FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4095, 468 aa 1>>>pF1KE4095 468 - 468 aa - 468 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3553+/-0.00112; mu= -1.4564+/- 0.066 mean_var=222.7620+/-46.538, 0's: 0 Z-trim(109.7): 129 B-trim: 13 in 1/50 Lambda= 0.085932 statistics sampled from 10921 (11050) to 10921 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16 Scan time: 2.810 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 3112 399.0 5.6e-111 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 1112 151.0 2.4e-36 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 1027 140.5 3.7e-33 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 929 128.4 1.7e-29 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 895 124.1 2.9e-28 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 893 123.9 3.5e-28 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 871 121.1 2.3e-27 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 864 120.3 4.2e-27 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 811 113.7 4.2e-25 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 782 110.1 4.9e-24 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 779 109.7 6.3e-24 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 778 109.6 6.9e-24 CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 771 108.7 1.2e-23 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 768 108.4 1.7e-23 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 766 108.1 1.9e-23 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 757 107.0 4.3e-23 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 742 105.2 1.6e-22 CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 681 97.6 2.9e-20 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 599 87.4 3.4e-17 CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 581 85.2 1.6e-16 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 576 84.6 2.6e-16 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 558 82.4 1.2e-15 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 558 82.4 1.2e-15 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 556 82.1 1.5e-15 CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 539 80.0 6.6e-15 CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 539 80.1 7e-15 CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 537 79.8 7.7e-15 CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 279) 528 78.5 1e-14 CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 532 79.3 1.6e-14 CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 521 77.7 2e-14 CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 521 77.7 2.5e-14 CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 521 77.8 2.7e-14 CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 521 77.8 3e-14 CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 521 77.8 3e-14 CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 516 77.2 4.5e-14 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 511 76.5 6.7e-14 CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 504 75.6 9.2e-14 CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 504 75.7 1.2e-13 CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 504 75.7 1.3e-13 CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 263) 493 74.1 1.9e-13 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 498 74.9 2.1e-13 CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 493 74.2 2.1e-13 CCDS46694.1 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 317) 486 73.3 4.1e-13 CCDS43009.2 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 378) 486 73.4 4.7e-13 CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 483 73.1 7.3e-13 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 479 72.5 8e-13 CCDS13904.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 288) 472 71.6 1.3e-12 CCDS43011.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 317) 472 71.6 1.4e-12 CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 354) 471 71.5 1.6e-12 CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 472 71.7 1.9e-12 >>CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 (468 aa) initn: 3112 init1: 3112 opt: 3112 Z-score: 2105.9 bits: 399.0 E(32554): 5.6e-111 Smith-Waterman score: 3112; 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40.3% identity (66.6% similar) in 467 aa overlap (1-462:1-455) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL :.. :: ::.:: :: ::::::..:: :.:::.:: :. : : . . : .:::: . CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ ... :. :...: .::.:. : :: : : .: .:. . : . CCDS31 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHP---PSPVPQGVCPAHREPLAA-FCGDELRLLCAACER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQ : : :.::. ..: : . ::.. :. :: . ..: .. : : :. ... .: CCDS31 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS :..:. .....: :::: :: ::.:: : . .::.. .: :: :...::..:. CCDS31 NVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATA : :. :.... ::.: . . :: ::.. :: ..::. :. : ::.: ..:::: :: CCDS31 QLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEV : :.:::: .::. : :: :::.::::: . ::: . :::::::::::::..: : . CCDS31 NPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 GICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYES :.:...:.:: . :. : .. . .:. :. :: .:.: .::.:::::. CCDS31 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 GHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV ::..::..:: ::.. ::. :. .:::.::: ... :.::: CCDS31 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 >>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa) initn: 744 init1: 463 opt: 1027 Z-score: 708.9 bits: 140.5 E(32554): 3.7e-33 Smith-Waterman score: 1027; 39.6% identity (66.7% similar) in 475 aa overlap (1-465:1-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL :..: . . ::.:: :::: : ::. ::::::: :. : .. :: : . . CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECI--SQVGKGGGSVCPVCRQRF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYG-RMPTTAKALSD-DEQGGSAFV-- ... :..:. ... ... :: : ..:. : : . .. : :. :.:. CCDS44 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEI-SQ----EAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 -AQSHGANRVHLS---SEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETK :::. .: : :: ....:::: :. :: ... :. . .. . .. .. CCDS44 CAQSR-KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQI : :. . .:......:: :::: ::: ::..:.:..: : ..: ::.:: ..:...:... CCDS44 TQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISEL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLD . .:::.: :.:: .::::: :. . :. :: :.:.. :.:.::: ...:::: CCDS44 DRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 PATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKT : ::: .:.:::: ..:. : ..:..: : ::::. :::.: : ::.:::::.: .: CCDS44 PDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL :..:.:.::: :::.. . : : : . : . : :.. : :.::.:: CCDS44 AWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAG-TYPQTPLHLQVPPCQVGIFL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDE-SLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV :::.: ..::: ::. :::::: . .: :::.::: . . : :: :::.: :: CCDS44 DYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQG 420 430 440 450 460 470 CCDS44 STDY >>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 (486 aa) initn: 712 init1: 343 opt: 929 Z-score: 643.1 bits: 128.4 E(32554): 1.7e-29 Smith-Waterman score: 929; 36.4% identity (64.4% similar) in 461 aa overlap (1-448:1-451) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTP----LSCPEC :. : : :::. : .:::... ::...::::::: :. . :. . .::.: CCDS16 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 WRTLEGPHFQSNERLGR-LASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAF .:: :. : .: ::......: : . .: . . ...... . CCDS16 ----RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCW 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VAQSHGANRVHLSS---EAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEK---ERVKLCQE : .. .:.: .. :: .. ::: :.:.: :: . .::.: ... . .: CCDS16 VCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMR---KELEDALTQEANVGKKTVIWKE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 ETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMI ... .: :. : . :: .::: ::. :: ::. ....::... .:.:: ..:... CCDS16 KVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 AQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEI ... : :. :: :::.: ::. . : :: . : : : .:.::::.... CCDS16 DELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 TLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVG ::::::. :.:. ::.::. : ...:.:::::: .:: : :.:::::::: :: CCDS16 KLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 NKTEWEVGICKDSVSRKGNL-PKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKV . .:: .:.:.:.. :::. :.: . ...: :: :..: . .: . ... : : . CCDS16 EGAEWGLGVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLK-GNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-I 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 GVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSH :.:::::.:.:.::: :: : ::.: : :. ::: : : CCDS16 GIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWA 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 V CCDS16 SRDHLDPASDVRDDHL 480 >>CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 704 init1: 407 opt: 895 Z-score: 620.8 bits: 124.1 E(32554): 2.9e-28 Smith-Waterman score: 895; 34.7% identity (64.6% similar) in 444 aa overlap (4-445:3-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL .: .. ...:: : ::..:: .::: .:::::: :: :: .:. :: : . CCDS73 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQ-GGSAFVAQS : :.:..: : .:.:.::: : : ..: :. . .: . : . CCDS73 EKPNFNTNVVLKKLSSLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQVVV : :. . : :. :::: . .. : .:.. :..: . . .. ... :.... CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETRTFHSLKDYVSVRKRIIT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 SEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSSQSS .:.:: :: :::: .:: ::.: .: ...:.......::... .. : .. . . CCDS73 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHVP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 AFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATANAY : :..::.. :.. .: :. .. :: : : :::. .:: .: .. .:. : CCDS73 DVELLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWC-ITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEVGIC . ::::.. : .: .. . : .:. : : .: :.: ::::.:::::.: ...: .:.: CCDS73 ISLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVD-SFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 KDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYESGHI .:: . .:. . : ::. : .. ::: ..:: :.:..:. .:::::::..: . CCDS73 QDSRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGQVGVFLDYDNGSV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 AFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV .:.. . ::::.:: .::. :::.: CCDS73 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 >>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 693 init1: 406 opt: 893 Z-score: 619.4 bits: 123.9 E(32554): 3.5e-28 Smith-Waterman score: 893; 34.7% identity (64.4% similar) in 444 aa overlap (4-445:3-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL .: .. ...:: : ::..:: .::: .:::::: :: :: .:. :: : .: CCDS53 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQ-GGSAFVAQS : :.:..: : .:.:.::: : : ..: :. . .: . : . CCDS53 EKPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQVVV : :. . : :. :::: . .. : .:.. :..: . .. ... :.... CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 SEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSSQSS .:.:: :: :::: .:: ::.: .: ...:.......::... .. : .. . . CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 AFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATANAY :..::.. :.. .: :. .. :: : : :::. .:: .: .. .:. : CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWC-ITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEVGIC . ::::.. : .: .. . : .:. : : .: :.: ::::.:::::.: ...: .:.: CCDS53 ISLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVD-SFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 KDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYESGHI .:: . .:. . : ::. : .. ::: ..:: :.:..:. .:::::::..: . CCDS53 RDSRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 AFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV .:.. . ::::.:: .::. :::.: CCDS53 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 >>CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 (446 aa) initn: 820 init1: 310 opt: 871 Z-score: 604.7 bits: 121.1 E(32554): 2.3e-27 Smith-Waterman score: 871; 33.5% identity (63.6% similar) in 445 aa overlap (4-445:3-441) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL .:. . ...:::: :::.:. .::: :::::: :: :::: ..: .:: : . CCDS20 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFV---A :..: : :..:::. . : ..: : : : . : ... .. . CCDS20 PKMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQIC-GTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 QSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQV : :::.. : :: :.::::: . . .: . .: : : .: . . : . .. :. CCDS20 QEHGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSSQ . .:: :.: :..::. .:. :..: .: ...:. . .:. :. . :..: .. . CCDS20 IRNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCH 