Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4103
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4103, 472 aa
  1>>>pF1KE4103 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9729+/-0.00118; mu= 13.9054+/- 0.070
 mean_var=75.2354+/-15.160, 0's: 0 Z-trim(102.5): 72  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.147864
 statistics sampled from 6920 (6992) to 6920 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.215), width:  16
 Scan time:  2.810

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS75152.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4     ( 472) 3162 684.5 6.2e-197
CCDS34022.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4     ( 473) 3150 682.0 3.7e-196
CCDS75151.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4     ( 431) 2474 537.8 8.7e-153
CCDS4452.1 RASGEF1C gene_id:255426|Hs108|chr5      ( 466) 2099 457.8 1.1e-128
CCDS7202.2 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10     ( 481) 1905 416.4 3.3e-116
CCDS60517.1 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10    ( 489) 1905 416.4 3.4e-116
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4        (1499)  345 83.8 1.4e-15
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1391)  312 76.7 1.7e-13
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1504)  312 76.8 1.8e-13
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1509)  312 76.8 1.8e-13
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1601)  312 76.8 1.9e-13
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1609)  312 76.8 1.9e-13
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5         (1237)  303 74.8 5.8e-13
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       ( 489)  295 72.9 8.3e-13
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       (1257)  295 73.1 1.9e-12
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       (1273)  295 73.1 1.9e-12
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 791)  278 69.4 1.6e-11
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 840)  278 69.4 1.6e-11
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 858)  278 69.4 1.7e-11
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 867)  278 69.4 1.7e-11
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       (1011)  278 69.4 1.9e-11
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 597)  266 66.8 7.2e-11
CCDS45221.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 762)  266 66.8 8.9e-11
CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 797)  266 66.8 9.3e-11


>>CCDS75152.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4          (472 aa)
 initn: 3162 init1: 3162 opt: 3162  Z-score: 3649.0  bits: 684.5 E(32554): 6.2e-197
Smith-Waterman score: 3162; 100.0% identity (100.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 TDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLDN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 DKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIGN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 FNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSLT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 AHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVECP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVECP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470  
pF1KE4 FERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
              430       440       450       460       470  

>>CCDS34022.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4          (473 aa)
 initn: 2163 init1: 2163 opt: 3150  Z-score: 3635.2  bits: 682.0 E(32554): 3.7e-196
Smith-Waterman score: 3150; 99.8% identity (99.8% similar) in 473 aa overlap (1-472:1-473)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
               70        80        90       100       110       120

              130       140        150       160       170         
pF1KE4 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEE-TYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST
       :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE4 STDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 STDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE4 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470  
pF1KE4 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
              430       440       450       460       470   

>>CCDS75151.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4          (431 aa)
 initn: 2862 init1: 2463 opt: 2474  Z-score: 2856.4  bits: 537.8 E(32554): 8.7e-153
Smith-Waterman score: 2784; 91.3% identity (91.3% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-431)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS75 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPD-
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
                                               ::::::::::::::::::::
CCDS75 ----------------------------------------NQMRKIAPKILQLLTEWTET
                                              60        70         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
      80        90       100       110       120       130         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 TDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLDN
     140       150       160       170       180       190         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 DKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIGN
     200       210       220       230       240       250         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 FNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSLT
     260       270       280       290       300       310         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 AHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVECP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVECP
     320       330       340       350       360       370         

              430       440       450       460       470  
pF1KE4 FERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
     380       390       400       410       420       430 

>>CCDS4452.1 RASGEF1C gene_id:255426|Hs108|chr5           (466 aa)
 initn: 2103 init1: 1278 opt: 2099  Z-score: 2423.6  bits: 457.8 E(32554): 1.1e-128
Smith-Waterman score: 2099; 68.0% identity (85.4% similar) in 472 aa overlap (1-471:1-465)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
       ::::   : :   .. .    . ..   .:    :.   :.:::.:::::::..::::..
CCDS44 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
       .::::::::::::..: ::.:.:::::.:.:.:. :  :: ..::..::.::::.:::::
CCDS44 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
       :: ::..:  . .:::.. :::  .:.::: ..:..: : .::::: :  : :.     .
CCDS44 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G
              130       140       150       160       170          

