FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4086, 449 aa 1>>>pF1KE4086 449 - 449 aa - 449 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7562+/-0.00102; mu= 12.6228+/- 0.061 mean_var=173.1902+/-36.519, 0's: 0 Z-trim(110.0): 134 B-trim: 412 in 1/51 Lambda= 0.097457 statistics sampled from 11136 (11286) to 11136 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.347), width: 16 Scan time: 2.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 3120 451.1 1.1e-126 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 3078 445.2 6.4e-125 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 2811 407.6 1.3e-113 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 1446 215.7 7.6e-56 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 1356 203.1 4.9e-52 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 1348 201.9 1.1e-51 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 1323 198.4 1.2e-50 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 1263 190.0 4.2e-48 CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 1204 181.7 1.3e-45 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 910 140.4 3.8e-33 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 893 138.0 2e-32 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 888 137.3 3.3e-32 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 788 123.2 5.7e-28 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 781 122.2 1.1e-27 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 694 110.0 5.4e-24 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 677 107.6 2.7e-23 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 634 101.6 1.8e-21 CCDS7947.2 TRIM48 gene_id:79097|Hs108|chr11 ( 224) 568 91.9 7e-19 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 565 91.9 1.6e-18 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 558 90.9 3e-18 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 514 84.7 2.3e-16 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 502 82.9 5.7e-16 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 500 82.7 8.8e-16 CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 452 75.9 8.8e-14 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 450 75.7 1.1e-13 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 450 75.7 1.2e-13 CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 439 74.2 3.3e-13 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 434 73.5 5.5e-13 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 429 72.8 9.2e-13 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 429 72.8 9.2e-13 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 420 71.5 2.1e-12 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 420 71.5 2.2e-12 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 420 71.8 3.1e-12 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 412 70.4 4.7e-12 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 408 69.6 5.3e-12 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 408 69.6 5.5e-12 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 401 68.7 1.2e-11 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 401 68.8 1.3e-11 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 397 68.2 1.8e-11 >>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 3120 init1: 3120 opt: 3120 Z-score: 2388.1 bits: 451.1 E(32554): 1.1e-126 Smith-Waterman score: 3120; 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90.9% identity (94.2% similar) in 450 aa overlap (1-449:1-450) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE :::: :.:::::::::::::::::::: :: :::::::::::::::::::::: ::: :: CCDS73 MDSDTLRVFQNELICCICVNYFIDPVTTDCVHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPLCRKISE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPEH :::::::..::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 KPNFNTNVALKKLASLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPEH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 MAHSHSPIGWAAEECR-EKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT :::::::::::::::: .::::::::::.:::::.:::::::: : :: ::::.:: ::: CCDS73 MAHSHSPIGWAAEECRVQKLIKEMDYLWKINQETQNNLNQETSKFCSLVDYVSLRKVIIT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP :::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::: ::: CCDS73 IQYQKMHIFLDEEEQRHLQALEREAKELFQQLQDSQVRMTQHLEGMKDMYRELWETYHMP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI :: ::::: :.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::: :::: CCDS73 DVELLQDVGNISARTDLAQMPKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDNALSTEMTPCYI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD ::::::: ::::::: ::: :::::.::::: :::::::::::::::: ::::::::::: CCDS73 SLSEDVRRVIFGDDHRSAPMDPQGVESFAVWCAQAFTSGKHYWEVDVTHSSNWILGVCRD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSVSF :::::.:.:::::. :: :::: :::::::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS73 SRTADTNIVIDSDKTFFSISSKTSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGWVGVFLDYDNGSVSF 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE4 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 430 440 450 >>CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 (446 aa) initn: 1444 init1: 660 opt: 1446 Z-score: 1116.1 bits: 215.7 E(32554): 7.6e-56 Smith-Waterman score: 1446; 48.0% identity (73.7% similar) in 448 aa overlap (1-447:1-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE :::: ..::.:: : ::.::..::::: :::::::::::: ::...: ::.::. : CCDS20 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRP-QNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE : .:.::..::.: ..::.. : ..: .:: :..::..::. :: ::: ::.: : CCDS20 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT : ::.: :: :::: ::::.:.: ::. ::.. :: .: : . : .: ..: CCDS20 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP .:.:. : .::..::. :..: .:.::::: : :.: :. ...:.::.:: : :: : CCDS20 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI :: ::::. .. ::.. . .. :::::::::. :::.. :: :::. .. :. : CCDS20 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD : :::: .: .: . . : ::.:::..:. ::::::.:: : .: :::: . CCDS20 RLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSVSF : . ...:.. :.:. : .::..: :.:: . .:...::::::::::...::::: CCDS20 SWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVSF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT ..:.:.:::...: .:.. :.:::: : CCDS20 LNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR 420 430 440 >>CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1315 init1: 795 opt: 1356 Z-score: 1047.7 bits: 203.1 E(32554): 4.9e-52 Smith-Waterman score: 1356; 47.1% identity (71.7% similar) in 448 aa overlap (1-445:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE :.: :::::.:::: .:.:::::::::::::::::::. : .. ..: : :..: CCDS53 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQN-INSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE . :..::. :::..::::.. ..: ...: :.:::..:::.:. ::: :: : : CCDS53 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT : : : :: ::::: ::::...:. ::: :.. ::: ::. . ::::..: . : CCDS53 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP .::::: : :::...:. :.....:.:..:. :...:....: .. ::.:: : :: : CCDS53 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI :: ::: .. :.. . .. :::.::::.. :::. : ::.::: .: : : CCDS53 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD : : .: . .: :: ..: :: .::.:.:::::.:::: : : :: .::: CCDS53 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SRTA-DANFVIDSDERFFLISSKRSN-HYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSV : . : ::. : .::.. ... . :: :.:: ..::. .: .:::.::: . .: CCDS53 YRKEKNQNEKIDGKEGLFLLGCIKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE4 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT :: ::...:::: .: ::: ::::.:: CCDS53 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1314 init1: 794 opt: 1348 Z-score: 1041.6 bits: 201.9 E(32554): 1.1e-51 Smith-Waterman score: 1348; 46.9% identity (71.4% similar) in 448 aa overlap (1-445:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE :.: :::::.:::: .:.:::::::::::::::::::. : .. ..: : :..: CCDS82 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQN-INSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE . :..::. :::..::::.. ..: ...: :.:::..:::.:. ::: :: : : CCDS82 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT : : : :: ::::: ::::...:. ::: :.. ::: ::. . ::::..: . : CCDS82 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP .::::: : :::...:. :.....:.:..:. :...:....: .. ::.:: : :: : CCDS82 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI :: ::: .. :.. . .. :::.::::.. :::. : ::.::: .: : : CCDS82 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD : : .: . .: :: ..: :: .::.:.:::::.:::: : : :: .::: CCDS82 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SRTA-DANFVIDSDERFFLISSKRSN-HYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSV : . : ::. .::.. ... . :: :.:: ..::. .: .:::.::: . .: CCDS82 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE4 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT :: ::...:::: .: ::: ::::.:: CCDS82 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1287 init1: 767 opt: 1323 Z-score: 1022.6 bits: 198.4 E(32554): 1.2e-50 Smith-Waterman score: 1323; 46.4% identity (71.2% similar) in 448 aa overlap (1-445:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE :.: ::::: :::: ::.:::::::::::::::::::. : ... ..: : :.. CCDS55 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDSPFLVQCSECTKSTG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQN-INSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE . :..::. .::..::::.. ..: ...: :.:::..:::.:. ::: :: : : CCDS55 QINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT : : : :: :::: .:::...:. ::: :.. ::: ::. . ::::..: . : CCDS55 HRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP .::::: : :::...:. :.......:..:. :...:... : .. ::.:: : :: : CCDS55 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI :: ::: .. :.. . .. :::.::::.. :::. : ::.::: .: : : CCDS55 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD : : .: . .: :: ..: :: .::::.:::::.:::: : : :: .::: CCDS55 FLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 S-RTADANFVIDSDERFFLISSKRSN-HYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSV . . : ::... .::.. ... . :: :.:: :.::. :: .:::.::: . .: CCDS55 YWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLLLQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE4 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT :: ::...:::: .: ::: ::::.:: CCDS55 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1241 init1: 765 opt: 1263 Z-score: 977.0 bits: 190.0 E(32554): 4.2e-48 Smith-Waterman score: 1263; 45.1% identity (69.0% similar) in 448 aa overlap (1-445:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE :.: :::: :: : ::.:::::::::::::::::::. : .. .: : ::.. CCDS60 MNSGISQVFQRELTCPICLNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPILTQCFECLKTTQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQN-INSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE . :..::. :::..: ::.. ..: ...: :.:::..:::.:. ::: :: : : CCDS60 QRNLKTNIRLKKMASRARKASLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSLE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT : : : : ::::: ::::.:.:. ::: :.. ::: ::. . ::::.:: . : CCDS60 HRYHRHCPAEWAAEEHREKLLKKMQSLWEKVCENQRNLNVETTRISHWKDYVNVRLEAIR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP .::::: : :::...:. :.......:..:. :...:... : .. : :: . :: : CCDS60 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGTYAELMKMCHKP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI :: ::: .. :.. . .. :::.: :: . :::. : ::.:::: .: . .: CCDS60 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNLELRAGPITGLRDRLNQFRVDITLPHNEANSHI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD :.: . .: :. .:: :: .::::.:::::.:::: : : :: .::: CCDS60 FRRGDLRSICIGCDRQNAPHITATPTSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 S-RTADANFVIDSDERFFLISSKRSN-HYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSV . .. : : ..: .: .. ... . :: :.:: .::: :: ..::.::: . .: CCDS60 YWKGTNQNGNIHGEEGLFSLGCVKNDIQCSLFTTSPLTLQYVPRPTNHVGLFLDCEARTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE4 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT :: ::...: :. .: ::: ::::.:: CCDS60 SFVDVNQSSPIHTIPNCSFSPPLRPIFCCVHL 430 440 450 >>CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 (450 aa) initn: 1201 init1: 966 opt: 1204 Z-score: 932.2 bits: 181.7 E(32554): 1.3e-45 Smith-Waterman score: 1204; 41.1% identity (68.1% similar) in 448 aa overlap (1-447:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE : : : .:: : ::..:. ::::: ::: :: ::::: :. .: :: ::. :. 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