FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4095, 468 aa 1>>>pF1KE4095 468 - 468 aa - 468 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0904+/-0.000483; mu= 0.2786+/- 0.030 mean_var=245.6112+/-51.231, 0's: 0 Z-trim(116.9): 212 B-trim: 1339 in 1/53 Lambda= 0.081837 statistics sampled from 28161 (28401) to 28161 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16 Scan time: 10.050 The best scores are: opt bits E(85289) NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 1112 144.8 4.8e-34 XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 1102 143.6 1.1e-33 NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 1027 134.8 5e-31 XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 811 109.3 2.4e-23 XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 811 109.3 2.4e-23 NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 811 109.3 2.4e-23 NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 811 109.3 2.4e-23 XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 811 109.3 2.4e-23 NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 779 105.5 3.2e-22 NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 768 104.2 8.3e-22 NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 742 101.1 6.9e-21 XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 705 96.8 1.3e-19 NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262) 694 95.3 2.2e-19 XP_011542587 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 391) 663 91.7 3.8e-18 XP_011538872 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 475) 581 82.1 3.6e-15 NP_061008 (OMIM: 111620,111750,609017) erythroid m ( 475) 581 82.1 3.6e-15 XP_006710376 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 475) 581 82.1 3.6e-15 NP_001017922 (OMIM: 111620,111750,609017) erythroi ( 475) 581 82.1 3.6e-15 XP_011538873 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 468) 575 81.4 5.8e-15 NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 558 79.4 2.5e-14 NP_006501 (OMIM: 602165) zinc finger protein RFP [ ( 513) 556 79.2 2.9e-14 NP_001229732 (OMIM: 613595) butyrophilin subfamily ( 374) 539 77.1 9.3e-14 NP_932078 (OMIM: 613595) butyrophilin subfamily 3 ( 535) 539 77.2 1.2e-13 NP_008925 (OMIM: 613595) butyrophilin subfamily 3 ( 584) 539 77.2 1.3e-13 NP_001723 (OMIM: 601610) butyrophilin subfamily 1 ( 526) 537 77.0 1.4e-13 XP_005249397 (OMIM: 601610) PREDICTED: butyrophili ( 626) 537 77.0 1.6e-13 NP_001288074 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein l ( 279) 528 75.7 1.8e-13 XP_016878725 (OMIM: 134610,249100,608107) PREDICTE ( 780) 532 76.5 2.9e-13 NP_000234 (OMIM: 134610,249100,608107) pyrin isofo ( 781) 532 76.5 2.9e-13 XP_011512533 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 313) 521 74.9 3.6e-13 NP_001184168 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily ( 313) 521 74.9 3.6e-13 XP_005248855 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 407) 521 75.0 4.3e-13 XP_016865656 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 407) 521 75.0 4.3e-13 NP_853509 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily 2 ( 407) 521 75.0 4.3e-13 XP_006715046 (OMIM: 613593) PREDICTED: butyrophili ( 419) 521 75.0 4.4e-13 NP_001138480 (OMIM: 613593) butyrophilin subfamily ( 461) 521 75.0 4.8e-13 XP_016865655 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 461) 521 75.0 4.8e-13 XP_011512531 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 461) 521 75.0 4.8e-13 XP_005248890 (OMIM: 613593) PREDICTED: butyrophili ( 506) 521 75.1 5.1e-13 NP_008979 (OMIM: 613593) butyrophilin subfamily 3 ( 513) 521 75.1 5.1e-13 NP_008926 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily 2 ( 523) 521 75.1 5.2e-13 XP_005248854 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 523) 521 75.1 5.2e-13 XP_006715016 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 523) 521 75.1 5.2e-13 NP_001184166 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily ( 523) 521 75.1 5.2e-13 XP_011512530 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 523) 521 75.1 5.2e-13 NP_892030 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 500) 516 74.5 7.6e-13 NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 511 73.9 1.1e-12 NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 511 73.9 1.1e-12 NP_542783 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 341) 504 72.9 1.5e-12 NP_001184162 (OMIM: 613590) butyrophilin subfamily ( 466) 504 73.0 1.9e-12 >>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa) initn: 1066 init1: 483 opt: 1112 Z-score: 732.3 bits: 144.8 E(85289): 4.8e-34 Smith-Waterman score: 1112; 40.3% identity (66.6% similar) in 467 aa overlap (1-462:1-455) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL :.. :: ::.:: :: ::::::..:: :.:::.:: :. : : . . : .:::: . NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ ... :. :...: .::.:. : :: : : .: .:. . : . NP_660 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHP---PSPVPQGVCPAHREPLAA-FCGDELRLLCAACER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQ : : :.::. ..: : . ::.. :. :: . ..: .. : : :. ... .: NP_660 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS :..:. .....: :::: :: ::.:: : . .::.. .: :: :...::..:. NP_660 NVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATA : :. :.... ::.: . . :: ::.. :: ..::. :. : ::.: ..:::: :: NP_660 QLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEV : :.:::: .::. : :: :::.::::: . ::: . :::::::::::::..: : . NP_660 NPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 GICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYES :.:...:.:: . :. : .. . .:. :. :: .:.: .::.:::::. NP_660 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 GHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV ::..::..:: ::.. ::. :. .:::.::: ... :.::: NP_660 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 >>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa) initn: 804 init1: 618 opt: 1102 Z-score: 725.9 bits: 143.6 E(85289): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 1102; 40.1% identity (66.3% similar) in 469 aa overlap (1-462:1-454) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL :.. :: ::.:: :: ::::::..:: :.:::.:: :. : : . . : .:::: . XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ ... :. :...: .::.:. : :: : : .: .:. . : . XP_016 