Result of FASTA (ccds) for pFN21AE9222
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9222, 1045 aa
  1>>>pF1KE9222 1045 - 1045 aa - 1045 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8469+/-0.00114; mu= 9.0668+/- 0.068
 mean_var=116.0164+/-23.222, 0's: 0 Z-trim(105.9): 48  B-trim: 496 in 1/51
 Lambda= 0.119073
 statistics sampled from 8660 (8698) to 8660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.267), width:  16
 Scan time:  4.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS73394.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11        ( 920) 6138 1066.3       0
CCDS31680.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11        (1077) 5112 890.0       0
CCDS33515.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21        (1055) 3244 569.1 1.7e-161
CCDS63337.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21        (1087) 2315 409.6 1.9e-113
CCDS63336.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21        (1125) 2315 409.6  2e-113


>>CCDS73394.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11             (920 aa)
 initn: 6138 init1: 6138 opt: 6138  Z-score: 5700.7  bits: 1066.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6138; 100.0% identity (100.0% similar) in 920 aa overlap (126-1045:1-920)

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE9 HDNKDDLQAAIALSLLESPKIQADGRDLNRMHEATSAETKRSKRKRCEVWGENPNPNDWR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73                               MHEATSAETKRSKRKRCEVWGENPNPNDWR
                                             10        20        30

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE9 RVDGWPVGLKNVGNTCWFSAVIQSLFQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNIMFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RVDGWPVGLKNVGNTCWFSAVIQSLFQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNIMFM
               40        50        60        70        80        90

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE9 QELQYLFALMMGSNRKFVDPSAALDLLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QELQYLFALMMGSNRKFVDPSAALDLLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAV
              100       110       120       130       140       150

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE9 NVNSPRNKSENPMVQLFYGTFLTEGVREGKPFCNNETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NVNSPRNKSENPMVQLFYGTFLTEGVREGKPFCNNETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMV
              160       170       180       190       200       210

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE9 EGDVELLPSDHSVKYGQERWFTKLPPVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EGDVELLPSDHSVKYGQERWFTKLPPVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMD
              220       230       240       250       260       270

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE9 RYMYRSKELIRNKRECIRKLKEEIKILQQKLERYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RYMYRSKELIRNKRECIRKLKEEIKILQQKLERYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTK
              280       290       300       310       320       330

         460       470       480       490       500       510     
pF1KE9 PASESCPPESDTHMTLPLSSVHCSVSDQTSKESTSTESSSQDVESTFSSPEDSLPKSKPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PASESCPPESDTHMTLPLSSVHCSVSDQTSKESTSTESSSQDVESTFSSPEDSLPKSKPL
              340       350       360       370       380       390

         520       530       540       550       560       570     
pF1KE9 TSSRSSMEMPSQPAPRTVTDEEINFVKTCLQRWRSEIEQDIQDLKTCIASTTQTIEQMYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TSSRSSMEMPSQPAPRTVTDEEINFVKTCLQRWRSEIEQDIQDLKTCIASTTQTIEQMYC
              400       410       420       430       440       450

         580       590       600       610       620       630     
pF1KE9 DPLLRQVPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIYNQPRQSWLKYNDISVTESSWEEVERDSYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DPLLRQVPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIYNQPRQSWLKYNDISVTESSWEEVERDSYG
              460       470       480       490       500       510

         640       650       660       670       680       690     
pF1KE9 GLRNVSAYCLMYINDKLPYFNAEAAPTESDQMSEVEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GLRNVSAYCLMYINDKLPYFNAEAAPTESDQMSEVEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEW
              520       530       540       550       560       570

         700       710       720       730       740       750     
pF1KE9 EEEQSCKIPQMESSTNSSSQDYSTSQEPSVASSHGVRCLSSEHAVIVKEQTAQAIANTAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EEEQSCKIPQMESSTNSSSQDYSTSQEPSVASSHGVRCLSSEHAVIVKEQTAQAIANTAR
              580       590       600       610       620       630

