Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4213
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4213, 705 aa
1>>>pF1KE4213 705 - 705 aa - 705 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8671+/-0.00115; mu= 7.7024+/- 0.068
mean_var=158.2679+/-34.255, 0's: 0 Z-trim(105.8): 128 B-trim: 167 in 1/52
Lambda= 0.101948
statistics sampled from 8515 (8651) to 8515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 705) 4782 716.3 3.9e-206
CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 667) 3624 545.9 6.9e-155
CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 735) 3016 456.6 6.2e-128
CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 540) 1470 229.1 1.4e-59
CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 228) 1091 173.1 4.1e-43
CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 710) 562 95.6 2.7e-19
CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 716) 558 95.0 4.1e-19
CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 728) 558 95.0 4.1e-19
CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 573) 548 93.5 9.5e-19
CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 550) 523 89.8 1.2e-17
CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 633) 502 86.7 1.1e-16
CCDS73048.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 721) 496 85.9 2.3e-16
CCDS61738.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 ( 704) 483 84.0 8.4e-16
CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 ( 749) 429 76.1 2.2e-13
CCDS44333.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 783) 411 73.4 1.4e-12
>>CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (705 aa)
initn: 4782 init1: 4782 opt: 4782 Z-score: 3814.3 bits: 716.3 E(32554): 3.9e-206
Smith-Waterman score: 4782; 100.0% identity (100.0% similar) in 705 aa overlap (1-705:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE4 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
670 680 690 700
>>CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (667 aa)
initn: 3687 init1: 3624 opt: 3624 Z-score: 2894.2 bits: 545.9 E(32554): 6.9e-155
Smith-Waterman score: 3624; 76.2% identity (93.2% similar) in 665 aa overlap (21-685:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS14 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
CCDS14 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
:.::.::.:.::. ::.::.::::::::.:::::::::::::::::::::.:..:..:::
CCDS14 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
:.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:
CCDS14 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQII
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
..:::: :::.:::::::.:::.::.:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.
CCDS14 GTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
:::::::::::.::.::.:..::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.::::
CCDS14 MATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
::: ::::::. :::::::::::::: .:: ::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS14 VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
:.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::::::
CCDS14 FMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.. ::
CCDS14 RFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRC
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
:.:.:::::.::. .. :::.:.:.::::::. ..::: ::.::.::::.: :::::
CCDS14 NNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPT
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700
pF1KE4 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
::.::: : :..::: :: .: :.
CCDS14 FTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
650 660
>>CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (735 aa)
initn: 4768 init1: 2995 opt: 3016 Z-score: 2410.3 bits: 456.6 E(32554): 6.2e-128
Smith-Waterman score: 4712; 95.9% identity (95.9% similar) in 735 aa overlap (1-705:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE4 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFIS------------------------------L
::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS14 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISKSWCSWGLWPEIRKCKEAVSCSRLAGAPRGL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 YNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDP
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 TWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDY
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 DNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNC
670 680 690 700 710 720
700
pF1KE4 RPQESPYVSGMKTCH
:::::::::::::::
CCDS14 RPQESPYVSGMKTCH
730
>>CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (540 aa)
initn: 2392 init1: 1470 opt: 1470 Z-score: 1183.3 bits: 229.1 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 2294; 70.5% identity (84.6% similar) in 482 aa overlap (21-451:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS75 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
CCDS75 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
:.::.::.:.::. ::.::.::::::::.:::::::::::::::::::::.:..:..:::
CCDS75 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVE----------------------------
:.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::
CCDS75 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVETVKDQKVIGREKQQYYPRNRRKWVSNSL
230 240 250 260 270 280
280 290 300
pF1KE4 -----------------------VNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKV
::.. .:::: :::: :.::::::.:.:..:::: ::
CCDS75 QARLMGRRCISRRERKLTLDVEKVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKV
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVAMATASSQVL
:.:::::::.:::.::.:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.:::::::::
CCDS75 MRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVL
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 IPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTITVHWISDDEF
::.::.::.:..::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.::::::: :::::
CCDS75 IPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEF
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQA
:. :::::::::::::: .: :
CCDS75 SVVSYELQYTIFTGQANVVSEYLMAYLFLSLVAFFRLIAFLNLNFKGRQGRKEHTIFIDL
470 480 490 500 510 520
>>CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (228 aa)
initn: 1233 init1: 1091 opt: 1091 Z-score: 887.5 bits: 173.1 E(32554): 4.1e-43
Smith-Waterman score: 1148; 65.0% identity (80.2% similar) in 257 aa overlap (21-277:1-219)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS75 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
CCDS75 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
:.::.::.:.::. ::.::.::
CCDS75 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEK--------------------------------------
170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
:.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::.. ..
CCDS75 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVELECSVLFPRVAQWG
190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
>>CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 (710 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
.: :: ::.: ....:..:::.:.:: .::. :::.
