Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3306
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3306, 770 aa
  1>>>pF1KE3306 770 - 770 aa - 770 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.8065+/-0.00138; mu= -26.8590+/- 0.083
 mean_var=778.2287+/-164.198, 0's: 0 Z-trim(114.2): 374  B-trim: 104 in 1/54
 Lambda= 0.045975
 statistics sampled from 14380 (14754) to 14380 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.453), width:  16
 Scan time:  2.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 770) 5048 350.8 4.9e-96
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 780) 4376 306.2 1.3e-82
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 782) 4374 306.1 1.4e-82
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 748) 4365 305.5 2.1e-82
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 779) 4137 290.4 7.6e-78
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 795) 3657 258.5   3e-68
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 783) 3633 256.9 8.8e-68
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 360) 1224 96.9 6.3e-20
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 272)  974 80.2 5.1e-15
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  912 76.1 9.5e-14
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298)  905 75.6 1.3e-13
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297)  834 70.9 3.4e-12
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  827 70.5 5.2e-12
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  814 69.6 9.4e-12
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 292)  809 69.2   1e-11
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523)  808 69.4 1.7e-11
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523)  804 69.1   2e-11
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496)  793 68.4 3.2e-11
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502)  793 68.4 3.2e-11
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570)  793 68.4 3.6e-11
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7            ( 326)  784 67.6 3.6e-11
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 423)  773 67.0 7.2e-11
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7           ( 451)  773 67.0 7.5e-11
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 469)  773 67.0 7.7e-11


>>CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1            (770 aa)
 initn: 5048 init1: 5048 opt: 5048  Z-score: 1837.7  bits: 350.8 E(32554): 4.9e-96
Smith-Waterman score: 5048; 99.2% identity (99.6% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-770)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS44 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKWKHARVKEREHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKWKHARVKEREHE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQQKEQREQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQQKEQREQK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 ERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFELGDGRKPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFELGDGRKPV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 KEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 EEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESRFDRDSRESE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS44 EEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESRFDRDSGESE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 EAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 EGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 GSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 SNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 CIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLR
       :::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS44 CIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHPYNNLR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 KRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770
pF1KE3 RVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
              730       740       750       760       770

>>CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1            (780 aa)
 initn: 4330 init1: 4330 opt: 4376  Z-score: 1596.7  bits: 306.2 E(32554): 1.3e-82
Smith-Waterman score: 5000; 97.8% identity (98.2% similar) in 780 aa overlap (1-770:1-780)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS44 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                 110
pF1KE3 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEK----------WK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           :
CCDS44 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKCRHHSHSAEGGK
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KE3 HARVKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HARVKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMR
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KE3 EQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRER
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KE3 FELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEE
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KE3 EGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPES
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390       400       410
pF1KE3 RFDRDSRESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSV
       :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSV
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KE3 EEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHP
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500       510       520       530
pF1KE3 NIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHD
              490       500       510       520       530       540

              540       550       560       570       580       590
pF1KE3 NWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS44 NWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEY
              550       560       570       580       590       600

              600       610       620       630       640       650
pF1KE3 STAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMT
       :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::.:::::
CCDS44 STAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMT
              610       620       630       640       650       660

              660       670       680       690       700       710
pF1KE3 FSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMF
              670       680       690       700       710       720

              720       730       740       750       760       770
pF1KE3 PTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
              730       740       750       760       770       780

>>CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1               (782 aa)
 initn: 4346 init1: 4346 opt: 4374  Z-score: 1596.0  bits: 306.1 E(32554): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 5008; 98.0% identity (98.1% similar) in 782 aa overlap (1-770:1-782)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                 110
pF1KE3 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKW----------K
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::           :
CCDS72 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
               70        80        90       100       110       120

                120       130       140       150       160        
pF1KE3 HARVKE--REHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
       ::::::  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
              130       140       150       160       170       180

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE3 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
              190       200       210       220       230       240

