FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4042, 217 aa 1>>>pF1KE4042 217 - 217 aa - 217 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3187+/-0.00106; mu= 13.2918+/- 0.065 mean_var=72.2777+/-14.070, 0's: 0 Z-trim(103.1): 220 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.150859 statistics sampled from 7005 (7246) to 7005 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 1.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7 ( 217) 1417 317.8 3.3e-87 CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 212) 764 175.7 2e-44 CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 613 142.8 1.5e-34 CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11 ( 203) 605 141.1 4.9e-34 CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 599 139.7 1.2e-33 CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 583 136.3 1.4e-32 CCDS56275.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 155) 576 134.7 3.2e-32 CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 576 134.8 4e-32 CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 571 133.7 8.3e-32 CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 ( 216) 563 131.9 2.9e-31 CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 212) 551 129.3 1.8e-30 CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 ( 215) 551 129.3 1.8e-30 CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 256) 543 127.6 6.9e-30 CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 216) 533 125.4 2.7e-29 CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 ( 218) 533 125.4 2.7e-29 CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 ( 200) 531 124.9 3.4e-29 CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1 ( 213) 529 124.5 4.9e-29 CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 223) 525 123.7 9.3e-29 CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 196) 518 122.1 2.4e-28 CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 228) 518 122.2 2.7e-28 CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 190) 516 121.7 3.2e-28 CCDS14621.1 RAB33A gene_id:9363|Hs108|chrX ( 237) 515 121.5 4.4e-28 CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 511 120.6 7.1e-28 CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 ( 218) 510 120.4 8.8e-28 CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4 ( 229) 510 120.4 9.1e-28 CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18 ( 244) 505 119.3 2e-27 CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 504 119.1 2.2e-27 CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 ( 219) 502 118.7 2.9e-27 CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19 ( 213) 501 118.4 3.3e-27 CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 496 117.4 7.3e-27 CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5 ( 227) 490 116.1 1.8e-26 CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 ( 220) 487 115.4 2.8e-26 CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3 ( 215) 481 114.1 6.9e-26 CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 216) 480 113.9 8e-26 CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 249) 480 113.9 9e-26 CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 155) 477 113.1 9.7e-26 CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14 ( 212) 477 113.2 1.2e-25 CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11 ( 217) 476 113.0 1.5e-25 CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX ( 213) 475 112.8 1.7e-25 CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12 ( 215) 472 112.1 2.7e-25 CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 206) 460 109.5 1.6e-24 CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3 ( 208) 450 107.3 7.2e-24 CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 188) 447 106.6 1e-23 CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 442 105.6 2.4e-23 CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 438 104.7 4.4e-23 CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2 ( 212) 428 102.5 2e-22 CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20 ( 194) 426 102.1 2.5e-22 CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12 ( 225) 422 101.3 5.2e-22 CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18 ( 195) 421 101.0 5.4e-22 CCDS54162.