Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4208
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4208, 728 aa
  1>>>pF1KE4208 728 - 728 aa - 728 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6063+/-0.00107; mu= 14.4832+/- 0.064
 mean_var=127.2237+/-26.310, 0's: 0 Z-trim(106.8): 88  B-trim: 5 in 2/51
 Lambda= 0.113708
 statistics sampled from 9127 (9212) to 9127 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.283), width:  16
 Scan time:  3.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5         ( 728) 4941 822.7       0
CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5        ( 716) 4809 801.0       0
CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5        ( 573) 3881 648.7  7e-186
CCDS58033.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1        ( 736) 1779 304.0 5.4e-82
CCDS72931.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1        ( 746) 1779 304.0 5.4e-82
CCDS1097.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1         ( 759) 1779 304.0 5.5e-82
CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1        ( 633) 1708 292.3 1.5e-78
CCDS60285.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1        ( 551) 1365 236.0 1.2e-61
CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14        ( 710)  610 112.2 2.8e-24
CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14       ( 550)  599 110.3 8.1e-24
CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX           ( 667)  570 105.6 2.5e-22
CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX          ( 705)  558 103.7   1e-21
CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX          ( 735)  558 103.7 1.1e-21
CCDS73048.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1       ( 721)  429 82.5 2.5e-15
CCDS44333.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1       ( 783)  429 82.6 2.6e-15
CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9          ( 497)  409 79.1 1.8e-14
CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9         ( 530)  399 77.5 5.9e-14
CCDS6185.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8         ( 452)  382 74.6 3.6e-13
CCDS6187.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8         ( 540)  382 74.7 4.1e-13
CCDS6184.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8         ( 548)  382 74.7 4.2e-13
CCDS1746.2 TRIM54 gene_id:57159|Hs108|chr2         ( 358)  367 72.1 1.7e-12
CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX           ( 540)  357 70.6 7.1e-12
CCDS273.1 TRIM63 gene_id:84676|Hs108|chr1          ( 353)  334 66.7 7.1e-11


>>CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5              (728 aa)
 initn: 4941 init1: 4941 opt: 4941  Z-score: 4389.0  bits: 822.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4941; 99.9% identity (100.0% similar) in 728 aa overlap (1-728:1-728)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 PMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PMPTSIGIFLDCDKGKVDFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
              670       680       690       700       710       720

               
pF1KE4 YLEYQEDM
       ::::::::
CCDS41 YLEYQEDM
               

>>CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5             (716 aa)
 initn: 4809 init1: 4809 opt: 4809  Z-score: 4272.0  bits: 801.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4809; 99.9% identity (100.0% similar) in 707 aa overlap (22-728:10-716)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75             MEGDGSDSPVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
                           10        20        30        40        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
       50        60        70        80        90       100        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
      110       120       130       140       150       160        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
      170       180       190       200       210       220        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
      230       240       250       260       270       280        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
      290       300       310       320       330       340        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
      350       360       370       380       390       400        

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
      410       420       430       440       450       460        

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
      470       480       490       500       510       520        

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
      530       540       550       560       570       580        

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
      590       600       610       620       630       640        

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 PMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PMPTSIGIFLDCDKGKVDFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
      650       660       670       680       690       700        

               
pF1KE4 YLEYQEDM
       ::::::::
CCDS75 YLEYQEDM
      710      

>>CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5             (573 aa)
 initn: 3881 init1: 3881 opt: 3881  Z-score: 3450.6  bits: 648.7 E(32554): 7e-186
Smith-Waterman score: 3881; 99.8% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (156-728:1-573)

         130       140       150       160       170       180     
pF1KE4 ERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78                               MCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKI
                                             10        20        30

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE4 HHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHR
               40        50        60        70        80        90

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE4 VTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEK
              100       110       120       130       140       150

         310       320       330       340       350       360     
pF1KE4 LFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFV
              160       170       180       190       200       210

         370       380       390       400       410       420     
pF1KE4 QTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEE
              220       230       240       250       260       270

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE4 QSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLENSSTYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLENSSTYA
              280       290       300       310       320       330

