FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1120, 364 aa 1>>>pF1KE1120 364 - 364 aa - 364 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8160+/-0.000893; mu= 19.3353+/- 0.054 mean_var=129.8224+/-46.515, 0's: 0 Z-trim(106.5): 271 B-trim: 1058 in 2/47 Lambda= 0.112564 statistics sampled from 8545 (9030) to 8545 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16 Scan time: 2.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX ( 364) 2496 417.3 1e-116 CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX ( 364) 2496 417.3 1e-116 CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX ( 364) 2496 417.3 1e-116 CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX ( 364) 2427 406.1 2.5e-113 CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 ( 348) 1033 179.7 3.4e-45 CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 ( 348) 1002 174.6 1.1e-43 CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 ( 402) 512 95.2 1.1e-19 CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 507 94.2 1.7e-19 CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 ( 354) 446 84.4 1.7e-16 CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 382 74.2 2.7e-13 CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 361 70.8 2.9e-12 CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 350 68.8 8.9e-12 CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4 ( 350) 346 68.1 1.3e-11 CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 338 67.0 3.7e-11 >>CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX (364 aa) initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 2208.7 bits: 417.3 E(32554): 1e-116 Smith-Waterman score: 2496; 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100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 VSPA :::: CCDS83 VSPA >>CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX (364 aa) initn: 2427 init1: 2427 opt: 2427 Z-score: 2148.2 bits: 406.1 E(32554): 2.5e-113 Smith-Waterman score: 2427; 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44.3% identity (74.8% similar) in 345 aa overlap (23-363:5-347) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM .. .. . : .:. ::..::.::::: :...: ...: CCDS58 MRKMSEEEFYLFKNISSV-GPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFM 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV : . . :..::.::...::::.:::.::::.. . . ... : . :::: CCDS58 GTVFLIGFPLNAMVLVATLRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVFVASCNGYFV 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA .:. .:.:::. .. :.. ::::....::..:.:::::: ::..: :.. . .: . CCDS58 FGRHVCALEGFLGTVAGLVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKHALTVVLATWTIG 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFS-GSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCY . ::.:::::. :.::. ::::: .. :..: . .:: :.. : :.:::.: . : CCDS58 IGVSIPPFFGWSRFIPEGLQCSCGPDWYTVGTKYRS-ESYTWFLFIFCFIVPLSLICFSY 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPF :. :..::: ::.:: .:::::.::.::::::: .:: :. ::: :: . . : .. . CCDS58 TQLLRALKAVAAQQQESATTQKAEREVSRMVVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 HPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF-GKKVDDGSELSSASKTEVSSV ....:.::.::: ::::.:: :::.::. ::... :: . : :. :..:::::.: CCDS58 DLRLVTIPSFFSKSACIYNPIIYCFMNKQFQACIMKMVCGKAMTDESDTCSSQKTEVSTV 290 300 310 320 330 340 360 pF1KE1 SS--VSPA :: :.: CCDS58 SSTQVGPN >>CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 (348 aa) initn: 977 init1: 977 opt: 1002 Z-score: 897.7 bits: 174.6 E(32554): 1.1e-43 Smith-Waterman score: 1002; 44.3% identity (74.2% similar) in 345 aa overlap (21-359:2-346) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNST---RGPFEGPNYHIAPRWVYHLTS ..:.. : ::.: :.::: :.:..: : . . . CCDS30 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 VWMIFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYG ..:..... . : :.: .:.. :::: :::.::.::::::: .. . : .. ....: CCDS30 AYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 YFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSW :::.: : :::. ..: : .::::.... ::..:::::..: :: . ::.:.::.: CCDS30 YFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTW 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 IWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVL . : . .:::. ::::: :.::. ::: : .. . . .:..: ..:. :. :: . CCDS30 VMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFF 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 CYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGY :: :. .... .: ::.:: .::::::::::::..::.:: .:: ::: : . .. : CCDS30 CYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 PFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF--GKK-VDDGSELSSASKTE : :.. ..::::::::.:::::::..::.:::::.: . ::. . : ...:::: CCDS30 NFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTE 290 300 310 320 330 340 360 pF1KE1 VSSVSSVSPA .:.:. CCDS30 TSQVAPA >>CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 (402 aa) initn: 523 init1: 223 opt: 512 Z-score: 467.0 bits: 95.2 E(32554): 1.1e-19 Smith-Waterman score: 512; 30.9% identity (64.3% similar) in 311 aa overlap (38-337:23-324) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 QRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRW---VYHLTSVWMIFVV :: . . :: . .:. .. . . CCDS31 MYSGNRSGGHGYWDGGGAAGAEGPAPAGTLSPAPLFSPGTYERLALLLGSIG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHP . .: .: :::. .::..:: : . .:::....:: .... :.. :. . . .: CCDS31 LLGVGNNLLVLVLYYKFQRLRTPTHLLLVNISLSDLLVSLFGVTFTFVSCLRNGWVWDTV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 MCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWT :: .:.. :: ::... .:.....::.. : . . :. : .:.. :... .:. CCDS31 GCVWDGFSGSLFGIVSIATLTVLAYERYIRVVHAR-VINFS--WAWRAITYIWLYSLAWA 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 APPIFGWSRYW--PHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQV . :..::.:: ::: .: : : .. .:... :.. : ..::..:. :: .. CCDS31 GAPLLGWNRYILDVHGL--GCTVDWKSKDAND--SSFVLFLFLGCLVVPLGVIAHCYGHI 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE1 WLAIRAVAKQQKESESTQ-----KAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANP-G .:: . . .. .. : : ::....: .:...: :: :: . :: ..: : CCDS31 LYSIRML-RCVEDLQTIQVIKILKYEKKLAKMCFLMIFTFLVCWMPY-IVICFLVVNGHG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 YPFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVS . : .. . .:::: :.::::::::: :.:: .:::. CCDS31 HLVTPTISIVSYLFAKSNTVYNPVIYVFMIRKFRRSLLQLLCLRLLRCQRPAKDLPAAGS 290 300 310 320 330 340 360 pF1KE1 SVSSVSPA CCDS31 EMQIRPIVMSQKDGDRPKKKVTFNSSSIIFIITSDESLSVDDSDKTNGSKVDVIQVRPL 350 360 370 380 390 400 >>CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 (337 aa) initn: 425 init1: 425 opt: 507 Z-score: 463.4 bits: 94.2 E(32554): 1.7e-19 Smith-Waterman score: 507; 28.3% identity (65.1% similar) in 307 aa overlap (53-356:25-328) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 TQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVVIASVFTNGLVLAATMKFK ........:.. . :...: .::. .:.: CCDS36 MLRNNLGNSSDSKNEDGSVFSQTEHNIVATYLIMAGMISIISNIIVLGIFIKYK 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 KLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHPMC-VLEGYTVSLCGITGL .:: : : :..::::.:.. . :. .:.....:: . .:. : : : .. . :.... CCDS36 ELRTPTNAIIINLAVTDIGVSSIGYPMSAASDLYGSWKFGYAGCQVYAGLNI-FFGMASI 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 WSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKT :.... .:....: : . :. .. : : .:: . :. ::.::. : : . CCDS36 GLLTVVAVDRYLTICLPDVGRRMTTNTYIGLILGAWINGLFWALMPIIGWASYAPDPTGA 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 SCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQVWLAIRA-VAKQQKESESTQ .: . ... . :: ..... :.::... :: .: :.:. .... :: . . CCDS36 TCTINWRKNDR--SFVSYTMTVIAINFIVPLTVMFYCYYHVTLSIKHHTTSDCTESLNRD 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 pF1KE1 KAEK-EVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFHPLMAALPAFFAKSATIYNP ... .::.: :.:. : :.::.. .:. . . : :: . .::::.:.::: CCDS36 WSDQIDVTKMSVIMICMFLVAWSPYSIVCLWASFGDPKKIPPPMAIIAPLFAKSSTFYNP 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 pF1KE1 VIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA ::: :..:: .: .: .. . ..: .:: CCDS36 CIYVVANKKFRRAMLAMFKCQTHQTMPVTSILPMDVSQNPLASGRI 300 310 320 330 >>CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 (354 aa) initn: 409 init1: 282 opt: 446 Z-score: 409.7 bits: 84.4 E(32554): 1.7e-16 Smith-Waterman score: 446; 26.2% identity (61.2% similar) in 317 aa overlap (51-357:30-344) 30 40 50 60 70 pF1KE1 DSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVV-IASVFTNGLVLAATM : :.. ... .. : :.: :: :: . CCDS49 MALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSS 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 KFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHPMCVLEGYTVSLCGIT . :: .: . . .:::: ::. .:... ..... .:.: : :.. . : CCDS49 RRKKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCG 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 GLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGL .: ... .: .:.. .: .: . : : . .: : .:. ::. :. : . : :. . CCDS49 SLITMTAVSLDRYLKICYLSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 KTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQVWLAIRAVAKQ----QKE ::: : . ... : : ... .. : . : ..::. :... ... .:. ... CCDS49 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 SESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH-PL-MAALPAFFAKS .:.. : ..:...... .: . : ::: . ..: : : :. ....:...::: CCDS49 IHSSHVLEMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAF--GRPDSIPIQLSVVPTLLAKS 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 pF1KE1 ATIYNPVIYVFMNRQFRNCI---LQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA :..:::.:: .. .: : :. :: .: .: ... .. :: CCDS49 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE 300 310 320 330 340 350 >>CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 (478 aa) initn: 426 init1: 144 opt: 382 Z-score: 352.2 bits: 74.2 E(32554): 2.7e-13 Smith-Waterman score: 514; 28.6% identity (63.9% similar) in 346 aa overlap (18-335:27-363) 10 20 30 40 pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTY----TNSNSTRGPFEG----- :. ::.:::: . . : .. : . . 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CCDS73 GVASKRRAAFVLLGV---WLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLTSCSWDYMSFT--PAVRA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE1 YMIVLMVTCCIT---PLSIIVLCYLQVWLAIRAVAKQQK-------ESEST---QKAEKE : ..: ::.. :: ::. ::. .. ::: ... . ..:: :. ..: CCDS73 YTMLL---CCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQSE 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 --VTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYV .........: : . :.::. : : :. .. . : :...:: .::...:.::.::. CCDS73 CKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAVIAKASAIHNPIIYA 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 pF1KE1 FMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA . . ..: : : CCDS73 ITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQES 360 370 380 390 400 410 364 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 18:01:19 2016 done: Mon Nov 7 18:01:19 2016 Total Scan time: 2.270 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]