Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3333
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3333, 967 aa
  1>>>pF1KE3333 967 - 967 aa - 967 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6231+/-0.00134; mu= 17.7097+/- 0.081
 mean_var=242.3495+/-44.787, 0's: 0 Z-trim(110.2): 935  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.082386
 statistics sampled from 10418 (11439) to 10418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.351), width:  16
 Scan time:  4.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16     ( 967) 6685 809.2       0
CCDS10095.2 ZSCAN29 gene_id:146050|Hs108|chr15     ( 852) 2380 297.5 7.7e-80
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667)  893 120.6 1.1e-26
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692)  893 120.6 1.1e-26
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869)  893 120.7 1.2e-26
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  887 119.6 1.4e-26
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614)  886 119.7 1.8e-26
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665)  886 119.7 1.9e-26
CCDS66920.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16      ( 408)  882 118.9   2e-26
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10        ( 458)  882 119.0 2.2e-26
CCDS10503.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16      ( 485)  882 119.0 2.2e-26
CCDS66921.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16      ( 697)  882 119.3 2.7e-26
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15      ( 483)  867 117.3 7.7e-26
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 687)  865 117.2 1.1e-25
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 715)  865 117.3 1.1e-25
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4       ( 923)  865 117.4 1.3e-25
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  862 116.8 1.3e-25
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  862 116.9 1.4e-25
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  862 116.9 1.4e-25
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682)  862 116.9 1.4e-25
CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 350)  857 115.9 1.5e-25
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568)  859 116.4 1.6e-25
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604)  859 116.5 1.7e-25
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 527)  858 116.2 1.7e-25
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620)  859 116.5 1.7e-25
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 563)  858 116.3 1.8e-25
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7           ( 446)  855 115.8   2e-25
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536)  856 116.0   2e-25
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592)  856 116.1 2.1e-25
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 533)  855 115.9 2.2e-25
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 503)  854 115.7 2.3e-25
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 555)  854 115.8 2.4e-25
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 564)  854 115.8 2.4e-25
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 657)  855 116.0 2.4e-25
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 577)  854 115.8 2.5e-25
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 616)  854 115.9 2.6e-25
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 629)  854 115.9 2.6e-25
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19        ( 738)  855 116.1 2.6e-25
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682)  854 115.9 2.7e-25
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19       ( 541)  852 115.5 2.8e-25
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 560)  852 115.6 2.9e-25
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19     ( 491)  848 115.0 3.7e-25
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 539)  848 115.1 3.9e-25
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585)  848 115.1 4.1e-25
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643)  848 115.2 4.3e-25
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8        ( 671)  848 115.2 4.4e-25
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19         (1159)  851 115.9 4.6e-25
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19         (1191)  851 115.9 4.7e-25
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678)  847 115.1 4.8e-25
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 816)  848 115.3 4.9e-25


