FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4244, 909 aa 1>>>pF1KE4244 909 - 909 aa - 909 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6178+/-0.00143; mu= 2.1364+/- 0.084 mean_var=353.5856+/-77.721, 0's: 0 Z-trim(109.6): 875 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.068207 statistics sampled from 10059 (11005) to 10059 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16 Scan time: 3.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS30960.1 ZBTB41 gene_id:360023|Hs108|chr1 ( 909) 6292 634.5 2.6e-181 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 738 88.2 1.1e-16 CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 725 86.6 1.8e-16 CCDS75188.1 PRDM5 gene_id:11107|Hs108|chr4 ( 599) 703 84.4 7.1e-16 CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 698 83.9 9.9e-16 CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 700 84.2 1.1e-15 CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 698 83.9 1.1e-15 CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 698 83.9 1.1e-15 CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 690 83.1 1.7e-15 CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 690 83.1 1.7e-15 CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19 ( 412) 686 82.5 1.8e-15 CCDS3716.1 PRDM5 gene_id:11107|Hs108|chr4 ( 630) 686 82.7 2.3e-15 CCDS33132.2 ZNF749 gene_id:388567|Hs108|chr19 ( 778) 679 82.1 4.3e-15 CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 669 81.1 7.9e-15 CCDS61813.1 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 386) 663 80.2 8.2e-15 CCDS61814.1 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 643) 663 80.5 1.1e-14 CCDS10493.2 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 780) 663 80.6 1.3e-14 CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19 ( 670) 660 80.2 1.4e-14 CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 647 78.7 2.7e-14 CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 647 78.7 2.8e-14 CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 648 78.9 2.8e-14 CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 647 78.8 2.9e-14 CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 647 78.8 2.9e-14 CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 647 78.8 2.9e-14 CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 647 78.8 2.9e-14 CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 648 79.0 3e-14 CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 646 78.8 3.6e-14 CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 645 78.7 3.8e-14 CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 644 78.5 3.9e-14 CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 646 78.8 3.9e-14 CCDS41300.1 ZSCAN20 gene_id:7579|Hs108|chr1 (1043) 649 79.3 4.1e-14 CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 642 78.4 4.6e-14 CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 641 78.2 4.7e-14 CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 638 77.9 5.6e-14 CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 638 77.9 5.7e-14 CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 638 77.9 5.8e-14 CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 494) 636 77.7 6.1e-14 CCDS46990.1 ZNF732 gene_id:654254|Hs108|chr4 ( 585) 637 77.9 6.3e-14 CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 627) 636 77.8 7.1e-14 CCDS84.1 ZBTB48 gene_id:3104|Hs108|chr1 ( 688) 636 77.8 7.5e-14 CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 638 78.2 7.9e-14 CCDS32797.1 ZNF519 gene_id:162655|Hs108|chr18 ( 540) 633 77.4 7.9e-14 CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 638 78.2 7.9e-14 CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 627 76.8 1.1e-13 CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 632 77.6 1.2e-13 CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 627 76.8 1.2e-13 CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 627 76.9 1.2e-13 CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 627 76.9 1.2e-13 CCDS54214.