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE3 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
              250       260       270       280       290       300

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE3 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
              310       320       330       340       350       360

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE3 ESRFDRDSRESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCR
       :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS72 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCR
              370       380       390       400       410       420

      410       420       430       440       450       460        
pF1KE3 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
              430       440       450       460       470       480

      470       480       490       500       510       520        
pF1KE3 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
              490       500       510       520       530       540

      530       540       550       560       570       580        
pF1KE3 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAK
              550       560       570       580       590       600

      590       600       610       620       630       640        
pF1KE3 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKK
              610       620       630       640       650       660

      650       660       670       680       690       700        
pF1KE3 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
              670       680       690       700       710       720

      710       720       730       740       750       760        
pF1KE3 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
              730       740       750       760       770       780

      770
pF1KE3 KF
       ::
CCDS72 KF
         

>>CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1               (748 aa)
 initn: 4346 init1: 4346 opt: 4365  Z-score: 1593.0  bits: 305.5 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 4774; 97.5% identity (98.0% similar) in 748 aa overlap (35-770:1-748)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE3 KDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEITIRN
                                     ...:::::::::::::::::::::::::::
CCDS72                               MSQSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEITIRN
                                             10        20        30

           70        80        90       100                 110    
pF1KE3 SPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKW----------KHARV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::           :::::
CCDS72 SPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGKHARV
               40        50        60        70        80        90

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE3 KE--REHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQ
       ::  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQ
              100       110       120       130       140       150

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE3 QKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFE
              160       170       180       190       200       210

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE3 LGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEEG
              220       230       240       250       260       270

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE3 STSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 STSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESRF
              280       290       300       310       320       330

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE3 DRDSRESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEE
       :::: ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS72 DRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEE
              340       350       360       370       380       390

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE3 FQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNI
              400       410       420       430       440       450

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE3 VTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNW
              460       470       480       490       500       510

            540       550       560       570       580       590  
pF1KE3 ILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYST
              520       530       540       550       560       570

            600       610       620       630       640       650  
pF1KE3 AVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFS
              580       590       600       610       620       630

            660       670       680       690       700       710  
pF1KE3 EHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPT
              640       650       660       670       680       690

            720       730       740       750       760       770
pF1KE3 WPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 WPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
              700       710       720       730       740        

>>CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1            (779 aa)
 initn: 4092 init1: 4092 opt: 4137  Z-score: 1511.0  bits: 290.4 E(32554): 7.6e-78
Smith-Waterman score: 5020; 98.1% identity (98.5% similar) in 779 aa overlap (1-770:1-779)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS81 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKWKHARVKEREHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKWKHARVKEREHE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150                160       170 
pF1KE3 RRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRER---------DRLEQLERKRERERKMRE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::         ::::::::::::::::::
CCDS81 RRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERGNDGVCLFRDRLEQLERKRERERKMRE
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE3 QQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERF
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE3 ELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEE
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE3 GSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESR
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE3 FDRDSRESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVE
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVE
              370       380       390       400       410       420

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE3 EFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPN
              430       440       450       460       470       480

             480       490       500       510       520       530 
pF1KE3 IVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDN
              490       500       510       520       530       540

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE3 WILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS81 WILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYS
              550       560       570       580       590       600

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE3 TAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTF
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::.::::::
CCDS81 TAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTF
              610       620       630       640       650       660

             660       670       680       690       700       710 
pF1KE3 SEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFP
              670       680       690       700       710       720

             720       730       740       750       760       770
pF1KE3 TWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
              730       740       750       760       770         

>>CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1               (795 aa)
 initn: 3451 init1: 3451 opt: 3657  Z-score: 1338.9  bits: 258.5 E(32554): 3e-68
Smith-Waterman score: 4968; 96.2% identity (96.5% similar) in 795 aa overlap (1-770:1-795)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                 110
pF1KE3 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKW----------K
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::           :
CCDS72 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
               70        80        90       100       110       120