>>CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16          (967 aa)
 initn: 6685 init1: 6685 opt: 6685  Z-score: 4311.7  bits: 809.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6685; 99.9% identity (100.0% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAVALDSQIDAPLEVEGCLIMKVEKDPEWASEPILEGSDSSETFRKCFRQFCYEDVTGPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAVALDSQIDAPLEVEGCLIMKVEKDPEWASEPILEGSDSSETFRKCFRQFCYEDVTGPH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 EAFSKLWELCCRWLKPEMRSKEQILELLVIEQFLTILPEKIQAWAQKQCPQSGEEAVALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAFSKLWELCCRWLKPEMRSKEQILELLVIEQFLTILPEKIQAWAQKQCPQSGEEAVALV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VHLEKETGRLRQQVSSPVHREKHSPLGAAWEVADFQPEQVETQPRAVSREEPGSLHSGHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VHLEKETGRLRQQVSSPVHREKHSPLGAAWEVADFQPEQVETQPRAVSREEPGSLHSGHQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 EQLNRKRERRPLPKNARPSPWVPALADEWNTLDQEVTTTRLPAGSQEPVKDVHVARGFSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQLNRKRERRPLPKNARPSPWVPALADEWNTLDQEVTTTRLPAGSQEPVKDVHVARGFSY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 RKSVHQIPAQRDLYRDFRKENVGNVVSLGSAVSTSNKITRLEQRKEPWTLGLHSSNKRSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKSVHQIPAQRDLYRDFRKENVGNVVSLGSAVSTSNKITRLEQRKEPWTLGLHSSNKRSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 LRSNYVKEKSVHAIQVPARSAGKTWREQQQWGLEDEKIAGVHWSYEETKTFLAILKESRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LRSNYVKEKSVHAIQVPARSAGKTWREQQQWGLEDEKIAGVHWSYEETKTFLAILKESRF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 YETLQACPRNSQVYGAVAEWLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVRNGHMLEPCAFFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YETLQACPRNSQVYGAVAEWLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVRNGHMLEPCAFFE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 DMDALLNPAARAPSTDKPKEMIPVPRLKRIAISAKEHISLVEEEEAAEDSDDDEIGIEFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DMDALLNPAARAPSTDKPKEMIPVPRLKRIAISAKEHISLVEEEEAAEDSDDDEIGIEFI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 RKSEIHGAPVLFQNLSGVHWGYEETKTFLDILRETRFYEALQACHRKSKLYGAVAEQLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKSEIHGAPVLFQNLSGVHWGYEETKTFLDILRETRFYEALQACHRKSKLYGAVAEQLRE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 CGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVKNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVKNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 PSRQERGGIEVEPQDPTGWEPEETSQEAVIEDSCSERMSEEEIVQEPEFQGPPGLLQSPN
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSRQERGGIEVEPQEPTGWEPEETSQEAVIEDSCSERMSEEEIVQEPEFQGPPGLLQSPN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 DFEIGSSIKEDPTQIVYKDMEQHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFEIGSSIKEDPTQIVYKDMEQHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 RQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVC
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 GKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 SQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 RFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKT
              910       920       930       940       950       960

              
pF1KE3 DEFRKTF
       :::::::
CCDS32 DEFRKTF
              

>>CCDS10095.2 ZSCAN29 gene_id:146050|Hs108|chr15          (852 aa)
 initn: 3515 init1: 1254 opt: 2380  Z-score: 1546.9  bits: 297.5 E(32554): 7.7e-80
Smith-Waterman score: 2786; 48.5% identity (69.9% similar) in 926 aa overlap (30-943:3-846)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAVALDSQIDAPLEVEGCLIMKVEKDPEWASEPILEGSDSSETFRKCFRQFCYEDVTGPH
                                    :.  . :.. .:::::. ::.: :..:.::.
CCDS10                            MMAKSALRENGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPR
                                          10        20        30   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 EAFSKLWELCCRWLKPEMRSKEQILELLVIEQFLTILPEKIQAWAQKQCPQSGEEAVALV
       ::::.:::::::::.::.:.::::.::::.:::::.:: .:: :.:.:::..:::::.::
CCDS10 EAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPENGEEAVTLV
            40        50        60        70        80        90   

              130            140       150       160       170     
pF1KE3 VHLEKETGRLRQQVS-----SPVHREKHSPLGAAWEVADFQPEQVETQPRAVSREEPG-S
         ::.: :: :..:.     . :. :: .:  .. :. . . :.:: :::.: ..: . :
CCDS10 EDLEREPGRPRSSVTVSVKGQEVRLEKMTPPKSSQELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARS
           100       110       120       130       140       150   

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE3 LHSGHQEQLNRKRERRPLPKNARPSPWVPALADEWNTLDQEVTTTRLPAGSQEPVKDVHV
          : :::.: :.. .:. ... : :                                  
CCDS10 PDLGPQEQMNPKEKLKPFQRSGLPFP----------------------------------
           160       170                                           

