Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4256, 1025 aa
1>>>pF1KE4256 1025 - 1025 aa - 1025 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5239+/-0.0012; mu= 16.1225+/- 0.073
mean_var=135.7682+/-27.263, 0's: 0 Z-trim(107.1): 73 B-trim: 269 in 2/49
Lambda= 0.110072
statistics sampled from 9327 (9396) to 9327 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 5.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7890.2 ABTB2 gene_id:25841|Hs108|chr11 (1025) 6794 1091.8 0
CCDS31893.1 BTBD11 gene_id:121551|Hs108|chr12 (1104) 3059 498.7 2.8e-140
CCDS41827.1 BTBD11 gene_id:121551|Hs108|chr12 ( 641) 2579 422.2 1.7e-117
>>CCDS7890.2 ABTB2 gene_id:25841|Hs108|chr11 (1025 aa)
initn: 6794 init1: 6794 opt: 6794 Z-score: 5837.8 bits: 1091.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6794; 100.0% identity (100.0% similar) in 1025 aa overlap (1-1025:1-1025)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAGTYSSTLKTLEDLTLDSGYGAGDSCRSLSLSSSKSNSQALNSSAQQHRGAAWWCYSGS
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CCDS78 MAGTYSSTLKTLEDLTLDSGYGAGDSCRSLSLSSSKSNSQALNSSAQQHRGAAWWCYSGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 MNSRHNSWDTVNTVLPEDPEVADLFSRCPRLPELEEFPWTEGDVARVLRKGAGGRRLPQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MNSRHNSWDTVNTVLPEDPEVADLFSRCPRLPELEEFPWTEGDVARVLRKGAGGRRLPQF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SAEAVRRLAGLLRRALIRVAREAQRLSVLHAKCTRFEVQSAVRLVHSWALAESCALAAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SAEAVRRLAGLLRRALIRVAREAQRLSVLHAKCTRFEVQSAVRLVHSWALAESCALAAVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ALSLYSMSAGDGLRRGKSARCGLTFSVGRFFRWMVDTRISVRIHEYAAISLTACMENLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ALSLYSMSAGDGLRRGKSARCGLTFSVGRFFRWMVDTRISVRIHEYAAISLTACMENLVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EIRARVMASHSPDGGGAGGGEVSAEALEMVINNDAELWGVLQPYEHLICGKNANGVLSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EIRARVMASHSPDGGGAGGGEVSAEALEMVINNDAELWGVLQPYEHLICGKNANGVLSLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AYFSPYNGGSLGHDERADAYAQLELRTLEQSLLATCVGSISELSDLVSRAMHHMQGRHPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AYFSPYNGGSLGHDERADAYAQLELRTLEQSLLATCVGSISELSDLVSRAMHHMQGRHPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 CPGASPARQARQPPQPITWSPDALHTLYYFLRCPQMESMENPNLDPPRMTLNNERPFMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CPGASPARQARQPPQPITWSPDALHTLYYFLRCPQMESMENPNLDPPRMTLNNERPFMLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PPLMEWMRVAITYAEHRRSLTVDSGDIRQAARLLLPGLDCEPRQLKPEHCFSSFRRLDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PPLMEWMRVAITYAEHRRSLTVDSGDIRQAARLLLPGLDCEPRQLKPEHCFSSFRRLDAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 AATEKFNQDLGFRMLNCGRTDLINQAIEALGPDGVNTMDDQGMTPLMYACAAGDEAMVQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AATEKFNQDLGFRMLNCGRTDLINQAIEALGPDGVNTMDDQGMTPLMYACAAGDEAMVQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LIDAGANLDIQVPSNSPRHPSIHPDSRHWTSLTFAVLHGHISVVQLLLDAGAHVEGSAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LIDAGANLDIQVPSNSPRHPSIHPDSRHWTSLTFAVLHGHISVVQLLLDAGAHVEGSAVN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 GGEDSYAETPLQLASAAGNYELVSLLLSRGADPLLSMLEAHGMGSSLHEDMNCFSHSAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GGEDSYAETPLQLASAAGNYELVSLLLSRGADPLLSMLEAHGMGSSLHEDMNCFSHSAAH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 