CCDS97 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQ
10 20 30 40
70
pF1KE4 SCSS--------------------------------------GESIEPITAFQ-------
. : : . : : :
CCDS97 TPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVR
50 60 70 80 90 100
80 90 100
pF1KE4 ---------------------------CPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQK
:: :. . :. ::: :. .: .:...:::.:.
CCDS97 VFPPAMPPPATHLSPALAPVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 ASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRA
..... . ::.::. :..:. : :.: ::: :
CCDS97 SKAAA-----------------------LKCQLCEK-APKEATVMCEQCDVFYCDPCRLR
170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 THPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGI------TCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVG
:: . :...:::: :. : . :: ::: :. .::::. . .: : :
CCDS97 CHPPRGPLAKHRLVPPAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEG
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 RHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKL
.: .:.: .:. .. :. : . :..: : .: .. ...: .. ::.. :.. :: :
CCDS97 KHSSHEVKALGAMWKLHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACL
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 MEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKE
. .:: :.. ...:: .. ..... . ::. . .:...: :...: :.. ...::
CCDS97 VAQCDALIDALNRRKAQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKE
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KE4 NDQARFLQSAKNIAERVAMATAS--SQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYL-
:: . ::: . . .:: .. . . .: : .. . :. ..:: : . .. ::..
CCDS97 NDPSGFLQISDALIRRVHLTEDQWGKGTLTPRMTTD--FD-LSLDNSPLLQSIHQLDFVQ
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 ---TAPNP--PSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISS--YELQYTIFTGQANFISLYN
..: : : .. : : . ... :. : . .. . : :. .: ..: .:
CCDS97 VKASSPVPATPILQLEECCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILELDDGNG-GQFREVYV
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 SVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAG-SRNSEPTRLKTNSQP-FKLDP
. :.. :: ::. .. : :::.:..: : :. :.:. : .::
CCDS97 G----------KETMCTVDGLHFNSTYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEVAWFAFDP
500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 KMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSS
.:. . .:::.: .. : .: : .: ...: ::::...
CCDS97 GSAHSDIILSNDNL-------TVTCSSYDDRV----VLGKTG---FSKGIHYWELTVDRY
550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KE4 TWY---AIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLK--RLG
. :.:.: .. :. .::. ..:.. :. :::.. : .:
CCDS97 DNHPDPAFGVARMDVMKDVMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIG
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 VLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMIL--SGLPAPDFIDYP
:::: . . :.:. .. .:: . : :. .. :..... .:::.:::
CCDS97 VLLDLNRKNLTFFINDEQQGPIAFDNVEGL-FFPAVSL-NRNVQVTLHTGLPVPDFYSSR
650 660 670 680 690 700
690 700
pF1KE4 ERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
CCDS97 ASIA
710
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRIL--
....:. . ....: :: :: : ::: ::.::: ::.: .:....:
CCDS75 MEGDGSDSPVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKELLLT
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KE4 -------VSSCSSGES--------------------------IEP-ITAFQCPTCRYVIS
:.: .:..: . : :.: :: :.. ..
CCDS75 LDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVD
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 LNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQ
:..::..:: :: ::..:..:...:. : .:: : :..: .
CCDS75 LGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAA----------------RAATA-----IMCDLC-K
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150 160 170 180 190 200
pF1KE4 DPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVN
::....:.:. : .:::..:.. :: ..:. : :. . . . . : .::.:..:
CCDS75 PPPQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERIN
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKL
::: . .: :::: : : .:.:..... .. ::. : .. :. ..:....:...:
CCDS75 MYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISEL
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 IQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQ
. ...: : . . . . ..: :....::. . : .: ..: :. :. . .
CCDS75 NLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQG
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 CLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVAMATASSQVLIPDINFNDAFENFAL
:: . :.. :...:::.::. :.:.::.. :. :: : . . : . .::....
CCDS75 LLENNG-LVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQ--TSFEDYVV
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 DFSREKKLLEGLDYLTAP-NPPSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISSYELQYTIFTG
. :.. .:: :..... . : : :: . ... ..: .. . .:: :.:
CCDS75 NTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEEQ-SKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYR----
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 QANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTR-LKTN
. : .. :: . .. . .. :.... : : :.: . :: : .: : .
CCDS75 KIN----RDDEMSWNEI-EVCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYK--GSICSPCSRELILH
450 460 470 480 490
510 520 530 540 550
pF1KE4 SQPFKLDPKMTHKKLKISNDGL--QMEKDESSLKKSHT----PERFSGTGCYGA----AG
. : . . .: .:. : ....:. . . . ::.. .: : . :
CCDS75 TPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQ-VGYYTSLDYIIG
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 NIFIDSGCHYWEV-VMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNK
. : .: :.: : : .:.: .: .::.