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE3 ARGFSYRKSVHQIPAQRDLYRDFRKENVGNVVSLGSAVSTSNKITRLEQRKEPWTLGLHS
                                               :. ..::::  :::   : .
CCDS10 ---------------------------------------KSGVVSRLEQ-GEPWIPDLLG
                                            180        190         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE3 SNKRSILRSNYVKEKSVHAIQVPARSAGKTWREQQQWGLEDEKIAGVHWSYEETKTFLAI
       :... .  .... .. :::  .:...  ..: ::..:..::::.:::::.::::.:.:::
CCDS10 SKEKELPSGSHIGDRRVHADLLPSKKDRRSWVEQDHWSFEDEKVAGVHWGYEETRTLLAI
     200       210       220       230       240       250         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE3 LKESRFYETLQACPRNSQVYGAVAEWLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVRNGHMLE
       :....:::.:. : ::::::::::: ::: ::::: ::::::::.::::::::..::  :
CCDS10 LSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPE
     260       270       280       290       300       310         

          420       430        440       450       460             
pF1KE3 PCAFFEDMDALLNPAARA-PSTDKPKEMIPVPRLKRIAISAKEHISLVEEEEAAED----
        : :::.:.::..  . : ::.           .   : . .      ..::.::.    
CCDS10 TCPFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEAAASHSGLVGSDAETEEPGQRGWQHEEGAEEAVAQ
     320       330       340       350       360       370         

      470       480       490       500       510       520        
pF1KE3 -SDDDEIGIEFIRKSEIHGAPVLFQNLSGVHWGYEETKTFLDILRETRFYEALQACHRKS
        ::.:.. .:   ..   .:::.:.. .:::::::::::.: :: ::.:::::. :::.:
CCDS10 ESDSDDMDLEATPQDPNSAAPVVFRSPGGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNS
     380       390       400       410       420       430         

      530       540       550       560       570       580        
pF1KE3 KLYGAVAEQLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVKNGHVLESCAFYKEMDALINSRAS
       .:::::::.: : ::::::::::::::::: ::::::::.. :.: :..:::::.. :..
CCDS10 QLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSVRVA
     440       450       460       470       480       490         

      590       600       610       620       630       640        
pF1KE3 APSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTGWEPEETSQEAVIEDSCSERMSEEEIVQEPE
       ::  .  ::. :   :  :  :.: :     .  : ..::. ::: ..   . ::     
CCDS10 APPNDGQEETASCPVQ--GTSEAEAQ-----KQAEEADEATEEDS-DDDEEDTEIPPGAV
     500       510         520            530        540       550 

      650       660       670       680       690       700        
pF1KE3 FQGPPGLLQSPNDFEIGSSIKEDPTQIVYKDMEQHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKREC
       .   : :.:::  :: :   ...  . . .... ::.:. .:.: . .    .:  . .:
CCDS10 ITRAPVLFQSPRGFEAGFENEDNSKRDISEEVQLHRTLLARSERKIPRYLHQGKGNESDC
             560       570       580       590       600       610 

      710       720       730       740       750       760        
pF1KE3 ISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMT
        ::::: . .: ..::     ..:.... .::: .:.:::. :::..::: .. :: ...
CCDS10 RSGRQWAKTSGEKRGKLTLPEKSLSEVLSQQRPCLGERPYKYLKYSKSFGPNSLLMHQVS
             620       630       640       650       660       670 

      770       780       790       800       810       820        
pF1KE3 HHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGE
       :. ::::::. ::: :.::  ::::.::::::::.::::::::: ::::: .:.::::::
CCDS10 HQVENPYKCADCGKSFSRSARLIRHRRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGE
             680       690       700       710       720       730 

      830       840       850       860       870       880        
pF1KE3 KPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYK
       :::.::::::::.:::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::.:::: :. 
CCDS10 KPYQCGECGKCFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHV
             740       750       760       770       780       790 

      890       900       910       920       930       940        
pF1KE3 CVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPS
       : :: :::.. . .: :.: ::::::::: .::: :::::.:.:: :.:.::: :     
CCDS10 CPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHGEIHAREKLLTQSAP
             800       810       820       830       840       850 

      950       960       
pF1KE3 LYCPENPHKGKTDEFRKTF
                          
CCDS10 K                  
                          

>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (667 aa)
 initn: 2942 init1: 810 opt: 893  Z-score: 592.7  bits: 120.6 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 893; 56.3% identity (79.3% similar) in 222 aa overlap (723-943:390-608)

