FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4270, 1125 aa 1>>>pF1KE4270 1125 - 1125 aa - 1125 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8222+/-0.00111; mu= -6.4704+/- 0.067 mean_var=383.7001+/-77.990, 0's: 0 Z-trim(114.3): 47 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.065475 statistics sampled from 14841 (14878) to 14841 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16 Scan time: 4.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS72987.1 RC3H1 gene_id:149041|Hs108|chr1 (1125) 7669 739.4 1.1e-212 CCDS30940.1 RC3H1 gene_id:149041|Hs108|chr1 (1133) 7106 686.2 1.1e-196 CCDS48014.1 RC3H2 gene_id:54542|Hs108|chr9 (1064) 2710 271.0 1e-71 CCDS43874.1 RC3H2 gene_id:54542|Hs108|chr9 (1191) 2710 271.0 1.1e-71 >>CCDS72987.1 RC3H1 gene_id:149041|Hs108|chr1 (1125 aa) initn: 7669 init1: 7669 opt: 7669 Z-score: 3932.1 bits: 739.4 E(32554): 1.1e-212 Smith-Waterman score: 7669; 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