FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3471, 1452 aa 1>>>pF1KE3471 1452 - 1452 aa - 1452 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2479+/-0.00109; mu= -5.2446+/- 0.066 mean_var=543.4252+/-117.531, 0's: 0 Z-trim(116.3): 355 B-trim: 1082 in 1/55 Lambda= 0.055018 statistics sampled from 16509 (16948) to 16509 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.521), width: 16 Scan time: 5.820 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 9679 784.4 0 CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 7130 582.1 4.3e-165 CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481) 2806 238.9 8.8e-62 CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490) 2679 228.8 9.5e-59 CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 976 92.9 1.8e-18 CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 686 70.3 2.7e-11 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1222.7 bits: 238.9 E(32554): 8.8e-62 Smith-Waterman score: 3184; 43.3% identity (62.2% similar) in 1519 aa overlap (127-1452:10-1481) 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 RRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVS ..::.:::: :::: . : . . CCDS45 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLV 10 20 30 160 170 180 190 200 pF1KE3 SQ-----SEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRR :. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.: CCDS45 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 pF1KE3 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR .: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. . CCDS45 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR----- . ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:. CCDS45 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP 160 170 180 190 200 210 320 330 340 pF1KE3 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS .::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . : CCDS45 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 pF1KE3 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR ::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. ::: CCDS45 PPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSS 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 pF1KE3 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS ::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.: CCDS45 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 pF1KE3 SLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKA----AEAAAKAAKASNT----------- ::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :. CCDS45 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL 400 410 420 430 440 450 500 510 520 pF1KE3 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE-- :.: :. :::.. :. :. . :::.: .: : CCDS45 EKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIV 460 470 480 490 500 510 530 540 550 pF1KE3 ----------------------HAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATK : :.. .. ::. . . : .. . CCDS45 TPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAF 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 KAVIVGKESK---SAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPL . : ... : :. .: .:: . ...: . ....: . . .: . ::::::::: CCDS45 SQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQANSQPPV-QVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPL 580 590 600 610 620 630 620 630 640 650 660 pF1KE3 PPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK- ::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: : CCDS45 PPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAI 640 650 660 670 680 690 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGE : : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS45 TPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGE 700 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 MVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYL .::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.:::::::::::::: CCDS45 LVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYL 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRG ::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.::::::::::::::::::::: : CCDS45 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSG 820 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 QIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 QIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT 880 890 900 910 920 930 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 KKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPA :::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::. CCDS45 KKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPS 940 950 960 970 980 990 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 AALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQK :::::.:.::.:::::::::::.:: .::.::: ::: ::::: :::::::::::::::. CCDS45 AALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 QMGMT-DDVSTIKAPRKDLSLGL--DDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTDPS : :.. .. :. ::. . : . ....: :. .:... : : . . CCDS45 QSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGD-AIGLADITQQ 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 TPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPK------VETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD :.: . :. .: ... :. .... . :. .. : .: ...: . CCDS45 LNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEP------STPVSGQDDL--IQHQDMRILELTPE---- . .:. . .. . : : :::.. :. : . : :. : . CCDS45 ETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQTTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEEN 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1190 1200 1210 1220 pF1KE3 -------PDRPRILP--P-----DQRPPEPP------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTS :. :: : : ..:::::: :::..: :: : CCDS45 NSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAAEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDL------------S 1240 1250 1260 1270 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE3 SSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAP :. . . .: :::::::. ::. .: . ..:: . .:. : CCDS45 SAPQELNPAVTAALLQLLS--QPEAEPPGHLPHEHQA-------------LRPMEYSTRP 1280 1290 1300 1310 1320 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE3 YVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYG : :....: : : :.. :. ... . . . : . ...: .:.. : CCDS45 R-PNRTYGNTDGPET------GFSAIDT-DERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLG 1330 1340 1350 1360 1370 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE3 DI--YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGG . : ..: . : ::.: :: .. :.:. ..: : :. . :. . ::: CCDS45 ESSSYQGTGSVQFPGDQDLRF--ARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG- 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE3 NLQENPSGPSLMH-GQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY .: . .: : : : .:.:. .:.. ::: . :::::.:: CCDS45 ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY 1440 1450 1460 1470 1480 >>CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490 aa) initn: 2708 init1: 2243 opt: 2679 Z-score: 1168.2 bits: 228.8 E(32554): 9.5e-59 Smith-Waterman score: 3201; 43.4% identity (61.7% similar) in 1549 aa overlap (127-1452:10-1490) 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 RRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVS ..::.:::: :::: . : . . CCDS11 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLV 10 20 30 160 170 180 190 200 pF1KE3 SQ-----SEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRR :. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.: CCDS11 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 pF1KE3 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR .: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. . CCDS11 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR----- . ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:. CCDS11 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP 160 170 180 190 200 210 320 330 340 pF1KE3 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS .::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . : CCDS11 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 pF1KE3 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR ::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. ::: CCDS11 PPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSS 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 pF1KE3 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS ::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.: CCDS11 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 pF1KE3 SLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKA----AEAAAKAAKASNT----------- ::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :. CCDS11 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL 400 410 420 430 440 450 500 510 520 pF1KE3 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE-- :.: :. :::.. :. :. . :::.: .: : CCDS11 EKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIV 460 470 480 490 500 510 530 540 550 pF1KE3 ----------------------HAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATK : :.. .. ::. . . : .. . CCDS11 TPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAF 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 KAVIVGKESK---SAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPL . : ... : :. .: .:: . ...: . ....: . . .: . ::::::::: CCDS11 SQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQANSQPPV-QVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPL 580 590 600 610 620 630 620 630 640 650 660 pF1KE3 PPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK- ::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: : CCDS11 PPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAI 640 650 660 670 680 690 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGE : : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS11 TPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGE 700 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 MVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYL .::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.:::::::::::::: CCDS11 LVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYL 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRG ::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.::::::::::::::::::::: : CCDS11 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSG 820 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 QIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT 880 890 900 910 920 930 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 KKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPA :::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::. CCDS11 KKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPS 940 950 960 970 980 990 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 AALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQK :::::.:.::.:::::::::::.:: .::.::: ::: ::::: :::::::::::::::. CCDS11 AALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 QMGMT-DDVSTIKAPRKDLSLG-----LDDSRTNTPQ---GVLPSSQLKSQGSSNVAPG- : :.. .. :. ::. . : . .: :: : . :. . : .... CCDS11 QSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQQL 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1080 1090 pF1KE3 ------------EKQTDPSTPQ---------------------------------QESSK ..::: : :: :..:. CCDS11 NQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSE 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 PLGGIQ-----PSSQTIQPKVETDAAQAA-----VQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLE .. . ::. .: :..: . .:. .:. .::::.::.:.:. . :: CCDS11 TMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQTTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGS---LE 1180 1190 1200 1210 1220 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE3 ERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRPPEP ::.: .... : : :. : :. : . : :.::::..::::: CCDS11 --ENNSDKNSGPQ-GPRRTPTMP---QE-----------EAAACP--PHILPPEKRPPEP 1230 1240 1250 1260 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 P------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKRE : :::..: :: ::. . . .: :::::::. ::. .: . CCDS11 PGPPPPPPPPPLVEGDL------------SSAPQELNPAVTAALLQLLS--QPEAEPPGH 1270 1280 1290 1300 1310 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE3 GGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLD ..:: . .:. : : :....: : : :.. : CCDS11 LPHEHQA-------------LRPMEYSTRPR-PNRTYGNTDGPET------GFSAIDT-D 1320 1330 1340 1350 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE3 NYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI--YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAV . ... . . . : . ...: .:.. :. : ..: . : ::.: :: .. :.:. CCDS11 ERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRF--ARVPLAL 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE3 LANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMH-GQTWTSPAQGPGYSQG ..: : :. . :. . ::: .: . .: : : : .:.:. .:.. CCDS11 HPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKL 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1440 1450 pF1KE3 YRGHISTSTGRGRGRGLPY ::: . :::::.:: CCDS11 YRGPTRVPPRGGRGRGVPY 1480 1490 >>CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 (372 aa) initn: 961 init1: 361 opt: 976 Z-score: 444.9 bits: 92.9 E(32554): 1.8e-18 Smith-Waterman score: 976; 46.0% identity (74.5% similar) in 337 aa overlap (702-1031:16-349) 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 TQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMV :.:.. .. ::.::.:.:.::: . ::. : CCDS68 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV 10 20 30 40 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVF ::::: ..::::::::::.::::::. : :....:. :: : : ... ::..:::: CCDS68 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF 50 60 70 80 90 100 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 EYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQI .. .::: ::: . ::.:. ..:: :..:..:: : :....::::.: .:.:.. : . CCDS68 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL 110 120 130 140 150 160 860 870 880 890 900 pF1KE3 KLADFGLARLYS-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF ::::::::: .: ...:.: :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:.. CCDS68 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW 170 180 190 200 210 220 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 TKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FV :..::.:.: : :: :::..::: : :::.: . .. .. : .::.... .: CCDS68 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV 230 240 250 260 270 280 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 FIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKK : : :::.: .:.:::..: ...::. .:. : :: . . : . CCDS68 RDPYA-LDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP 290 300 310 320 330 340 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 RRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTD ::. .:. CCDS68 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF 350 360 370 >>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa) initn: 532 init1: 231 opt: 686 Z-score: 316.4 bits: 70.3 E(32554): 2.7e-11 Smith-Waterman score: 691; 26.8% identity (51.4% similar) in 828 aa overlap (650-1452:4-745) 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 KEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSKSPEEKKTATQLHSKRR :: : :.: : : : :. CCDS11 MAEPLKEE--DGEDGSAEPPGPVKAEPAHTA-- 10 20 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 PKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLD .. . . : ...: :...:: ::.:.:: : .:: . ::..::.::. CCDS11 ASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTGQQVAIKKIPNA 30 40 50 60 70 80 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 NEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLM . ..::.:::... :..:: .:.:. .:: . :.:.. :. :: CCDS11 FDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFK----SVYVVLDLMESDLH 90 100 110 120 130 140 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 GLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLA ...:. .. .:.. :. ::..:: : :. . .:::.: ::.:.:. ..:..:::.: CCDS11 QIIHSSQ-PLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKIGDFGMA 150 160 170 180 190 200 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 R-LYSSEESRPY--TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQA : : .: . : :. : : ::: :::.:. ..:: :::.:: :::.::..... .: . CCDS11 RGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLARRQLFPG 210 220 230 240 250 260 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 NQELAQLELISRICGSPCPAVWPDV----IKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAA-- .. . ::.:: . :.: ::: : .. :.... : :. . : :. :.: CCDS11 KNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVR-AYIQSLPP----RQPVPWETVY-PGADR 270 280 290 300 310 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 -ALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLR-----DVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKK ::.:. :: ..:: : .: ::. :: : ::. :: :. . : .: ... CCDS11 QALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAF--D-REALTRE 320 330 340 350 360 370 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 RRRQKQMGMTDDVSTIKAP-RKDL----SLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPG : .. .. .: . . :... :: :. . :. .:: : . .: CCDS11 RIKEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPP 380 390 400 410 420 430 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 EKQTDPSTPQQES-SKPLGGIQPSSQTIQPKVE---TDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQ : .. . : : :. :: . .: ..::...: :.:. . CCDS11 PAPPPCPGPAPDTIDLTLQPPPPVSEPAPPKKDGAISDNTKAALKAA-------LLKSLR 440 450 460 470 480 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 SKQKDVLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRIL :. .: : : :. ::: ::..: ..: : : : : CCDS11 SRLRD----------GPSAPLE---APEPRKPVTAQ----ERQRER------EEKRRR-- 490 500 510 520 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 PPDQRPPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDP : . : .: . ... . .... ::: :: :. . . .. CCDS11 ----RQERAKEREKRRQE---RERKERGAGASGGPSTDPLAG-------LVLSDNDRSLL 530 540 550 560 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE3 KREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQ .: . :. . .:. . . :: . . .: :: : CCDS11 ERWTRMARPAAPALTSVP---------APAPAPTPTPTPVQPTSPPP-------GPVAQP 570 580 590 600 610 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE3 SLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSES-FPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPI . . ..:.: :: :::. . : .. : : . : :.. .. . . : : CCDS11 TGPQPQSAGSTSGPVPQPACPPPGPAPHPTGPPGPIPVPAPPQIATSTSLLAAQ-SLVPP 620 630 640 650 660 670 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE3 AVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGY : .:: :.. : :: . ....:.:. .:. : : .. : . CCDS11 PGLPGSSTPGVLPYFPPGLPPPDAGGAPQSSMSESPD-VNLVTQQLSKSQVEDP-LPPVF 680 690 700 710 720 730 1440 1450 pF1KE3 RGHISTSTGRGRGRGLPY : : : : : :. . CCDS11 SG---TPKGSGAGYGVGFDLEEFLNQSFDMGVADGPQDGQADSASLSASLLADWLEGHGM 740 750 760 770 780 >>CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 (326 aa) initn: 483 init1: 201 opt: 673 Z-score: 315.6 bits: 68.8 E(32554): 2.9e-11 Smith-Waterman score: 673; 37.9% identity (65.8% similar) in 330 aa overlap (700-1020:8-323) 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARD-KDTG : .... .. ::::.::.:.:::: :. : CCDS56 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGG 10 20 30 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 EMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLT---HQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKG ..::::.::... .::.:...:::. .::.: : ... . .. : .. . : CCDS56 RFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETK---- 40 50 60 70 80 90 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 AFYLVFEYMDHDLMGLL----ESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCS . ::::..:.:: : : :. . ::..: ::..:::. :.. .:::.: . CCDS56 -LTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGV---PTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQ 100 110 120 130 140 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 NILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCG :::... ::::::::::::.:: . . :. :.::::: ::.:: :: .:.:: : CCDS56 NILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMA--LTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATP-VDLWSVG 150 160 170 180 190 200 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 CILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLR ::..:.: .::.:...... :: : . : : :: . :: . . : .:. CCDS56 CIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFV 210 220 230 240 250 260 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 EEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMP-PPDLPLWQDCHEL . : . ::. :...:.:: .: .::. ...:.: : :: :. :: CCDS56 TD---IDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSEL 270 280 290 300 310 320 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGE CCDS56 NTA 1452 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:19:11 2016 done: Mon Nov 7 17:19:12 2016 Total Scan time: 5.820 Total Display time: 0.450 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]