            700       710       720       730       740       750  
pF1KE3 VVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLK
                                     :: .::   :   :::::  .:..::.  .
CCDS62 ECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVL---VVHQRTHTGEKPYECNQ
     360       370       380       390          400       410      

            760        770       780       790       800       810 
pF1KE3 YGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKS
        :.:: .: .:. .. ::  :.::.:. ::: : .: .:: ::::::::::..: .::::
CCDS62 CGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKS
        420       430       440       450       460       470      

             820       830       840       850       860       870 
pF1KE3 FNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNS
       :..: .. :::: ::::::..:..::: :: ::.:. :::::::::::.:.::::::. :
CCDS62 FSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRS
        480       490       500       510       520       530      

             880       890       900       910       920       930 
pF1KE3 SHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLT
       ::.  :.:.::::.::.: .: :::..   .  :.: ::::::: :.:::: : .:: ::
CCDS62 SHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLT
        540       550       560       570       580       590      

             940       950       960                               
pF1KE3 KHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF                        
       .:...:. :::.                                                
CCDS62 QHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQCGKAFINSYKLIRHQA
        600       610       620       630       640       650      

>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (692 aa)
 initn: 2942 init1: 810 opt: 893  Z-score: 592.6  bits: 120.6 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 893; 56.3% identity (79.3% similar) in 222 aa overlap (723-943:415-633)

            700       710       720       730       740       750  
pF1KE3 VVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLK
                                     :: .::   :   :::::  .:..::.  .
CCDS12 ECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVL---VVHQRTHTGEKPYECNQ
          390       400       410       420          430       440 

            760        770       780       790       800       810 
pF1KE3 YGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKS
        :.:: .: .:. .. ::  :.::.:. ::: : .: .:: ::::::::::..: .::::
CCDS12 CGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKS
             450       460       470       480       490       500 

             820       830       840       850       860       870 
pF1KE3 FNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNS
       :..: .. :::: ::::::..:..::: :: ::.:. :::::::::::.:.::::::. :
CCDS12 FSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRS
             510       520       530       540       550       560 

             880       890       900       910       920       930 
pF1KE3 SHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLT
       ::.  :.:.::::.::.: .: :::..   .  :.: ::::::: :.:::: : .:: ::
CCDS12 SHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLT
             570       580       590       600       610       620 

             940       950       960                               
pF1KE3 KHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF                        
       .:...:. :::.                                                
CCDS12 QHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQCGKAFINSYKLIRHQA
             630       640       650       660       670       680 

>>CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16            (869 aa)
 initn: 2275 init1: 789 opt: 893  Z-score: 591.6  bits: 120.7 E(32554): 1.2e-26
Smith-Waterman score: 897; 41.4% identity (64.4% similar) in 382 aa overlap (590-946:10-377)

     560       570       580       590       600        610        
pF1KE3 SYRKVKNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGG-IEVEPQDPTG
                                     :. . ::.  ::.  .::.  : : ..:  
CCDS45                      MEPETALWGPDLQGPEQ--SPNDAHRGAESENEEESPR-
                                    10          20        30       

      620       630               640        650       660         
pF1KE3 WEPEETSQEAVI--------EDSCSERMSEEEIVQEPEF-QGPPGLLQSPNDFEIGSSIK
          .:.: : .:        :.. : .:: :.  :.:   :.::  :   : ..   .: 
CCDS45 ---QESSGEEIIMGDPAQSPESKDSTEMSLERSSQDPSVPQNPPTPLGHSNPLD--HQIP
            40        50        60        70        80          90 

     670               680          690       700       710        
pF1KE3 EDPT--QIV------YKDME---QHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQ
        ::   ..:       :  :   :  ::   ..  :  ...::    :: ..::     .
CCDS45 LDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSL---RELVQGRPAGAEK
             100       110       120       130          140        

      720          730       740       750       760        770    
pF1KE3 GI---RQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRM-THHKENP
            . :: .::    .: . :::  .:.::    . :.:: .:..:. .. ::  :.:
CCDS45 PYICNECGKSFSQ---WSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKP
      150       160          170       180       190       200     

