FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4273, 1189 aa 1>>>pF1KE4273 1189 - 1189 aa - 1189 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1466+/-0.00109; mu= 18.8155+/- 0.066 mean_var=94.4176+/-18.908, 0's: 0 Z-trim(104.9): 62 B-trim: 35 in 1/49 Lambda= 0.131992 statistics sampled from 8081 (8134) to 8081 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16 Scan time: 4.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7588.1 TDRD1 gene_id:56165|Hs108|chr10 (1189) 7964 1527.9 0 CCDS55017.1 TDRD6 gene_id:221400|Hs108|chr6 (2066) 414 90.4 5e-17 CCDS34470.1 TDRD6 gene_id:221400|Hs108|chr6 (2096) 414 90.4 5e-17 CCDS41395.1 TDRKH gene_id:11022|Hs108|chr1 ( 516) 301 68.5 4.8e-11 CCDS41394.1 TDRKH gene_id:11022|Hs108|chr1 ( 561) 301 68.5 5.2e-11 >>CCDS7588.1 TDRD1 gene_id:56165|Hs108|chr10 (1189 aa) initn: 7964 init1: 7964 opt: 7964 Z-score: 8192.7 bits: 1527.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7964; 100.0% identity (100.0% similar) in 1189 aa overlap (1-1189:1-1189) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSVKSPFNVMSRNNLEAPPCKMTEPFNFEKNENKLPPHESLRSPGTLPNHPNFRLKSSEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 MSVKSPFNVMSRNNLEAPPCKMTEPFNFEKNENKLPPHESLRSPGTLPNHPNFRLKSSEN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GNKKNNFLLCEQTKQYLASQEDNSVSSNPNGINGEVVGSKGDRKKLPAGNSVSPPSAESN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 GNKKNNFLLCEQTKQYLASQEDNSVSSNPNGINGEVVGSKGDRKKLPAGNSVSPPSAESN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SPPKEVNIKPGNNVRPAKSKKLNKLVENSLSISNPGLFTSLGPPLRSTTCHRCGLFGSLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 SPPKEVNIKPGNNVRPAKSKKLNKLVENSLSISNPGLFTSLGPPLRSTTCHRCGLFGSLR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 CSQCKQTYYCSTACQRRDWSAHSIVCRPVQPNFHKLENKSSIETKDVEVNNKSDCPLGVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 CSQCKQTYYCSTACQRRDWSAHSIVCRPVQPNFHKLENKSSIETKDVEVNNKSDCPLGVT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KEIAIWAERIMFSDLRSLQLKKTMEIKGTVTEFKHPGDFYVQLYSSEVLEYMNQLSASLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 KEIAIWAERIMFSDLRSLQLKKTMEIKGTVTEFKHPGDFYVQLYSSEVLEYMNQLSASLK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 ETYANVHEKDYIPVKGEVCIAKYTVDQTWNRAIIQNVDVQQKKAHVLYIDYGNEEIIPLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 ETYANVHEKDYIPVKGEVCIAKYTVDQTWNRAIIQNVDVQQKKAHVLYIDYGNEEIIPLN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 RIYHLNRNIDLFPPCAIKCFVANVIPAEGNWSSDCIKATKPLLMEQYCSIKIVDILEEEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RIYHLNRNIDLFPPCAIKCFVANVIPAEGNWSSDCIKATKPLLMEQYCSIKIVDILEEEV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 VTFAVEVELPNSGKLLDHVLIEMGYGLKPSGQDSKKENADQSDPEDVGKMTTENNIVVDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VTFAVEVELPNSGKLLDHVLIEMGYGLKPSGQDSKKENADQSDPEDVGKMTTENNIVVDK 