         760       770       780       790       800       810     
pF1KE9 AYEKSGVEAALSEAFHEEYSRLYQLAKETPTSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKRVVERTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AYEKSGVEAALSEAFHEEYSRLYQLAKETPTSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKRVVERTLL
              640       650       660       670       680       690

         820       830       840       850       860       870     
pF1KE9 EQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVSVYLLTGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVSVYLLTGLE
              700       710       720       730       740       750

         880       890       900       910       920       930     
pF1KE9 LYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAKAASLFETN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAKAASLFETN
              760       770       780       790       800       810

         940       950       960       970       980       990     
pF1KE9 DDHSVTEGINVMNELIIPCIHLIINNDISKDDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAENLQLCLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DDHSVTEGINVMNELIIPCIHLIINNDISKDDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAENLQLCLG
              820       830       840       850       860       870

        1000      1010      1020      1030      1040     
pF1KE9 EFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDLCSRFAAVMESIQGVSTVTVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDLCSRFAAVMESIQGVSTVTVK
              880       890       900       910       920

>>CCDS31680.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11             (1077 aa)
 initn: 5112 init1: 5112 opt: 5112  Z-score: 4747.0  bits: 890.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6851; 97.0% identity (97.0% similar) in 1077 aa overlap (1-1045:1-1077)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MTAELQQDDAAGAADGHGSSCQMLLNQLREITGIQDPSFLHEALKASNGDITQAVSLLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTAELQQDDAAGAADGHGSSCQMLLNQLREITGIQDPSFLHEALKASNGDITQAVSLLTD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ERVKEPSQDTVATEPSEVEGSAANKEVLAKVIDLTHDNKDDLQAAIALSLLESPKIQADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ERVKEPSQDTVATEPSEVEGSAANKEVLAKVIDLTHDNKDDLQAAIALSLLESPKIQADG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 RDLNRMHEATSAETKRSKRKRCEVWGENPNPNDWRRVDGWPVGLKNVGNTCWFSAVIQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RDLNRMHEATSAETKRSKRKRCEVWGENPNPNDWRRVDGWPVGLKNVGNTCWFSAVIQSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 FQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNIMFMQELQYLFALMMGSNRKFVDPSAALD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNIMFMQELQYLFALMMGSNRKFVDPSAALD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 LLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAVNVNSPRNKSENPMVQLFYGTFLTEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAVNVNSPRNKSENPMVQLFYGTFLTEG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 VREGKPFCNNETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMVEGDVELLPSDHSVKYGQERWFTKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VREGKPFCNNETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMVEGDVELLPSDHSVKYGQERWFTKLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 PVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMDRYMYRSKELIRNKRECIRKLKEEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMDRYMYRSKELIRNKRECIRKLKEEIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 ILQQKLERYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTKPASESCPPESDTHMTLPLSSVHCSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ILQQKLERYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTKPASESCPPESDTHMTLPLSSVHCSV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 SDQTSKESTSTESSSQDVESTFSSPEDSLPKSKPLTSSRSSMEMPSQPAPRTVTDEEINF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDQTSKESTSTESSSQDVESTFSSPEDSLPKSKPLTSSRSSMEMPSQPAPRTVTDEEINF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 VKTCLQRWRSEIEQDIQDLKTCIASTTQTIEQMYCDPLLRQVPYRLHAVLVHEGQANAGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VKTCLQRWRSEIEQDIQDLKTCIASTTQTIEQMYCDPLLRQVPYRLHAVLVHEGQANAGH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 YWAYIYNQPRQSWLKYNDISVTESSWEEVERDSYGGLRNVSAYCLMYINDKLPYFNAEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YWAYIYNQPRQSWLKYNDISVTESSWEEVERDSYGGLRNVSAYCLMYINDKLPYFNAEAA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 PTESDQMSEVEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEWEEEQSCKIPQMESSTNSSSQDYSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTESDQMSEVEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEWEEEQSCKIPQMESSTNSSSQDYSTS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760                    
pF1KE9 QEPSVASSHGVRCLSSEHAVIVKEQTAQAIANTARAYEKSGVEAALSE------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS31 QEPSVASSHGVRCLSSEHAVIVKEQTAQAIANTARAYEKSGVEAALSEVMLSPAMQGVIL
              730       740       750       760       770       780