          780       790       800       810       820       830    
pF1KE3 YKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCG
       :::  :::::. : .:..::: ::::::.:: .: :.:..:.:.  ::: :::::::.::
CCDS45 YKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCG
         210       220       230       240       250       260     

          840       850       860       870       880       890    
pF1KE3 ECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEK
       :: . : .::.:: :: ::::::::.: :::: : .. ..  :...:.::.::.:..: :
CCDS45 ECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGK
         270       280       290       300       310       320     

          900       910       920       930       940       950    
pF1KE3 SFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPEN
       :: . ... .:.: ::::::: : .::: :..::.: ::...:.:: :.  :        
CCDS45 SFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTL
         330       340       350       360       370       380     

          960                                                      
pF1KE3 PHKGKTDEFRKTF                                               
                                                                   
CCDS45 SATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTL
         390       400       410       420       430       440     

>--
 initn: 1288 init1: 691 opt: 691  Z-score: 461.9  bits: 96.7 E(32554): 2.1e-19
Smith-Waterman score: 691; 57.1% identity (76.1% similar) in 163 aa overlap (779-941:378-540)

      750       760       770       780       790       800        
pF1KE3 RLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDC
                                     :::: :  : .:.:::: ::::.:.:: .:
CCDS45 CLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPEC
       350       360       370       380       390       400       

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE3 GKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSF
       ::::. :::.  ::::: ::.:: :..::: : .::.:: ::: :::::::.:..:::::
CCDS45 GKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSF
       410       420       430       440       450       460       

      870       880       890       900       910       920        
pF1KE3 TNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSS
         :::.  :::.::::.:::: .: :::.. . .  : : :  :. . :..::: : .. 
CCDS45 IRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAH
       470       480       490       500       510       520       

      930       940       950       960                            
pF1KE3 VLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF                     
        : .:: .: : :                                               
CCDS45 ELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQH
       530       540       550       560       570       580       

>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5                (461 aa)
 initn: 1564 init1: 822 opt: 887  Z-score: 590.5  bits: 119.6 E(32554): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 892; 40.1% identity (68.6% similar) in 344 aa overlap (612-942:13-353)

             590       600       610        620       630       640
pF1KE3 LINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTGW-EPEETSQEAVIEDSCSERMSE
                                     :  .:..: : .. :. . .  . .: ..:
CCDS44                   MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFTE
                                 10        20        30        40  

              650          660       670        680       690      
pF1KE3 EEIVQEPEFQ---GPPGLLQSPNDFEIGSSIKEDPTQIVY-KDMEQHRALIEKSKRVVSQ
        ..    ::.   .  ..:.. ... .   .:.  .   . .:  :.  ::. ..  :..
CCDS44 MRVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPM---VKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGK
             50        60           70        80        90         

        700       710       720       730              740         
pF1KE3 STDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKA-------VVHQRPFVGKRPYR
       .    .  ..   .. .  . : :. :.   .    ::        .::::  .:..::.
CCDS44 KIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYK
     100       110       120       130       140       150         

     750       760        770       780       790       800        
pF1KE3 LLKYGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDC
         . :..:..:  :  .. ::  :.::.:  ::: : .. :::.:.::::::::.:: .:
CCDS44 CNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNEC
     160       170       180       190       200       210         

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE3 GKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSF
       ::.:..: :. .::: :::::::.:.:::: ::::  ::.:::.:::::::.:..:::.:
CCDS44 GKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAF
     220       230       240       250       260       270         

      870       880       890       900       910       920        
pF1KE3 TNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSS
       ..:: .. :.: ::::.::::  : :::.. : . ::.:.:.: ::. : .::: :::.:
CCDS44 SKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNS
     280       290       300       310       320       330         

      930       940       950       960                            
pF1KE3 VLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF                     
        ::.::..:. :::                                              
CCDS44 SLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIE
     340       350       360       370       380       390         

