Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6247
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6247, 754 aa
  1>>>pF1KB6247 754 - 754 aa - 754 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6975+/-0.00153; mu= 11.3474+/- 0.092
 mean_var=259.7095+/-48.742, 0's: 0 Z-trim(109.1): 948  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.079585
 statistics sampled from 9617 (10650) to 9617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time:  3.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 5282 620.9 2.3e-177
CCDS74924.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3       ( 373) 2537 305.3 1.1e-82
CCDS2714.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 276) 1858 227.2 2.8e-59
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544) 1858 227.6 4.2e-59
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1846 226.2 1.2e-58
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1846 226.3 1.2e-58
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1846 226.3 1.2e-58
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1846 226.3 1.3e-58
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1837 225.3 2.6e-58
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 782) 1833 224.9 3.9e-58
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 818) 1833 224.9   4e-58
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9       ( 744) 1825 223.9 7.1e-58
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1823 223.6 7.2e-58
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1823 223.6 7.6e-58
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678) 1817 223.0 1.3e-57
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1812 222.2 1.5e-57
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1815 222.8 1.6e-57
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1812 222.3 1.6e-57
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1812 222.4 1.9e-57
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1802 221.2 4.2e-57
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 620) 1799 220.8   5e-57
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 639) 1799 220.9 5.1e-57
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 839) 1800 221.1 5.6e-57
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 840) 1800 221.1 5.6e-57
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1790 219.7 8.9e-57
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19        ( 516) 1783 218.9 1.6e-56
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502) 1781 218.7 1.8e-56
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 555) 1781 218.7   2e-56
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 560) 1781 218.7   2e-56
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17       ( 761) 1778 218.6   3e-56
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1777 218.4 3.2e-56
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19      ( 808) 1776 218.4 3.7e-56
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1773 217.8 3.8e-56
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19         ( 595) 1773 217.8 3.9e-56
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19      ( 924) 1776 218.4   4e-56
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1773 217.9 4.1e-56
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19      ( 717) 1773 217.9 4.3e-56
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19      ( 617) 1771 217.6 4.6e-56
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869) 1767 217.4 7.9e-56
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1755 215.8 1.7e-55
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1755 215.8 1.7e-55
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1755 215.9 1.8e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17       ( 865) 1756 216.1 1.9e-55
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706) 1754 215.8   2e-55
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1751 215.3 2.3e-55
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10         ( 778) 1752 215.6 2.4e-55
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059) 1752 215.8 2.9e-55
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620) 1747 214.9 3.1e-55
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19      ( 936) 1750 215.5 3.2e-55
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 687) 1747 214.9 3.3e-55


>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3             (754 aa)
 initn: 5282 init1: 5282 opt: 5282  Z-score: 3297.6  bits: 620.9 E(32554): 2.3e-177
Smith-Waterman score: 5282; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPGAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPGAH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 TQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 GEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 RQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 RLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLID
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 HQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 HTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 KPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750    
pF1KB6 CSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
              730       740       750    

>>CCDS74924.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3            (373 aa)
 initn: 1720 init1: 1720 opt: 2537  Z-score: 1597.6  bits: 305.3 E(32554): 1.1e-82
Smith-Waterman score: 2537; 99.7% identity (99.7% similar) in 369 aa overlap (151-519:1-368)

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPGAH
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74                               MHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPGAH
                                             10        20        30

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDY
               40        50        60        70        80        90

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 TQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGG
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASL-GENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGG
              100       110       120        130       140         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEV
     150       160       170       180       190       200         

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 GEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTF
     210       220       230       240       250       260         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 RQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSS
     270       280       290       300       310       320         

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 RLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLID
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
CCDS74 RLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGWSTMA                
     330       340       350       360       370                   

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 HQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERI

>>CCDS2714.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3             (276 aa)
 initn: 1858 init1: 1858 opt: 1858  Z-score: 1177.8  bits: 227.2 E(32554): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1858; 98.5% identity (99.3% similar) in 275 aa overlap (1-275:1-275)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPGAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPGAH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 TQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::.  .:                         
CCDS27 TQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLGWSTMA                        
              250       260       270                              