GHRNVLRKLLTQPQQAKADVLSLEEILAEGVEESDASSQGSGSEGPVRLSRTRTKALQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GHRNVLRKLLTQPQQAKADVLSLEEILAEGVEESDASSQGSGSEGPVRLSRTRTKALQEA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 MYYSAEHGYVDITMELRALGVPWKLHIWIESLRTSFSQSRYSVVQSLLRDFSSIREEEYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MYYSAEHGYVDITMELRALGVPWKLHIWIESLRTSFSQSRYSVVQSLLRDFSSIREEEYN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 EELVTEGLQLMFDILKTSKNDSVIQQLATIFTHCYGSSPIPSIPEIRKTLPARLDPHFLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EELVTEGLQLMFDILKTSKNDSVIQQLATIFTHCYGSSPIPSIPEIRKTLPARLDPHFLN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 NKEMSDVTFLVEGKLFYAHKVLLVTASNRFKTLMTNKSEQDGDSSKTIEISDMKYHIFQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NKEMSDVTFLVEGKLFYAHKVLLVTASNRFKTLMTNKSEQDGDSSKTIEISDMKYHIFQM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MMQYLYYGGTESMEIPTTDILELLSAASLFQLDALQRHCEILCSQTLSMESAVNTYKYAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MMQYLYYGGTESMEIPTTDILELLSAASLFQLDALQRHCEILCSQTLSMESAVNTYKYAK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 IHNAPELALFCEGFFLKHMKALLEQDAFRQLIYGRSSKVQGLDPLQDLQNTLAERVHSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IHNAPELALFCEGFFLKHMKALLEQDAFRQLIYGRSSKVQGLDPLQDLQNTLAERVHSVY
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 ITSRV
:::::
CCDS78 ITSRV
>>CCDS31893.1 BTBD11 gene_id:121551|Hs108|chr12 (1104 aa)
initn: 3474 init1: 1019 opt: 3059 Z-score: 2631.9 bits: 498.7 E(32554): 2.8e-140
Smith-Waterman score: 3611; 53.6% identity (75.7% similar) in 1057 aa overlap (54-1023:52-1098)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 GDSCRSLSLSSSKSNSQALNSSAQQHRGAAWWCYSGSMNSRHNSWDTVNTVLPEDPEVAD
: . ::.:::::.:::::.: :: : :
CCDS31 YGGAADSVRSSNLSLCCSDSHPASPYGGSCWPPLADSMHSRHNSFDTVNTALVEDSEGLD
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130
pF1KE4 LFSR-CPRL-PELEEFPWTEGDVARVLRKGAGGRRLPQ----FSAEAVRRLAGLLRRALI
.. : :: :.:.: ::: .. .: .. : : . .:. .:. :. :::.
CCDS31 CAGQHCSRLLPDLDEVPWTLQELEALLLRSRDPRAGPAVPGGLPKDALAKLSTLVSRALV
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 RVAREAQRLSVLHAKCTRFEVQSAVRLVHSWALAESCALAAVKALSLYSMSA--GDGLRR
:.:.::::::. ::::..:.:::...: ::.:: :. ::. :::::.::. :: : :
CCDS31 RIAKEAQRLSLRFAKCTKYEIQSAMEIVLSWGLAAHCTAAALAALSLYNMSSAGGDRLGR
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KE4 GKSARCGLTFSVGRFFRWMVDTRISVRIHEYAAISLTACMENLVEEIRARVMAS------
:::::::::::::: .:::::.:...::::.::: ::::::.: ..: .::.::
CCDS31 GKSARCGLTFSVGRVYRWMVDSRVALRIHEHAAIYLTACMESLFRDIYSRVVASGVPRSC
210 220 230 240 250 260
250 260
pF1KE4 ---------------------------HSPDGGGAGGGEVSA------------------
..: ::.:.:: ::
CCDS31 SGPGSGSGSGPGPSSGPGAAPAADKEREAPGGGAASGGACSAASSASGGSSCCAPPAAAA
270 280 290 300 310 320
270 280 290
pF1KE4 ---------------------------EALEMVINNDAELWGVLQPYEHLICGKNANGVL
:.:: ..:::.:.::.::::.::::::::.:::
CCDS31 AAVPPAAAANHHHHHHHALHEAPKFTVETLEHTVNNDSEIWGLLQPYQHLICGKNASGVL
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SLPAYFSPYNGGSLGHDE-RADAYAQLELRTLEQSLLATCVGSISELSDLVSRAMHHMQG
:: .. . . .. . ..: ::::.::::::: ::::.::::::::::::.:
CCDS31 CLPDSLNLHRDPQRSNKPGELPMFSQSELRTIEQSLLATRVGSIAELSDLVSRAMHHLQP
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RHPLCPGASPARQARQPPQPITWSPDALHTLYYFLRCPQMESMENPNLDPPRMTLNNERP
. : . . .: . : :.::.:: ::..::::: ::::..: ...:. :::
CCDS31 LNAKHHGNGTPLHHKQG--ALYWEPEALYTLCYFMHCPQME-WENPNVEPSKVNLQVERP
450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FMLLPPLMEWMRVAITYAEHRRSLTVDSGDIRQAARLLLPGLDCEPRQLKPEHCFSSFRR
:..:::::::.:::...: ::::...:: :.::::::::::.:::::::. . :: . :.