                          770       780       790       800        
pF1KE9 --------------------AFHEEYSRLYQLAKETPTSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKR
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AIAKARQTFDRDGSEAGLIKAFHEEYSRLYQLAKETPTSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKR
              790       800       810       820       830       840

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE9 VVERTLLEQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVERTLLEQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVSV
              850       860       870       880       890       900

      870       880       890       900       910       920        
pF1KE9 YLLTGLELYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLLTGLELYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAKA
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pF1KE9 ASLFETNDDHSVTEGINVMNELIIPCIHLIINNDISKDDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASLFETNDDHSVTEGINVMNELIIPCIHLIINNDISKDDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAE
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pF1KE9 NLQLCLGEFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDLCSRFAAVMESIQGVSTVTVK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLQLCLGEFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDLCSRFAAVMESIQGVSTVTVK
             1030      1040      1050      1060      1070       

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       ::.:   :::.    ::. :    : .::::::::::.: ..:..::: :::..  ::..
CCDS33 MTVEQNVLQQS----AAQKHQ---QTFLNQLREITGINDTQILQQALKDSNGNLELAVAF
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pF1KE9 LTDERVKEPSQDTVATEPSEVEGS----AANKEVLAKVIDLTHDNKDDLQAAIALSLLES
       :: . .: :.:. ..   . . :.    ...... ..::::: :.::::: :::::: ::
CCDS33 LTAKNAKTPQQEETTYYQTALPGNDRYISVGSQADTNVIDLTGDDKDDLQRAIALSLAES
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pF1KE9 PK------IQADGRDLNRMHEATSAETKRS-KRKRCEVWGENPNPNDWRRVDGWPVGLKN
        .      :  . . ..:. ::. ::.:   ::   ::: .. :: : .: :  ::::::
CCDS33 NRAFRETGITDEEQAISRVLEASIAENKACLKRTPTEVWRDSRNPYDRKRQDKAPVGLKN
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pF1KE9 VGNTCWFSAVIQSLFQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNIMFMQELQYLFALMM
       :::::::::::::::.: :::::::.:. :.:. .  :.. :.::. ::.::.:::::..
CCDS33 VGNTCWFSAVIQSLFNLLEFRRLVLNYKPPSNAQDLPRNQKEHRNLPFMRELRYLFALLV
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pF1KE9 GSNRKFVDPSAALDLLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAVNVNSPRNKSEN
       :..::.:::: :...:: ::.:.. :::::::::::::::::::::. .. .. ..: .:
CCDS33 GTKRKYVDPSRAVEILKDAFKSNDSQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQMKAEEETDEEKPKN
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        290       300       310       320       330       340      
pF1KE9 PMVQLFYGTFLTEGVREGKPFCNNETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMVEGDVELLPSDH
       :::.:::: ::. :: ::: : :.: ::::::::::...: ::::.::.::..: : :..
CCDS33 PMVELFYGRFLAVGVLEGKKFENTEMFGQYPLQVNGFKDLHECLEAAMIEGEIESLHSEN
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pF1KE9 SVKYGQERWFTKLPPVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMDRYMYRSKELIR
       : : :::.:::.::::::::::::::::.::.::::::::::::..:.::::.:..:. :
CCDS33 SGKSGQEHWFTELPPVLTFELSRFEFNQALGRPEKIHNKLEFPQVLYLDRYMHRNREITR
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pF1KE9 NKRECIRKLKEEIKILQQKLERYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTKPASESCPPESD
        ::: :..::. . .:::.::::..::::: :::: :.:.:..::::.::.  :  : .:
CCDS33 IKREEIKRLKDYLTVLQQRLERYLSYGSGPKRFPLVDVLQYALEFASSKPVCTS--PVDD
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pF1KE9 THMTLPLSSVHCSVSDQTSKESTSTESS-SQDVESTFSSPEDSLPKS----KPLTSSRSS
          . : :.   :. .::   .:  ... :... ::  :   .. .     ::.:.::  
CCDS33 IDASSPPSG---SIPSQTLPSTTEQQGALSSELPSTSPSSVAAISSRSVIHKPFTQSRIP
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             530       540       550       560       570       580 
pF1KE9 MEMPSQPAPRTVTDEEINFVKTCLQRWRSEIEQDIQDLKTCIASTTQTIEQMYCDPLLRQ
        ..: .:::: .:.::.. ...::.:::.:::.: .::.  :.   .::: :: :  . :
CCDS33 PDLPMHPAPRHITEEELSVLESCLHRWRTEIENDTRDLQESISRIHRTIELMYSDKSMIQ
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KE9 VPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIYNQPRQSWLKYNDISVTESSWEEVERDSYGGLRNVS
       ::::::::::::::::::::::::... .. :.:::::.::.:::::. :::.:: ::.:
CCDS33 VPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIFDHRESRWMKYNDIAVTKSSWEELVRDSFGGYRNAS
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pF1KE9 AYCLMYINDKLPYFNAEAAPTESDQ-MSEVEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEWEEEQS
       ::::::::::  ..  :    :. : .  .:.:  .:. ...::: :::.:.:::. . .
CCDS33 AYCLMYINDKAQFLIQEEFNKETGQPLVGIETLPPDLRDFVEEDNQRFEKELEEWDAQLA
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pF1KE9 CKIPQMESSTNSSSQDYSTSQEPSVASS------HGVRCLSSEHAVIVKEQTAQAIANTA
        :  : .  .... ..  ::   . :..      .  :   :.:   .::.: : :....
CCDS33 QKALQEKLLASQKLRESETSVTTAQAAGDPEYLEQPSRSDFSKH---LKEETIQIITKAS
      710       720       730       740       750          760     