         490       500       510       520       530       540     
pF1KE4 FRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNL
              340       350       360       370       380       390

         550       560       570       580       590       600     
pF1KE4 LLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPR
              400       410       420       430       440       450

         610       620       630       640       650       660     
pF1KE4 DAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTS
              460       470       480       490       500       510

         670       680       690       700       710       720     
pF1KE4 IGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQ
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IGIFLDCDKGKVDFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQ
              520       530       540       550       560       570

          
pF1KE4 EDM
       :::
CCDS78 EDM
          

>>CCDS58033.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1             (736 aa)
 initn: 1457 init1: 626 opt: 1779  Z-score: 1585.6  bits: 304.0 E(32554): 5.4e-82
Smith-Waterman score: 2102; 42.8% identity (75.3% similar) in 726 aa overlap (24-720:1-722)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
                              .::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS58                        MKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
                                      10        20        30       

               70             80              90             100   
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
       :   ....   :.: :..     :.:  : :       :. :..::. .      :: ::
CCDS58 L--GQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
          40        50        60        70        80        90     

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
       ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS58 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
         100       110       120       130       140       150     

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
       : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS58 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
         160       170       180       190       200        210    

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
       :. :.: ::.::..  .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. 
CCDS58 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
          220       230       240       250       260       270    

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
        ...:: .:..::::.    . :  ::::...:.:.::.  .. :: ....:..:...::
CCDS58 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
          280       290       300       310       320       330    

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
       ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::.   ......
CCDS58 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
          340       350       360       370       380       390    

           410       420       430        440       450            
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
        .:: ::.:.    ..: :. ... .:.. .. :.  :..  :  :..:.:. .   .  
CCDS58 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
          400        410       420       430       440       450   

     460        470       480       490       500       510        
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
          :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . .  .  :... ::::::::. :..:
CCDS58 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD
           460       470       480       490       500       510   

      520       530       540       550       560       570        
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
        . : . :.: ..  .  :.:  :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .:: 
CCDS58 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC
           520       530       540       550       560       570   

      580       590       600       610       620       630        
pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI
        :.: ::::::::.  .:::: ...  :..::::. :::::::.:::  ..: ::...::
CCDS58 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI
           580       590       600       610       620       630   

      640       650              660       670       680       690 
pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER
       :: :... .. .:.    .:       ..:.:  .:: :: ..:.:.: :  ... : : 
CCDS58 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC
           640       650       660       670       680       690   

             700       710       720              
pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM      
        .:::  . ::: ..:.:..::.::. .:              
CCDS58 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD
           700       710       720       730      

>>CCDS72931.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1             (746 aa)
 initn: 1457 init1: 626 opt: 1779  Z-score: 1585.5  bits: 304.0 E(32554): 5.4e-82
Smith-Waterman score: 2109; 42.7% identity (75.3% similar) in 730 aa overlap (20-720:7-732)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
                          : ...::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS72              MGAKGNGLTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
                            10        20        30        40       

               70             80              90             100   
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
       :   ....   :.: :..     :.:  : :       :. :..::. .      :: ::
CCDS72 LG--QQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
          50        60        70        80        90       100     

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
       ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS72 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
         110       120       130       140       150       160     

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
       : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS72 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
         170       180       190       200       210        220    

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
       :. :.: ::.::..  .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. 
CCDS72 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
          230       240       250       260       270       280    

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
        ...:: .:..::::.    . :  ::::...:.:.::.  .. :: ....:..:...::
CCDS72 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
          290       300       310       320       330       340    

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
       ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::.   ......
CCDS72 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
          350       360       370       380       390       400    

           410       420       430        440       450            
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
        .:: ::.:.    ..: :. ... .:.. .. :.  :..  :  :..:.:. .   .  
CCDS72 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
          410        420       430       440       450       460   

     460        470       480       490       500       510        
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
          :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . .  .  :... ::::::::. :..:
CCDS72 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD
           470       480       490       500       510       520   

      520       530       540       550       560       570        
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
        . : . :.: ..  .  :.:  :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .:: 
CCDS72 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC
           530       540       550       560       570       580   