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 SDLIPKVLTLNVGDEFCGVVAHIQTPEDFFCQQLQSGRKLAELQASLSKYCDQLPPRSDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 SDLIPKVLTLNVGDEFCGVVAHIQTPEDFFCQQLQSGRKLAELQASLSKYCDQLPPRSDF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 YPAIGDICCAQFSEDDQWYRASVLAYASEESVLVGYVDYGNFEILSLMRLCPIIPKLLEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 YPAIGDICCAQFSEDDQWYRASVLAYASEESVLVGYVDYGNFEILSLMRLCPIIPKLLEL 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 PMQAIKCVLAGVKPSLGIWTPEAICLMKKLVQNKIITVKVVDKLENSSLVELIDKSETPH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 PMQAIKCVLAGVKPSLGIWTPEAICLMKKLVQNKIITVKVVDKLENSSLVELIDKSETPH 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 VSVSKVLLDAGFAVGEQSMVTDKPSDVKETSVPLGVEGKVNPLEWTWVELGVDQTVDVVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VSVSKVLLDAGFAVGEQSMVTDKPSDVKETSVPLGVEGKVNPLEWTWVELGVDQTVDVVV 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 CVIYSPGEFYCHVLKEDALKKLNDLNKSLAEHCQQKLPNGFKAEIGQPCCAFFAGDGSWY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 CVIYSPGEFYCHVLKEDALKKLNDLNKSLAEHCQQKLPNGFKAEIGQPCCAFFAGDGSWY 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE4 RALVKEILPNGHVKVHFVDYGNIEEVTADELRMISSTFLNLPFQGIRCQLADIQSRNKHW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RALVKEILPNGHVKVHFVDYGNIEEVTADELRMISSTFLNLPFQGIRCQLADIQSRNKHW 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE4 SEEAITRFQMCVAGIKLQARVVEVTENGIGVELTDLSTCYPRIISDVLIDEHLVLKSASP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 SEEAITRFQMCVAGIKLQARVVEVTENGIGVELTDLSTCYPRIISDVLIDEHLVLKSASP 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE4 HKDLPNDRLVNKHELQVHVQGLQATSSAEQWKTIELPVDKTIQANVLEIISPNLFYALPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 HKDLPNDRLVNKHELQVHVQGLQATSSAEQWKTIELPVDKTIQANVLEIISPNLFYALPK 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE4 GMPENQEKLCMLTAELLEYCNAPKSRPPYRPRIGDACCAKYTSDDFWYRAVVLGTSDTDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 GMPENQEKLCMLTAELLEYCNAPKSRPPYRPRIGDACCAKYTSDDFWYRAVVLGTSDTDV 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE4 EVLYADYGNIETLPLCRVQPITSSHLALPFQIIRCSLEGLMELNGSSSQLIIMLLKNFML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 EVLYADYGNIETLPLCRVQPITSSHLALPFQIIRCSLEGLMELNGSSSQLIIMLLKNFML 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE4 NQNVMLSVKGITKNVHTVSVEKCSENGTVDVADKLVTFGLAKNITPQRQSALNTEKMYRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 NQNVMLSVKGITKNVHTVSVEKCSENGTVDVADKLVTFGLAKNITPQRQSALNTEKMYRM 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE4 NCCCTELQKQVEKHEHILLFLLNNSTNQNKFIEMKKLLKKTASLGGKPL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 NCCCTELQKQVEKHEHILLFLLNNSTNQNKFIEMKKLLKKTASLGGKPL 1150 1160 1170 1180 >>CCDS55017.1 TDRD6 gene_id:221400|Hs108|chr6 (2066 aa) initn: 397 init1: 247 opt: 414 Z-score: 419.2 bits: 90.4 E(32554): 5e-17 Smith-Waterman score: 633; 23.6% identity (51.3% similar) in 1004 aa overlap (258-1151:246-1199) 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EVNNKSDCPLGVTKEIAIWAERIMFSDLRSLQLKKTMEIKGTVTEFKHPGDFYVQLYSSE ::: : . ..:. :: .. :: : CCDS55 ATASVGSGVPVLSRVPLKQKQPGLDYFYPQLQLGVTEAV--VITQVCHPHRIHCQLRS-- 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 pF1KE4 VLEYMNQLSASLKETY-------------ANVHEKDYIPVK-GEVCIAKYTVDQTWNRAI : . ...:: :. ..: :. .:.. : : : : :. .: : ::. CCDS55 VSQEIHRLSESMAQVYRGSTGTGDENSTSATWEEREESPDKPGSPC-ASCGLDGHWYRAL 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 IQNVDVQQKKAHVLYIDYGNEEIIPLNRIYHLNRNIDLFPPCAIKCFVANVIPAEGNWSS . .. :. :.::..::: .:.. . . .: . .: . : . .. . .:: CCDS55 LLETFRPQRCAQVLHVDYGRKELVSCSSLRYLLPEYFRMPVVTYPCALYGLWDGGRGWSR 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 DCIKATKPLLMEQYCSIKIVDILEEEVVTFAVEVELPNSGKLLDHVLIEMGYGLKP---S . . : :.. . . :: : .: . :. : . .. .:.. . CCDS55 SQVGDLKTLILGKAVNAKI-----EFYCSFEHVYYVSLYGE--DGINLNRVFGVQSCCLA 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 pF1KE4 GQDSKKENADQSDPEDVGKMTTENNIVVDKSDLIP--KVLTLNVGDEFCGVVAHIQTPED . ... ... .:: ... .. ::. .: . . :... . . : ...: . CCDS55 DRVLQSQATEEEEPETSQSQSPAEE--VDEEISLPALRSIRLKMNAFYDAQVEFVKNPSE 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 FFCQQLQSGRKLAELQASLSKYCDQLPPRSDF-----YPAIGDICCAQFSEDDQWYRASV :. . . . ...: . ..: : . : :.::....:. .::: . CCDS55 FWIRLRKHNVTFSKL---MRRMCGFYSSASKLDGVVLKPEPDDLCCVKWKENG-YYRA-I 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 LAYASEESVLVGYVDYGNFEILSLMRLCPIIPKLLELPMQAIKCVLAGVKPSLGIWTPEA .. ...:: : :: :: : .. . . ..:.. .::. :.::.:: . : :. :: CCDS55 VTKLDDKSVDVFLVDRGNSENVDWYDVRMLLPQFRQLPILAVKCTLADIWPLGKTWSQEA 560 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 pF1KE4 ICLMKKLVQNKIITVKVVDKLENSSLVELIDKSETPHVSVSKVLLDAGFAV--------- . ..:: : .: ......:: ... ..:..:.:.: . ..:::. .::.: CCDS55 VSFFKKTVLHKELVIHILDKQDHQYVIEILDESRTGEENISKVIAQAGYAKYQEFETKEN 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 -----------------------------GEQ--------SMVTDKPSD---VKETSVPL ::: . :. :: : . :. : CCDS55 ILVNAHSPGHVSNHFTTESNKIPFAKTGEGEQKAKRENKTTSVSKALSDTTVVTNGSTEL 680 690 700 710 720 730 700 710 720 730 pF1KE4 GVEGKVN------PLEWTWVE----------LGVDQTVDVVVCVIYSPGEFYCHVLKEDA :. ::. :: . .: : : .::.: : . .:: :.:.. .. CCDS55 VVQEKVKRASVYFPLMQNCLEIKPGSSSKGELEVGSTVEVRVSYVENPGYFWCQLTRN-- 740 750 760 770 780 790 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 LKKLNDLNKSLAEHCQQKLPNGFKAEIGQPCCAFFAGDGSWYRALVKEILPNGHVKVHFV .. :. : ... .:.. . .. : : . . .: :::.. : ::.: :: CCDS55 IQGLKTLMSDIQYYCKNTAAPHQRNTLA--CLAKRTVNRQWSRALISGIQSVEHVNVTFV 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 