FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0120, 1529 aa 1>>>pF1KB0120 1529 - 1529 aa - 1529 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6270+/-0.00199; mu= 19.5586+/- 0.119 mean_var=324.1708+/-63.460, 0's: 0 Z-trim(105.1): 306 B-trim: 49 in 1/49 Lambda= 0.071234 statistics sampled from 7915 (8237) to 7915 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16 Scan time: 5.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 10738 1120.5 0 CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 10657 1112.2 0 CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 10639 1110.3 0 CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 7465 784.1 0 CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 7433 780.9 0 CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 6289 663.3 1.6e-189 CCDS13112.1 JAG1 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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB0 ELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 ELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLEN 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB0 VQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 STLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 STLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGN 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB0 DDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNY 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CCDS64 LVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTIS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK :: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.::: CCDS64 KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB0 SKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIP ::::::: :.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.: CCDS64 SKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLP 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB0 QYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSN .:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.: CCDS64 EYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGN 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB0 RLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDT .::.:. ..:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: : CCDS64 QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTT 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 LHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTC : ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.::::::::::::::::: CCDS64 LVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTC 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB0 DDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKE : ::...::. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.: CCDS64 D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB0 LSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSL :: .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.: CCDS64 LSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTL 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB0 HGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEM :::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: : CCDS64 HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KB0 ADKLLLTTPSKKFTCQ-------GPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTC ::.::::::...: :. ::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.: CCDS64 ADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCAC 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KB0 PYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDN ::..::.:: :::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::: CCDS64 PYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDN 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB0 DCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCT :::::.:::::::::.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..::: :::.:.:. CCDS64 DCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB0 PGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPC ::: :. :. : ::: .::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::: CCDS64 PGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPC 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB0 DNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNIT :...::::::::: .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::. CCDS64 DQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANIS 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KB0 LQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVEL ::.:::.:.::::::::.: .:.:::.:.:: ::. : : ...:::::.:::.:: ::: CCDS64 LQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVEL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KB0 LALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFH ..:.:.:.: :: :.:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::. . .:: CCDS64 VTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFH 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KB0 GCIRNLYINSELQDFQKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMG :::... ::.:::::. .: :. :. :::. : :: :: :. . . .:::. :: : CCDS64 GCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTG 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB0 PLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHG :::::.. :::::..: :: :. .. :: ::: ::.:: :::...: : :.:.::.:: CCDS64 PLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHG 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KB0 KCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRG .:..: :.::: :. :..:. :..: : :. .:. ..:.:::.: :..:: .:::: CCDS64 QCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRG 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KB0 GCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS :: : ::: : ::::::: :.::::::::.:::. ..::: : CCDS64 GC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS 1490 1500 1510 1520 1530 >>CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534 aa) initn: 6576 init1: 3063 opt: 7433 Z-score: 4151.2 bits: 780.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7433; 66.1% identity (87.5% similar) in 1516 aa overlap (15-1527:21-1533) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP :. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.::: CCDS74 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH ::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::. CCDS74 RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL :...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.:::::: CCDS74 LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT : :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.: CCDS74 RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL :: ::. ::: ::::::: :: :::. .. .:.:.. ::: :::::.::::::::: CCDS74 QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN : ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.:::::::::::: CCDS74 TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI ::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:.. CCDS74 SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI :::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::::: CCDS74 AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KB0 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI ::::::::::::::::::::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.: CCDS74 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB0 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS :: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::. CCDS74 PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB0 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD :.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.::::: CCDS74 NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT ::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: CCDS74 TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB0 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK :..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: CCDS74 CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB0 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::::: CCDS74 QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB0 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE :::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: . CCDS74 LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB0 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG : :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.:: CCDS74 MEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKG 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB0 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS .::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :.. CCDS74 RDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGG 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB0 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE .::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:. CCDS74 VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB0 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ .:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : . :. :::.. .:: CCDS74 NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB0 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD :::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . . :..:::::..: CCDS74 NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KB0 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: CCDS74 EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB0 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL ..::.:::.: . :..:. ::: ..:::::::: : :..: :::.:::::::: CCDS74 VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB0 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT :::.::::: :. :. :..::::::.: : :: :::.. : :.:. ::.: ::: . CCDS74 YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KB0 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL . :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::.. : .::....: ::.:. :: CCDS74 DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB0 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC .: :. :..:. :..: :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: : : CCDS74 KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KB0 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS : :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. : CCDS74 CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 1500 1510 1520 1530 >>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523 aa) initn: 6253 init1: 3023 opt: 6289 Z-score: 3515.8 bits: 663.3 E(32554): 1.6e-189 Smith-Waterman score: 7489; 66.6% identity (88.0% similar) in 1530 aa overlap (3-1527:7-1522) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MRGVGWQMLS-LSLGLVLA-ILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP ::: . . :.:.:.:: .:. :::..:.::...::::::.::.:::.:: CCDS43 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH ::.:::::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:. CCDS43 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL ::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.:::::::::::: CCDS43 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT ::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .: CCDS43 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRGKGLT ::.: :::: :::.:::.:.:: . .: :::.. . ::. ::::::::::::::: CCDS43 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHS-EPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 EIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNS :::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.::.: CCDS43 EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 LVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIA ::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::. 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CCDS43 ADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGK 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB0 DCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNST :: :::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::::.: CCDS43 DCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNAT 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB0 CVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEH ::::::::.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..::: :::.:.:.::: :. CCDS43 CVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB0 CDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQN :. : ::: .::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::::...::: CCDS43 CETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQN 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB0 GAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDE :::::: .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::. 