FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3315, 861 aa 1>>>pF1KE3315 861 - 861 aa - 861 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9362+/-0.000932; mu= 17.6792+/- 0.056 mean_var=76.5306+/-15.021, 0's: 0 Z-trim(106.1): 55 B-trim: 3 in 1/46 Lambda= 0.146608 statistics sampled from 8727 (8782) to 8727 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 3.800 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41318.1 HECTD3 gene_id:79654|Hs108|chr1 ( 861) 5847 1246.7 0 CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15 (4861) 709 160.3 7.7e-38 CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834) 645 146.7 9.1e-34 CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 357 85.6 5.4e-16 CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 357 85.8 1.8e-15 CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 335 80.9 1.2e-14 CCDS4890.1 CUL9 gene_id:23113|Hs108|chr6 (2517) 321 78.1 2.2e-13 CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 312 76.0 3.2e-13 CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 312 76.0 3.3e-13 CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 312 76.0 3.3e-13 CCDS4881.1 CUL7 gene_id:9820|Hs108|chr6 (1698) 312 76.1 5.8e-13 CCDS55003.1 CUL7 gene_id:9820|Hs108|chr6 (1782) 312 76.1 6.1e-13 CCDS11043.1 ZZEF1 gene_id:23140|Hs108|chr17 (2961) 315 76.9 6.1e-13 CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 285 70.3 1.5e-11 CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 285 70.3 1.5e-11 CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 283 69.8 2e-11 CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 275 68.2 8.7e-11 >>CCDS41318.1 HECTD3 gene_id:79654|Hs108|chr1 (861 aa) initn: 5847 init1: 5847 opt: 5847 Z-score: 6677.8 bits: 1246.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5847; 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CCDS45 VRQISAGRCHSAAWTAPPVPPRAPGVSVPLQLGL-PDTVPP----QYGALREVSIHTVRA 4350 4360 4370 4380 4390 410 420 430 440 450 pF1KE3 RAVLLQRFIKILDSV--LHHLVPAWDHTL-----GTFSEIKQVKQFLLLSRQRPGLVAQC : :: .: .. : : .: : ... ::.. .. . :: : ... CCDS45 RLRLLYHFSDLMYSSWRLLNLSPNNQNSTSHYNAGTWGIVQGQLRPLLAPRVYTLPMVRS 4400 4410 4420 4430 4440 4450 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LRDSESSKPSFMPRLYINRRLAMEHRACPSRDPACKNAVFTQVYEGLKPSDKYEKPLDYR . . . .. :.. . .:.. . : : . .:.:. . . . : : CCDS45 IGKTMVQGKNYGPQITV-KRISTRGRKC--------KPIFVQIARQVVKLNAS----DLR 4460 4470 4480 4490 4500 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 WPMRYDQWWECKFIAEGIIDQGGGFRDSLADMSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGT : : :. :...:: : :: : :....: .:: . .: .: : : . CCDS45 LPSRA---WKVKLVGEGADDAGGVFDDTITEMCQELETGIVDLLIPSP------NATAEV 4510 4520 4530 4540 4550 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 GEARDMYVPNPS-CRD--FAKYEWIGQLMGAALRGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWSK : :: .. ::: : : . .....: :::.:.: :. : : : .::::: .. . CCDS45 GYNRDRFLFNPSACLDEHLMQFKFLGILMGVAIRTKKPLDLHLAPLVWKQLCCVPLTL-E 4560 4570 4580 4590 4600 4610 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 DFPAVDSVLVKLLE-VMEGMDKETFEFKFGKEL---TFTTVLSDQQVVELIPGGAGIVVG :. :: . :. :. ... :. : .: . . .:. .: ..: .:::: .: . CCDS45 DLEEVDLLYVQTLNSILHIEDSGITEESFHEMIPLDSFVGQSADGKMVPIIPGGNSIPLT 4620 4630 4640 4650 4660 4670 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 YGDRSRFIQLVQKARLEESKEQVAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKKVCGDPEVTVD ...:..... . . ::.: .::::.. :. .:: .:.::: ..::. ::: ::..:. CCDS45 FSNRKEYVERAIEYRLHEMDRQVAAVREGMSWIVPVPLLSLLTAKQLEQMVCGMPEISVE 4680 4690 4700 4710 4720 4730 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 ALRKLTRFEDFEPSDSRVQYFWEALNNFTNEDRSRFLRFVTGRSRLPARIYIYPDKLGYE .:.:..:... . . . ::.::..:..:.::.: :.:::.::::::: ... CCDS45 