FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3202, 471 aa 1>>>pF1KE3202 471 - 471 aa - 471 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5948+/-0.00107; mu= 16.2332+/- 0.064 mean_var=68.1647+/-13.564, 0's: 0 Z-trim(102.8): 23 B-trim: 3 in 1/51 Lambda= 0.155344 statistics sampled from 7099 (7112) to 7099 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16 Scan time: 2.370 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 471) 3150 715.4 3.2e-206 CCDS65273.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 406) 2664 606.4 1.7e-173 CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 469) 2398 546.9 1.7e-155 CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 462) 2338 533.4 1.9e-151 CCDS81439.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 514) 2226 508.3 7.5e-144 CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 520) 2226 508.3 7.6e-144 CCDS44353.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 500) 2165 494.6 9.6e-140 CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 534) 2164 494.4 1.2e-139 CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 471) 2159 493.3 2.3e-139 CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 505) 2156 492.6 3.9e-139 CCDS82769.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 434) 1547 356.1 4.2e-98 >>CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX (471 aa) initn: 3150 init1: 3150 opt: 3150 Z-score: 3815.8 bits: 715.4 E(32554): 3.2e-206 Smith-Waterman score: 3150; 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CCDS82 SKKLTRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NYLSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLG .::.: ::::::::::::::::. :..:....:::.::.:::: :: .:: :: ::::: CCDS82 RFLSEEGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SPDYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQ ::::.. : ... :::..:::::: .:. :::.:: ::::::.::: :.:::: :::: CCDS82 SPDYVNRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDEDLDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 SRTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGIS :: :::::::::::::::::::::::::..:::::: ::: ::...: .::.::..:.:. 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CCDS44 RIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKD 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY :.::::..: :::::::: .::::::::::::::::::.:::::.. ::::.:::.:::: CCDS44 LRVWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKY 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP :::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:.:::::: CCDS44 YYRYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCP 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY ::::::::::::::.:::::::::.: ::::. :.. .: CCDS44 LHTVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKK 400 410 420 430 440 450 CCDS44 PRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 460 470 480 490 500 >>CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 (534 aa) initn: 2137 init1: 1315 opt: 2164 Z-score: 2620.7 bits: 494.4 E(32554): 1.2e-139 Smith-Waterman score: 2164; 72.1% identity (91.3% similar) in 427 aa overlap (36-460:43-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 GELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYISTKLTRY :..:::::...::::::::::::: ::::: CCDS60 QAGALPLLCQLDTFSPKATVFGVSINPACGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRY 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 LNWIGTPTKVFNLGQYRREAVS-YKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNYLSHEE :::::.::::::.:.::::::. :..:.:: ::: ::...:::::::::.::..::..: CCDS60 LNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEG 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 GHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSPDYIDC :..::::::::::::: .::.::::. .:.:::::.:.:: ..: :: .::..:::: :: CCDS60 GQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDC 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 DREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQSRTVYY . ....::.::: :::..::::: .. : :: ::..::: :..::::::::::: ::: CCDS60 NSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYY 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 LMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISSLKVWT :::::: ::.::::::::.: :..:::::::::: :::..: ::..:.. :....:.::: CCDS60 LMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWT 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 SHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKYRYRYP :..: :::::::: .::::::::::::::::::.:::::.. ::::.:::.:::: :::: CCDS60 SQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYP 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 KGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCPLHTVL ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:.::::::::::: CCDS60 TGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVL 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 pF1KE3 KLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY :::::::::.:::::::::.: ::::. :.. .: CCDS60 KLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKKPRINS 440 450 460 470 480 490 CCDS60 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 500 510 520 530 >>CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 (471 aa) initn: 2132 init1: 1313 opt: 2159 Z-score: 2615.5 bits: 493.3 E(32554): 2.3e-139 Smith-Waterman score: 2159; 70.4% identity (89.5% similar) in 449 aa overlap (26-468:22-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST :..... : .:::::...:.:::::::::.: CCDS31 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY ::::::::::.:::::::: :::::: :::.:.:: :: ::..:::::::.::.::. : CCDS31 KLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP :..:.:..:::::::::::::..::.::.....::::.::.:.:: .:: :: .::..:: CCDS31 LTEENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS :: . .::.:.::::::::::.:.:.::: .. :. ::.::...:: :..::::::.::: CCDS31 DYPERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS . ::::::::: ::.::::::::::.:. :.:::::::::::::.: :: .:.. : :.. CCDS31 KIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY ::::::..::::::::.::::::::: :::::::::::::: ::...::::::::::.:: CCDS31 LKVWTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP :::: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::..::::::.:: CCDS31 LYRYPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDIT----REPEEALDTVPAHY :::..::::::::::::.: ::::::::::.:: .. : :.: : .: CCDS31 LHTIFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTAAETTLAVRRRPSAASLMLPC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 (505 aa) initn: 2134 init1: 1315 opt: 2156 Z-score: 2611.4 bits: 492.6 E(32554): 3.9e-139 Smith-Waterman score: 2156; 72.6% identity (91.6% similar) in 430 aa overlap (26-453:22-451) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST :..... : .:::::...:.:::::::::.: CCDS31 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY ::::::::::.:::::::: :::::: :::.:.:: :: ::..:::::::.::.::. : CCDS31 KLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP :..:.:..:::::::::::::..::.::.....::::.::.:.:: .:: :: .::..:: CCDS31 LTEENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS :: . .::.:.::::::::::.:.:.::: .. :. ::.::...:: :..::::::.::: CCDS31 DYPERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS . ::::::::: ::.::::::::::.:. :.:::::::::::::.: :: .:.. : :.. CCDS31 KIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY ::::::..::::::::.::::::::: :::::::::::::: ::...::::::::::.:: CCDS31 LKVWTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP :::: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::..::::::.:: CCDS31 LYRYPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY :::..::::::::::::.: ::::::::::.:: : CCDS31 LHTIFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTI 420 430 440 450 460 470 CCDS31 RRPRNYSVGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD 480 490 500 471 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:32:50 2016 done: Mon Nov 7 17:32:50 2016 Total Scan time: 2.370 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]