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 186) 403 97.1 7.9e-21 >>CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7 (217 aa) initn: 1417 init1: 1417 opt: 1417 Z-score: 1679.2 bits: 317.8 E(32554): 3.3e-87 Smith-Waterman score: 1417; 99.5% identity (100.0% similar) in 217 aa overlap (1-217:1-217) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKYGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC 190 200 210 >>CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 (212 aa) initn: 739 init1: 739 opt: 764 Z-score: 911.2 bits: 175.7 E(32554): 2e-44 Smith-Waterman score: 764; 53.6% identity (85.0% similar) in 207 aa overlap (11-217:12-212) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSL ::..:.:::..:.::..::::::::.::.:...: : .:::::::...: CCDS33 MAGPGPGPGDPDEQYDFLFKLVLVGDASVGKTCVVQRFKTGAFSERQGSTIGVDFTMKTL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 DIDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYG .:.::.::.:.::::::::::::::::::::..::.:::.:.::.: :.::::....::. CCDS33 EIQGKRVKLQIWDTAGQERFRTITQSYYRSANGAILAYDITKRSSFLSVPHWIEDVRKYA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 AANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKEL ..:.: .::::: :: : :.: . .: .:::.. .: ..:::::.:.:.::.:. .: :: CCDS33 GSNIVQLLIGNKSDLSELREVSLAEAQSLAEHYDILCAIETSAKDSSNVEEAFLRVATEL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 pF1KE4 IARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC : :.. :..:.. . . :.:. . . : : : CCDS33 IMRHGGPLFSEKSPDHIQLNSKDIGEGWG------CGC 190 200 210 >>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 (205 aa) initn: 604 init1: 539 opt: 613 Z-score: 733.8 bits: 142.8 E(32554): 1.5e-34 Smith-Waterman score: 613; 45.2% identity (77.4% similar) in 199 aa overlap (11-208:5-202) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD . ..:::::..:::::.:::.:.. .: . .:::. .:::::: .:... CCDS46 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA .::: .:.:.:::::::::::::.::::.::. :..::.: . .:... .:..::..:.. CCDS46 LDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYAS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI :: .:.:::::: :. : . : .:.. :. ::::::.. :.:. :. :: :. CCDS46 ENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGI-PFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE4 AR-NSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC : . : . ... ..:.:: .. : CCDS46 KRMGPGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC 180 190 200 >>CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11 (203 aa) initn: 594 init1: 505 opt: 605 Z-score: 724.5 bits: 141.1 E(32554): 4.9e-34 Smith-Waterman score: 605; 46.4% identity (80.2% similar) in 192 aa overlap (12-203:4-194) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD :..:.::::.:::...:::::.:..: .:.. : :::::: ..... CCDS82 MSMEDYDFLFKIVLIGNAGVGKTCLVRRFTQGLFPPGQGATIGVDFMIKTVE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA :.:.:::.:.::::::::::.:::::::::.: :..::.: . .:. .:.:..:::.:.. CCDS82 INGEKVKLQIWDTAGQERFRSITQSYYRSANALILTYDITCEESFRCLPEWLREIEQYAS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI .:. .:.::: :: :.:.: . : ..: . . :::::::: :.:..:. .: .:: CCDS82 NKVITVLVGNKIDLAERREVSQQRAEEFSEAQDMY-YLETSAKESDNVEKLFLDLACRLI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC .. . ... . :: ... . CCDS82 SEARQNTLVNNVSSPLPGEGKSISYLTCCNFN 180 190 200 >>CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 (201 aa) initn: 583 init1: 501 opt: 599 Z-score: 717.5 bits: 139.7 E(32554): 1.2e-33 Smith-Waterman score: 599; 45.5% identity (75.8% similar) in 198 aa overlap (11-208:2-198) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD . ..:::::..:::::.:::.:.. .: . .:::. .:::::: .:... CCDS31 MNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA .::: .:.:.:::::::::::::.::::.::. :..::.: . .. .. .:..::..:.. CCDS31 LDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYAS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI :: .:.::: :: :. : : .:.. :. ::::::.. :.:..:. :: :. CCDS31 ENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGI-PFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC : . . . .: .::.:: : : CCDS31 KRMGPGAASGGERPNLKIDSTPVKPAGGGCC 180 190 200 >>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 (207 aa) initn: 595 init1: 509 opt: 583 Z-score: 698.5 bits: 136.3 E(32554): 1.4e-32 Smith-Waterman score: 583; 43.6% identity (79.7% similar) in 202 aa overlap (12-213:3-199) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD ...:::::..:::::.:::::.. .:. ... : .:::.:: .:... CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA .::::.:.:.::::::::::::: .:::.: . ...::.: ...:..: .::..::.... CCDS10 LDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHAS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI ..: :..:::::. .::.: : . :: .:. :::::: : :.::.: .:.... CCDS10 SDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGI-KFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC .. . .. ..: : ..:: .... :.:: CCDS10 TKLNRKM-NDSNSAGA---GGPVKITENRSKKTSFFRCSLL 180 190 200 >>CCDS56275.