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pF1KE9 RAYEKSGVEAALSEAFHEEYSRLYQLAKETPTSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKRVVERTL
       . .: .. :..:. :.. ::.:: .::.:    ..: ::.::.:::.::.:::...:.::
CCDS33 HEHEDKSPETVLQSAIKLEYARLVKLAQEDTPPETDYRLHHVVVYFIQNQAPKKIIEKTL
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pF1KE9 LEQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVSVYLLTGL
       ::::.:.:::.:::  .:::::::::. : :...:.:::..::.::  ::....::. ::
CCDS33 LEQFGDRNLSFDERCHNIMKVAQAKLEMIKPEEVNLEEYEEWHQDYRKFRETTMYLIIGL
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pF1KE9 ELYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAKAASLFET
       : .:. .: ..: .:. :::.:  :: ::  ::  : .:. :::.:::.:: .:: :::.
CCDS33 ENFQRESYIDSLLFLICAYQNNKELLSKGLYRGHDEELISHYRRECLLKLNEQAAELFES
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pF1KE9 NDDHSVTEGINVMNELIIPCIHLIINNDISKDDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAENLQLCL
       ..:. :..:. .:::.:.: . :.. ... . :. :.: :::.:::::::..  .::  :
CCDS33 GEDREVNNGLIIMNEFIVPFLPLLLVDEMEEKDILAVEDMRNRWCSYLGQEMEPHLQEKL
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pF1KE9 GEFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDLCSRFAAVMESIQGVSTVTVK
        .:::.::: : ::  ..::: .   : ..:: ::: .: :.         
CCDS33 TDFLPKLLDCSMEIKSFHEPPKLPSYSTHELCERFARIMLSLSRTPADGR 
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>>CCDS63337.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21             (1087 aa)
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pF1KE9 MTAE---LQQDDAAGAADGHGSSCQMLLNQLREITGIQDPSFLHEALKASNGDITQAVSL
       ::.:   :::.    ::. :    : .::::::::::.: ..:..::: :::..  ::..
CCDS63 MTVEQNVLQQS----AAQKHQ---QTFLNQLREITGINDTQILQQALKDSNGNLELAVAF
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pF1KE9 LTDERVKEPSQDTVATEPSEVEGS----AANKEVLAKVIDLTHDNKDDLQAAIALSLLES
       :: . .: :.:. ..   . . :.    ...... ..::::: :.::::: :::::: ::
CCDS63 LTAKNAKTPQQEETTYYQTALPGNDRYISVGSQADTNVIDLTGDDKDDLQRAIALSLAES
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pF1KE9 PK------IQADGRDLNRMHEATSAETKRS-KRKRCEVWGENPNPNDWRRVDGWPVGLKN
        .      :  . . ..:. ::. ::.:   ::   ::: .. :: : .: :  ::::::
CCDS63 NRAFRETGITDEEQAISRVLEASIAENKACLKRTPTEVWRDSRNPYDRKRQDKAPVGLKN
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pF1KE9 VGNTCWFSAVIQSLFQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNIMFMQELQYLFALMM
       :::::::::::::::.: :::::::.:. :.:. .  :.. :.::. ::.::.:::::..
CCDS63 VGNTCWFSAVIQSLFNLLEFRRLVLNYKPPSNAQDLPRNQKEHRNLPFMRELRYLFALLV
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KE9 GSNRKFVDPSAALDLLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAVNVNSPRNKSEN
       :..::.:::: :...:: ::.:.. :::::::::::::::::::::. .. .. ..: .:
CCDS63 GTKRKYVDPSRAVEILKDAFKSNDSQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQMKAEEETDEEKPKN
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        290       300       310       320       330       340      
pF1KE9 PMVQLFYGTFLTEGVREGKPFCNNETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMVEGDVELLPSDH
       :::.:::: ::. :: ::: : :.: ::::::::::...: ::::.::.::..: : :..
CCDS63 PMVELFYGRFLAVGVLEGKKFENTEMFGQYPLQVNGFKDLHECLEAAMIEGEIESLHSEN
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KE9 SVKYGQERWFTKLPPVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMDRYMYRSKELIR
       : : :::.:::.::::::::::::::::.::.::::::::::::..:.::::.:..:. :
CCDS63 SGKSGQEHWFTELPPVLTFELSRFEFNQALGRPEKIHNKLEFPQVLYLDRYMHRNREITR
           360       370       380       390       400       410   