      580       590       600       610       620       630        
pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI
        :.: ::::::::.  .:::: ...  :..::::. :::::::.:::  ..: ::...::
CCDS72 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI
           590       600       610       620       630       640   

      640       650              660       670       680       690 
pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER
       :: :... .. .:.    .:       ..:.:  .:: :: ..:.:.: :  ... : : 
CCDS72 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC
           650       660       670       680       690       700   

             700       710       720              
pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM      
        .:::  . ::: ..:.:..::.::. .:              
CCDS72 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD
           710       720       730       740      

>>CCDS1097.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1              (759 aa)
 initn: 1474 init1: 626 opt: 1779  Z-score: 1585.4  bits: 304.0 E(32554): 5.5e-82
Smith-Waterman score: 2140; 42.3% identity (75.3% similar) in 749 aa overlap (1-720:1-745)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
       :.:. .:. :  ::. ... ....::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS10 MAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
               10        20        30        40        50        60

               70             80              90             100   
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
       :   ....   :.: :..     :.:  : :       :. :..::. .      :: ::
CCDS10 LG--QQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
                 70        80        90       100       110        

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
       ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS10 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
      120       130       140       150       160       170        

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
       : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS10 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
      180       190       200       210       220       230        

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
       :. :.: ::.::..  .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. 
CCDS10 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
       240       250       260       270       280       290       

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
        ...:: .:..::::.    . :  ::::...:.:.::.  .. :: ....:..:...::
CCDS10 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
       300       310       320       330       340       350       

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
       ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::.   ......
CCDS10 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
       360       370       380       390       400       410       

           410       420       430        440       450            
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
        .:: ::.:.    ..: :. ... .:.. .. :.  :..  :  :..:.:. .   .  
CCDS10 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
       420       430        440       450       460       470      

     460        470       480       490       500       510        
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
          :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . .  .  :... ::::::::. :..:
CCDS10 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD
        480       490       500       510       520       530      

      520       530       540       550       560       570        
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
        . : . :.: ..  .  :.:  :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .:: 
CCDS10 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC
        540       550       560       570       580       590      

      580       590       600       610       620       630        
pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI
        :.: ::::::::.  .:::: ...  :..::::. :::::::.:::  ..: ::...::
CCDS10 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI
        600       610       620       630       640       650      

      640       650              660       670       680       690 
pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER
       :: :... .. .:.    .:       ..:.:  .:: :: ..:.:.: :  ... : : 
CCDS10 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC
        660       670       680       690       700       710      

             700       710       720              
pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM      
        .:::  . ::: ..:.:..::.::. .:              
CCDS10 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD
        720       730       740       750         

>>CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1             (633 aa)
 initn: 1281 init1: 626 opt: 1708  Z-score: 1523.5  bits: 292.3 E(32554): 1.5e-78
Smith-Waterman score: 1868; 44.3% identity (77.0% similar) in 621 aa overlap (112-720:1-619)

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE4 RLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
                                     .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .
CCDS72                               MFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERV
                                             10        20        30

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGP
       ::::::.. .. ::.:.:::::: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :
CCDS72 VERYRQSVSVGGAILCQLCKPPPLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLP
               40        50        60        70        80        90

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE4 TTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLS
       : .:::: ::::.:. :... ::. :.: ::.::..  .:..:..: . :::..::.::.
CCDS72 TLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHYCKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLT
              100        110       120       130       140         

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE4 KDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAI
       :.. :..:... :..:: ::.  ...:: .:..::::.    . :  ::::...:.:.::
CCDS72 KSLTYILGNQDTVQTQICELEEAVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAI
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             330       340       350       360       370       380 
pF1KE4 DSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATES
       .  .. :: ....:..:...::...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.
CCDS72 EECQQERLARLSAQIQEHRSLLDGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEA
     210       220       230       240       250       260         

             390       400       410       420       430        440
pF1KE4 LKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HP
       :..:::::..::.   ...... .:: ::.:.    ..: :. ... .:.. .. :.  :
CCDS72 LQTFRPAASSSFRHCQLDVGREMKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPP
     270       280       290       300        310       320        