850 pF1KE4 DYGNIEEVTADELRMISSTFLNLPFQGIRCQLAD-IQSRNKH---WSEEAITRFQMCVAG :::. : :.. .. :: ::.. :..::.: . :: ... :. .:: :. . . CCDS55 DYGDREMVSVKNIYSISEEFLKVKAQAFRCSLYNLIQPVGQNPFVWDVKAIQAFNEFIDN 860 870 880 890 900 910 860 870 880 890 900 910 pF1KE4 I---KLQARVVEVTENGIGVELTDLSTCYPRIISDVLIDEHLVLKSASPHKDLPNDRLVN .:. . . . .:. :: . : :.: ..:: : . ::. CCDS55 AWQKNLELKCTIFALASINEELFN--------IVDLLTP----FQSACHF--LVEKRLAR 920 930 940 950 920 930 940 950 960 970 pF1KE4 KHELQVHVQGLQATSSAEQWKTIELPVDKTIQANVLEIISPNLFYALPKGMPENQEKL-C .:: ... : ..: .. . . . . .: .: :: . :.: : CCDS55 PVKLQKPLESSVQLHSYF-YSTHDMKIGSEELVYITHIDDPWTFYCQLARNANILEQLSC 960 970 980 990 1000 1010 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE4 MLTAELLEYCNAPKSRPPYRPRIGDACCAKYTSDDFWYRAVVLGTSDTDVEVLYADYGNI .: : : : : : : :::: : :::..:. .:...:.::: CCDS55 SITQLSKVLLNLKTS--PLNP--GTLCLAKYT-DGNWYRGIVIEKEPK--KVFFVDFGNI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE4 ETLPLCRVQPITSSH---LALPFQIIRCSLEGLMELNGSSSQLIIMLLKNFMLNQNVMLS .. . :: :. : ::.: .:::: .. . ... ... .:.... CCDS55 YVVTSDDLLPIPSDAYDVLLLPMQAVRCSLS---DIPDHIPEEVVVWFQETILDKSLKAL 1080 1090 1100 1110 1120 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE4 VKGITKNVH-TVSVEKCSENGTVD--VADKLVTFGLAKNITPQRQSALNT------EKMY : ..:. :. .: ..: .. . :: .. : ... .: . :: CCDS55 V--VAKDPDGTLIIELYGDNIQISASINKKLGLLSYKDRIRKKESEVLCSTTETLEEKNE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE4 RMNCCCTE-LQKQVEKHEHILLFLLNNSTNQNKFIEMKKLLKKTASLGGKPL :. ::: :.:.: CCDS55 NMKLPCTEYLSKSVGYKLPNKEILEESYKPQINSSYKELKLLQSLTKTNLVTQYQDSVGN 1190 1200 1210 1220 1230 1240 >>CCDS34470.1 TDRD6 gene_id:221400|Hs108|chr6 (2096 aa) initn: 397 init1: 247 opt: 414 Z-score: 419.1 bits: 90.4 E(32554): 5e-17 Smith-Waterman score: 633; 23.6% identity (51.3% similar) in 1004 aa overlap (258-1151:246-1199) 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EVNNKSDCPLGVTKEIAIWAERIMFSDLRSLQLKKTMEIKGTVTEFKHPGDFYVQLYSSE ::: : . ..:. :: .. :: : CCDS34 ATASVGSGVPVLSRVPLKQKQPGLDYFYPQLQLGVTEAV--VITQVCHPHRIHCQLRS-- 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 pF1KE4 VLEYMNQLSASLKETY-------------ANVHEKDYIPVK-GEVCIAKYTVDQTWNRAI : . ...:: :. ..: :. .:.. : : : : :. .: : ::. CCDS34 VSQEIHRLSESMAQVYRGSTGTGDENSTSATWEEREESPDKPGSPC-ASCGLDGHWYRAL 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 IQNVDVQQKKAHVLYIDYGNEEIIPLNRIYHLNRNIDLFPPCAIKCFVANVIPAEGNWSS . .. :. :.::..::: .:.. . . .: . .: . : . .. . .:: CCDS34 LLETFRPQRCAQVLHVDYGRKELVSCSSLRYLLPEYFRMPVVTYPCALYGLWDGGRGWSR 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 DCIKATKPLLMEQYCSIKIVDILEEEVVTFAVEVELPNSGKLLDHVLIEMGYGLKP---S . . : :.. . . :: : .: . :. : . .. .:.. . CCDS34 SQVGDLKTLILGKAVNAKI-----EFYCSFEHVYYVSLYGE--DGINLNRVFGVQSCCLA 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 pF1KE4 