FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8549, 990 aa 1>>>pF1KB8549 990 - 990 aa - 990 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9912+/-0.000458; mu= -1.9417+/- 0.028 mean_var=505.1443+/-106.460, 0's: 0 Z-trim(122.4): 398 B-trim: 2072 in 1/60 Lambda= 0.057065 statistics sampled from 39987 (40491) to 39987 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16 Scan time: 14.130 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004477 (OMIM: 602580) golgin subfamily A member (1002) 6338 537.5 1.3e-151 XP_005251987 (OMIM: 602580) PREDICTED: golgin subf (1029) 5968 507.1 2e-142 XP_005251988 (OMIM: 602580) PREDICTED: golgin subf (1002) 5554 473.0 3.5e-132 XP_005251989 (OMIM: 602580) PREDICTED: golgin subf ( 975) 5228 446.1 4.2e-124 NP_001033729 (OMIM: 610288) golgin subfamily A mem ( 693) 675 71.1 2.3e-11 XP_016877702 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 603) 528 58.9 9.3e-08 XP_011519899 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 603) 528 58.9 9.3e-08 XP_016877700 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 603) 528 58.9 9.3e-08 XP_011519898 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 603) 528 58.9 9.3e-08 XP_016877699 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 603) 528 58.9 9.3e-08 XP_016877701 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 603) 528 58.9 9.3e-08 NP_001018861 (OMIM: 609619) golgin subfamily A mem ( 603) 528 58.9 9.3e-08 NP_851422 (OMIM: 616180) golgin subfamily A member ( 603) 526 58.8 1e-07 XP_016877705 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 460) 518 58.0 1.4e-07 XP_016877706 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 460) 518 58.0 1.4e-07 XP_016877704 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 460) 518 58.0 1.4e-07 XP_016877707 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 460) 518 58.0 1.4e-07 XP_016877703 (OMIM: 609619) PREDICTED: golgin subf ( 602) 520 58.3 1.5e-07 XP_016877507 (OMIM: 616180) PREDICTED: golgin subf ( 495) 516 57.8 1.6e-07 XP_016877508 (OMIM: 616180) PREDICTED: golgin subf ( 495) 516 57.8 1.6e-07 XP_006720503 (OMIM: 616180) PREDICTED: golgin subf ( 602) 518 58.1 1.6e-07 XP_016877509 (OMIM: 616180) PREDICTED: golgin subf ( 459) 508 57.1 2.4e-07 XP_016883108 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (1976) 380 47.4 0.00091 NP_003557 (OMIM: 605070) early endosome antigen 1 (1411) 374 46.7 0.001 NP_001305148 (OMIM: 609689) centrosome-associated (1810) 374 46.8 0.0012 XP_011537117 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endos (1365) 369 46.3 0.0013 XP_016875507 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endos (1417) 369 46.3 0.0014 XP_011537116 (OMIM: 605070) PREDICTED: early endos (1453) 369 46.3 0.0014 XP_016858404 (OMIM: 615776) PREDICTED: rootletin i (1855) 363 46.0 0.0023 NP_005955 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 2 [Homo (1976) 363 46.0 0.0024 XP_016880171 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 363 46.0 0.0024 XP_016880170 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 363 46.0 0.0024 NP_001243024 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 3 [H (1985) 363 46.0 0.0024 XP_016880169 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1985) 363 46.0 0.0024 XP_016880167 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 363 46.0 0.0024 XP_016880166 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 363 46.0 0.0024 XP_016880168 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 363 46.0 0.0024 XP_011522182 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2006) 363 46.0 0.0024 NP_001242941 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 1 [H (2007) 363 46.0 0.0024 XP_011522181 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2015) 363 46.0 0.0024 XP_011522180 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2016) 363 46.0 0.0024 XP_011522177 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2037) 363 46.0 0.0024 XP_016858403 (OMIM: 615776) PREDICTED: rootletin i (1894) 362 45.9 0.0025 XP_006711121 (OMIM: 615776) PREDICTED: rootletin i (1945) 362 45.9 0.0025 XP_011540772 (OMIM: 615776) PREDICTED: rootletin i (1958) 362 45.9 0.0025 XP_016858402 (OMIM: 615776) PREDICTED: rootletin i (2012) 362 45.9 0.0026 NP_055490 (OMIM: 615776) rootletin [Homo sapiens] (2017) 362 45.9 0.0026 XP_011540770 (OMIM: 615776) PREDICTED: rootletin i (2019) 362 45.9 0.0026 NP_001166028 (OMIM: 602581) golgin subfamily A mem (1134) 338 43.6 0.007 XP_005266224 (OMIM: 602581) PREDICTED: golgin subf (1307) 338 43.7 0.0077 >>NP_004477 (OMIM: 602580) golgin subfamily A member 2 [ (1002 aa) initn: 6338 init1: 6338 opt: 6338 Z-score: 2842.9 bits: 537.5 E(85289): 1.3e-151 Smith-Waterman score: 6338; 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