                120       130       140       150       160        
pF1KE3 HARVKE--REHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
       ::::::  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
              130       140       150       160       170       180

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE3 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
              190       200       210       220       230       240

      230                    240       250       260       270     
pF1KE3 ERFELGDGRKP-------------VKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESG
       :::::::::::             .:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERFELGDGRKPGEARPAPAQKPAQLKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESG
              250       260       270       280       290       300

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE3 SGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSED
              310       320       330       340       350       360

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE3 EERENENHLLVVPESRFDRDSRESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQ
       ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS72 EERENENHLLVVPESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQ
              370       380       390       400       410       420

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE3 ELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPI
              430       440       450       460       470       480

         460       470       480       490       500       510     
pF1KE3 TSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVK
              490       500       510       520       530       540

         520       530       540       550       560       570     
pF1KE3 TLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVT
              550       560       570       580       590       600

         580       590       600       610       620       630     
pF1KE3 LWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEK
              610       620       630       640       650       660

         640       650       660       670       680       690     
pF1KE3 IWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKH
              670       680       690       700       710       720

         700       710       720       730       740       750     
pF1KE3 EYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTT
              730       740       750       760       770       780

         760       770
pF1KE3 NQGASAAGPGFSLKF
       :::::::::::::::
CCDS72 NQGASAAGPGFSLKF
              790     

>>CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1            (783 aa)
 initn: 3435 init1: 3435 opt: 3633  Z-score: 1330.3  bits: 256.9 E(32554): 8.8e-68
Smith-Waterman score: 5008; 97.4% identity (98.0% similar) in 783 aa overlap (1-770:1-783)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS81 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKWKHARVKEREHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKWKHARVKEREHE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQQKEQREQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQQKEQREQK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE3 ERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFELGDGRKP-
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS81 ERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFELGDGRKPG
              190       200       210       220       230       240

                 240       250       260       270       280       
pF1KE3 ------------VKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEE
                   .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EARPAPAQKPAQLKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEE
              250       260       270       280       290       300

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE3 EEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVV
              310       320       330       340       350       360

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE3 PESRFDRDSRESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGC
       ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGC
              370       380       390       400       410       420

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE3 RSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKA
              430       440       450       460       470       480

       470       480       490       500       510       520       
pF1KE3 QHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKH
              490       500       510       520       530       540

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE3 LHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS81 LHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGA
              550       560       570       580       590       600

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE3 KEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVK
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::.::
CCDS81 KEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVK
              610       620       630       640       650       660

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE3 KMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDP
              670       680       690       700       710       720

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE3 SMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFS
              730       740       750       760       770       780

       770
pF1KE3 LKF
       :::
CCDS81 LKF
          

>>CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16              (360 aa)
 initn: 1185 init1: 1085 opt: 1224  Z-score: 471.2  bits: 96.9 E(32554): 6.3e-20
Smith-Waterman score: 1224; 53.8% identity (82.3% similar) in 327 aa overlap (407-733:33-353)

        380       390       400       410       420       430      
pF1KE3 TEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTD
                                     ::::.::. :::: :::::.::::.: .::
CCDS10 EPDLECEQIRLKCIRKEGFFTVPPEHRLGRCRSVKEFEKLNRIGEGTYGIVYRARDTQTD
             10        20        30        40        50        60  

        440       450       460       470       480       490      
pF1KE3 EIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEH
       ::::::...:.:::.:.::.:::::. .:. .::::: ..:.:::.....:..::.: :.
CCDS10 EIVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQ
             70        80        90       100       110       120  

        500       510       520       530       540       550      
pF1KE3 DLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDF
       :: ::.:.:  ::  ..:: ...:.:::...:: :.:.:::::.::::..  : .:..::
CCDS10 DLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADF
            130       140       150       160       170       180  