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 (155 aa) initn: 576 init1: 576 opt: 576 Z-score: 692.0 bits: 134.7 E(32554): 3.2e-32 Smith-Waterman score: 576; 64.4% identity (96.6% similar) in 118 aa overlap (11-128:12-129) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSL ::..:.:::..:.::..::::::::.::.:...: : .:::::::...: CCDS56 MAGPGPGPGDPDEQYDFLFKLVLVGDASVGKTCVVQRFKTGAFSERQGSTIGVDFTMKTL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 DIDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYG .:.::.::.:.::::::::::::::::::::..::.:::.:.::.: :.::::....::. CCDS56 EIQGKRVKLQIWDTAGQERFRTITQSYYRSANGAILAYDITKRSSFLSVPHWIEDVRKYA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 AANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKEL ..:.: .:: CCDS56 GSNIVQLLIEMQSCYVAQADLELLASSNPPASTSK 130 140 150 >>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 (207 aa) initn: 557 init1: 504 opt: 576 Z-score: 690.2 bits: 134.8 E(32554): 4e-32 Smith-Waterman score: 576; 46.1% identity (81.7% similar) in 180 aa overlap (12-191:3-181) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD ...:::::..:::::.::::::. .:. ... : .:::.:: .:... CCDS12 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA .:::..:.:.::::::::::::: .:::.: . ...::.: ...:..: .::..::.... CCDS12 LDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHAS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI :.: :..:::::. .::.: : . :: .:. .::::: . :.:..: .:... CCDS12 ADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGI-KFMETSAKANINVENAFFTLARDIK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC :. . .: :.: CCDS12 AKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL 180 190 200 >>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 (203 aa) initn: 542 init1: 500 opt: 571 Z-score: 684.5 bits: 133.7 E(32554): 8.3e-32 Smith-Waterman score: 571; 46.7% identity (79.7% similar) in 182 aa overlap (14-195:5-181) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD .:.:::..:::::.:::::.. .: ...: .:::.:: .:..: CCDS10 MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYISTIGIDFKIRTVD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA :.:::.:.:::::::::::.::: .:::.: . :..::.: ...::.: .:.. :.. .. CCDS10 IEGKKIKLQVWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMKSIKENAS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI :.: .:.:::::. ::.: :.: ::..::. .::::: : :..:.: .:.... CCDS10 AGVERLLLGNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHGI-RFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYGESALNGLPLDSSPVLMAQGPSEKTHCTC ... :. . :: CCDS10 LKSG----GRRSGNGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG 180 190 200 >>CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 (216 aa) initn: 547 init1: 488 opt: 563 Z-score: 674.7 bits: 131.9 E(32554): 2.9e-31 Smith-Waterman score: 563; 43.2% identity (76.4% similar) in 199 aa overlap (14-210:3-200) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MHFSSSARAADENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFKSGVYTETQQNTIGVDFTVRSLD . :::: :.:::..:::.:.. .: . . ... ::::.: .: .. CCDS95 MTYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMVN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 IDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHEIEKYGA ::::..:.:.::::::: ::.::.::::.: .:...::.::: ::. . :... ..... CCDS95 IDGKQIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLTSWLEDARQHSS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ANVVIMLIGNKCDLWEKRHVLFEDACTLAEKHGLLAVLETSAKESKNIEEVFVLMAKELI .:.:::::::: :: .: : :.. ..:..:::. .::::: . :.::.:. :::. CCDS95 SNMVIMLIGNKSDLESRRDVKREEGEAFAREHGLI-FMETSAKTACNVEEAFINTAKEIY 110 120 130 140 150 160 190 200 210 pF1KE4 ARNSLHLYG-ESALNGLPLD-SSPVLMAQGPSEKTHCTC . . :. .. ::. . .. . . ::: CCDS95 RKIQQGLFDVHNEANGIKIGPQQSISTSVGPSASQRNSRDIGSNSGCC 170 180 190 200 210 217 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:36:09 2016 done: Mon Nov 7 17:36:09 2016 Total Scan time: 1.280 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]