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE9 NKRECIRKLKEEIKILQQKLERYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTKPASESCPPESD
        ::: :..::. . .:::.::::..::::: :::: :.:.:..::::.::.  :  : .:
CCDS63 IKREEIKRLKDYLTVLQQRLERYLSYGSGPKRFPLVDVLQYALEFASSKPVCTS--PVDD
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        470       480       490        500       510           520 
pF1KE9 THMTLPLSSVHCSVSDQTSKESTSTESS-SQDVESTFSSPEDSLPKS----KPLTSSRSS
          . : :.   :. .::   .:  ... :... ::  :   .. .     ::.:.::  
CCDS63 IDASSPPSG---SIPSQTLPSTTEQQGALSSELPSTSPSSVAAISSRSVIHKPFTQSRIP
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pF1KE9 MEMPSQPAPRTVTDEEINFVKTCLQRWRSEIEQDIQDLKTCIASTTQTIEQMYCDPLLRQ
        ..: .:::: .:.::.. ...::.:::.:::.: .::.  :.   .::: :: :  . :
CCDS63 PDLPMHPAPRHITEEELSVLESCLHRWRTEIENDTRDLQESISRIHRTIELMYSDKSMIQ
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KE9 VPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIYNQPRQSWLKYNDISVTESSWEEVERDSYGGLRNVS
       ::::::::::::::::::::::::... .. :.:::::.::.:::::. :::.:: ::.:
CCDS63 VPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIFDHRESRWMKYNDIAVTKSSWEELVRDSFGGYRNAS
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pF1KE9 AYCLMYINDKLPYFNAEAAPTESDQ-MSEVEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEWE----
       ::::::::::  ..  :    :. : .  .:.:  .:. ...::: :::.:.:::.    
CCDS63 AYCLMYINDKAQFLIQEEFNKETGQPLVGIETLPPDLRDFVEEDNQRFEKELEEWDAQLA
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pF1KE9 ----EEQ---SCKIPQMESS--TNSSSQDYSTSQEPSVA--SSHG-------VRCLSSEH
           .:.   : :. . :.:  : ... :    ..:: .  :.:        .   : ::
CCDS63 QKALQEKLLASQKLRESETSVTTAQAAGDPEYLEQPSRSDFSKHLKEETIQIITKASHEH
      710       720       730       740       750       760        