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEV

>>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3              (544 aa)
 initn: 1839 init1: 1839 opt: 1858  Z-score: 1174.5  bits: 227.6 E(32554): 4.2e-59
Smith-Waterman score: 1858; 60.7% identity (82.3% similar) in 407 aa overlap (340-744:138-544)

     310       320       330       340         350       360       
pF1KB6 ETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKS--TKDRYDKYKEVGEHPPLS
                                     .:.:..:  .  :. .  : .: :.    :
CCDS27 LLLTSSLVTRLRVSTEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQS
       110       120       130       140       150       160       

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB6 SSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLI
       :: ..:. .  :.. : :.::::::.::: :. ::::::: ::: :..::::::  : : 
CCDS27 SSLTQHQRTHTGERPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLT
       170       180       190       200       210       220       

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB6 VHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQR
        : : :::::::.:.:::...:. ::: .:::.:.::::::::.:.:::.:...:  :::
CCDS27 QHQRIHTGEKPYKCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQR
       230       240       250       260       270       280       

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB6 THTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTG
        ::::::: :.::: .: . ..:..:: .:::.::.::.:::..: .. :: .:::::.:
CCDS27 IHTGEKPYICSECGSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSG
       290       300       310       320       330       340       

       550       560       570       580       590       600       
pF1KB6 EKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPF
       ::::.:.:::::: .:  ::.:: .:::::::::.::::::.:.. : .:.::::::.:.
CCDS27 EKPYKCKECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGERPY
       350       360       370       380       390       400       

       610       620       630       640       650       660       
pF1KB6 ECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNE
       .::::::::  : ::::::: ::::::::::::::.::::. :  :.:::::::::.:.:
CCDS27 KCSECGKAFIQSICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKCKE
       410       420       430       440       450       460       

       670       680       690       700       710       720       
pF1KB6 CGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKA
       :::.:..::::  :.::::::: :::..: :.:   ..:  : :.::::::::: :::: 
CCDS27 CGKAFAHSSSLTEHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKF
       470       480       490       500       510       520       

       730       740       750    
pF1KB6 FSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
       : . :.. .::. :.:.          
CCDS27 FRHSSVLFRHQKLHSGD          
       530       540              

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 3451 init1: 1845 opt: 1846  Z-score: 1166.5  bits: 226.2 E(32554): 1.2e-58
Smith-Waterman score: 1863; 62.0% identity (82.8% similar) in 400 aa overlap (346-745:163-562)

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB6 EDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSPVEHEG
                                     .:  .:..  : .: :.    ::. .::. 
CCDS74 LPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHR
            140       150       160       170       180       190  

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB6 VLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTG
       .  :.. :.: :: :.:  :: :  :::::::::::.:..::.:: : . :: : :::::
CCDS74 THTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
            200       210       220       230       240       250  

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB6 EKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPY
       :::::::::::..   : . ::.: :.:::::.:.::.::: :: .::.: : :::::::
CCDS74 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
            260       270       280       290       300       310  

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB6 ECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSE
       .:.:::.:: .:.::..:: .:::.:::.:.:::.:: .   ::.::: :::::::::.:
CCDS74 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
            320       330       340       350       360       370  

         560       570       580       590       600       610     
pF1KB6 CGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKA
       ::::::.:  : .:. .::::::: :.::::.:...:.: .::: ::::::.:::.::::
CCDS74 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
            380       390       400       410       420       430  

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB6 FGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYS
       :  :  : .:::.:::::::.::.:::.:...: :  ::::::::::::::.::..::  
CCDS74 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
            440       450       460       470       480       490  

         680       690       700       710       720       730     
pF1KB6 SSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFN
       . :. ::: :::::::.::.::.:::.:: :: :::.:: :::: :.::::.::. :...
CCDS74 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
            500       510       520       530       540       550  

         740       750                                             
pF1KB6 HHQRTHTGEKSSGLAWSVS                                         
       .:.:::::::                                                  
CCDS74 QHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQR
            560       570       580       590       600       610  

>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 3451 init1: 1845 opt: 1846  Z-score: 1166.2  bits: 226.3 E(32554): 1.2e-58
Smith-Waterman score: 1863; 62.0% identity (82.8% similar) in 400 aa overlap (346-745:205-604)

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB6 EDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSPVEHEG
                                     .:  .:..  : .: :.    ::. .::. 
CCDS74 LPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHR
          180       190       200       210       220       230    