              190        200       210       220       230         
pF1KE4 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
       .:.    .:::  ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.:::: 
CCDS44 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA
         180       190       200       210       220       230     

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE4 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
       . : :.:.  :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::::
CCDS44 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG
         240         250       260       270       280       290   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
       :::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:::
CCDS44 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL
           300       310       320       330       340       350   

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::
CCDS44 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC
           360       370       380       390       400       410   

     420       430       440       450       460       470  
pF1KE4 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
       :::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::. 
CCDS44 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
           420       430       440       450       460      

>>CCDS7202.2 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10          (481 aa)
 initn: 1863 init1: 1160 opt: 1905  Z-score: 2199.7  bits: 416.4 E(32554): 3.3e-116
Smith-Waterman score: 1906; 58.6% identity (82.7% similar) in 481 aa overlap (1-471:1-480)

                10           20        30           40        50   
pF1KE4 MPQTPP-FSAMFDSSGYNR---NLYQSAEDSCGG---LYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPN
       ::::   ::...  :  ..   .. . .  . ::   : ..:..:.:::::::..::::.
CCDS72 MPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEALMEHLVPT
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE4 VDYYPDRTYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQL
       ::::::::::::::::::.:: :..:.:.: ..:::...  .   .: ...... ::.::
CCDS72 VDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKSFSAKIVQL
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140          150       160       170
pF1KE4 LTEWTETFPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEE---TYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYE
       : ::::.:::::.::. : .:: ..::... .:   : .: . :: : :. .::: :: .
CCDS72 LKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLSLAARSQLQ
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KE4 EVLAKISSTSTDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQ
       :.  :.   ..:.  .::::: . :.::. :: :: .::::::::::.:.. : ::...:
CCDS72 ELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAAQKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVSSIYPEDLMQ
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KE4 AFVQKDPLDNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFID
          . : ::: . : ..  :: .:::: .::: ::.:::::.:  ::::::.::.:.:::
CCDS72 IVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHRTRMLEFFID
              250        260       270       280       290         

              300       310       320       330       340       350
pF1KE4 VARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTA
       :::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::::::::.:::.::::::: :::::
CCDS72 VARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPSSNFCNYRTA
     300       310       320       330       340       350         

              360       370       380       390       400       410
pF1KE4 LRGAAQRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSE
       :.::.:::  :.::::::::: :.:..::::::..  .:.:::::.::.::::...:. :
CCDS72 LQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKFWEISRQIHE
     360       370       380       390       400       410         

              420       430       440       450       460       470
pF1KE4 FMTWKQVECPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLG
       :::: :::::::.:.:: .::::.:..::.::..::.::::::::.::: ::.::..::.
CCDS72 FMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSWKTLRTTLLN
     420       430       440       450       460       470         

         
pF1KE4 RV
       : 
CCDS72 RA
     480 

>>CCDS60517.1 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10         (489 aa)
 initn: 1863 init1: 1160 opt: 1905  Z-score: 2199.6  bits: 416.4 E(32554): 3.4e-116
Smith-Waterman score: 1906; 58.6% identity (82.7% similar) in 481 aa overlap (1-471:9-488)

                        10           20        30           40     
pF1KE4         MPQTPP-FSAMFDSSGYNR---NLYQSAEDSCGG---LYYHDNNLLSGSLEA
               ::::   ::...  :  ..   .. . .  . ::   : ..:..:.::::::
CCDS60 MFLEPQETMPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEA
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KE4 LIQHLVPNVDYYPDRTYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRK
       :..::::.::::::::::::::::::.:: :..:.:.: ..:::...  .   .: ....
CCDS60 LMEHLVPTVDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKS
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140          150       160  
pF1KE4 IAPKILQLLTEWTETFPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEE---TYRKNVQQMMQCLIRK
       .. ::.::: ::::.:::::.::. : .:: ..::... .:   : .: . :: : :. .
CCDS60 FSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLS
              130       140       150       160       170       180

