR 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 PMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITTLKCEPPQRPQGNPQEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKA : : .: : : . . .: . : .. .: ..:: . :. . . CCDS60 P---EAEGDS-EGEESEYFP-TEEEEEEEDDEVEGAEADLSGDGTDYELKPLPKGGKRQK 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 260 pF1KB0 VVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQAVAAEKWSHLSLTRRNLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVT ::: . . .. . .. ::. : ..: . . : .. . . ::: . .. CCDS60 KVPV-QEIDDDFFPSSGEEAEAASVGEGGGGGRKVGRYRDDGDEDYYKQRLSPKMPRTLS 420 430 440 450 460 470 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 KDRLFKAKQETSEEMEQSGEASGKPNRECAPQIPCSTPIATERTVAHLNTLKDRHPGDLW .. ::.. .: :. . :. : : : . .. . .:.: ::.: CCDS60 LHEITDL-LETDDSIEASAIVIQPPENATA---PVSDEESGDEEGGTINNL----PGSL- 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 380 pF1KB0 ARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSELLQGLSFSGDSDVEKDNEPEIQ--PAQKKLK .: .. : : . .: . . :: : . .: : ... : CCDS60 --LHTAA--YLIQDGSDAESDSDDPSYAP-------KDDSPDEVPSTFTVQQPPPSRRRK 530 540 550 560 570 390 400 410 420 430 pF1KB0 VSCFPEKSWTKRD--IKPNFPSWSALDSGLLNLKSEKLNPVELFELFFDDETFNLIVNET .. . : : : : ..: .: . .... .:.:..:::.:::...:::. . CCDS60 MTKILCK-WKKADLTVQPVAGRVTAPPNDFFTVMR---TPTEILELFLDDEVIELIVKYS 580 590 600 610 620 630 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 NNYASQKNVSLEVTVQEMRCVFGVLLLSGFMRHPRREMYWEV-SDTDQNLVRDAIRRDRF : :: .:.: : .: .:..: .:...:::.. :::.:.:: .:. . :: :.::::: CCDS60 NLYACSKGVHLGLTSSEFKCFLGIIFLSGYVSVPRRRMFWEQRTDVHNVLVSAAMRRDRF 640 650 660 670 680 690 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 ELIFSNLHFADNGHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLEEYYCFDKSMCECFDSD-- : :::::: :::..:: :::.::::::...:. . ..: : :. ::. : : CCDS60 ETIFSNLHVADNANLDPVDKFSKLRPLISKLNERCMKFVPNETYFSFDEFMVPYFGRHGC 700 710 720 730 740 750 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 -QFLNGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDLGLGGNLVMNFADVLL ::. :::::.:::.:::.: ::. ::.::: .. : . :.:..::..:...: CCDS60 KQFIRGKPIRFGYKFWCGATCLGYICWFQPYQGKNPNTKHE--EYGVGASLVLQFSEALT 760 770 780 790 800 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 ERGQYPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPLMNVEHMKKMKRGYFD : ::. :..::::. ::. :.. : .::::.:... .. :: . .:: .:: :: CCDS60 EAHPGQYHFVFNNFFTSIALLDKLSSMGHQATGTVRKDHIDRVPLESDVALKKKERGTFD 810 820 830 840 850 860 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 FRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQISQPSIVKVYDEC .::. ...:. ::: ...... :...::.:. :: . .. :..::...:::.. CCDS60 YRIDGKGNIV-CRWNDNSVVTVASSGAGIHPLCLVSRYSQKLKKKIQVQQPNMIKVYNQF 870 880 890 900 910 920 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 KEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACNPGASLDPLDFRRF :: . :. :.:::. ::.::::: . . ......::::::.. . .: :.::: CCDS60 MGGVDRADENIDKYRASIRGKKWYSSPLLFCFELVLQNAWQLHKTYDE-KPVDFLEFRRR 930 940 950 960 970 980 800 pF1KB0 VAHFYLEHNAHLSD :. ::: ..: CCDS60 VVCHYLETHGHPPEPGQKGRPQKRNIDSRYDGINHVIVKQGKQTRCAECHKNTTFRCEKC 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS31129.1 PGBD2 gene_id:267002|Hs108|chr1 (341 aa) initn: 911 init1: 815 opt: 1087 Z-score: 1093.6 bits: 212.0 E(32554): 1.4e-54 Smith-Waterman score: 1087; 55.7% identity (79.6% similar) in 280 aa overlap (529-805:1-278) 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 ELIFSNLHFADNGHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLEEYYCFDKSMCECFD---S :: :: .:::::.: : .:::: : : CCDS31 MNCNFQKHAPLEEFYSFGESMCEYFGHRGS 10 20 30 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 DQFLNGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDLGLGGNLVMNFADVLL :. :::.:.:::::::::..:::::::: : .:. . : .: :::..:..:.:.: CCDS31 KQLHRGKPVRLGYKIWCGTTSRGYLVWFEPSQ--GTLFTKPDRSLDLGGSMVIKFVDALQ 40 50 60 70 80 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 ERGQYPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPLMNVEHMKKMKRGYFD ::: :::. ::. ::::::.: :.::::.::::.:: :::.::: . ...:::::: :: CCDS31 ERGFLPYHIFFDKVFTSVKLMSILRKKGVKATGTVREYRTERCPLKDPKELKKMKRGSFD 90 100 110 120 130 140 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 FRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQISQPSIVKVYDEC ....:..:::.:::. ......:::::::::: .: .. . :. :::.::.:.: CCDS31 YKVDESEEIIVCRWHDSSVVNICSNAVGIEPVRLTSRHSGAAKTRTQVHQPSLVKLYQEK 150 160 170 180 190 200 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 KEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACNPGASLDPLDFRRF ::..::: :.::.:.::. :::: ...:.::.:.:::::::: : :..: : :::. CCDS31 VGGVGRMDQNIAKYKVKIRGMKWYSSFIGYVIDAALNNAWQLHRICCQDAQVDLLAFRRY 210 220 230 240 250 260 800 pF1KB0 VAHFYLEHNAHLSD .: ::: :: CCDS31 IACVYLESNADTTSQGRRSRRLETESRFDMIGHWIIHQDKRTRCALCHSQTNTRCEKCQK 270 280 290 300 310 320 >>CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 (563 aa) initn: 558 init1: 424 opt: 617 Z-score: 620.8 bits: 125.2 E(32554): 2.9e-28 Smith-Waterman score: 617; 41.2% identity (65.3% similar) in 294 aa overlap (5-291:12-300) 10 20 30 40 pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGLVKVK-----EEDPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFR : : ...::.: :: ::: : : . :. :: : ::: CCDS34 MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 HFCYQEAHGPQEALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYP .::::.. ::.:::..:.::::::::::..:::::.:::::::::.::::::: .. : CCDS34 RFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYR 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 LESGEEAVTVLENLETGSGDTGQQASVYIQGQDM--HPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGIT .:::::::.::.:: .:::. ..: .: . :: . :. : .:..: : CCDS34 PDSGEEAVTLLEDLELDL--SGQQVPGQVHGPEMLARGMVP-LDPVQ-ESSSFDLHHEAT 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 TLKCEPPQRPQGNPQEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQA . . .: : . :. : : .: .:::.:.. .. . ::..:: :. : . CCDS34 QSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIED-MAVS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 VAAEKWSHLSLTRRNLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQSGEASG . :.:. .:.:::: .. ::. : :. : .... .: ::::. . ::..: CCDS34 LILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTG 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 KPNRECAPQIPCSTPIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRKGRKKD . ..: CCDS34 RSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLG 300 310 320 330 340 350 >>CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 (527 aa) initn: 529 init1: 395 opt: 581 Z-score: 585.2 bits: 118.6 E(32554): 2.8e-26 Smith-Waterman score: 581; 40.6% identity (64.7% similar) in 266 aa overlap (26-291:2-264) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGLVKVKEEDPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFRHFCYQEAHGPQE : : . :. :: : :::.::::.. ::.: CCDS69 MWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFGPRE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 ALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYPLESGEEAVTVLE ::..:.::::::::::..:::::.:::::::::.::::::: .. : .:::::::.:: CCDS69 ALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLE 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 NLETGSGDTGQQASVYIQGQDMHPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITTLKCEPPQRPQGNP .:: .:::. ..: .: : .:..: : . . .: CCDS69 DLELDL--SGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLL 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 QEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQAVAAEKWSHLSLTRR : . :. : : .: .:::.:.. .. . ::..:: :. : .. :.:. .:.:: CCDS69 QSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIED-MAVSLILEEWGCQNLARR 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 NLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQSGEASGKPNRECAPQIPCST :: .. ::. : :. : .... .: ::::. . ::..:. ..: CCDS69 NLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEG 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 PIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSELLQGLSFS CCDS69 KTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEE 280 290 300 310 320 330 >>CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 (578 aa) initn: 492 init1: 466 opt: 559 Z-score: 562.7 bits: 114.5 E(32554): 5.1e-25 Smith-Waterman score: 559; 37.7% identity (64.8% similar) in 284 aa overlap (6-289:14-290) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGLVKVKEEDPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFRHFCY : .::.. .::: ::: :.: . .:.. ::. :::::.. : CCDS46 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKV-EEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 QEAHGPQEALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYPLESG ::. ::.::: ::: ::::::::...:::::.:::::::::::::.::: :: . ::.: CCDS46 QETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 EEAVTVLENLETGSGDTGQQASVYIQGQDMHPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITTLKCEP ::.::.::.:: :. .:. ..:. . . ... . : . :: : : CCDS46 EEVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQSEATQHKSPV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 PQRPQGNPQEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQAVAAEKW ::. : : . . .. .. :. . :. .. .. . ::: : :. : .. :.: CCDS46 PQESQ----ERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIED-MAVSLIREEW 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 SHLSLTRRNLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQSGEASGKPNREC :. ....:: .. :. .. . : ...: . .:: : .. ::...: : CCDS46 L-LDPSQKDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 APQIPCSTPIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSE CCDS46 IRGLEHEEARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCN 300 310 320 330 340 350 >>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa) initn: 382 init1: 382 opt: 535 Z-score: 537.1 bits: 110.2 E(32554): 1.4e-23 Smith-Waterman score: 535; 38.1% identity (63.3% similar) in 289 aa overlap (9-286:17-299) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGLVKVKEE--DPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFRHF : ....: . ::.: . :: : . :.. . :: ::.::.. CCDS27 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 CYQEAHGPQEALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYPLE ::.: ::::::..:::::. :: ::.::::::.:::::::::.::: ::. :. . : CCDS27 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KB0 SGEEAVTVLENLETG-SGDTGQQASVYIQGQDMHPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITT-- ::::::.:.:... :: ....:. : :.:: . :.. : . : : .. CCDS27 SGEEAVAVVEDFQRHLSG--SEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPG 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 LKCEPP------QRPQGNPQEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEE . ::: . :.:. . ..::: : : :.: . :. :: : : :. CCDS27 AHLEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLP---QVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYED 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 ETAQAVAAEKWSHLSLTRRNLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQS ... . .::. :.:..: : : :. :.. .. : . : . ::: . :.: CCDS27 LSVD-YTQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 GEASGKPNRECAPQIPCSTPIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRK ...:: CCDS27 NRTSGGLFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRY 300 310 320 330 340 350 >>CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325 aa) initn: 539 init1: 502 opt: 537 Z-score: 535.7 bits: 110.7 E(32554): 1.6e-23 Smith-Waterman score: 537; 49.7% identity (71.8% similar) in 181 aa overlap (1-174:7-182) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGL--VKVKEEDPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFRHFCY .. :: : :::.. . ::::::: ::.: ... :.:.:. : :::.::: CCDS34 MEAVSRVFPALAGQAPEEQGEIIKVKVKEEDHTWDQESALRRNLSYTRELSRQRFRQFCY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 QEAHGPQEALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYPLESG ::. ::.:::.::::::.::: ::.::::::.:::::::::::::.::: :. . ::: CCDS34 QETPGPREALSQLRELCRQWLNPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQSWVREHNPESG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KB0 EEAVTVLENLETGSGDTGQQASVYIQGQD-----MHPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITT ::.::.::.:: . ::.: ::. : :. . .... . ::.. CCDS34 EEVVTLLEDLERELDEPRQQVSQGTYGQEVSMEEMIPLDSAKESLGTQLQSME-----DR 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 LKCEPPQRPQGNPQEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQAV ..:: :. CCDS34 MECESPEPHPLQDNGSFLWFSMMSQSMGGDNLSSLDTNEAEIEPENMREKFFRSLARLLE 180 190 200 210 220 230 809 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 18:59:05 2016 done: Mon Nov 7 18:59:05 2016 Total Scan time: 2.960 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]