FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6296, 792 aa 1>>>pF1KB6296 792 - 792 aa - 792 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2696+/-0.000375; mu= 9.8050+/- 0.023 mean_var=112.1834+/-22.227, 0's: 0 Z-trim(116.0): 128 B-trim: 320 in 3/56 Lambda= 0.121090 statistics sampled from 26710 (26861) to 26710 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16 Scan time: 8.630 The best scores are: opt bits E(85289) NP_037452 (OMIM: 607926) host cell factor 2 [Homo ( 792) 5379 951.3 0 XP_016874731 (OMIM: 607926) PREDICTED: host cell f ( 636) 3950 701.6 2.7e-201 XP_016874730 (OMIM: 607926) PREDICTED: host cell f ( 736) 2546 456.3 2.1e-127 NP_005325 (OMIM: 300019,309541) host cell factor 1 (2035) 2005 362.0 1.5e-98 XP_011529450 (OMIM: 300019,309541) PREDICTED: host (2038) 2005 362.0 1.5e-98 XP_011529449 (OMIM: 300019,309541) PREDICTED: host (2039) 2005 362.0 1.5e-98 XP_006724879 (OMIM: 300019,309541) PREDICTED: host (2079) 2005 362.0 1.5e-98 XP_006724878 (OMIM: 300019,309541) PREDICTED: host (2080) 2005 362.0 1.5e-98 XP_016884960 (OMIM: 300019,309541) PREDICTED: host (2013) 2001 361.3 2.4e-98 XP_016884961 (OMIM: 300019,309541) PREDICTED: host (1776) 822 155.3 2.1e-36 XP_016869672 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 241) 213 48.6 3.9e-05 NP_001167624 (OMIM: 605962) rab9 effector protein ( 321) 213 48.6 5e-05 XP_005251698 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 329) 213 48.6 5.1e-05 NP_001401 (OMIM: 604267,614976) multiple epidermal (2778) 227 51.4 6.1e-05 NP_001258867 (OMIM: 604267,614976) multiple epider (2845) 227 51.4 6.3e-05 NP_061867 (OMIM: 609109) F-box only protein 42 [Ho ( 717) 202 46.8 0.00038 XP_006710761 (OMIM: 609109) PREDICTED: F-box only ( 717) 202 46.8 0.00038 XP_016869667 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 318) 190 44.6 0.0008 NP_006758 (OMIM: 600574,615670,616564) leucine-zip ( 840) 197 46.0 0.00081 XP_005251699 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 326) 190 44.6 0.00082 XP_011516422 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 300) 181 43.0 0.0023 XP_016869668 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 305) 181 43.0 0.0023 XP_016869666 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 372) 181 43.1 0.0027 NP_005824 (OMIM: 605962) rab9 effector protein wit ( 372) 181 43.1 0.0027 NP_001167623 (OMIM: 605962) rab9 effector protein ( 372) 181 43.1 0.0027 XP_005251697 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 380) 181 43.1 0.0028 XP_016869669 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 267) 173 41.6 0.0054 XP_016869671 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 267) 173 41.6 0.0054 XP_016869670 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 267) 173 41.6 0.0054 XP_005251701 (OMIM: 605962) PREDICTED: rab9 effect ( 275) 173 41.6 0.0055 XP_016871525 (OMIM: 612869) PREDICTED: attractin-l (1113) 183 43.6 0.0057 XP_011537892 (OMIM: 612869) PREDICTED: attractin-l (1233) 183 43.6 0.0062 XP_011537893 (OMIM: 612869) PREDICTED: attractin-l (1233) 183 43.6 0.0062 XP_011537891 (OMIM: 612869) PREDICTED: attractin-l (1304) 183 43.6 0.0065 XP_011537890 (OMIM: 612869) PREDICTED: attractin-l (1312) 183 43.6 0.0065 XP_016871524 (OMIM: 612869) PREDICTED: attractin-l (1370) 183 43.6 0.0068 NP_997186 (OMIM: 612869) attractin-like protein 1 (1379) 183 43.6 0.0068 XP_016862552 (OMIM: 611909) PREDICTED: fibronectin ( 956) 178 42.7 0.0091 >>NP_037452 (OMIM: 607926) host cell factor 2 [Homo sapi (792 aa) initn: 5379 init1: 5379 opt: 5379 Z-score: 5082.5 bits: 951.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5379; 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