VLKKVVRYREVDEQHQLVQWFWHTLEEFSNEERVLFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIM 4740 4750 4760 4770 4780 4790 820 830 840 850 860 pF1KE3 TTD----ALPESSTCSSTLFLPHYASAKVCEEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE .: .:: :.:: : :: :.: : :.:::: :: .:: : CCDS45 KVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQLVMAERLRYAINNCRSIDMDNYMLSRNVDNAEG 4800 4810 4820 4830 4840 4850 CCDS45 SDTDY 4860 >>CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834 aa) initn: 719 init1: 314 opt: 645 Z-score: 719.7 bits: 146.7 E(32554): 9.1e-34 Smith-Waterman score: 645; 35.7% identity (64.0% similar) in 339 aa overlap (528-855:4466-4794) 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 VFTQVYEGLKPSDKYEKPLDYRWPMRYDQWWECKFIAEGIIDQGGGFRDSLADMSEELCP :. ::..:.. : :::. .:.:.. ::: CCDS10 GPDGTKSVFGQMCAKMSSFGPDSLLLPHRVWKVKFVGESVDDCGGGYSESIAEICEEL-- 4440 4450 4460 4470 4480 4490 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 SSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARDMYVPNPSCR---DFAKYEWIGQLMGAALRGKEF ... ::. .. : : . .: :: :. .:. : . ....: :.: :.: CCDS10 QNGLTPL----LIVTPNGRDESGANRDCYLLSPAARAPVHSSMFRFLGVLLGIAIRTGSP 4500 4510 4520 4530 4540 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 LVLALPGFVWKQLSGEEVSWSKDFPAVDSVLVKLLEVMEGMDKETFEFKFGKELTFTTVL : : : :::::.: .. . :. ::. .. : .. . . ::. . : ::. CCDS10 LSLNLAEPVWKQLAGMSLTIA-DLSEVDKDFIPGLMYIRDNEATSEEFE-AMSLPFTVPS 4550 4560 4570 4580 4590 4600 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 SDQQVVELIPGGAGIVVGYGDRSRFIQLVQKARLEESKEQVAAMQAGLLKVVPQAVLDLL .. : ..: . :.. .:.....:. . ::.: :::::.. :. .::: .:.:. CCDS10 ASGQDIQLSSKHTHITL--DNRAEYVRLAINYRLHEFDEQVAAVREGMARVVPVPLLSLF 4610 4620 4630 4640 4650 4660 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 TWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDSRVQYFWEALNNFTNEDRSRFLRFVTG : ::: :::.:.. . :.... .. .::: : .:.:::....:.: .:: ::::: : CCDS10 TGYELETMVCGSPDIPLHLLKSVATYKGIEPSASLIQWFWEVMESFSNTERSLFLRFVWG 4670 4680 4690 4700 4710 4720 800 810 820 830 840 pF1KE3 RSRLP-------ARIYIYPDKLGYETTDA-LPESSTCSSTLFLPHYASAKVCEEKLRYAA :.::: .: .. :. : :::: :: : ::.:. .: ::::.:: CCDS10 RTRLPRTIADFRGRDFVIQVLDKYNPPDHFLPESYTCFFLLKLPRYSCKQVLEEKLKYAI 4730 4740 4750 4760 4770 4780 850 860 pF1KE3 YNCVAIDTDMSPWEE . : .:::: CCDS10 HFCKSIDTDDYARIALTGEPAADDSSDDSDNEDVDSFASDSTQDYLTGH 4790 4800 4810 4820 4830 >>CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083 aa) initn: 242 init1: 93 opt: 357 Z-score: 400.7 bits: 85.6 E(32554): 5.4e-16 Smith-Waterman score: 369; 27.7% identity (57.6% similar) in 375 aa overlap (495-851:729-1078) 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 SSKPSFMPRLYINRRLAMEHRACPSRDPACKNAVFTQVYEGLKPSDKYEKPLDYRWPMRY .: .. ..:. :.: . .: : . .: CCDS34 VKIFQRLIYADKQEVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPEN---EP-DLKKRIRV 700 710 720 730 740 750 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 DQWWECKFIAEGIIDQGGGFRDSLADMSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARD . . . . :. :: :: ::. : .:: :. . : : .:.:.: CCDS34 -HLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFL----NELLKSGFN---PNQGFFKTTNEG-------- 760 770 780 790 590 600 610 620 630 pF1KE3 MYVPNPSCR-----DFAK-YEWIGQLMGAALRGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWS-KD . :::. . .::. : ..:...: :: . .. : . :: ..: : .. . . CCDS34 LLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLGRMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDIHH 800 810 820 830 840 850 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 FPAVDSVLVKLLEVMEGMDKETFEFKFGKELTFTTV---LSDQQVVELIPGGAGIVVGYG . ..: . : : ..... .. :. :.::.: :.. ::::: :: : : . CCDS34 LASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELG----LNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSA 860 870 880 890 900 910 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 DRSRFIQLVQKARLEES-KEQVAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKKVCGDP-EVTVD .: .:.:: ::... ... :.. :: .:: : .. ::.. . : .... CCDS34 NRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLE 920 930 940 950 960 970 760 770 780 790 800 pF1KE3 ALRKLTRFEDFEPSDSRV-QYFWEALNNFTNEDRSRFLRFVTGRSRLPARIY--IYPD-- :...: . .: : . ::.....::.:.. ..:.:::. :: : . .:: CCDS34 DLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFC 980 990 1000 1010 1020 1030 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 -KLGYETTDALPESSTCSSTLFLPHYASAKVCEEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE . : . :: .::: . : ::.. . . . :: :: .:.: CCDS34 IHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAI-ECAAGFELS 1040 1050 1060 1070 1080 >>CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374 aa) initn: 285 init1: 234 opt: 357 Z-score: 391.2 bits: 85.8 E(32554): 1.8e-15 Smith-Waterman score: 393; 26.5% identity (57.5% similar) in 358 aa overlap (510-849:4029-4367) 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 LAMEHRACPSRDPACKNAVFTQVYEGLKPSDKYEKPLDYRWPMRYDQWWECKFIAEGIID :.: . : . : .. . : .: : CCDS35 KYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSY-RELHRKSPEEMKNRLYIVFEGEEGQD 4000 4010 4020 4030 4040 4050 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 QGGGFRDSLADMSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARDMYVPNPS--CRD--F :: .:. .:.:. :. . ::. :. : :. ::: : . CCDS35 AGGLLREWYMIISREMFN-------PMYALFRTS-PGD-----RVTYTINPSSHCNPNHL 4060 4070 4080 4090 4100 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AKYEWIGQLMGAALRGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWSKDFPAVDSVLVKLLEVMEGM . ....:.... :. ...: . .:.. :. : .. :. . : . . : . CCDS35 SYFKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYT-DMESEDYHFYQGLVYLLEN 4110 4120 4130 4140 4150 4160 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 DKETFEFKFGKELTFTTVLSDQQVVE---LIPGGAGIVVGYGDRSRFIQLVQKARLEES- : :. : .:::.: ... : : : :.::.:.: .......:: . :. . CCDS35 DVSTL----GYDLTFSTEVQEFGVCEVRDLKPNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAI 4170 4180 4190 4200 4210 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 KEQVAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDSRVQ ..:.::. :. ...:. .....: :::: . : : . .: :.. :... .. .. ..: CCDS35 RKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELLISGLPTIDIDDLKSNTEYHKYQSNSIQIQ 4220 4230 4240 4250 4260 4270 780 790 800 810 820 pF1KE3 YFWEALNNFTNEDRSRFLRFVTGRSRLPARIYIYPDKL-GYE---------TTDALPESS .::.:: .: . ::..::.:::: :..: . . . . : . .:: :: . CCDS35 WFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTDRLPSAH 4280 4290 4300 4310 4320 4330 830 840 850 860 pF1KE3 TCSSTLFLPHYASAKVCEEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE :: . : :: : : . .. : : .: CCDS35 TCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQECSEGFGLA 4340 4350 4360 4370 >>CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 (909 aa) initn: 262 init1: 102 opt: 335 Z-score: 376.7 bits: 80.9 E(32554): 1.2e-14 Smith-Waterman score: 382; 28.6% identity (60.9% similar) in 297 aa overlap (568-849:615-901) 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 IDQGGGFRDSLADMSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARDMYVPNPSCRDFAK .:...:. :. . :: ::. .. CCDS50 RFHGEEGMGQGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSAD-GTTFQPNSNSYV-NPDHLNY-- 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 YEWIGQLMGAALRGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWSKDFPAVDSVLVKLLEVMEGMDK ... ::..: :: .... . . .:.. : :.. .: ..: .: :. . .:. CCDS50 FRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNY-QDVASIDPEYAKNLQWI--LDN 650 660 670 680 690 