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pF1KE9 AVIVKEQTAQ-------------AIANTARAYEKSGVEAALSEAFHEEYSRLYQLAKETP
            : . :             ::...  .:.. : ::.. .:.. ::.:: .::.:  
CCDS63 EDKSPETVLQSIMMTPNMQGIIMAIGKSRSVYDRCGPEAGFFKAIKLEYARLVKLAQEDT
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pF1KE9 TSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKRVVERTLLEQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGP
         ..: ::.::.:::.::.:::...:.::::::.:.:::.:::  .:::::::::. : :
CCDS63 PPETDYRLHHVVVYFIQNQAPKKIIEKTLLEQFGDRNLSFDERCHNIMKVAQAKLEMIKP
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pF1KE9 DDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVSVYLLTGLELYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPR
       ...:.:::..::.::  ::....::. ::: .:. .: ..: .:. :::.:  :: ::  
CCDS63 EEVNLEEYEEWHQDYRKFRETTMYLIIGLENFQRESYIDSLLFLICAYQNNKELLSKGLY
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pF1KE9 RGVKESVIALYRRKCLLELNAKAASLFETNDDHSVTEGINVMNELIIPCIHLIINNDISK
       ::  : .:. :::.:::.:: .:: :::...:. :..:. .:::.:.: . :.. ... .
CCDS63 RGHDEELISHYRRECLLKLNEQAAELFESGEDREVNNGLIIMNEFIVPFLPLLLVDEMEE
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pF1KE9 DDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAENLQLCLGEFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDL
        :. :.: :::.:::::::..  .::  : .:::.::: : ::  ..::: .   : ..:
CCDS63 KDILAVEDMRNRWCSYLGQEMEPHLQEKLTDFLPKLLDCSMEIKSFHEPPKLPSYSTHEL
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pF1KE9 CSRFAAVMESIQGVSTVTVK
       : ::: .: :.         
CCDS63 CERFARIMLSLSRTPADGR 
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       ::.:   :::    .::. :    : .::::::::::.: ..:..::: :::..  ::..
CCDS63 MTVEQNVLQQ----SAAQKHQ---QTFLNQLREITGINDTQILQQALKDSNGNLELAVAF
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pF1KE9 LTDERVKEPSQDTVATEPSEVEGS----AANKEVLAKVIDLTHDNKDDLQAAIALSLLES
       :: . .: :.:. ..   . . :.    ...... ..::::: :.::::: :::::: ::
CCDS63 LTAKNAKTPQQEETTYYQTALPGNDRYISVGSQADTNVIDLTGDDKDDLQRAIALSLAES
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        .      :  . . ..:. ::. ::.:   ::   ::: .. :: : .: :  ::::::
CCDS63 NRAFRETGITDEEQAISRVLEASIAENKACLKRTPTEVWRDSRNPYDRKRQDKAPVGLKN
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CCDS63 VGNTCWFSAVIQSLFNLLEFRRLVLNYKPPSNAQDLPRNQKEHRNLPFMRELRYLFALLV
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       :..::.:::: :...:: ::.:.. :::::::::::::::::::::. .. .. ..: .:
CCDS63 GTKRKYVDPSRAVEILKDAFKSNDSQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQMKAEEETDEEKPKN
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       :::.:::: ::. :: ::: : :.: ::::::::::...: ::::.::.::..: : :..