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB6 VLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTG
       .  :.. :.: :: :.:  :: :  :::::::::::.:..::.:: : . :: : :::::
CCDS74 THTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
          240       250       260       270       280       290    

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB6 EKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPY
       :::::::::::..   : . ::.: :.:::::.:.::.::: :: .::.: : :::::::
CCDS74 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
          300       310       320       330       340       350    

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB6 ECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSE
       .:.:::.:: .:.::..:: .:::.:::.:.:::.:: .   ::.::: :::::::::.:
CCDS74 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
          360       370       380       390       400       410    

         560       570       580       590       600       610     
pF1KB6 CGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKA
       ::::::.:  : .:. .::::::: :.::::.:...:.: .::: ::::::.:::.::::
CCDS74 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
          420       430       440       450       460       470    

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB6 FGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYS
       :  :  : .:::.:::::::.::.:::.:...: :  ::::::::::::::.::..::  
CCDS74 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
          480       490       500       510       520       530    

         680       690       700       710       720       730     
pF1KB6 SSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFN
       . :. ::: :::::::.::.::.:::.:: :: :::.:: :::: :.::::.::. :...
CCDS74 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
          540       550       560       570       580       590    

         740       750                                             
pF1KB6 HHQRTHTGEKSSGLAWSVS                                         
       .:.:::::::                                                  
CCDS74 QHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQR
          600       610       620       630       640       650    

>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 3451 init1: 1845 opt: 1846  Z-score: 1166.1  bits: 226.3 E(32554): 1.2e-58
Smith-Waterman score: 1863; 62.0% identity (82.8% similar) in 400 aa overlap (346-745:217-616)

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB6 EDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSPVEHEG
                                     .:  .:..  : .: :.    ::. .::. 
CCDS12 LPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHR
        190       200       210       220       230       240      

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB6 VLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTG
       .  :.. :.: :: :.:  :: :  :::::::::::.:..::.:: : . :: : :::::
CCDS12 THTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
        250       260       270       280       290       300      

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB6 EKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPY
       :::::::::::..   : . ::.: :.:::::.:.::.::: :: .::.: : :::::::
CCDS12 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
        310       320       330       340       350       360      

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB6 ECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSE
       .:.:::.:: .:.::..:: .:::.:::.:.:::.:: .   ::.::: :::::::::.:
CCDS12 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
        370       380       390       400       410       420      

         560       570       580       590       600       610     
pF1KB6 CGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKA
       ::::::.:  : .:. .::::::: :.::::.:...:.: .::: ::::::.:::.::::
CCDS12 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
        430       440       450       460       470       480      

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB6 FGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYS
       :  :  : .:::.:::::::.::.:::.:...: :  ::::::::::::::.::..::  
CCDS12 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
        490       500       510       520       530       540      

         680       690       700       710       720       730     
pF1KB6 SSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFN
       . :. ::: :::::::.::.::.:::.:: :: :::.:: :::: :.::::.::. :...
CCDS12 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
        550       560       570       580       590       600      

         740       750                                             
pF1KB6 HHQRTHTGEKSSGLAWSVS                                         
       .:.:::::::                                                  
CCDS12 QHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQR
        610       620       630       640       650       660      

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 3451 init1: 1845 opt: 1846  Z-score: 1166.0  bits: 226.3 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1863; 62.0% identity (82.8% similar) in 400 aa overlap (346-745:229-628)

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB6 EDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSPVEHEG
                                     .:  .:..  : .: :.    ::. .::. 
CCDS54 LPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHR
      200       210       220       230       240       250        

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB6 VLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTG
       .  :.. :.: :: :.:  :: :  :::::::::::.:..::.:: : . :: : :::::
CCDS54 THTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
      260       270       280       290       300       310        

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB6 EKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPY
       :::::::::::..   : . ::.: :.:::::.:.::.::: :: .::.: : :::::::
CCDS54 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
      320       330       340       350       360       370        

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB6 ECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSE
       .:.:::.:: .:.::..:: .:::.:::.:.:::.:: .   ::.::: :::::::::.:
CCDS54 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
      380       390       400       410       420       430        