GQDSKKENADQSDPEDVGKMTTENNIVVDKSDLIP--KVLTLNVGDEFCGVVAHIQTPED . ... ... .:: ... .. ::. .: . . :... . . : ...: . CCDS34 DRVLQSQATEEEEPETSQSQSPAEE--VDEEISLPALRSIRLKMNAFYDAQVEFVKNPSE 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 FFCQQLQSGRKLAELQASLSKYCDQLPPRSDF-----YPAIGDICCAQFSEDDQWYRASV :. . . . ...: . ..: : . : :.::....:. .::: . CCDS34 FWIRLRKHNVTFSKL---MRRMCGFYSSASKLDGVVLKPEPDDLCCVKWKENG-YYRA-I 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 LAYASEESVLVGYVDYGNFEILSLMRLCPIIPKLLELPMQAIKCVLAGVKPSLGIWTPEA .. ...:: : :: :: : .. . . ..:.. .::. :.::.:: . : :. :: CCDS34 VTKLDDKSVDVFLVDRGNSENVDWYDVRMLLPQFRQLPILAVKCTLADIWPLGKTWSQEA 560 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 pF1KE4 ICLMKKLVQNKIITVKVVDKLENSSLVELIDKSETPHVSVSKVLLDAGFAV--------- . ..:: : .: ......:: ... ..:..:.:.: . ..:::. .::.: CCDS34 VSFFKKTVLHKELVIHILDKQDHQYVIEILDESRTGEENISKVIAQAGYAKYQEFETKEN 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 -----------------------------GEQ--------SMVTDKPSD---VKETSVPL ::: . :. :: : . :. : CCDS34 ILVNAHSPGHVSNHFTTESNKIPFAKTGEGEQKAKRENKTTSVSKALSDTTVVTNGSTEL 680 690 700 710 720 730 700 710 720 730 pF1KE4 GVEGKVN------PLEWTWVE----------LGVDQTVDVVVCVIYSPGEFYCHVLKEDA :. ::. :: . .: : : .::.: : . .:: :.:.. .. CCDS34 VVQEKVKRASVYFPLMQNCLEIKPGSSSKGELEVGSTVEVRVSYVENPGYFWCQLTRN-- 740 750 760 770 780 790 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 LKKLNDLNKSLAEHCQQKLPNGFKAEIGQPCCAFFAGDGSWYRALVKEILPNGHVKVHFV .. :. : ... .:.. . .. : : . . .: :::.. : ::.: :: CCDS34 IQGLKTLMSDIQYYCKNTAAPHQRNTLA--CLAKRTVNRQWSRALISGIQSVEHVNVTFV 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 850 pF1KE4 DYGNIEEVTADELRMISSTFLNLPFQGIRCQLAD-IQSRNKH---WSEEAITRFQMCVAG :::. : :.. .. :: ::.. :..::.: . :: ... :. .:: :. . . CCDS34 DYGDREMVSVKNIYSISEEFLKVKAQAFRCSLYNLIQPVGQNPFVWDVKAIQAFNEFIDN 860 870 880 890 900 910 860 870 880 890 900 910 pF1KE4 I---KLQARVVEVTENGIGVELTDLSTCYPRIISDVLIDEHLVLKSASPHKDLPNDRLVN .:. . . . .:. :: . : :.: ..:: : . ::. CCDS34 AWQKNLELKCTIFALASINEELFN--------IVDLLTP----FQSACHF--LVEKRLAR 920 930 940 950 920 930 940 950 960 970 pF1KE4 KHELQVHVQGLQATSSAEQWKTIELPVDKTIQANVLEIISPNLFYALPKGMPENQEKL-C .:: ... : ..: .. . . . . .: .: :: . :.: : CCDS34 PVKLQKPLESSVQLHSYF-YSTHDMKIGSEELVYITHIDDPWTFYCQLARNANILEQLSC 960 970 980 990 1000 1010 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE4 MLTAELLEYCNAPKSRPPYRPRIGDACCAKYTSDDFWYRAVVLGTSDTDVEVLYADYGNI .: : : : : : : :::: : :::..:. .:...:.::: CCDS34 SITQLSKVLLNLKTS--PLNP--GTLCLAKYT-DGNWYRGIVIEKEPK--KVFFVDFGNI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE4 ETLPLCRVQPITSSH---LALPFQIIRCSLEGLMELNGSSSQLIIMLLKNFMLNQNVMLS .. . :: :. : ::.: .:::: .. . ... ... .:.... CCDS34 YVVTSDDLLPIPSDAYDVLLLPMQAVRCSLS---DIPDHIPEEVVVWFQETILDKSLKAL 1080 1090 1100 1110 1120 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE4 