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19 ( 481) 625 76.6 1.3e-13 CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 622 76.1 1.3e-13 >>CCDS30960.1 ZBTB41 gene_id:360023|Hs108|chr1 (909 aa) initn: 6292 init1: 6292 opt: 6292 Z-score: 3368.6 bits: 634.5 E(32554): 2.6e-181 Smith-Waterman score: 6292; 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CCDS12 ------TGEQPFRCAECGQSFRQRSNLLQHQRIHGDPPGPGAKPPAPPGAPEPPGPFPCS 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 YCEEHFKSRFARLKHQEKFHLGP--FPCDICGRQFNDTGNLKRHIECTHGGKRKWTCFIC :.: : : . :.:: : : : : ::..:. . : .: . .:.:.: ..: : CCDS12 ECRESFARRAVLLEHQA-VHTGDKSFGCVECGERFGRRSVLLQHRR-VHSGERPFACAEC 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 GKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHLRVHHDDKRYECDECGKTF :.: :.:..: .: :::.::.: :. ::..::. . ::::: .: . : :::. : CCDS12 GQSFRQRSNLTQHRRIHTGERPFACAECGKAFRQRPTLTQHLRVHTGEKPFACPECGQRF 550 560 570 580 590 600 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 IRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVWQKYKATFHQCDV .. .::.:.. :.::: ..: ::: : . ..:: : . .: ::. . : CCDS12 SQRLKLTRHQRTHTGEKPYHCGECGLGFTQVSRLTEHQR-IHTGERPFA--------CPE 610 620 630 640 650 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 CKKIFKGKSSLEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKHLVIHSDARPFNCQHCNAT : . :. ...: .: : :.::.:: : :...:: . :::.:: : .:: :: :. CCDS12 CGQSFRQHANLTQHRRIHTGERPYACPECGKAFRQRPTLTQHLRTHRREKPFACQDCGRR 660 670 680 690 700 710 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 FKRKDKLKYHIDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSDDKIFQTETKQYMDQPKVYQ :... :: : ..:: CCDS12 FHQSTKLIQH-QRVHSAE 720 730 >>CCDS75188.1 PRDM5 gene_id:11107|Hs108|chr4 (599 aa) initn: 668 init1: 325 opt: 703 Z-score: 398.5 bits: 84.4 E(32554): 7.1e-16 Smith-Waterman score: 838; 31.3% identity (58.0% similar) in 486 aa overlap (300-749:126-596) 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 EQESGDGSDNLNQENFDKEKSDRNDSEDPGSEYNAEEDELEEEMSDEYSDIEE---QS-- :...:::.: . . ...:. :: CCDS75 LAAIQEGENIFYLAVEDIETDTELLIGYLDSDMEAEEEEQQIMTVIKEGEVENSRRQSTA 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 pF1KE4 -EKDHNDAEEE---PEAGDSVGN---VHEGLTPVVIQNSNKKILQCPKCDKTFDRIG--- .::. .:. :. .: . . : : . . ...: ..: .: : : CCDS75 GRKDRLGCKEDYACPQCESSFTSEDILAEHLQTLHQKPTEEKEFKCKNCGKKFPVKQALQ 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 -KYESHTRVHTGEKPFEC--DICHQRYSTKSNLTVHRKK-HSNETEFHKKEHKCPYCNKL ..:.: .. :. : : : : .: ..:. : :... :... ::. : ::: CCDS75 RHFEQHQETCRGDARFVCKADSCGKRLKSKDALKRHQENVHTGDP---KKKLICSVCNKK 220 230 240 250 260 270 440 450 460 470 pF1KE4 HASKKTLAKHVKRFHP-----ENAQEFISIKKTK------SES--WKCDICKKSFTRRPH .: ..: .: ...: : ..::: .. : ::. ..:.::.::: : . CCDS75 CSSASSLQEH-RKIHEIFDCQECMKKFISANQLKRHMITHSEKRPYNCEICNKSFKRLDQ 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 LEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLG--PFPCDICGRQFNDTGNLKR . : ..::.:::.:: : . : : . :...: : :: :. : : .:.: CCDS75 VGAHKVIHSEDKPYKCKLCGKGFAHRNVY-KNHKKTHSEERPFQCEECKALFRTPFSLQR 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 HIECTHGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRI-HSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHL :. :...: . : : . ... ::. :... : .: . : .:...: : : : CCDS75 HL-LIHNSERTFKCHHCDATFKRKDTLNVHVQVVHERHKKYRCELCNKAFVTPSVLRSHK 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 RVHHDDKRYECDECGKTFIRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVH ..: .:. : ::. : : : . :.::. .:: : : :.. : : .: .. : CCDS75 KTHTGEKEKICPYCGQKFASSGTLRVHIRSHTGERPYQCPYCEKGFSKNDGLKMHIRT-H 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 LGEKVWQKYKATFHQCDVCKKIFKGKSSLEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKH :: :: :. :.: :. : .:. : :::.::::..:..:. .: .:: : .: CCDS75 TREK---PYK-----CSECSKAFSQKRGLDEHKRTHTGEKPFQCDVCDLAFSLKKMLIRH 510 520 530 540 550 560 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 LVIHSDARPF-NCQHCNATFKRKDKLKYHIDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSD . :. ::. .:: :. : :.: :: :.:..: . 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CCDS64 RTHTGE-----RPYPCKECGKAFSQSSTLAQH-QRMHTGEKAQILKASDSPSLVAHQRIH 260 270 280 290 300 310 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 S--ESWKCDICKKSFTRRPHLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLG- . . .::: : :.: .: .:...:. .::.::. : . : ..:: . : : CCDS64 AVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQ-RTHTGE 320 330 340 350 360 370 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 -PFPCDICGRQFNDTGNLKRHIECTHGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPH :: :: ::. : . ..: .: . : :.. ..: :::. . ..: : :::.::::. CCDS64 KPFKCDECGKGFVQGSHLIQH-QRIHTGEKPYVCNDCGKAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPY 380 390 400 410 420 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 LCSICGQSFRHGSSYRLHLRVHHDDKRYECDECGKTFIRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEE : ::..: ... .: ::: .. :.:.::::.: ... : .:. ::.: : ..: : CCDS64 ECLQCGKAFSMSTQLTIHQRVHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQIIHAGVKPYECSE 430 440 450 460 470 480 640 650 660 670 pF1KE4 CGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVWQKYK-----ATF------------HQCDVCKKIFK ::: :.: ..: : . .: . . .: .:: :::. :.:::. CCDS64 CGKAFSRSSYLIEHQR-IHTRAQWFYEYGNALEGSTFVSRKKVNTIKKLHQCEDCEKIFR 490 500 510 520 530 540 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 GKSSLEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKHLVIHSDARPFNCQHCNATFKRKDK .: : .: : :.:::::::. :...: .. ::.: :: CCDS64 WRSHLIIHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFNRSSRLTQHQKIHMG 550 560 570 580 590 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 LKYHIDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSDDKIFQTETKQYMDQPKVYQSEAKTM >>CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 (807 aa) initn: 1518 init1: 423 opt: 700 Z-score: 395.3 bits: 84.2 E(32554): 1.1e-15 Smith-Waterman score: 933; 29.5% identity (57.1% similar) in 597 aa overlap (229-784:98-680) 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 LTGRLSNNHQCKFCSRHFCYKKSLENHLAKTHRSLLLGK----KHGLKMLERSFSARRSK .:: . :. : :: .. . .. CCDS42 EMHIIPQKAIVGEIGHGCNEGEKILSAGESSHRYEVSGQNFKQKSGLTEHQKIHNINKTY 70 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 RNRKCPVKFDDTSDD--EQESGDGSDNLNQENFDKEKSDRNDSEDPGSEYNAEEDELEEE . ..: :. .:. .:. :. .. :.... .. ..... . .: CCDS42 ECKECEKTFNRSSNLIIHQRIHTGNKPYVCNECGKDSNQSSNLIIHQRIHTGKKPYICHE 130 140 150 160 170 180 320 330 340 350 360 pF1KE4 MSDEYSDIEEQSEKDHNDAEEEPEAGDSVGNVHEGLTPVVIQ---NSNKKILQCPKCDKT . .... . .. . . .: :.. .: . .:.. .: : : :: :. CCDS42 CGKDFNQSSNLVRHKQIHSGGNPYECKECGKAFKGSSNLVLHQRIHSRGKPYLCNKCGKA 190 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 FDRIGKYESHTRVHTGEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHSNETEFHKKEHKCPYCNK :.. : :.::::::.:: : : .: .:.:. :.. :..: : :: :.: CCDS42 FSQSTDLIIHHRIHTGEKPYECYDCGQMFSQSSHLVPHQRIHTGE-----KPLKCNECEK 250 260 270 280 290 300 430 440 450 460 470 pF1KE4 LHASKKTLAKHVKRFHP-ENAQEFISIKKTKS------------ESWKCDICKKSFTRRP ... :..: .:.: :. : :: : . : . :.:.:.. CCDS42 AFRQHSHLTEH-QRLHSGEKPYECHRCGKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEECEKTFSKDE 310 320 330 340 350 360 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 HLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLG--PFPCDICGRQFNDTGNLK .:.:.. .:...: . :. : ..:.. ..:: : : :. : ::. ::....: CCDS42 ELREEQRIHQEEKAYWCNQCGRNFQGTSDLIRHQVT-HTGEKPYECKECGKTFNQSSDLL 370 380 390 400 410 420 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 RHIECTHGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHL :: . :.:.. .: :::: : . : .: :.:.::::. :: ::..: . : : CCDS42 RH-HRIHSGEKPCVCSKCGKSFRGSSDLIRHHRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLVTHQ 430 440 450 460 470 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 RVHHDDKRYECDECGKTFIRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVH ..: .: :.: ::::.: :.. : .:..:::::: ..:.:::: : : . : .:.: CCDS42 KIHTGEKPYQCTECGKAFRRRSLLIQHRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKH-QSLH 480 490 500 510 520 530 660 670 680 690 pF1KE4 LGEKVW--------------QKY--KATFHQCDVCKKIFKGKSSLEMHFRTHSGEKPYKC :::. :: .: . :. : . :.:.:.: : ::. ::::.: CCDS42 TGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKAYWCNQCGRAFQGSSDLIRHQVTHTREKPYEC 540 550 560 570 580 590 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 QICNQSFRIKKTLTKHLVIHSDARPFNCQHCNATFKRKDKLKYHIDHVHEIKSPDDPLST . :...: .. : .: ::: .:. :..:. .:. .. : : :.:.. . : CCDS42 KECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPYVCNKCGKSFRGSSDLIKH----HRIHTGEKPYEC 600 610 620 630 640 650 760 770 780 790 800 810 pF1KE4 SEE-KLVSLPVEYSSDDKIFQTETKQYMDQPKVYQSEAKTMLQNVSAEVCVPVTLVPVQM :: : : . .. .:: .: : : CCDS42 SECGKAFSQRSHLATHQKI-HTGEKPYQCSECGNAFRRRSLLIQHRRLHSGEKPYECKEC 660 670 680 690 700 710 >>CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 (686 aa) initn: 1119 init1: 443 opt: 698 Z-score: 395.1 bits: 83.9 E(32554): 1.1e-15 Smith-Waterman score: 896; 33.3% identity (61.6% similar) in 430 aa overlap (323-718:267-684) 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NDSEDPGSEYNAEEDELEEEMSDEYSDIEEQSEKDHNDAEEEPEAGDSVGNVHEGLTPVV : .. :. :.: :.. . :. . CCDS64 QGKHTNNCHGEKPYECAECGKVFRLCSQLNQHQRIHTG--EKPFKCTECGKAFR-LSSKL 240 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 pF1KE4 IQN----SNKKILQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHTGEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHR ::. ...: .: .: :.: . .. : :.::::.:. : : . .: .:.:. :. CCDS64 IQHQRIHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRECGKAFSQQSQLVRHQ 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 pF1KE4 KKHSNETEFHKKEHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRFHP-ENAQ--------EFISIKKTK . :..: . . : :.: ....:::.: .:.: :.:: ... .. . CCDS64 RTHTGE-----RPYPCKECGKAFSQSSTLAQH-QRMHTGEKAQILKASDSPSLVAHQRIH 360 370 380 390 400 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 S--ESWKCDICKKSFTRRPHLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLG- . . .::: : :.: .: .:...:. .::.::. : . : ..:: . : : CCDS64 AVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQ-RTHTGE 410 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 -PFPCDICGRQFNDTGNLKRHIECTHGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPH :: :: ::. : . ..: .: . : :.. ..: :::. . ..: : :::.::::. 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