         560       570       580       590       600       610     
pF1KB6 CGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKA
       ::::::.:  : .:. .::::::: :.::::.:...:.: .::: ::::::.:::.::::
CCDS54 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
      440       450       460       470       480       490        

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB6 FGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYS
       :  :  : .:::.:::::::.::.:::.:...: :  ::::::::::::::.::..::  
CCDS54 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
      500       510       520       530       540       550        

         680       690       700       710       720       730     
pF1KB6 SSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFN
       . :. ::: :::::::.::.::.:::.:: :: :::.:: :::: :.::::.::. :...
CCDS54 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
      560       570       580       590       600       610        

         740       750                                             
pF1KB6 HHQRTHTGEKSSGLAWSVS                                         
       .:.:::::::                                                  
CCDS54 QHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQR
      620       630       640       650       660       670        

>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19           (688 aa)
 initn: 1829 init1: 1829 opt: 1837  Z-score: 1160.4  bits: 225.3 E(32554): 2.6e-58
Smith-Waterman score: 1926; 51.6% identity (77.1% similar) in 525 aa overlap (231-745:6-529)

              210       220       230       240       250       260
pF1KB6 TSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDYTQKKWKSLTLSQRALQWNMM
                                     : ..:...:..:..:. :  .:: :  ..:
CCDS12                          MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVM
                                        10        20        30     

              270       280       290       300       310       320
pF1KB6 PENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGGLFGVVPGAAETGDVCEDTFK
        ::. ...::   .   ...:.:... ..   :. . :  : .     ... :  :   :
CCDS12 LENYSNLVSLDLPSRCASKDLSPEKNTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGK
          40        50        60        70        80        90     

              330                 340       350       360       370
pF1KB6 ELEGQTSDEEGSR----------LENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSP
         . : ...:  :          . :.   ...... .::.  : : :: :.    .:  
CCDS12 MEKQQENQKEYFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPY-KCKECGKAFRRASHL
         100       110       120       130        140       150    

              380       390       400       410       420       430
pF1KB6 VEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHL
       ..:...  :.: :.: .:::::.:.:.:  :::.::::::: :.::::.: :.::::.: 
CCDS12 TQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHH
          160       170       180       190       200       210    

              440       450       460       470       480       490
pF1KB6 RTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHT
       : :::::::.: :::::. .::.: .::..:.:::::.:.::.:::::.:.:: ::: ::
CCDS12 RIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHT
          220       230       240       250       260       270    

              500       510       520       530       540       550
pF1KB6 GEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKP
       ::: :::.:: ..: . ..:  :. .:::.:::.:.:::.::  . .: .::.::.::::
CCDS12 GEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKP
          280       290       300       310       320       330    

              560       570       580       590       600       610
pF1KB6 YECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECS
       :::.:::.:: :.. :..:: .::::::::: :::::: ..::: .:.::::.:::.::.
CCDS12 YECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECK
          340       350       360       370       380       390    

              620       630       640       650       660       670
pF1KB6 ECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGK
       :::: :. .. : .:::.:::::::.:.::::.::..: :  :::::::::::::.::::
CCDS12 ECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGK
          400       410       420       430       440       450    

              680       690       700       710       720       730
pF1KB6 VFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQ
       .:: .: :  :.: :::::::.:..:::.:  .:::  :::.:::::::::.::  ::.:
CCDS12 TFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQ
          460       470       480       490       500       510    

              740       750                                        
pF1KB6 RSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS                                    
        : ...::: :::::                                             
CCDS12 SSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQL
          520       530       540       550       560       570    

>--
 initn: 2146 init1: 749 opt: 749  Z-score: 485.2  bits: 100.3 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 749; 63.5% identity (84.9% similar) in 159 aa overlap (522-680:530-688)

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB6 EKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPY
                                     :: :::::.::  .  ::.:::::::::::
CCDS12 EKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPY
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       .:.:::::: :.. : .:: .:::::::.:.::::::...:::  :.::::::::.:: :
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       : :::  :. : ::::.:::::::.:.::::.:...:.:  ::::: .:: .: .:::  
CCDS12 CRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGID
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       ::..:....                                                   
CCDS12 FSHGSQVYM                                                   
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       :..:.::::::.. . :  :: .:.::::::: ::::::.:.:::  :. ::.:::::.:
CCDS82 PYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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