CCDS75 DTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVA-SSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSED
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 EMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSLMIL
CCDS75 ACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTSIGIFLDCDKGKVDFYDMDQ
620 630 640 650 660 670
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pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRI
....: :: :: : ::: ::.::: ::.: .:....
CCDS41 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80
pF1KE4 L---------VSSCSSGES--------------------------IEP-ITAFQCPTCRY
: :.: .:..: . : :.: :: :..
CCDS41 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQF
..:..::..:: :: ::..:..:...:. : .:: : :..
CCDS41 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAA----------------RAATA-----IMCDL
130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGITCLDHENE
: . ::....:.:. : .:::..:.. :: ..:. : :. . . . . : .::.:
CCDS41 C-KPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETE
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 KVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQM
..:::: . .: :::: : : .:.:..... .. ::. : .. :. ..:....:.
CCDS41 RINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQI
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 AKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVAN
..: . ...: : . . . . ..: :....::. . : .: ..: :. :. .
CCDS41 SELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEE
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 CRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVAMATASSQVLIPDINFNDAFEN
. :: . :.. :...:::.::. :.:.::.. :. :: : . . : . .::.
CCDS41 YQGLLENNG-LVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAA--QTSFED
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 FALDFSREKKLLEGLDYLTAP-NPPSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISSYELQYTI
.... :.. .:: :..... . : : :: . .... ..: .. . .:: :.:
CCDS41 YVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNAL-INWHHPEKDKADSYVLEYR-
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490
pF1KE4 FTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTR-L
. : .. :: . .. . .. :.... : : :.: . :: : .: :
CCDS41 ---KIN----RDDEMSWNEI-EVCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYK--GSICSPCSREL
460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 KTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGL--QMEKDESSLKKSHT----PERFSGTGCYGA---
.. : . . .: .:. : ....:. . . . ::.. .: : .
CCDS41 ILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQ-VGYYTSLDY
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600
pF1KE4 -AGNIFIDSGCHYWEV-VMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRH
:. : .: :.: : : .:.: .: .::.
CCDS41 IIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVA-SSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSG
570 580 590 600 610 620
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 NNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPTFTIWNKSL
CCDS41 SEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTSIGIFLDCDKGKVDFYD
630 640 650 660 670 680
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pF1KE4 ASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRA
:..: . ::....:.:. : .:::..:..
CCDS78 MCDLC-KPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKI
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 THPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQ
:: ..:. : :. . . . . : .::.:..:::: . .: :::: : : .:.
CCDS78 HHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHR
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDE
:..... .. ::. : .. :. ..:....:...: . ...: : . . . . ..
CCDS78 VTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEK
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARF
: :....::. . : .: ..: :. :. . . :: . :.. :...:::.::. :
CCDS78 LFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNG-LVGYAQEVLKETDQSCF
160 170 180 190 200
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LQSAKNIAERVAMATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAP-NPPSI
.:.::.. :. :: : . . : . .::..... :.. .:: :..... . : :
CCDS78 VQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAA--QTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEI
210 220 230 240 250 260
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 REELCTASHDTITVHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNH
:: . .... ..: .. . .:: :.: .. . .. :: . .. .
CCDS78 NEEQSKVYNNAL-INWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEM--------SWNEI-EVCGTS
270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 YTVHGLQSGTRYIFIVKAINQAGSRNSEPTR-LKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGL--
.. :.... : : :.: . :: : .: : .. : . . .: .:. :
CCDS78 KIIQDLENSSTYAFRVRAYK--GSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLL
320 330 340 350 360 370
530 540 550 560 570
pF1KE4 QMEKDESSLKKSHT----PERFSGTGCYGA----AGNIFIDSGCHYWEV-VMGSSTWYAI
....:. . . . ::.. .: : . :. : .: :.: : : .
CCDS78 NLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQ-VGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKV
380 390 400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 GIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNML
:.: .: .::.
CCDS78 GVA-SSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKS
440 450 460 470 480 490
>>CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 (550 aa)
initn: 752 init1: 330 opt: 523 Z-score: 430.5 bits: 89.8 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 602; 24.9% identity (51.8% similar) in 583 aa overlap (24-518:4-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
.: :: ::.: ....:..:::.:.:: .::. :::.
CCDS45 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNILVQ
10 20 30 40
70
pF1KE4 SCSS--------------------------------------GESIEPITAFQ-------
. : : . : : :
CCDS45 TPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPNGVR
50 60 70 80 90 100
80 90 100
pF1KE4 ---------------------------CPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQK
:: :. . :. ::: :. .: .:...:::.:.
CCDS45 VFPPAMPPPATHLSPALAPVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGVIDRYQQ
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 ASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRA
..... . ::.::. :..:. : :.: ::: :
CCDS45 SKAAA-----------------------LKCQLCEK-APKEATVMCEQCDVFYCDPCRLR
170 180 190
170 180 190 200 210 220
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:: . :...:::: :. : . :: ::: :. .::::. . .: : :
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CCDS45 SERELRGI
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