FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9222, 1045 aa 1>>>pF1KE9222 1045 - 1045 aa - 1045 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8469+/-0.00114; mu= 9.0668+/- 0.068 mean_var=116.0164+/-23.222, 0's: 0 Z-trim(105.9): 48 B-trim: 496 in 1/51 Lambda= 0.119073 statistics sampled from 8660 (8698) to 8660 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16 Scan time: 4.850 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS73394.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11 ( 920) 6138 1066.3 0 CCDS31680.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11 (1077) 5112 890.0 0 CCDS33515.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21 (1055) 3244 569.1 1.7e-161 CCDS63337.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21 (1087) 2315 409.6 1.9e-113 CCDS63336.1 USP25 gene_id:29761|Hs108|chr21 (1125) 2315 409.6 2e-113 >>CCDS73394.1 USP28 gene_id:57646|Hs108|chr11 (920 aa) initn: 6138 init1: 6138 opt: 6138 Z-score: 5700.7 bits: 1066.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6138; 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