CCDS63 PMVELFYGRFLAVGVLEGKKFENTEMFGQYPLQVNGFKDLHECLEAAMIEGEIESLHSEN
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pF1KE9 SVKYGQERWFTKLPPVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYMDRYMYRSKELIR
       : : :::.:::.::::::::::::::::.::.::::::::::::..:.::::.:..:. :
CCDS63 SGKSGQEHWFTELPPVLTFELSRFEFNQALGRPEKIHNKLEFPQVLYLDRYMHRNREITR
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CCDS63 IKREEIKRLKDYLTVLQQRLERYLSYGSGPKRFPLVDVLQYALEFASSKPVCTS--PVDD
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          . : :.   :. .::   .:  ... :... ::  :   .. .     ::.:.::  
CCDS63 IDASSPPSG---SIPSQTLPSTTEQQGALSSELPSTSPSSVAAISSRSVIHKPFTQSRIP
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CCDS63 PDLPMHPAPRHITEEELSVLESCLHRWRTEIENDTRDLQESISRIHRTIELMYSDKSMIQ
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CCDS63 VPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIFDHRESRWMKYNDIAVTKSSWEELVRDSFGGYRNAS
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CCDS63 AYCLMYINDKAQFLIQEEFNKETGQPLVGIETLPPDLRDFVEEDNQRFEKELEEWDAQLA
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pF1KE9 ---------QSCKIPQMESS--TNSSSQDYSTSQEPSVA--SSHG-------VRCLSSEH
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CCDS63 QKALQEKLLASQKLRESETSVTTAQAAGDPEYLEQPSRSDFSKHLKEETIQIITKASHEH
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pF1KE9 A-----VIVKEQ----TAQ-----------------------------------------
             .... .    :.:                                         
CCDS63 EDKSPETVLQSKPENTTSQPLSNQRVVEVAIPHVGKFMIESKEGGYDDEIMMTPNMQGII
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pF1KE9 -AIANTARAYEKSGVEAALSEAFHEEYSRLYQLAKETPTSHSDPRLQHVLVYFFQNEAPK
        ::...  .:.. : ::.. .:.. ::.:: .::.:    ..: ::.::.:::.::.:::
CCDS63 MAIGKSRSVYDRCGPEAGFFKAIKLEYARLVKLAQEDTPPETDYRLHHVVVYFIQNQAPK
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pF1KE9 RVVERTLLEQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMEEYKKWHEDYSLFRKVS
       ...:.::::::.:.:::.:::  .:::::::::. : :...:.:::..::.::  ::...
CCDS63 KIIEKTLLEQFGDRNLSFDERCHNIMKVAQAKLEMIKPEEVNLEEYEEWHQDYRKFRETT
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pF1KE9 VYLLTGLELYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAK
       .::. ::: .:. .: ..: .:. :::.:  :: ::  ::  : .:. :::.:::.:: .
CCDS63 MYLIIGLENFQRESYIDSLLFLICAYQNNKELLSKGLYRGHDEELISHYRRECLLKLNEQ
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       :: :::...:. :..:. .:::.:.: . :.. ... . :. :.: :::.:::::::.. 
CCDS63 AAELFESGEDREVNNGLIIMNEFIVPFLPLLLVDEMEEKDILAVEDMRNRWCSYLGQEME
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CCDS63 PHLQEKLTDFLPKLLDCSMEIKSFHEPPKLPSYSTHELCERFARIMLSLSRTPADGR 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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