FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4225, 794 aa 1>>>pF1KE4225 794 - 794 aa - 794 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5851+/-0.00139; mu= -4.6310+/- 0.081 mean_var=319.4345+/-69.605, 0's: 0 Z-trim(108.8): 136 B-trim: 660 in 1/50 Lambda= 0.071760 statistics sampled from 10369 (10481) to 10369 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 3.900 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 5134 546.4 6.7e-155 CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 2673 291.6 3.4e-78 CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 2330 256.1 1.7e-67 CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 2318 254.9 4e-67 CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 872 105.3 5.6e-22 CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 832 101.0 8.1e-21 CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 602 77.4 1.6e-13 CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 602 77.4 1.7e-13 CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 602 77.4 1.7e-13 CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 584 75.5 5.7e-13 CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 523 69.0 3.4e-11 CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 519 68.6 4.6e-11 CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 519 68.6 4.7e-11 >>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (794 aa) initn: 5134 init1: 5134 opt: 5134 Z-score: 2894.4 bits: 546.4 E(32554): 6.7e-155 Smith-Waterman score: 5134; 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CCDS30 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV 760 770 780 790 800 810 >>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa) initn: 2952 init1: 2187 opt: 2318 Z-score: 1318.6 bits: 254.9 E(32554): 4e-67 Smith-Waterman score: 3323; 68.9% identity (85.5% similar) in 758 aa overlap (1-749:49-771) 10 20 pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN .:::. : .::. .::.:. ::.: :. CCDS76 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ- 20 30 40 50 60 70 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL ::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS76 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP ::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.:: CCDS76 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ ::::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS :::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.::::::: CCDS76 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ :::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: : CCDS76 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR .::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.:::::::::: CCDS76 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN ::::::::::: ... :.. .....::: CCDS76 LLKQRIETLEKESASLADR------------LIQHKCSSN-------------------- 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK .:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.::::: CCDS76 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR :.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..::: CCDS76 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES ::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::. CCDS76 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY .::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.:: CCDS76 KRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQY 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 pF1KE4 IRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG----- : :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::... CCDS76 IGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQE 710 720 730 740 750 760 750 760 770 780 790 pF1KE4 VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN .::: :. CCDS76 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV 770 780 790 800 810 820 >>CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069 aa) initn: 873 init1: 621 opt: 872 Z-score: 508.0 bits: 105.3 E(32554): 5.6e-22 Smith-Waterman score: 900; 34.4% identity (65.2% similar) in 529 aa overlap (90-604:541-1046) 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 GSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHH ::.. ..:. . : :. :.:.:.:. CCDS68 EDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLNVRPKQLSSLVRNGVPEA 520 530 540 550 560 570 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FRAIVWQLL--CSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQE .:. ::::: : .: :. .: :. :: .. : ::: ::.: :..:: . ::. CCDS68 LRGEVWQLLAGCHNNDHLVE-KYRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQD 580 590 600 610 620 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMA :... ::::. :.:.:::::..:....::..::::.:: :.:..: .: :::::: .. CCDS68 SLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFE 630 640 650 660 670 680 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFM .: .::.: ..:: .::: .:: . :... ::::.:::::: . ::: .. ...:... CCDS68 DLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLL 690 700 710 720 730 740 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPD--KLVLKAYQVKY ::. ..: :.:.::.... .:. :.:: ..:. .:... : . ::. : ..: CCDS68 CEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENAKKLMELACNMKI 750 760 770 780 790 800 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 NPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVI . ::.:. :::: .:. .. ... :.:.. ::: :.. ::. . :.: .. CCDS68 SQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQEDPIERFERENRRLQEANMRLEQENDDLAHE-----LV 810 820 830 840 850 860 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 KRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETL ..:. :.. ..: : ::.. ..: ... .:. .:: : : :.: CCDS68 TSKIAL-RKDLDNAEE---KADALNKELLMTKQKLIDAEEEKRRLEEESAQ--LKEMCR- 870 880 890 900 910 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 GALREMQDKVLDMEKRNSSL-PDENNV-AQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELS ::. ::. . :.:::. : ... .::.:.: : : .:. :.. :... CCDS68 ---REL-DKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERL------EKQQTANKVEIEKIRQKVD 920 930 940 950 960 540 550 560 570 580 pF1KE4 DTWQAH--LARGGRWKE-SPRKLVVGELQDE---LMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELE : . . . . :: : : : :. : :: .. .::: . .:. .: . CCDS68 DCERCREFFNKEGRVKGISSTKEVLDEDTDEEKETLKNQLREMELELAQTKLQLVEAECK 970 980 990 1000 1010 1020 590 600 610 620 630 640 pF1KE4 TQDHIHR-NL-LNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMA :: :. .: ::.:.: . CCDS68 IQDLEHHLGLALNEVQAAKKTWFNRTLSSIKTATGVQGKETC 1030 1040 1050 1060 >>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa) initn: 780 init1: 623 opt: 832 Z-score: 487.2 bits: 101.0 E(32554): 8.1e-21 Smith-Waterman score: 832; 38.2% identity (74.8% similar) in 317 aa overlap (73-385:495-811) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 EQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSH-LEEDTWILWGRIANEWEEWR ::.....:. : ::.. ..:. CCDS13 DKEEPVTPTSGGGPMSPQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGKWHSNL 470 480 490 500 510 520 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 RRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATD-MPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIAR . : :. :...:.:. .:: ::::: . : . . ..: :. .: :..: ::: : CCDS13 GARPKGLSTLVKSGVPEALRAEVWQLLAGCHDNQAMLDRYRILITKDSAQESVITRDIHR 530 540 550 560 570 580 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 TYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFV :.: :..:: . ::: :... ::::. :...:::::..:....::..::::.::::.: CCDS13 TFPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLV 590 600 610 620 630 640 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 RLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLF ..: .: ::.:.. .. .: .::.: ..:::::::..:: . .... ::::.:::::: CCDS13 KIMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLF 650 660 670 680 690 700 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFD . ::: .. ...:... :::.:.:.:.::::.... .:.: :.:: ..:. .:... CCDS13 TAKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQADFEGALKFFRVQLPKRYR 710 720 730 740 750 760 350 360 370 380 390 pF1KE4 SCPD--KLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETL . . .:. .: ..: ::.:. :::: .:. ...... . : . CCDS13 AEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL 770 780 790 800 810 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 EKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVS >>CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235 aa) initn: 595 init1: 512 opt: 602 Z-score: 356.1 bits: 77.4 E(32554): 1.6e-13 Smith-Waterman score: 652; 29.8% identity (64.0% similar) in 470 aa overlap (6-445:742-1204) 10 20 pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN ::: : ..: ::. .: . : CCDS66 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGED-DPEKIEER 720 730 740 750 760 770 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW . ::. : . ...: ::. ...... ...:: . : :. . ... .... CCDS66 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQK-LEASRDELQSRKVKLDY--EEVGACQKEVL 780 790 800 810 820 90 100 110 120 130 pF1KE4 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVKNQ--- : : . . : . : : . . :...:.:. :. .::.: . : :.: CCDS66 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD 830 840 850 860 870 880 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ :.::::. . .. : :..::.: : .:. : . :: :::..:::::.:.:::::: CCDS66 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ 890 900 910 920 930 940 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL : .:..:.::..: ::.:: .. :: . .:. ..:.: : . .::. .:.. :: CCDS66 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL 950 960 970 980 990 1000 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA .:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ... CCDS66 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET 1010 1020 1030 1040 1050 1060 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME .:. . .:.. .... ..: . : .:.. ..... . :... : :: ..... .: CCDS66 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 380 390 400 410 420 pF1KE4 -----EQIE-IKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ :. : ...: :....: .: .. ::: :: :. : : : .. :: . .. CCDS66 SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-KSL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV . .. . :.:..::.. CCDS66 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP 1190 1200 1210 1220 1230 >>CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290 aa) initn: 595 init1: 512 opt: 602 Z-score: 355.8 bits: 77.4 E(32554): 1.7e-13 Smith-Waterman score: 652; 29.8% identity (64.0% similar) in 470 aa overlap (6-445:797-1259) 10 20 pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN ::: : ..: ::. .: . : CCDS66 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGED-DPEKIEER 770 780 790 800 810 820 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW . ::. : . ...: ::. ...... ...:: . : :. . ... .... CCDS66 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQK-LEASRDELQSRKVKLDY--EEVGACQKEVL 830 840 850 860 870 880 90 100 110 120 130 pF1KE4 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVKNQ--- : : . . : . : : . . :...:.:. :. .::.: . : :.: CCDS66 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD 890 900 910 920 930 940 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ :.::::. . .. : :..::.: : .:. : . :: :::..:::::.:.:::::: CCDS66 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ 950 960 970 980 990 1000 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL : .:..:.::..: ::.:: .. :: . .:. ..:.: : . .::. .:.. :: CCDS66 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA .:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ... CCDS66 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET 1070 1080 1090 1100 1110 1120 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME .:. . .:.. .... ..: . : .:.. ..... . :... : :: ..... .: CCDS66 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 380 390 400 410 420 pF1KE4 -----EQIE-IKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ :. : ...: :....: .: .. ::: :: :. : : : .. :: . .. CCDS66 SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-KSL 1190 1200 1210 1220 1230 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV . .. . :.:..::.. CCDS66 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP 1240 1250 1260 1270 1280 1290 >>CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298 aa) initn: 595 init1: 512 opt: 602 Z-score: 355.8 bits: 77.4 E(32554): 1.7e-13 Smith-Waterman score: 652; 29.8% identity (64.0% similar) in 470 aa overlap (6-445:805-1267) 10 20 pF1KE4 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN ::: : ..: ::. .: . : CCDS41 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGED-DPEKIEER 780 790 800 810 820 830 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW . ::. : . ...: ::. ...... ...:: . : :. . ... .... CCDS41 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQK-LEASRDELQSRKVKLDY--EEVGACQKEVL 840 850 860 870 880 890 90 100 110 120 130 pF1KE4 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVKNQ--- : : . . : . : : . . :...:.:. :. .::.: . : :.: CCDS41 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD 900 910 920 930 940 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ :.::::. . .. : :..::.: : .:. : . :: :::..:::::.:.:::::: CCDS41 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ 950 960 970 980 990 1000 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL : .:..:.::..: ::.:: .. :: . .:. ..:.: : . .::. .:.. :: CCDS41 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA .:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ... 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CCDS41 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP 1250 1260 1270 1280 1290 >>CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168 aa) initn: 523 init1: 523 opt: 584 Z-score: 346.4 bits: 75.5 E(32554): 5.7e-13 Smith-Waterman score: 626; 31.1% identity (66.7% similar) in 351 aa overlap (112-446:797-1145) 90 100 110 120 130 pF1KE4 LEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVK . .:.:.: :. .:..: . : : CCDS33 LKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSK 770 780 790 800 810 820 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 NQ-----YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE .: :.::::. . .. : :..::.: : .:..: . :: :.:..:::::.:.: CCDS33 QQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQE 830 840 850 860 870 880 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQE :::::: .:..:.::..: ::::: .. :: .. ::. ..:.: : . .::. .:.. 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CCDS33 LKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD 1130 1140 1150 1160 794 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:09:22 2016 done: Mon Nov 7 17:09:22 2016 Total Scan time: 3.900 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]