              450          460        470       480       490      
pF1KE4 EKDKADSYVLEYRKIN---RDDEMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSIC
       ..  :  :..:.:. .   .     :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . .  
CCDS72 HSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPGPTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGY
      330       340       350       360       370       380        

        500       510       520       530       540       550      
pF1KE4 SPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGY
       .  :... ::::::::. :..: . : . :.: ..  .  :.:  :. :::::.:. .: 
CCDS72 GEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLDSRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGC
      390       400       410       420       430       440        

        560       570       580       590       600       610      
pF1KE4 YTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDS
       . :.: ..::...:.:. .::  :.: ::::::::.  .:::: ...  :..::::. ::
CCDS72 HLSVDVVLGDVAVTQGRSYWACAVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDS
      450       460       470       480       490       500        

        620       630       640       650              660         
pF1KE4 GHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIF
       :::::.:::  ..: ::...:::: :... .. .:.    .:       ..:.:  .:: 
CCDS72 GHDSGAEDATVEASPPFAFLTIGMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGIC
      510       520       530       540       550       560        

     670       680       690       700       710       720         
pF1KE4 LDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM 
       :: ..:.:.: :  ... : :  .:::  . ::: ..:.:..::.::. .:         
CCDS72 LDYERGRVSFLDAVSFRGLLECPLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGG
      570       580       590       600       610       620        

CCDS72 FAKLD
      630   

>>CCDS60285.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1             (551 aa)
 initn: 1483 init1: 617 opt: 1365  Z-score: 1220.2  bits: 236.0 E(32554): 1.2e-61
Smith-Waterman score: 1566; 43.0% identity (76.5% similar) in 533 aa overlap (1-511:1-529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
       :.:. .:. :  ::. ... ....::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS60 MAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
               10        20        30        40        50        60

               70             80              90             100   
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
       :   ....   :.: :..     :.:  : :       :. :..::. .      :: ::
CCDS60 L--GQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
                 70        80        90       100       110        

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
       ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS60 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
      120       130       140       150       160       170        

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
       : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS60 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
      180       190       200       210       220       230        

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
       :. :.: ::.::..  .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. 
CCDS60 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
       240       250       260       270       280       290       

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
        ...:: .:..::::.    . :  ::::...:.:.::.  .. :: ....:..:...::
CCDS60 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
       300       310       320       330       340       350       

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
       ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::.   ......
CCDS60 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
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pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
        .:: ::.:.    ..: :. ... .:.. .. :.  :..  :  :..:.:. .   .  
CCDS60 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
       420       430        440       450       460       470      

     460        470       480       490       500       510        
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
          :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . .  .  :... :::::::       
CCDS60 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPGIQNLAR
        480       490       500       510       520       530      

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pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
                                                                   
CCDS60 RGGACLQFQLLGRLR                                             
        540       550                                              

>>CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14             (710 aa)
 initn: 595 init1: 223 opt: 610  Z-score: 549.4  bits: 112.2 E(32554): 2.8e-24
Smith-Waterman score: 748; 25.9% identity (56.2% similar) in 644 aa overlap (24-606:1-613)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
                              ....:.:: ::.:  .. .:.::::.:..:. :....
CCDS97                        MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNI
                                      10        20        30       

