FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4208, 728 aa 1>>>pF1KE4208 728 - 728 aa - 728 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6063+/-0.00107; mu= 14.4832+/- 0.064 mean_var=127.2237+/-26.310, 0's: 0 Z-trim(106.8): 88 B-trim: 5 in 2/51 Lambda= 0.113708 statistics sampled from 9127 (9212) to 9127 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16 Scan time: 3.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 728) 4941 822.7 0 CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 716) 4809 801.0 0 CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 573) 3881 648.7 7e-186 CCDS58033.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 736) 1779 304.0 5.4e-82 CCDS72931.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 746) 1779 304.0 5.4e-82 CCDS1097.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 759) 1779 304.0 5.5e-82 CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 633) 1708 292.3 1.5e-78 CCDS60285.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 551) 1365 236.0 1.2e-61 CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 710) 610 112.2 2.8e-24 CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 550) 599 110.3 8.1e-24 CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 667) 570 105.6 2.5e-22 CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 705) 558 103.7 1e-21 CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 735) 558 103.7 1.1e-21 CCDS73048.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 721) 429 82.5 2.5e-15 CCDS44333.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 783) 429 82.6 2.6e-15 CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 497) 409 79.1 1.8e-14 CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 530) 399 77.5 5.9e-14 CCDS6185.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8 ( 452) 382 74.6 3.6e-13 CCDS6187.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8 ( 540) 382 74.7 4.1e-13 CCDS6184.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8 ( 548) 382 74.7 4.2e-13 CCDS1746.2 TRIM54 gene_id:57159|Hs108|chr2 ( 358) 367 72.1 1.7e-12 CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 540) 357 70.6 7.1e-12 CCDS273.1 TRIM63 gene_id:84676|Hs108|chr1 ( 353) 334 66.7 7.1e-11 >>CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 (728 aa) initn: 4941 init1: 4941 opt: 4941 Z-score: 4389.0 bits: 822.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4941; 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CCDS58 MKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV 10 20 30 70 80 90 100 pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR : .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: :: CCDS58 L--GQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.::::: CCDS58 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... : CCDS58 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL :. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. CCDS58 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL ...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...:: CCDS58 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ...... CCDS58 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD .:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . . CCDS58 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... ::::::::. :..: CCDS58 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF . : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .:: CCDS58 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI :.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :::::::.::: ..: ::...:: CCDS58 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER :: :... .. .:. .: ..:.: .:: :: ..:.:.: : ... : : CCDS58 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM .::: . ::: ..:.:..::.::. .: CCDS58 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD 700 710 720 730 >>CCDS72931.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (746 aa) initn: 1457 init1: 626 opt: 1779 Z-score: 1585.5 bits: 304.0 E(32554): 5.4e-82 Smith-Waterman score: 2109; 42.7% identity (75.3% similar) in 730 aa overlap (20-720:7-732) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL : ...::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:. CCDS72 MGAKGNGLTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV 10 20 30 40 70 80 90 100 pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR : .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: :: CCDS72 LG--QQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.::::: CCDS72 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... : CCDS72 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL :. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. CCDS72 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL ...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...:: CCDS72 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ...... CCDS72 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD .:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . . CCDS72 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... ::::::::. :..: CCDS72 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF . : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .:: CCDS72 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI :.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :::::::.::: ..: ::...:: CCDS72 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER :: :... .. .:. .: ..:.: .:: :: ..:.:.: : ... : : CCDS72 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC 650 660 670 680 690 700 700 710 720 pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM .::: . ::: ..:.:..::.::. .: CCDS72 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD 710 720 730 740 >>CCDS1097.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (759 aa) initn: 1474 init1: 626 opt: 1779 Z-score: 1585.4 bits: 304.0 E(32554): 5.5e-82 Smith-Waterman score: 2140; 42.3% identity (75.3% similar) in 749 aa overlap (1-720:1-745) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL :.:. .:. : ::. ... ....::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:. CCDS10 MAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR : .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: :: CCDS10 LG--QQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.::::: CCDS10 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... : CCDS10 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL :. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. CCDS10 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL ...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...:: CCDS10 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ...... CCDS10 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD .:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . . CCDS10 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... ::::::::. :..: CCDS10 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF . : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .:: CCDS10 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI :.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :::::::.::: ..: ::...:: CCDS10 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER :: :... .. .:. .: ..:.: .:: :: ..:.:.: : ... : : CCDS10 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC 660 670 680 690 700 710 700 710 720 pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM .::: . ::: ..:.:..::.::. .: CCDS10 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD 720 730 740 750 >>CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (633 aa) initn: 1281 init1: 626 opt: 1708 Z-score: 1523.5 bits: 292.3 E(32554): 1.5e-78 Smith-Waterman score: 1868; 44.3% identity (77.0% similar) in 621 aa overlap (112-720:1-619) 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 RLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI .::::.:. ::.:::::. :::::.::: . CCDS72 MFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERV 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGP ::::::.. .. ::.:.:::::: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . : CCDS72 VERYRQSVSVGGAILCQLCKPPPLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLP 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 TTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLS : .:::: ::::.:. :... ::. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::. CCDS72 TLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHYCKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLT 100 110 120 130 140 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 KDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAI :.. :..:... :..:: ::. ...:: .:..::::. . : ::::...:.:.:: CCDS72 KSLTYILGNQDTVQTQICELEEAVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAI 150 160 170 180 190 200 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 DSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATES . .. :: ....:..:...::...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::. CCDS72 EECQQERLARLSAQIQEHRSLLDGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEA 210 220 230 240 250 260 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HP :..:::::..::. ...... .:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. : CCDS72 LQTFRPAASSSFRHCQLDVGREMKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPP 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 pF1KE4 EKDKADSYVLEYRKIN---RDDEMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSIC .. : :..:.:. . . :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . CCDS72 HSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPGPTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGY 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 SPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGY . :... ::::::::. :..: . : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: CCDS72 GEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLDSRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGC 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 YTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDS . :.: ..::...:.:. .:: :.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :: CCDS72 HLSVDVVLGDVAVTQGRSYWACAVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDS 450 460 470 480 490 500 620 630 640 650 660 pF1KE4 GHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIF :::::.::: ..: ::...:::: :... .. .:. .: ..:.: .:: CCDS72 GHDSGAEDATVEASPPFAFLTIGMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGIC 510 520 530 540 550 560 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 LDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM :: ..:.:.: : ... : : .::: . ::: ..:.:..::.::. .: CCDS72 LDYERGRVSFLDAVSFRGLLECPLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGG 570 580 590 600 610 620 CCDS72 FAKLD 630 >>CCDS60285.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (551 aa) initn: 1483 init1: 617 opt: 1365 Z-score: 1220.2 bits: 236.0 E(32554): 1.2e-61 Smith-Waterman score: 1566; 43.0% identity (76.5% similar) in 533 aa overlap (1-511:1-529) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL :.:. .:. : ::. ... ....::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:. CCDS60 MAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR : .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: :: CCDS60 L--GQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP ..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.::::: CCDS60 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY : :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... : CCDS60 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL :. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::. CCDS60 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL ...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...:: CCDS60 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ ...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ...... CCDS60 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD .:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . . 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