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHP---PSPVPQGVCPAHREPLAA-FCGDELRLLCAACER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLC--QEETKTC : : :.::. ..: : . ::.. :. :: :. : .: . . . : . ... XP_016 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLR---KQMQDALLFQAQADETCVLWQMVESQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 KQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIES .: :..:. .....: :::: :: ::.:: : . .::.. .: :: :...::..:. XP_016 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 SSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPA : :. :.... ::.: . . :: ::.. :: ..::. :. : ::.: ..:::: XP_016 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 TANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEW ::: :.:::: .::. : :: :::.::::: . ::: . :::::::::::::..: : XP_016 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDY .:.:...:.:: . :. : .. . .:. :. :: .:.: .::.:::: XP_016 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDY 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE4 ESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV :.::..::..:: ::.. ::. :. .:::.::: ... :.::: XP_016 EAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLA 410 420 430 440 450 460 XP_016 PQ >>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa) initn: 744 init1: 463 opt: 1027 Z-score: 678.0 bits: 134.8 E(85289): 5e-31 Smith-Waterman score: 1027; 39.6% identity (66.7% similar) in 475 aa overlap (1-465:1-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL :..: . . ::.:: :::: : ::. ::::::: :. : .. :: : . . NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECI--SQVGKGGGSVCPVCRQRF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYG-RMPTTAKALSD-DEQGGSAFV-- ... :..:. ... ... :: : ..:. : : . .. : :. :.:. NP_003 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEI-SQ----EAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 -AQSHGANRVHLS---SEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETK :::. .: : :: ....:::: :. :: ... :. . .. . .. .. NP_003 CAQSR-KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQI : :. . .:......:: :::: ::: ::..:.:..: : ..: ::.:: ..:...:... NP_003 TQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISEL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLD . .:::.: :.:: .::::: :. . :. :: :.:.. :.:.::: ...:::: NP_003 DRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 PATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKT : ::: .:.:::: ..:. : ..:..: : ::::. :::.: : ::.:::::.: .: NP_003 PDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL :..:.:.::: :::.. . : : : . : . : :.. : :.::.:: NP_003 AWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAG-TYPQTPLHLQVPPCQVGIFL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDE-SLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV :::.: ..::: ::. :::::: . .: :::.::: . . : :: :::.: :: NP_003 DYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQG 420 430 440 450 460 470 NP_003 STDY >>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23 Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL : ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. . XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG :::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:. XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ : .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . : XP_011 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM ..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: . XP_011 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST . :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: : XP_011 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE ... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.::::::: XP_011 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE : .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . : XP_011 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT : ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. : XP_011 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSLNSHV XP_011 TMWVKG >>XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23 Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL : ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. . XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG :::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:. XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ : .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . : XP_011 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM ..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: . XP_011 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST . :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: : XP_011 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE ... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.::::::: XP_011 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE : .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . : XP_011 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT : ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. : XP_011 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSLNSHV XP_011 TMWVKG >>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa) initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23 Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL : ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. . NP_057 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG :::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:. NP_057 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ : .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . : NP_057 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM ..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: . NP_057 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST . :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: : NP_057 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE ... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.::::::: NP_057 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE : .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . : NP_057 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT : ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. : NP_057 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSLNSHV NP_057 TMWVKG >>NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas (477 aa) initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23 Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL : ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. . NP_001 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG :::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:. NP_001 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ : .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . : NP_001 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM ..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: . NP_001 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST . :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: : NP_001 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE ... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.::::::: NP_001 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE : .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . : NP_001 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT : ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. : NP_001 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSLNSHV NP_001 TMWVKG >>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 540.1 bits: 109.3 E(85289): 2.4e-23 Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL : ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. . XP_006 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG :::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:. XP_006 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ : .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . : XP_006 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM ..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: . XP_006 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST . :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: : XP_006 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE ... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.::::::: XP_006 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE : .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . : XP_006 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT : ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. : XP_006 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSLNSHV XP_006 TMWVKG >>NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containing p (452 aa) initn: 790 init1: 271 opt: 779 Z-score: 520.0 bits: 105.5 E(85289): 3.2e-22 Smith-Waterman score: 779; 32.0% identity (62.9% similar) in 453 aa overlap (6-449:5-450) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL ... .. :: : .:..:: .::: .:::::: :. .:.. ..: :: .. NP_065 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKST 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQSH : ....: .: ..::.::.. .. : .:: : : : . . ... .. .: NP_065 EQINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMC-GTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 GANRVHLSSEAE---EHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCK-Q .: : : :.::::: . .. : . : . :. : :.. : .. . . . NP_065 QEHRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTR-CWKDYVNLRLE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS .. .::.:: : .:::. .:..:... :: ...:. .. :...... : : ... NP_065 AIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTELSLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATAN .. : :. :.::: .::. :. . ::: :::... : .: ..::: :: NP_065 HKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 AYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLP---DNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEW . : : :.:. : ..:..: .:. : . :.: ::::..::::.::.. .: NP_065 NDIFLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSF----LAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EVGICKDSVSRKGNLPKPPGD--LFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL :.:. ..:.. : : :: : .: . ::...::: :.. .:. .::.:: NP_065 AFGVCNMYRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV : :. ..: . .. ::::..:. ::. ::::: :. NP_065 DCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFC-CIHF 420 430 440 450 >>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa) initn: 827 init1: 274 opt: 768 Z-score: 512.5 bits: 104.2 E(85289): 8.3e-22 Smith-Waterman score: 1009; 36.8% identity (67.2% similar) in 476 aa overlap (2-461:15-481) 10 20 30 40 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEH ::: .:::. : .: .::.:.. :: ::::.:: .:. : ::. NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 NTPLSCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALS- . . :: : .: . .. :..:: .. ::.::.. . .::. : .::: NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLC----PQHHEALSL 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 ---DDEQGGSAFVAQSHGANRVHLS---SEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHE .:... . : :: ..:.: ..: ....::::. :. :. . .: . : NP_742 FCYEDQEAVCLICAISH-THRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 KERVKLCQEETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQ ... .. ... .: .. :. ..:. : ::.:. :. ::.::.. ...::.: .: . NP_742 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE4 QIRSLSKMIAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTELSLCR------- . :.:... :..:.. .:.:: :..:...::. : . . :.:.. . : . NP_742 KRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKV--KTMEVTSVSIELEKNFSNFPR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 -ITGMKEMLRKFSTEITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSR-QQLPDNPERFDQSATVL .....:... ...:::: ::. :::::: ::::. .: ..:::.:.:: :: NP_742 QYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVL 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 GTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWV .:. :::::::::::::.::.: ::.:.:::::::.: : . . : :: :. . NP_742 ATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAA-T 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 SSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPN ..:. :.. .::.:::::.: ..::: ::.: ::.: . .: : : :.: : . NP_742 TTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYPGIRA 420 430 440 450 460 470 460 pF1KE4 EGTNTDPLTICSLNSHV :. :::: NP_742 GRKNAAPLTIRPPTDWE 480 468 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 16:55:37 2016 done: Mon Nov 7 16:55:39 2016 Total Scan time: 10.050 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]