CCDS31 FLVLPPLMEWIRVAVAHAGHRRSFSMDSDDVRQAARLLLPGVDCEPRQLRADDCFCASRK
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LDARAATEKFNQDLGFRMLNCGRTDLINQAIEALGPDGVNTMDDQGMTPLMYACAAGDEA
::: : ::.:::::::::::::::..::. :::::.:::..::::::::::. ::::
CCDS31 LDAVAIEAKFKQDLGFRMLNCGRTDLVKQAVSLLGPDGINTMSEQGMTPLMYACVRGDEA
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 MVQMLIDAGANLDIQVPSNSPRHPSIHPDSRHWTSLTFAVLHGHISVVQLLLDAGAHVEG
:::::.::::.:...: :. ..::.::..::::.:::::::::: ::::::::::.:::
CCDS31 MVQMLLDAGADLNVEVVSTPHKYPSVHPETRHWTALTFAVLHGHIPVVQLLLDAGAKVEG
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 SAVNGGEDSYAETPLQLASAAGNYELVSLLLSRGADPLLSMLEAHGMGSSLHEDMNCFSH
: :. ::..:.:::::::.:.::.::::::: ::::::.. . .:.... . ::: ::.
CCDS31 S-VEHGEENYSETPLQLAAAVGNFELVSLLLERGADPLIGTMYRNGISTTPQGDMNSFSQ
680 690 700 710 720 730
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 SAAHGHRNVLRKLLTQPQQAKADVLSLEEILAEGVEESDASSQGSGSEGPVRLSRTRTKA
.::::::::.::::.::.. :.:.:::::::::: .: . . : :... .:
CCDS31 AAAHGHRNVFRKLLAQPEKEKSDILSLEEILAEG---TDLAETAPPPLCASRNSKAKLRA
740 750 760 770 780 790
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 LQEAMYYSAEHGYVDITMELRALGVPWKLHIWIESLRTSFSQSRYSVVQSLLRDFSSIRE
:.::::.::::::::.:...:..:::: :: :.:::: .:.: : ..: ::..:..:.:
CCDS31 LREAMYHSAEHGYVDVTIDIRSIGVPWTLHTWLESLRIAFQQHRRPLIQCLLKEFKTIQE
800 810 820 830 840 850
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 EEYNEELVTEGLQLMFDILKTSKNDSVIQQLATIFTHCYGSSPIPSIPEIRKTLPARLDP
:::.:::::.:: :::.:::.:::. . ::: .::::::: :::.. ::.. .::::
CCDS31 EEYTEELVTQGLPLMFEILKASKNEVISQQLCVIFTHCYGPYPIPKLTEIKRKQTSRLDP
860 870 880 890 900 910
840 850 860 870 880 890
pF1KE4 HFLNNKEMSDVTFLVEGKLFYAHKVLLVTASNRFKTLMTNKSEQDGDSSKTIEISDMKYH
:::::::::::::::::. :::::::: ::: :::.:...: .:: :::. .::
CCDS31 HFLNNKEMSDVTFLVEGRPFYAHKVLLFTASPRFKALLSSKPTNDG---TCIEIGYVKYS
920 930 940 950 960 970
900 910 920 930 940 950
pF1KE4 IFQMMMQYLYYGGTESMEIPTTDILELLSAASLFQLDALQRHCEILCSQTLSMESAVNTY
:::..:::::::: ::. : ...:.::::::..:::.::::::::.:..... .. :. :
CCDS31 IFQLVMQYLYYGGPESLLIKNNEIMELLSAAKFFQLEALQRHCEIICAKSINTDNCVDIY
980 990 1000 1010 1020 1030
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE4 KYAKIHNAPELALFCEGFFLKHMKALLEQDAFRQLIYGRSSKVQGLDPLQDLQNTLAERV
..::. .. ::. .:::.:::.: .:.:..::.::.: .... : : ::::: ::: :.
CCDS31 NHAKFLGVTELSAYCEGYFLKNMMVLIENEAFKQLLYDKNGEGTGQDVLQDLQRTLAIRI
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1020
pF1KE4 HSVYITSRV
.:....:
CCDS31 QSIHLSSSKGSVV
1100
>>CCDS41827.1 BTBD11 gene_id:121551|Hs108|chr12 (641 aa)
initn: 2637 init1: 967 opt: 2579 Z-score: 2223.0 bits: 422.2 E(32554): 1.7e-117
Smith-Waterman score: 2579; 61.0% identity (85.6% similar) in 610 aa overlap (414-1023:33-635)
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LHTLYYFLRCPQMESMENPNLDPPRMTLNNERPFMLLPPLMEWMRVAITYAEHRRSLTVD
.:::..:::::::.:::...: ::::...:
CCDS41 KLRPKDSREPAPGSPVRSGCLQRLSHYSGIQRPFLVLPPLMEWIRVAVAHAGHRRSFSMD
10 20 30 40 50 60
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 SGDIRQAARLLLPGLDCEPRQLKPEHCFSSFRRLDARAATEKFNQDLGFRMLNCGRTDLI
: :.::::::::::.:::::::. . :: . :.::: : ::.:::::::::::::::.