>--
 initn: 507 init1: 507 opt: 510  Z-score: 348.3  bits: 74.8 E(32554): 4.4e-13
Smith-Waterman score: 510; 63.3% identity (84.4% similar) in 109 aa overlap (775-882:354-461)

          750       760       770       780        790       800   
pF1KE3 KRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVCGKCF-GRSRSLIRHQRIHTGEKPF
                                     :.: :::: : ::: ::  :: :::::::.
CCDS44 KPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRS-SLTVHQVIHTGEKPY
           330       340       350       360        370       380  

           810       820       830       840       850       860   
pF1KE3 KCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGE
       .: .:::.:..:. .  :::::::::::.: .::: : ..::: .:::::::::::::.:
CCDS44 ECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNE
            390       400       410       420       430       440  

           870       880       890       900       910       920   
pF1KE3 CGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKR
       :::.:. :.... :.:.::                                         
CCDS44 CGKAFSRSTNLTRHQRTHT                                         
            450       460                                          

>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15            (614 aa)
 initn: 812 init1: 812 opt: 886  Z-score: 588.6  bits: 119.7 E(32554): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 928; 41.4% identity (65.5% similar) in 374 aa overlap (595-942:51-417)

          570       580       590       600       610              
pF1KE3 KNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVE----PQDPTG--
                                     ::  : :.   .:: . :    ::   :  
CCDS10 QEEDRQEEEVTTMILEDDSWVQEAVLQEDGPESEPFPQSAGKGGPQEEVTRGPQGALGRL
               30        40        50        60        70        80

             620       630       640            650                
pF1KE3 ------W-EPEETSQEAVIEDSCSERMSEEEI---VQE--PEFQGPPG-----LLQS--P
             : .::  ..: ..       :  .::   .::  :: .   .     : :.   
CCDS10 RELCRRWLRPEVHTKEQMLT------MLPKEIQAWLQEHRPESSEEAAALVEDLTQTLQD
               90       100             110       120       130    

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE3 NDFEIGSSIKEDPTQIVYKDMEQHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQG
       .:::: :   :. .: .... :... . :  .   .: .:  .  .:.    :   .  :
CCDS10 SDFEIQSENGENCNQDMFEN-ESRKIFSEMPEGESAQHSDGESDFERDAGIQRLQGHSPG
          140       150        160       170       180       190   

     720       730       740       750       760        770        
pF1KE3 IRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCG
         .:. .:: :..:. .  :  ..:..::.  . :..:.:...:. .  ::  :. ::: 
CCDS10 EDHGEVVSQDREVGQLIGLQGTYLGEKPYECPQCGKTFSRKSHLITHERTHTGEKYYKCD
           200       210       220       230       240       250   

      780       790       800       810       820       830        
pF1KE3 VCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGK
        ::: :. . .. :::  ::::::.:: ::::::. :.:. .::::::::::..:.::::
CCDS10 ECGKSFSDGSNFSRHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRIHTGEKPFQCAECGK
           260       270       280       290       300       310   

      840       850       860       870       880       890        
pF1KE3 CFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNN
        ::.: .:: :::::::::::.: :::::: : : ...:. .::::.::.: .: .::. 
CCDS10 SFSRSPNLIAHQRTHTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSY
           320       330       340       350       360       370   

      900       910       920       930       940       950        
pF1KE3 CTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKG
        . . .:.::::::::: :..::.:::.::.:  ::..:. :::                
CCDS10 NSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNL
           380       390       400       410       420       430   

      960                                                          
pF1KE3 KTDEFRKTF                                                   
                                                                   
CCDS10 ATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQ
           440       450       460       470       480       490   

>--
 initn: 1404 init1: 812 opt: 840  Z-score: 559.0  bits: 114.2 E(32554): 8.1e-25
Smith-Waterman score: 840; 58.5% identity (80.0% similar) in 195 aa overlap (748-941:418-612)

       720       730       740       750       760        770      
pF1KE3 QGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMC-RMTHHKENPYK
                                     :.  . :.::.::. :   : ::  :.:::
CCDS10 KPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYK
       390       400       410       420       430       440       