        560       570       580       590       600       610      
pF1KE3 GLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGK
       :::: :: :.: .:: ::::::::::::::.   .:..:::.::::..:::...::.:: 
CCDS10 GLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSIDMWAVGCILAELLAHRPLLPGT
            190       200       210       220       230       240  

        620       630       640       650       660       670      
pF1KE3 SEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMN
       ::: ::. . . ::::::.::::.:.:: : .... ..:::::...:   ::. :. :..
CCDS10 SEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQPYNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH
            250       260       270       280        290       300 

        680       690       700       710       720       730      
pF1KE3 KFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLG
        .. : : .: .: : :.  ::.: ::: .: ..::.:    ..: ::. .:   ::   
CCDS10 FLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP----HHRNKRA-APATSEGQSK
             310       320       330           340        350      

        740       750       760       770
pF1KE3 YSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
                                         
CCDS10 RCKP                              
        360                              

>>CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16              (272 aa)
 initn: 938 init1: 883 opt: 974  Z-score: 383.2  bits: 80.2 E(32554): 5.1e-15
Smith-Waterman score: 974; 53.1% identity (82.4% similar) in 262 aa overlap (446-705:1-261)

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE3 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV
                                     :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: .
CCDS32                               MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL
                                             10        20        30

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE3 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH
       .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.:  ::  ..:: ...:.:::...:: :.:.:
CCDS32 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH
               40        50        60        70        80        90

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE3 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVD
       ::::.::::..  : .:..:::::: :: :.: .:: ::::::::::::::.   .:..:
CCDS32 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID
              100       110       120       130       140       150

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pF1KE3 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHP
       ::.::::..:::...::.:: ::: ::. . . ::::::.::::.:.:: : .... ..:
CCDS32 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP
              160       170       180       190       200       210

         660       670       680       690       700         710   
pF1KE3 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPL--PIDPSMFPTW
       ::::...:   ::. :. :.. .. : : .: .: : :.  ::.: ::  ::        
CCDS32 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLHFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLRLPISGVCEGCR
               220       230       240       250       260         

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pF1KE3 PAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
                                                                
CCDS32 EPG                                                      
     270                                                        

>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17               (305 aa)
 initn: 851 init1: 560 opt: 912  Z-score: 360.3  bits: 76.1 E(32554): 9.5e-14
Smith-Waterman score: 912; 46.6% identity (76.0% similar) in 296 aa overlap (410-704:1-291)

     380       390       400       410       420       430         
pF1KE3 DYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIV
                                     .. :: ...: ::::::::.::...: ..:
CCDS11                               MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLV
                                             10        20        30

     440       450       460       470       480       490         
pF1KE3 ALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLK
       :::..... : :: : :..:::. . . .::::: . ..:   :  :.:.:.... .:::
CCDS11 ALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRLLDVV--HNERKLYLVFEFLSQDLK
               40        50        60        70          80        

     500       510        520       530       540       550        
pF1KE3 SLMETMKQPFLPGE-VKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGL
       . :..     :: . .:. ..:::.::.  :.. ..::::: .:::... : .:..::::
CCDS11 KYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGL
       90       100       110       120       130       140        

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE3 AREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSE
       :: .: ::..::  ::::::::::.:::.: :.::::.::.::::.:..:.: :::: ::
CCDS11 ARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSE
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KE3 IDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKF
       :::. ..:. ::::::  ::: ..::  :  .: .   ..:..    :   .: ::. ..
CCDS11 IDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKG-SFPKWTRKGLEEIVPNL-EPEGRDLLMQL
      210       220       230        240       250        260      

      680       690       700       710       720       730        
pF1KE3 LTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYS
       : : :..::.:. .: : ::  .: :                                  
CCDS11 LQYDPSQRITAKTALAHPYFS-SPEPSPAARQYVLQRFRH                    
        270       280        290       300                         




770 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Mon Nov  7 17:20:45 2016 done: Mon Nov  7 17:20:46 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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