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 SSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTELSLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATANA . : :... . ::: .::. :. .. ::. :::. : .: .::.. ..: CCDS20 KPDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 YLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEVGI . : ::..: . .. : : .: : :. :...:. :.::::..: :. .: .:. CCDS20 NIRLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAA-WGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 CKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYESGH :..: ::.. :.: :. ::. . ..: ..::. .....:. .::::::.::: CCDS20 CNNSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 IAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV ..: : : :::.:.: .:. .::.: CCDS20 VSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR 420 430 440 >>CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 (450 aa) initn: 864 init1: 327 opt: 864 Z-score: 600.0 bits: 120.3 E(32554): 4.2e-27 Smith-Waterman score: 864; 34.4% identity (64.1% similar) in 451 aa overlap (4-445:3-445) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL .: .. ...:: : ::..:: .::::.: :::: :: :: .:. :: : . CCDS73 MDSDTLRVFQNELICCICVNYFIDPVTTDCVHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPLCRKIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSED------EQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSA : :.:..: : .:::.::: : : ..: : :. . . . : . . CCDS73 EKPNFNTNVALKKLASLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FVAQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQE-ETKT .:.::. .. ::: . .:: . .. : .:.: : ..: :.:. . . CCDS73 HMAHSHSP----IGWAAEECRVQKLIKEMDYLWKINQETQNNL--NQETSKFCSLVDYVS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 CKQVVVS-EYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQI ..:... .:.::: :: :::: .:: ::.: :: ...:.......::...... : .. CCDS73 LRKVIITIQYQKMHIFLDEEEQRHLQALEREAKELFQQLQDSQVRMTQHLEGMKDMYREL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLD . . : :..: . :.. . :. .. :: : : :::. .:: .: .. .:. CCDS73 WETYHMPDVELLQDVGNISARTDLAQMPKPQPVNPELTSWC-ITGVLDMLNNFRVDNALS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 PATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKT . :. ::::.. : .: .... : .:. . : .: .: ::::.:::::.: ... CCDS73 TEMTPCYISLSEDVRRVIFGDDHRSAPMDPQGVE-SFAVWCAQAFTSGKHYWEVDVTHSS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL .: .:.:.:: . :. : :. : .. ::: ..:: :.:..:. ::::: CCDS73 NWILGVCRDSRTADTNIVIDSDKTFFSISSKTSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGWVGVFL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV ::..: ..:.. . ::::.:: .::. :::.: CCDS73 DYDNGSVSFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 450 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 722 init1: 227 opt: 811 Z-score: 564.1 bits: 113.7 E(32554): 4.2e-25 Smith-Waterman score: 811; 32.8% identity (61.5% similar) in 473 aa overlap (1-453:1-464) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEE---------HNTPL : ...: ..:.:: :: ::::::..:: : :::.:: .:. :::. .. . CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SCPECWRTLEGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQG :::: . .. :. : ..: .:.: ::..: . . : : . . .:. CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ--HPGLQKQDLCQEH-HEPL--KLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSAFV---AQSHGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQ : .. : .:: . :: . .. ::.: .. :: . .. . ..:.. . : CCDS15 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKM ..: .. .: :. ::. .: :::: :: :: ::.:. .::.. : .: .:: . CCDS15 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 IAQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEAT--TTELSLCRITGMKEMLRKFST . :.: : .. .. :.... : :.. . .::::.. : ..::. :. :.:: : CCDS15 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EITLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPD--NPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWE ... : ..: ::.: :. .. .: :: . . .:: ..: :.::::::: CCDS15 DVVPDATSAYPYLLLYES-RQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 V--EVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVRE : .. . . : .:.:.:.:::: .:: : . : .. :. : : : . : : . : CCDS15 VGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLME 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 PVCKVGVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCL--PNEGTNTDPLT : ..:.:::.:.:...::. .: : .... ::.: :.:.: :: :. : CCDS15 PPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTV 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSLNSHV CCDS15 TMWVKG >>CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 793 init1: 273 opt: 782 Z-score: 545.0 bits: 110.1 E(32554): 4.9e-24 Smith-Waterman score: 782; 32.0% identity (63.1% similar) in 453 aa overlap (6-449:5-450) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL ... .. :: : .:..:: .::: .:::::: :. .:.. ..: :: .. CCDS53 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKST 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQSH : ....: .: ..::.::.. .. : .:: : : : . . ... .. .: CCDS53 EQINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMC-GTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 GANRVHLSSEAE---EHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCK-Q .: : : :.::::: . .. : . : . :. : :.. : .. . . . CCDS53 QEHRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTR-CWKDYVNLRLE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS .. .::.:: : .:::. .:..:... :: ...:. .. :...... : : ... CCDS53 AIRAEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTELSLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATAN .. : :. :.::: .::. :. . ::: :::... : .: ..::: :: CCDS53 HKPDVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 AYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLP---DNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEW . . : : :.:. : ..:..: .:. : . :.: ::::..::::.::.. .: CCDS53 SDIFLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSF----LAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EVGICKDSVSRKGNLPKPPGD--LFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFL :.:. ..:.. : : :: : .: . ::...::: :.. .:. .::.:: CCDS53 AFGVCNMYRKEKNQNEKIDGKEGLFLLGCIKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 DYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV : :. ..: . .. ::::..:. ::. ::::: :. CCDS53 DCEAKTVSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFC-CIHF 420 430 440 450 468 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 16:55:36 2016 done: Mon Nov 7 16:55:37 2016 Total Scan time: 2.810 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]