        780       790       800       810       820       830      
pF1KE3 CGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGEC
       :::::: :..: ::: :: .::::::..:: ::.::. :::.  :::::::::::.:.::
CCDS10 CGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSEC
       450       460       470       480       490       500       

        840       850       860       870       880       890      
pF1KE3 GKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSF
       :::::: :.:..:::::::::::.:  :::::. .: .  :.:.: :..::.: .: :.:
CCDS10 GKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKGF
       510       520       530       540       550       560       

        900       910       920       930       940       950      
pF1KE3 NNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPH
       .  . .  :.::::::::: : .::: ::.:: .  :...:..::               
CCDS10 SWNSVLIIHQRIHTGEKPYKCPECGKGFSNSSNFITHQRTHMKEKLY             
       570       580       590       600       610                 

        960       
pF1KE3 KGKTDEFRKTF

>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (665 aa)
 initn: 2942 init1: 810 opt: 886  Z-score: 588.3  bits: 119.7 E(32554): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 893; 56.3% identity (79.3% similar) in 222 aa overlap (723-943:388-606)

            700       710       720       730       740       750  
pF1KE3 VVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLK
                                     :: .::   :   :::::  .:..::.  .
CCDS62 ECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVL---VVHQRTHTGEKPYECNQ
       360       370       380       390          400       410    

            760        770       780       790       800       810 
pF1KE3 YGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKS
        :.:: .: .:. .. ::  :.::.:. ::: : .: .:: ::::::::::..: .::::
CCDS62 CGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKS
          420       430       440       450       460       470    

             820       830       840       850       860       870 
pF1KE3 FNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNS
       :..: .. :::: ::::::..:..::: :: ::.:. :::::::::::.:.::::::. :
CCDS62 FSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRS
          480       490       500       510       520       530    

             880       890       900       910       920       930 
pF1KE3 SHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLT
       ::.  :.:.::::.::.: .: :::..   .  :.: ::::::: :.:::: : .:: ::
CCDS62 SHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLT
          540       550       560       570       580       590    

             940       950       960                               
pF1KE3 KHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF                        
       .:...:. :::.                                                
CCDS62 QHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQCGKAFINSYKLIRHQA
          600       610       620       630       640       650    

>>CCDS66920.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16           (408 aa)
 initn: 2164 init1: 818 opt: 882  Z-score: 587.8  bits: 118.9 E(32554): 2e-26
Smith-Waterman score: 1129; 46.2% identity (69.0% similar) in 407 aa overlap (534-939:1-396)

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE3 ETKTFLDILRETRFYEALQACHRKSKLYGAVAEQLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRK
                                     .:: : : ::::::::::::::::: ::::
CCDS66                               MAEGLWEQGFLRTPEQCRTKFKSLQLSYRK
                                             10        20        30

           570       580       590       600       610       620   
pF1KE3 VKNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTGWEPEE
       :. :.: : : ::.::.:: .: :::: : . . ::.   :: . ::.   .  . :: :
CCDS66 VRRGRVPEPCIFYEEMNALSGSWASAP-PMASDAVPG---QEGSDIEAGELNHQNGEPTE
               40        50         60           70        80      

           630       640       650       660       670        680  
pF1KE3 TSQEAVIEDSCSERMSEEEIVQEPEFQGPPGLLQSPNDFEIGSSIKEDPTQIV-YKDMEQ
       . ...... .  .. . ..  :: .    : :. .   ::. . ::..  .    ...: 
CCDS66 V-EDGTVDGADRDEKDFRNPGQEVRKLDLPVLFPNRLGFEFKNEIKKENLKWDDSEEVEI
          90       100       110       120       130       140     

            690       700       710       720       730       740  
pF1KE3 HRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPF
       ..:: .::. :  .: . .:  . :  : :: .:  :  . :  :: .     . ::   
CCDS66 NKALQRKSRGVYWHS-ELQKGLESEPTSRRQCRNSPGESEEKTPSQEK-----MSHQSFC
         150       160        170       180       190              