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pF1KE4 L------------------------LTLD--------DS-FNDVGSDNSNQSSPRLRLPS
       :                        : ::        :: ... :.  :  ..:  . :.
CCDS97 LVQTPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPN
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pF1KE4 ------PSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
             :.:        :.    . .::.. . :: :.... : .::. :. .: .:: .
CCDS97 GVRVFPPAMPPPATHLSPAL---APVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGV
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pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNEC-FKIHHPWGTIKAQHEYVG
       ..::.:.   :.:. :.::.  :.:.:  : .:.. ::. : .. : : : . :.:. : 
CCDS97 IDRYQQSK--AAALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPL-AKHRLVP
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pF1KE4 P-----TTNFRP-KILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYK
       :     .  . : :.  : .:: :  .:::  :. :::. :   :.:..:.: .... .:
CCDS97 PAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWK
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pF1KE4 TLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERK
         : .::. .. :  . ...:  . .:  .... . :. . .   ... . :...:..::
CCDS97 LHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRK
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pF1KE4 SSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQ-GLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHL
       ...:  ... .. .:   . :. .    : ...::. :  ::.::.: : :.: .  :  
CCDS97 AQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIR
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pF1KE4 RIQKATESLK--SFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFF----SSGIDV-PEINEEQ
       :.. . ..    .. :   :.: :  ...:   . . .:.:     :: . . : .. :.
CCDS97 RVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDF-DLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEE
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        430        440         450       460       470        480  
pF1KE4 SKVYNN-ALINWHHPEKDK--ADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCG-TSKIIQDLENSS
         ..:: : ..:..:  .   ::.:.::   ..  .  .. :. :   :   .. :. .:
CCDS97 CCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILE---LDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNS
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pF1KE4 TYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAG
       ::  ::.:.. .  :: :. :.:.:  . :  : ::   ....                 
CCDS97 TYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQT--SEVAWFAFDPGSAHSD-----------------
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pF1KE4 FNLLLAAERIQVGYYTSLDYII-GDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVK--VGVASSDKLQE
         ..:. . . :   .  : .. : ::..:: :.: . :. :.       :::  : ...
CCDS97 --IILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKD
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pF1KE4 WLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRV
        . .  :                                                     
CCDS97 VMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQ
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>>CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14            (550 aa)
 initn: 595 init1: 223 opt: 599  Z-score: 541.1  bits: 110.3 E(32554): 8.1e-24
Smith-Waterman score: 703; 26.9% identity (58.5% similar) in 542 aa overlap (24-507:1-532)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
                              ....:.:: ::.:  .. .:.::::.:..:. :....
CCDS45                        MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNI
                                      10        20        30       

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pF1KE4 L------------------------LTLD--------DS-FNDVGSDNSNQSSPRLRLPS
       :                        : ::        :: ... :.  :  ..:  . :.
CCDS45 LVQTPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPN
        40        50        60        70        80        90       

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE4 ------PSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
             :.:        :.    . .::.. . :: :.... : .::. :. .: .:: .
CCDS45 GVRVFPPAMPPPATHLSPAL---APVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGV
       100       110          120       130       140       150    

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pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNEC-FKIHHPWGTIKAQHEYVG
       ..::.:.   :.:. :.::.  :.:.:  : .:.. ::. : .. : : : . :.:. : 
CCDS45 IDRYQQSK--AAALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPL-AKHRLVP
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pF1KE4 P-----TTNFRP-KILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYK
       :     .  . : :.  : .:: :  .:::  :. :::. :   :.:..:.: .... .:
CCDS45 PAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWK
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pF1KE4 TLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERK
         : .::. .. :  . ...:  . .:  .... . :. . .   ... . :...:..::
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pF1KE4 SSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQ-GLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHL
       ...:  ... .. .:   . :. .    : ...::. :  ::.::.: : :.: .  :  
CCDS45 AQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIR
             340       350       360       370       380       390 

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pF1KE4 RIQKATESLK--SFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFF----SSGIDV-PEINEEQ
       :.. . ..    .. :   :.: :  ...:   . . .:.:     :: . . : .. :.
CCDS45 RVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDF-DLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEE
             400       410        420       430       440       450

        430        440         450       460       470        480  
pF1KE4 SKVYNN-ALINWHHPEKDK--ADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCG-TSKIIQDLENSS
         ..:: : ..:..:  .   ::.:.::   ..  .  .. :. :   :   .. :. .:
CCDS45 CCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILE---LDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNS
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            490       500       510       520       530       540  
pF1KE4 TYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAG
       ::  ::.:.. .  :: :. :.:.:                                   
CCDS45 TYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEGKALQQYPSERELRGI                 
       510       520       530       540       550                 




728 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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