VKGITKNVH-TVSVEKCSENGTVD--VADKLVTFGLAKNITPQRQSALNT------EKMY : ..:. :. .: ..: .. . :: .. : ... .: . :: CCDS34 V--VAKDPDGTLIIELYGDNIQISASINKKLGLLSYKDRIRKKESEVLCSTTETLEEKNE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE4 RMNCCCTE-LQKQVEKHEHILLFLLNNSTNQNKFIEMKKLLKKTASLGGKPL :. ::: :.:.: CCDS34 NMKLPCTEYLSKSVGYKLPNKEILEESYKPQINSSYKELKLLQSLTKTNLVTQYQDSVGN 1190 1200 1210 1220 1230 1240 >>CCDS41395.1 TDRKH gene_id:11022|Hs108|chr1 (516 aa) initn: 224 init1: 224 opt: 301 Z-score: 311.7 bits: 68.5 E(32554): 4.8e-11 Smith-Waterman score: 301; 31.2% identity (64.4% similar) in 160 aa overlap (713-869:260-418) 690 700 710 720 730 740 pF1KE4 KPSDVKETSVPLGVEGKVNPLEWTWVELGVDQTVDVVVCVIYSPGEFYCHVLKEDALKKL :. ..: : . :..:. ... .:. : CCDS41 SDDSFQKSEAQAIPEMPMFEIPSPDFSFHADEYLEVYVSASEHPNHFWIQIVGSRSLQ-L 230 240 250 260 270 280 750 760 770 780 790 800 pF1KE4 NDLNKSLAEHCQQKLPNGFKAEIGQPCCAFFAGDGSWYRALVKEILPNGHVKVHFVDYGN . : . ...: ....:. . ...:. : . .:::::: : : ::.. ..:::.:. CCDS41 DKLVNEMTQHYENSVPEDLTVHVGDIVAAPLPTNGSWYRARVLGTLENGNLDLYFVDFGD 290 300 310 320 330 340 810 820 830 840 850 pF1KE4 IEEVTADELRMISSTFLNLPFQGIRCQLADIQSRNKHWSEEAITRFQ---MCVAGIKLQA . .:: . : ::.::::.:.:.:: : . .: :::. .:. :. : : CCDS41 NGDCPLKDLRALRSDFLSLPFQAIECSLARIAPSGDQWEEEALDEFDRLTHCADWKPLVA 350 360 370 380 390 400 860 870 880 890 900 910 pF1KE4 RVVEVTENGIGVELTDLSTCYPRIISDVLIDEHLVLKSASPHKDLPNDRLVNKHELQVHV .. ...:: CCDS41 KISSYVQTGISTWPKIYLYDTSNGKKLDIGLELVHKGYAIELPEDIEENRAVPDMLKDMA 410 420 430 440 450 460 >>CCDS41394.1 TDRKH gene_id:11022|Hs108|chr1 (561 aa) initn: 224 init1: 224 opt: 301 Z-score: 311.2 bits: 68.5 E(32554): 5.2e-11 Smith-Waterman score: 301; 31.2% identity (64.4% similar) in 160 aa overlap (713-869:305-463) 690 700 710 720 730 740 pF1KE4 KPSDVKETSVPLGVEGKVNPLEWTWVELGVDQTVDVVVCVIYSPGEFYCHVLKEDALKKL :. ..: : . :..:. ... .:. : CCDS41 SDDSFQKSEAQAIPEMPMFEIPSPDFSFHADEYLEVYVSASEHPNHFWIQIVGSRSLQ-L 280 290 300 310 320 330 750 760 770 780 790 800 pF1KE4 NDLNKSLAEHCQQKLPNGFKAEIGQPCCAFFAGDGSWYRALVKEILPNGHVKVHFVDYGN . : . ...: ....:. . ...:. : . .:::::: : : ::.. ..:::.:. CCDS41 DKLVNEMTQHYENSVPEDLTVHVGDIVAAPLPTNGSWYRARVLGTLENGNLDLYFVDFGD 340 350 360 370 380 390 810 820 830 840 850 pF1KE4 IEEVTADELRMISSTFLNLPFQGIRCQLADIQSRNKHWSEEAITRFQ---MCVAGIKLQA . .:: . : ::.::::.:.:.:: : . .: :::. .:. :. : : CCDS41 NGDCPLKDLRALRSDFLSLPFQAIECSLARIAPSGDQWEEEALDEFDRLTHCADWKPLVA 400 410 420 430 440 450 860 870 880 890 900 910 pF1KE4 RVVEVTENGIGVELTDLSTCYPRIISDVLIDEHLVLKSASPHKDLPNDRLVNKHELQVHV .. ...:: CCDS41 KISSYVQTGISTWPKIYLYDTSNGKKLDIGLELVHKGYAIELPEDIEENRAVPDMLKDMA 460 470 480 490 500 510 1189 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 16:49:57 2016 done: Mon Nov 7 16:49:58 2016 Total Scan time: 4.380 Total Display time: 0.180 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]