CCDS41 SDDVRQAARLLLPGVDCEPRQLRADDCFCASRKLDAVAIEAKFKQDLGFRMLNCGRTDLV
70 80 90 100 110 120
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 NQAIEALGPDGVNTMDDQGMTPLMYACAAGDEAMVQMLIDAGANLDIQVPSNSPRHPSIH
.::. :::::.:::..::::::::::. :::::::::.::::.:...: :. ..::.:
CCDS41 KQAVSLLGPDGINTMSEQGMTPLMYACVRGDEAMVQMLLDAGADLNVEVVSTPHKYPSVH
130 140 150 160 170 180
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PDSRHWTSLTFAVLHGHISVVQLLLDAGAHVEGSAVNGGEDSYAETPLQLASAAGNYELV
:..::::.:::::::::: ::::::::::.:::: :. ::..:.:::::::.:.::.:::
CCDS41 PETRHWTALTFAVLHGHIPVVQLLLDAGAKVEGS-VEHGEENYSETPLQLAAAVGNFELV
190 200 210 220 230 240
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 SLLLSRGADPLLSMLEAHGMGSSLHEDMNCFSHSAAHGHRNVLRKLLTQPQQAKADVLSL
:::: ::::::.. . .:.... . ::: ::..::::::::.::::.::.. :.:.:::
CCDS41 SLLLERGADPLIGTMYRNGISTTPQGDMNSFSQAAAHGHRNVFRKLLAQPEKEKSDILSL
250 260 270 280 290 300
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 EEILAEGVEESDASSQGSGSEGPVRLSRTRTKALQEAMYYSAEHGYVDITMELRALGVPW
::::::: .: . . : :... .::.::::.::::::::.:...:..::::
CCDS41 EEILAEG---TDLAETAPPPLCASRNSKAKLRALREAMYHSAEHGYVDVTIDIRSIGVPW
310 320 330 340 350
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 KLHIWIESLRTSFSQSRYSVVQSLLRDFSSIREEEYNEELVTEGLQLMFDILKTSKNDSV
:: :.:::: .:.: : ..: ::..:..:.::::.:::::.:: :::.:::.:::. .
CCDS41 TLHTWLESLRIAFQQHRRPLIQCLLKEFKTIQEEEYTEELVTQGLPLMFEILKASKNEVI
360 370 380 390 400 410
810 820 830 840 850 860
pF1KE4 IQQLATIFTHCYGSSPIPSIPEIRKTLPARLDPHFLNNKEMSDVTFLVEGKLFYAHKVLL
::: .::::::: :::.. ::.. .:::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS41 SQQLCVIFTHCYGPYPIPKLTEIKRKQTSRLDPHFLNNKEMSDVTFLVEGRPFYAHKVLL
420 430 440 450 460 470
870 880 890 900 910 920
pF1KE4 VTASNRFKTLMTNKSEQDGDSSKTIEISDMKYHIFQMMMQYLYYGGTESMEIPTTDILEL
::: :::.:...: .:: :::. .:: :::..:::::::: ::. : ...:.::
CCDS41 FTASPRFKALLSSKPTNDGTC---IEIGYVKYSIFQLVMQYLYYGGPESLLIKNNEIMEL
480 490 500 510 520 530
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 LSAASLFQLDALQRHCEILCSQTLSMESAVNTYKYAKIHNAPELALFCEGFFLKHMKALL
::::..:::.::::::::.:..... .. :. :..::. .. ::. .:::.:::.: .:.
CCDS41 LSAAKFFQLEALQRHCEIICAKSINTDNCVDIYNHAKFLGVTELSAYCEGYFLKNMMVLI
540 550 560 570 580 590
990 1000 1010 1020
pF1KE4 EQDAFRQLIYGRSSKVQGLDPLQDLQNTLAERVHSVYITSRV
:..::.::.: .... : : ::::: ::: :..:....:
CCDS41 ENEAFKQLLYDKNGEGTGQDVLQDLQRTLAIRIQSIHLSSSKGSVV
600 610 620 630 640
1025 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:14:42 2016 done: Mon Nov 7 18:14:43 2016
Total Scan time: 5.000 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]