            750       760       770       780       790       800  
pF1KE3 VGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKP
       .  .    .  :.. ..:..   . . . :.  .:  ::: :.::  :.:::::::::::
CCDS66 ARDKACTHILCGKNCSQSVHSPHKPALKLEKVSQCPECGKTFSRSSYLVRHQRIHTGEKP
     200       210       220       230       240       250         

            810       820       830       840       850       860  
pF1KE3 FKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCG
        :: .:::.:.. ::. :: : ::::.::.::.::: :.::::::.::::::::::::: 
CCDS66 HKCSECGKGFSERSNLTAHLRTHTGERPYQCGQCGKSFNQSSSLIVHQRTHTGEKPYQCI
     260       270       280       290       300       310         

            870       880       890       900       910       920  
pF1KE3 ECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGK
        ::: :.:::.::::::.::::.::::. : : ::: ..:  ::. ::::::: :..: .
CCDS66 VCGKRFNNSSQFSAHRRIHTGESPYKCAVCGKIFNNSSHFSAHRKTHTGEKPYRCSHCER
     320       330       340       350       360       370         

            930       940       950       960       
pF1KE3 RFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF
        :.:.:.::.:. ::..                            
CCDS66 GFTKNSALTRHQTVHMKAVLSSQEGRDAL                
     380       390       400                        

>>CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10             (458 aa)
 initn: 1371 init1: 803 opt: 882  Z-score: 587.3  bits: 119.0 E(32554): 2.2e-26
Smith-Waterman score: 921; 43.0% identity (67.1% similar) in 356 aa overlap (612-942:85-430)

             590       600       610           620       630       
pF1KE3 LINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTG----WEPEETSQEAVIE-DSCSE
                                     ::::       .  ::.... ::. .::::
CCDS41 FENIESETYLPLKVSSQIDTQDSSVKFCKNEPQDHQESRRLFVMEESTERKVIKGESCSE
           60        70        80        90       100       110    

        640       650       660       670         680              
pF1KE3 RMSEEEIVQEPEFQGPPGLLQSPNDFEIGSSIKE--DPTQIVYKDME----------QHR
        .. . . .  :. .:  ::..    . :. .::  :: .   ::..          :.:
CCDS41 NLQVKLVSDGQELASP--LLNGEATCQNGQ-LKESLDPIDCNCKDIHGWKSQVVSCSQQR
          120       130         140        150       160       170 

          690              700       710       720       730       
pF1KE3 ALIEKSK-------RVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVV
       :  :..        .... : :   :.: .    .:.:  :    :: .::  .:   ..
CCDS41 AHTEEKPCDHNNCGKILNTSPDGHPYEKIHTAE-KQYECSQC---GKNFSQSSEL---LL
             180       190       200        210          220       

       740       750       760        770       780       790      
pF1KE3 HQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMT-HHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRI
       :::  . ..::.  . :..: ::. :. ... :  :.::::  ::: : :: ::. :. .
CCDS41 HQRDHTEEKPYKCEQCGKGFTRSSSLLIHQAVHTDEKPYKCDKCGKGFTRSSSLLIHHAV
          230       240       250       260       270       280    

        800       810       820       830       840       850      
pF1KE3 HTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGE
       ::::::.::  :::.:..::..  :::.:::::::.: :::  ::: :.: ::::.::::
CCDS41 HTGEKPYKCDKCGKGFSQSSKLHIHQRVHTGEKPYECEECGMSFSQRSNLHIHQRVHTGE
          290       300       310       320       330       340    

        860       870       880       890       900       910      
pF1KE3 KPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYG
       .::.::::::.:..::..  :: .::::.::.: .: :.:.. . .: : :.::::::: 
CCDS41 RPYKCGECGKGFSQSSNLHIHRCIHTGEKPYQCYECGKGFSQSSDLRIHLRVHTGEKPYH
          350       360       370       380       390       400    

        920       930       940       950       960          
pF1KE3 CAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF   
       :..::: ::.:: :  :..::. :::                            
CCDS41 CGKCGKGFSQSSKLLIHQRVHTGEKPYECSKCGKGFSQSSNLHIHQRVHKKDPR
          410       420       430       440       450        




967 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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