FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3769, 916 aa 1>>>pF1KE3769 916 - 916 aa - 916 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8547+/-0.000969; mu= 13.4838+/- 0.058 mean_var=104.7241+/-21.310, 0's: 0 Z-trim(107.6): 90 B-trim: 143 in 1/50 Lambda= 0.125329 statistics sampled from 9611 (9702) to 9611 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16 Scan time: 3.890 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 6276 1146.1 0 CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 4664 854.7 0 CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 2651 490.7 5.5e-138 CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 1639 307.7 6.6e-83 CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 1639 307.7 6.8e-83 CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 313) 1622 304.4 2.1e-82 CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 235) 1134 216.1 6.1e-56 CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 960 185.1 9.4e-46 CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 947 182.7 4e-45 CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 947 182.7 4.2e-45 CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 947 182.7 4.2e-45 CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 947 182.7 4.3e-45 CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 899 174.0 1.7e-42 CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 646 128.2 7.8e-29 CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 646 128.2 8.5e-29 CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 548 110.4 1.1e-23 CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 543 109.4 1.3e-23 CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 537 108.3 3e-23 CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 466 95.5 2.5e-19 CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 466 95.5 2.7e-19 CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 828) 384 80.8 1.2e-14 CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 911) 384 80.8 1.3e-14 CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 942) 384 80.8 1.3e-14 CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 377 79.4 2.1e-14 CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 370 78.3 7.5e-14 CCDS58516.1 USP43 gene_id:124739|Hs108|chr17 (1118) 342 73.2 3e-12 CCDS45610.1 USP43 gene_id:124739|Hs108|chr17 (1123) 342 73.2 3e-12 >>CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (916 aa) initn: 6276 init1: 6276 opt: 6276 Z-score: 6133.4 bits: 1146.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6276; 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CCDS14 SIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKK 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 DGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLT ::::: :. ....: .: . . :::.::: :::::::::::::::::. :: CCDS14 DGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLT 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 DYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFS .:::.. : :.: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: CCDS14 EYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFL 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 GYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVI ::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. :::::: CCDS14 GYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVI 400 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 VDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRV :::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:. CCDS14 VDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRL 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 TVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEV .:: : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::: CCDS14 VVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEV 520 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 pF1KE3 CST--SVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQA . ...:: : ...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::.. CCDS14 SGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNV 580 590 600 610 620 630 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 VCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETEG . :.:::: .: :. .:... . ::.... : .. : : CCDS14 LMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAG 640 650 660 670 680 640 650 660 670 680 pF1KE3 SGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSR . . : . .: :.: :::.. ::: ::.: .. . .... CCDS14 PSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHAQ 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 STLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHD .:.::. : .. :::: :.:.: :: . .:: . : :..:::::::.::: ... CCDS14 PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKK--APVRLQECIELFTTVETLEKEN 750 760 770 780 790 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 PWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFV :::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:::: CCDS14 PWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFV 800 810 820 830 840 850 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 CNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIV . . . : : :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.:: CCDS14 IQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIE 860 870 880 890 900 910 870 880 890 900 910 pF1KE3 TKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN .::::::::::.: :: .::: . . :. : CCDS14 SKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN 920 930 940 950 960 >>CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (952 aa) initn: 3610 init1: 1550 opt: 1639 Z-score: 1601.9 bits: 307.7 E(32554): 6.6e-83 Smith-Waterman score: 3698; 59.9% identity (79.4% similar) in 951 aa overlap (1-909:1-940) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG :::::. : .::.:... :..:.:..: :::.:::::::::::::::::: :..: CCDS89 MAEGGAA----DLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK ..:..:::::::::..: ..:.:::::::::::.:.:::.::::..:: .:::.::.:: CCDS89 DQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE :::.:.::::::::::: :::::::.. .::.. .::::::: :::::.::.:.:: :.: CCDS89 VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSG----- :::::::::::.: :.: :.:.:::::::::::::: .:::::::: : .. CCDS89 TRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 --FSA--SYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAE ..: .:. .:: .. :::::::.:::::::::::.:::::: :::.:::.:.:. : CCDS89 PSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 INRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELL .: ::::::.::::..:::::::::::. ..:.:: ::::::::::::::::::: :::: CCDS89 LNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 AFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKST :::::::::::::..::::..::::.:::: :::.:::::: ::::.::: :::::::: CCDS89 AFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKST 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 LVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDL ::::::::.:::::::::::::::.::.:..::.:: :: .: ::.:.:: .: . :: CCDS89 LVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 CEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECV : ::: :::: :..:.:.:.::::::.:: :::.:. :: ::::.:.:. . .. .: : CCDS89 CTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 TLPVYFRERKSRPSSTS--SASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLP .:: .:: : : :: . ..:.:.:::.:..::... : ..::. . :. :::: CCDS89 IIPVCLRE-KFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE3 DEFGSSPLEPGAC---NGSRNSCEGEDEE----EMEHQE------EGKEQLSETEGS-GE : . :. : : . :. .: :: ::: .: . .: ::.:.: .: CCDS89 TEETEGSLH--CCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSE 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 pF1KE3 DEPGND-PSET---TQKKIKGQPC--PKRLFTFSLVNSYGTADINSLAAD-------GKL : :.: ::. :. ::: ::::::.. :. :..::: . : . CCDS89 DSVGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQF-NNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQ 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 LKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTME :.:. :: ::.::: . .. :.::. .: .::: :. . . :: : :.:::::::: : CCDS89 LRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESV-EYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKE 720 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 TLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGL :: .:::::::::.:::::::.:::::: .::::::::::.:: ::::::.:.::: : CCDS89 KLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDL 780 790 800 810 820 830 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 NMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQ .::::. : .: : :.:::::::::.:: :::::.:::: .:::::::::.:: ::::: CCDS89 DMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQ 840 850 860 870 880 890 870 880 890 900 910 pF1KE3 IVTKAAYVLFYQRRDDE----FYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN ::.::::::::::.: :. ....:. : : :.. .:.. CCDS89 IVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGI-PLESDEDSNDNDNDIENENCM 900 910 920 930 940 CCDS89 HTN 950 >>CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (981 aa) initn: 3611 init1: 1550 opt: 1639 Z-score: 1601.7 bits: 307.7 E(32554): 6.8e-83 Smith-Waterman score: 3647; 58.6% identity (77.4% similar) in 978 aa overlap (3-909:3-969) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG :::. : .::.:... :..:.:..: :::.:::::::::::::::::: :..: CCDS58 MAEGGAA----DLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK ..:..:::::::::..: ..:.:::::::::::.:.:::.::::..:: .:::.::.:: CCDS58 DQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE :::.:.::::::::::: :::::::.. .::.. .::::::: :::::.::.:.:: :.: CCDS58 VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPR--QTLQSNG----- :::::::::::.: :.: :.:.:::::::::::::: .:::::::: .: .: : CCDS58 TRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPGASNFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 -------SGFSASYN------------C------------QEPPSSHIQPGLCGLGNLGN :..: .:: : .:: .. :::::::.:::: CCDS58 TLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGN 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 TCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAH :::::::.:::::: :::.:::.:.:. :.: ::::::.::::..:::::::::::. .. CCDS58 TCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSY 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 VAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDA :.:: ::::::::::::::::::: :::::::::::::::::..::::..::::.:::: CCDS58 VTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDK 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 VVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVM :::.:::::: ::::.::: ::::::::::::::::.:::::::::::::::.::.:.. CCDS58 VVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTL 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 EVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQM ::.:: :: .: ::.:.:: .: . ::: ::: :::: :..:.:.:.::::::.:: : CCDS58 EVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAM 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 DEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECVTLPVYFRERKSRPSSTS--SASALYGQPLLL ::.:. :: ::::.:.:. . .. .: : .:: .:: : : :: . ..:.:.:::.:. CCDS58 DENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLRE-KFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLM 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 pF1KE3 SVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGAC---NGSRNSCEGEDEE-- .::... : ..::. . :. :::: : . :. : : . :. .: :: CCDS58 AVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLH--CCKDQNINGNGPNGIHEEGS 600 610 620 630 640 650 620 630 640 650 660 pF1KE3 --EMEHQE------EGKEQLSETEGS-GEDEPGND-PSET---TQKKIKGQPC--PKRLF ::: .: . .: ::.:.: .:: :.: ::. :. ::: :::: CCDS58 PSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLF 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 pF1KE3 TFSLVNSYGTADINSLAAD-------GKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYE ::.. :. :..::: . : . :.:. :: ::.::: . .. :.::. .: .: CCDS58 TFQF-NNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFE 720 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 KHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKI :: :. . . :: : :.:::::::: : :: .:::::::::.:::::::.:::::: . CCDS58 KHESV-EYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPV 780 790 800 810 820 830 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 LVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVG ::::::::::.:: ::::::.:.::: :.::::. : .: : :.:::::::::.:: : CCDS58 LVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGG 840 850 860 870 880 890 840 850 860 870 880 pF1KE3 HYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDE----FYKTPSLSSS ::::.:::: .:::::::::.:: :::::::.::::::::::.: :. ... CCDS58 HYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKG 900 910 920 930 940 950 890 900 910 pF1KE3 GSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN .:. : : :.. .:.. CCDS58 ASAATGI-PLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN 960 970 980 >>CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (313 aa) initn: 1610 init1: 1610 opt: 1622 Z-score: 1592.8 bits: 304.4 E(32554): 2.1e-82 Smith-Waterman score: 1624; 79.9% identity (86.6% similar) in 313 aa overlap (1-311:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : : CCDS58 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKVSFFLPRL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 NCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAP--LTDYFLKDEYEAEINRDNPL .:. .: :.. :.. :: : .:: :...:. .: : . . : CCDS58 ECNGAILAH-----CNFCLPGSSNSPASA----SRVAPSHLANFFF---FEMESHSVTKL 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGL : .. ::... CCDS58 ECGGAVS-AYSRVQVMLLPQPPEWLG 290 300 310 >>CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (235 aa) initn: 1119 init1: 1119 opt: 1134 Z-score: 1117.8 bits: 216.1 E(32554): 6.1e-56 Smith-Waterman score: 1134; 69.5% identity (90.7% similar) in 226 aa overlap (1-226:1-222) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG :::::. : .::.:... :..:.:..: :::.:::::::::::::::::: :..: CCDS58 MAEGGAA----DLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK ..:..:::::::::..: ..:.:::::::::::.:.:::.::::..:: .:::.::.:: CCDS58 DQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE :::.:.::::::::::: :::::::.. .::.. .::::::: :::::.::.:.:: :.: CCDS58 VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY :::::::::::.: :.: :.:.:::::::::::::: .:::::::: CCDS58 TRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKKPLEQSC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGM >>CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604 aa) initn: 1531 init1: 826 opt: 960 Z-score: 934.9 bits: 185.1 E(32554): 9.4e-46 Smith-Waterman score: 1223; 29.9% identity (56.6% similar) in 911 aa overlap (66-900:521-1390) 40 50 60 70 80 pF1KE3 LIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFS-DP--------ESQTLKE- :: :::. : . .: :. ::. CCDS32 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT 500 510 520 530 540 550 90 100 110 120 130 pF1KE3 -HLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGC-VEGQQPIVRK----VVEHGLFVKH--------- .:: :: .:: .: : .::: . .:.... . : :: .. CCDS32 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPA 560 570 580 590 600 610 140 150 160 170 180 pF1KE3 CKVEVYLLELKLCENSDPTNVLS-------CHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRL ... . ... . .:. :. : ::. .:: :.. . . . : :.. :: CCDS32 TRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGC-FSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDMRL 620 630 640 650 660 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 WNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQ-TLQSNGSGFSASYNC : : :. :. .. . . : :::: .:.: .::.. .. .: :.. . CCDS32 WLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIAN----SSKIDR 670 680 690 700 710 720 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 QEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKG .. :. . : ::.::::::::::..::.::: :::.::.. .. :.:: ::.:::: CCDS32 HKVPT---EKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKG 730 740 750 760 770 780 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 EIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDL ..:. :..:....::: . .::: .. ....::.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS32 HMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDL 790 800 810 820 830 840 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 NRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSV :::..:::.::::..:::: :: :::.:: :: :..:: ::: ..: . : :...:: CCDS32 NRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISV 850 860 870 880 890 900 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 TFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIA :::: .:.::::. . .:. .. : :..: . . . . : . :: : :. 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CCDS32 EELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWI-KSQKIVKFPRE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 GLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASE ... : :. . : . . .. . .. . : .:. :.. : . : CCDS32 SFDPSAFL--VPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKV--------DAQSSAGEE 1310 1320 1330 1340 1350 870 880 890 900 910 pF1KE3 DQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTR-PSSSQQGFGDDEACSMDTN : ...:. : . .. ..:. : :.: .:: ::: CCDS32 DVLLSKSPSSL-----SANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRL 1360 1370 1380 1390 1400 CCDS32 RLPQIGSKNKLSSSKENLDASKENGAGQICELADALSRGHVLGGSQPELVTPQDHEVALA 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318 aa) initn: 1357 init1: 856 opt: 947 Z-score: 923.5 bits: 182.7 E(32554): 4e-45 Smith-Waterman score: 1277; 36.6% identity (58.4% similar) in 704 aa overlap (252-852:494-1190) 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 GTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTD ::. :: ::::::::::..: :::: : : CCDS43 PTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGLVNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRD 470 480 490 500 510 520 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 YFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSG .: .::::: .:::: :..: ..: :.. .:.: : .:. :. : ::.: CCDS43 FFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWKGTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTG 530 540 550 560 570 580 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 YQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIV : :.:.::..:::::::::::::...::: : :..:::: :::.:::. :..:::: :: CCDS43 YAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSDGRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIV 590 600 610 620 630 640 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 DTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVT : :.: .:: :::: :::::.::::: :: .::: .:..:. :: .:: .: .. :. CCDS43 DLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-QKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVS 650 660 670 680 690 700 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 VPLMGAV-SDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEV : ... :.. ..::. . ::. .:.: ..:::..: ...:. . : : .. .:. 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CCDS56 DLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-QKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVS 740 750 760 770 780 790 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 VPLMGAV-SDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEV : ... :.. ..::. . ::. .:.: ..:::..: ...:. . : : .. .:. 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