FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9628, 882 aa 1>>>pF1KE9628 882 - 882 aa - 882 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8107+/-0.000434; mu= 15.9115+/- 0.027 mean_var=141.4261+/-28.202, 0's: 0 Z-trim(115.5): 49 B-trim: 178 in 2/51 Lambda= 0.107847 statistics sampled from 25885 (25934) to 25885 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16 Scan time: 10.690 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001008496 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 882) 5913 932.5 0 NP_001242904 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 873) 3790 602.1 3.6e-171 XP_011537305 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2902 464.0 1.4e-129 NP_004755 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 isofo ( 861) 2902 464.0 1.4e-129 XP_011537306 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2902 464.0 1.4e-129 XP_011537304 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2902 464.0 1.4e-129 NP_001177900 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 is ( 829) 2681 429.6 3e-119 XP_016875718 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 832) 2681 429.6 3e-119 XP_011537307 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 819) 2251 362.7 4.1e-99 NP_060538 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 isofo ( 973) 1791 291.2 1.6e-77 NP_001129193 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 973) 1791 291.2 1.6e-77 XP_011537308 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 481) 1764 286.7 1.8e-76 NP_689644 (OMIM: 610315) piwi-like protein 4 [Homo ( 852) 1454 238.7 9.1e-62 NP_001317409 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 937) 1454 238.7 9.8e-62 XP_005273608 (OMIM: 610312) PREDICTED: piwi-like p ( 804) 1247 206.4 4.3e-52 XP_016868806 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 782) 432 79.6 6.3e-14 XP_011515268 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 813) 432 79.6 6.5e-14 NP_036286 (OMIM: 606229) protein argonaute-2 isofo ( 859) 432 79.7 6.8e-14 XP_011515267 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 873) 432 79.7 6.8e-14 XP_011515270 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 918) 432 79.7 7.1e-14 XP_005270633 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 412 76.4 4.4e-13 XP_016856017 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 412 76.4 4.4e-13 XP_016856013 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 412 76.4 4.6e-13 XP_016856014 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 412 76.4 4.6e-13 XP_016856016 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 412 76.4 4.6e-13 NP_803171 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 626) 412 76.4 4.6e-13 XP_016856015 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 412 76.4 4.6e-13 XP_011539184 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 412 76.4 4.6e-13 XP_011539181 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 845) 412 76.5 5.8e-13 XP_016856012 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 412 76.6 5.8e-13 XP_005270632 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 412 76.6 5.8e-13 NP_079128 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 860) 412 76.6 5.8e-13 XP_016856508 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 706) 397 74.1 2.5e-12 NP_001304052 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 782) 397 74.2 2.7e-12 NP_036331 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 isofo ( 857) 397 74.2 2.9e-12 XP_011539538 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 860) 397 74.2 2.9e-12 NP_001304051 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 891) 397 74.2 3e-12 XP_011539186 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 660) 295 58.2 1.5e-07 XP_011539185 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 711) 295 58.3 1.5e-07 XP_005270635 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 295 58.3 1.7e-07 XP_005270636 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 295 58.3 1.7e-07 NP_060099 (OMIM: 607356) protein argonaute-4 [Homo ( 861) 295 58.3 1.8e-07 >>NP_001008496 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 isofor (882 aa) initn: 5913 init1: 5913 opt: 5913 Z-score: 4979.2 bits: 932.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5913; 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XP_011 VMKDLAVHTRLTPEQRQREVGRLIDYIHKNDNVQRELRDWGLSFDSNLLSFSGRILQTEK 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 IVQGRRMVKANSQ-GDWSREIRELPLLNAMPLHSWLILYSRSSHREAMSLKGHLQSVTAP : :: . : : .:::.: : ::... :: .::..:.: ... : :: .: .:: XP_011 IHQGGKTFDYNPQFADWSKETRGAPLISVKPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKVTPA 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 MGITMKPAEMIEVDGDANSYIDTLRKYTRPTLQMGMSCLLVFKVICILPNDDKRRYDSIK ::. :. : ::::: ...:. .:.. . :. :.:.: .. : .::.:: XP_011 MGMQMRKAIMIEVDDRTEAYLRVLQQKVTADTQI---------VVCLLSSNRKDKYDAIK 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 RYLCTKCPIPSQCVVKKTLEKVQA-RTIVTKIAQQMNCKMGGALWKVETDVQRTMFVGID .:::: :: :::::: .:: : :. .:.:::: :::::::: ::.:. .. .:.:::: XP_011 KYLCTDCPTPSQCVVARTLGKQQTVMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGID 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 CFHDIVNRQKSIAGFVASTNAELTKWYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESS :.::.. ..:::::::: : .:.:.:.:..: :.::: :..::.::: .: . . 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