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE4 LAALSQYEEVLAKISSTSTDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNY
       ::: :: .:.  :.   ..:.  .::::: . :.::. :: :: .::::::::::.:.. 
CCDS60 LAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAAQKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVSS
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE4 IGPEEFVQAFVQKDPLDNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRA
       : ::...:   . : ::: . : ..  :: .:::: .::: ::.:::::.:  ::::::.
CCDS60 IYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHRT
              250       260        270       280       290         

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE4 RMIEYFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSS
       ::.:.::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::::::::.:::.:::::
CCDS60 RMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPSS
     300       310       320       330       340       350         

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE4 NFYNYRTALRGAAQRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFW
       :: ::::::.::.:::  :.::::::::: :.:..::::::..  .:.:::::.::.:::
CCDS60 NFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKFW
     360       370       380       390       400       410         

            410       420       430       440       450       460  
pF1KE4 ELAKQVSEFMTWKQVECPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWK
       :...:. ::::: :::::::.:.:: .::::.:..::.::..::.::::::::.::: ::
CCDS60 EISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSWK
     420       430       440       450       460       470         

            470  
pF1KE4 SLRSSLLGRV
       .::..::.: 
CCDS60 TLRTTLLNRA
     480         

>>CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4             (1499 aa)
 initn: 352 init1: 214 opt: 345  Z-score: 393.4  bits: 83.8 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 352; 30.2% identity (60.9% similar) in 258 aa overlap (208-458:721-958)

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE4 STSTDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDP
                                     .: ::.  ..: .  : : :... . .   
CCDS43 METETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFK---
              700       710       720       730       740          

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE4 LDNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFN
       : .  ::        ::. . : .:. .. ::.::   ... .: ..:..:: .: .: .
CCDS43 LRSKTSCA-------NLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRE
       750              760       770       780       790       800

       300       310       320         330        340       350    
pF1KE4 IGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKV--KTAK-FDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGA
         ::::..:::::.:..::.::. :: :.  :  : :. :.  .::: :. .::..: . 
CCDS43 CKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNS-
              810       820       830       840       850          

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE4 AQRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTW
               .. .  .::.: .. ::. ::.::  ... .: :::::.  .::.. .    
CCDS43 --------QNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRM
             860       870       880        890       900       910

           420          430       440       450       460       470
pF1KE4 KQVEC-P---FERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLG
        .:.  :   :.  .:  . : ..   : .:  :   .. : ......            
CCDS43 ASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYED
              920       930       940       950       960       970

                                                                   
pF1KE4 RV                                                          
                                                                   
CCDS43 AQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKSETSPVAPRAGS
              980       990      1000      1010      1020      1030

>>CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1391 aa)
 initn: 305 init1: 178 opt: 312  Z-score: 355.8  bits: 76.7 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 312; 29.6% identity (63.6% similar) in 206 aa overlap (208-410:864-1049)

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         :.:.  .. :. ...       :. .. ::.::   ... .: ..:..:: .: .: .
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Smith-Waterman score: 312; 29.6% identity (63.6% similar) in 206 aa overlap (208-410:864-1049)

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>>CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1509 aa)
 initn: 305 init1: 178 opt: 312  Z-score: 355.3  bits: 76.8 E(32554): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 312; 29.6% identity (63.6% similar) in 206 aa overlap (208-410:869-1054)

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE4 STSTDRLTVLKTKPQSIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDP
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pF1KE4 LDNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFN
         :.:.  .. :. ...       :. .. ::.::   ... .: ..:..:: .: .: .
CCDS54 --NSKTGNTHLKRFEDI------VNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRE
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pF1KE4 IGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTA---KFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGA
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CCDS54 CKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNIL---
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pF1KE4 AQRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTW
             . .: .  .::.: .. ::. ::.::  ... .: :::::.  ..:.. .    
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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