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ETFEFKFGKELTF---TTVLSDQQVVELIPGGAGIVVGYGDRSRFIQLVQKARLEES-KE . . .: :::: : :.. .. : : :::..:.: .......::: . :. .. . CCDS50 DISD--LGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQP 700 710 720 730 740 750 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 QVAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKKVCGDPEVTV-DALRKLTRFEDFEPSDSRVQY :. :. :. .: ....:. ::: . : ::. : : ... .: : .:. CCDS50 QINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQW 760 770 780 790 800 810 780 790 800 810 820 pF1KE3 FWEALNNFTNEDRSRFLRFVTGRSRLP----ARIYIYPDKLGYE------TTDALPESST :::.....:.:.: .:.:::: ::.: : :. .. : . :: ::: CCDS50 FWEVVEDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSST 820 830 840 850 860 870 830 840 850 860 pF1KE3 CSSTLFLPHYASAKVCEEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE : . : ::.: : .. ...: .: .: CCDS50 CINMLKLPEYPSKEILKDRL-LVALHCGSYGYTMA 880 890 900 >>CCDS4890.1 CUL9 gene_id:23113|Hs108|chr6 (2517 aa) initn: 310 init1: 207 opt: 321 Z-score: 353.8 bits: 78.1 E(32554): 2.2e-13 Smith-Waterman score: 330; 24.7% identity (51.0% similar) in 469 aa overlap (245-701:1171-1579) 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 TYECDEDLIHFLYDHLGKEDENLGSVKQYVESIDVSSYTEEFNVSCLTDSNADTYWESDG :...::: . .: ::: : :::::.: CCDS48 HQPINIPFFDVFLRHLCQGSSVEVKEDKCWEKVEVSS--NPHRASKLTDHNPKTYWESNG 1150 1160 1170 1180 1190 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 SQCQHWVRLTMKKGTIVKKLLLTVDTTDDNFMPKRVVVYGGEGDNL--KKLSDVSIDETL : .:.. : :..:..:..: : : . :...:: ::::.::.. . .:. :.. . CCDS48 STGSHYITLHMHRGVLVRQLTLLVASEDSSYMPARVVVFGGDSTSCIGTELNTVNVMPS- 1200 1210 1220 1230 1240 1250 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 IGDVCVLEDMTVHLPIIEIRIVECRDDGIDVRLRGVKIKSSRQRELGLNADLFQPTSLVR . : .::... :::.::: .:.. :::.:.:::.. :: : : : : CCDS48 ASRVILLENLNRFWPIIQIRIKRCQQGGIDTRVRGVEV-------LG-PKPTFWP--LFR 1260 1270 1280 1290 1300 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 YPRLEGTDPEVLYRRAVLLQRFIKILDSVLHHLVPAWDHTLGTFSEIKQVKQFLLLSRQR : : ::. : : : . ::.. .. .. ...: : CCDS48 ---------EQLCRRTCL---FYTIR-------AQAWSRDIA-----EDHRRLLQLC--- 1310 1320 1330 1340 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 PGLVAQCLRDSESSKPSFMPRLYINRRLAMEHRACPSRDPACKNAVFTQVYEGLKPSDKY : : . :: .. :.: . .: . .: .:. . . ... : CCDS48 PRL-NRVLRHEQNFADRFLP----------DDEAAQALGKTCWEALVSPLVQNITSPDA- 1350 1360 1370 1380 520 530 540 550 560 pF1KE3 EKPLDYRWPMRYDQWWECKFIAEGIIDQGGGFRDSLADMSEELC---PSSADTPVPLPFF : : . ::. : . ... ......: . . . . : : . .: : CCDS48 EGVSALGWLL--DQYLEQRETSRNPLSRAASFASRVRRLCHLLVHVEPPPGPSPEPSTRP 1390 1400 1410 1420 1430 1440 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 VRTANQGNGTGEARDMYVPNPSCRDFAK------YEWIGQLMGAALRGKEFLVLALPGFV ..: . : . .:. : :.... : ......:: :. .:. . CCDS48 FSKNSKGRDRSPAPSPVLPSSSLRNITQCWLSVVQEQVSRFLAAAWRAPDFVPRYCKLYE 1450 1460 1470 1480 1490 1500 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 WKQLSGEEVSWSKDFPAVDSVLVKLLEVMEG-MDKETFEFKFGKELTFTTVLSDQQVVEL : .: :. : . .. : . : . ...: :. . :::. CCDS48 HLQRAGSEL-----FGPRAAFMLALRSGFSGALLQQSFLTAAHMSEQFARYI-DQQIQGG 1510 1520 1530 1540 1550 1560 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 IPGGAGIVVGYGDRSRFIQLVQKARLEESKEQVAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKK . ::: : :. .: .. CCDS48 LIGGAPGVEMLGQLQRHLEPIMVLSGLELATTFEHFYQHYMADRLLSFGSSWLEGAVLEQ 1570 1580 1590 1600 1610 1620 >>CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (852 aa) initn: 187 init1: 100 opt: 312 Z-score: 350.9 bits: 76.0 E(32554): 3.2e-13 Smith-Waterman score: 312; 27.4% identity (62.4% similar) in 274 aa overlap (581-842:571-839) 560 570 580 590 600 pF1KE3 MSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARDMYVPNPSCRDF-AKYEWIGQLMGAAL :. .. ::: . ... :: ..: :. CCDS32 GVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAI 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 RGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWSKDF----PAVDSVLVKLLEVMEGMDKETFEFKFG .. .: . .: :...: :.. .. .:. :.. . : ::: .:: .. . . : CCDS32 YNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTF-RDLGDSHPVLYQSLKDLLE-YEGNVEDDMMITF- 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 KELTFTTVLSDQQVVELIPGGAGIVVGYGDRSRFIQLVQKARLEESKE-QVAAMQAGLLK ... : .... .. .: .: : . .:..:..: . :..: : : :.. :. CCDS32 -QISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHM 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 VVPQAVLD-LLTWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDSR-VQYFWEALNNFTN :. .. : :. .:.: .::. .. .::.. :... :: .. ::: ...::. CCDS32 VTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTD 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 pF1KE3 EDRSRFLRFVTGRSRLPA----RIYIYPDKLGYETTDALPESSTCSSTLFLPHYASAKVC :.. ::.:.:: .: :. .. . : : .: . :: : :: ..:.::.:.: . 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CCDS45 -QISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHM 680 690 700 710 720 730 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 VVPQAVLD-LLTWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDSR-VQYFWEALNNFTN :. .. : :. .:.: .::. .. .::.. :... :: .. ::: ...::. CCDS45 VTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTD 740 750 760 770 780 790 790 800 810 820 830 pF1KE3 EDRSRFLRFVTGRSRLPA----RIYIYPDKLGYETTDALPESSTCSSTLFLPHYASAKVC :.. ::.:.:: .: :. .. . : : .: . :: : :: ..:.::.:.: . CCDS45 EQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDT-ERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKL 800 810 820 830 840 850 840 850 860 pF1KE3 EEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE .:.: CCDS45 KERLLKAITYAKGFGML 860 870 >>CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (875 aa) initn: 187 init1: 100 opt: 312 Z-score: 350.7 bits: 76.0 E(32554): 3.3e-13 Smith-Waterman score: 312; 27.4% identity (62.4% similar) in 274 aa overlap (581-842:594-862) 560 570 580 590 600 pF1KE3 MSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARDMYVPNPSCRDF-AKYEWIGQLMGAAL :. .. ::: . ... :: ..: :. CCDS45 GVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAI 570 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 RGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWSKDF----PAVDSVLVKLLEVMEGMDKETFEFKFG .. .: . .: :...: :.. .. .:. :.. . : ::: .:: .. . . : CCDS45 YNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTF-RDLGDSHPVLYQSLKDLLE-YEGNVEDDMMITF- 630 640 650 660 670 680 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 KELTFTTVLSDQQVVELIPGGAGIVVGYGDRSRFIQLVQKARLEESKE-QVAAMQAGLLK ... : .... .. .: .: : . .:..:..: . :..: : : :.. :. CCDS45 -QISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHM 690 700 710 720 730 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 VVPQAVLD-LLTWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDSR-VQYFWEALNNFTN :. .. : :. .:.: .::. .. .::.. :... :: .. ::: ...::. CCDS45 VTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTD 740 750 760 770 780 790 790 800 810 820 830 pF1KE3 EDRSRFLRFVTGRSRLPA----RIYIYPDKLGYETTDALPESSTCSSTLFLPHYASAKVC :.. ::.:.:: .: :. .. . : : .: . :: : :: ..:.::.:.: . CCDS45 EQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDT-ERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKL 800 810 820 830 840 850 840 850 860 pF1KE3 EEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE .:.: CCDS45 KERLLKAITYAKGFGML 860 870 861 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:24:36 2016 done: Mon Nov 7 17:24:36 2016 Total Scan time: 3.800 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]