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CCDS43 INNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEA 1320 1330 1340 1350 1360 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KB0 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL :::::..: :: :. .. :: ::: ::.:: :::...: : :.:.::.::.:..: CCDS43 RDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQ 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB0 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC :.::: :. :..:. :..: : :. .:. ..:.:::.: :..:: .:::::: : :: CCDS43 GEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQC 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1500 1510 1520 pF1KB0 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS : : ::::::: :.::::::::.:::. ..::: : CCDS43 CQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS 1490 1500 1510 1520 >>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218 aa) initn: 406 init1: 294 opt: 940 Z-score: 545.8 bits: 113.4 E(32554): 4.4e-24 Smith-Waterman score: 979; 27.6% identity (50.4% similar) in 744 aa overlap (860-1529:248-938) 830 840 850 860 870 880 pF1KB0 LSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIAR--CA : : :.. : . . . .:: .. : CCDS13 KTCMEGWMGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICN 220 230 240 250 260 270 890 900 910 920 930 940 pF1KB0 GPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPY : . : : :. :.: . .::: : :::.. : :.:.:: CCDS13 EPW----QCLCETNWGGQLCDK--DLNYCGTHQPCL-----NGGTCSNTGPDKYQCSCPE 280 290 300 310 320 950 960 970 980 990 1000 pF1KB0 GFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDC :..: .:.. :::.:.::.. :.: :: :: : :. :. : .: .:.::: :.: CCDS13 GYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSC--KETSL-GFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNC 330 340 350 360 370 380 1010 1020 1030 1040 pF1KB0 ENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQ------------------------- ...:: : .:.. :.:::..::. :. . : CCDS13 SHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWM 390 400 410 420 430 440 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB0 ----DLN------PCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCT :.: ::.:..: .:..: : :::.:.::. :.:.: .: : ::.:: CCDS13 GQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQ 450 460 470 480 490 500 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB0 DAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQ . .: . :.:: :.:: .:... . :. ::::::: : .. .:.: :. CCDS13 NEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDY-------CEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYE 510 520 530 540 550 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB0 GEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIAT-DEDSGILLYKGD--KDHIAVE :..: .: :. : . . :. .:. : :. ... : . CCDS13 GKNCSHL-------KDHCRTTPCEVI---DSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCK 560 570 580 590 600 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB0 LYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVE-----LLALDQSLSLSVDGGNPKI- : . . : .. .. : :.::: . . . . .... . :: . CCDS13 SQSGG-KFTCDC-NKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYC 610 620 630 640 650 660 1270 1280 1290 1300 pF1KB0 ---ITNLSKQSTLN------FDSPLYV---GGMPGK---SNVASLRQAPGQNGTSFHG-- :.. :.. : . . .: .: :: : .. .: .:: . . CCDS13 ETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEG 670 680 690 700 710 720 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KB0 -CIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGP .. . .. .. ... ::. :::. ::: .... ::: :.::: :: CCDS13 DAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPN--PCHNG----GTCVVNGES-FTCVCKEGWEGP 730 740 750 760 770 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB0 LCDQRTNDPCLGNKCVH-GTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHG .: : ::: : . : . :::. . . : :.: : .: : . .: ::. : : CCDS13 ICAQNTND-CSPHPCYNSGTCVDGDNW-YRCECAPGFAGPDCRIN---INECQSSPCAFG 780 790 800 810 820 830 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB0 KCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCR-----GERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSR .. .. : : :..: .: .:.: : : : : . .. .:: CCDS13 ATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKC-QEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQC------ 840 850 860 870 880 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KB0 LECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFV---DEVEKVVKC-GCTRCVS :. : .:. : :: .: :: .:.: . :. : : : .: : CCDS13 LNGRIACSKVWC-GPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPV 890 900 910 920 930 940 CCDS13 KTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEP 950 960 970 980 990 1000 >>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003 aa) initn: 717 init1: 297 opt: 868 Z-score: 504.0 bits: 106.4 E(32554): 9.5e-22 Smith-Waterman score: 903; 26.8% identity (46.2% similar) in 887 aa overlap (687-1491:47-841) 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 STLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQ-KPYFLKEI-PIQDVAIQDFTCDD :. :: : :: : . : . :.. CCDS34 CVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGETCQFPDPCQNAQLCQN 20 30 40 50 60 70 720 730 740 750 760 pF1KB0 GNDDNSCSP----LSRCPTE------CTCLD--TVVRCSNKGLKVLPKGI--PRDVTELY :.. .. : : :. :::: : ::. : : .. : .. CCDS34 GGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLEDPCPPSFCSKRGRCHIQ 80 90 100 110 120 130 770 780 790 800 810 pF1KB0 LDGN-QFTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPR .: : . .: .. .: :. . .: .. . : : : ...: : CCDS34 ASGRPQCSCMPGWTGEQCQLR--DFCS------ANPCVNGGVCLAT----YPQIQCHCPP 140 150 160 170 180 820 830 840 850 860 870 pF1KB0 TFDGLKSLRLLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYK :.: : .. .: . :.:. : ..:. . : : . .. . : . CCDS34 GFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTS------CHNTLGS--FQCLCPVG--QEGPRCELR 190 200 210 220 230 880 890 900 910 920 930 pF1KB0 E-PGIAR-CAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKC--NP--CLSNPCKNDGTC : : :.. : .:. : : : : : :: :.:. :.: ::: CCDS34 AGPCPPRGCSNGGTC--QLMPEKDSTFHLCLCPPGF-IGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTC 240 250 260 270 280 290 940 950 960 970 980 990 pF1KB0 NSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHAC-ISNP--CKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGF . : .: : : :: . : ::. . : ..: :..::::. . : .: :.:..:. CCDS34 Q-DGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAG---SFHCVCVSGW 300 310 320 330 340 1000 1010 1020 1030 pF1KB0 EGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCE-EKLDF---------- : .:: :.::: : .:::.: .....::::: :: ::. : . . CCDS34 GGTSCEENLDDCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQC 350 360 370 380 390 400 1040 1050 1060 pF1KB0 ---------------------CAQDLN----------PCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY : :::. ::.: ..:. :: .:.: : ::: CCDS34 STNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGY 410 420 430 440 450 460 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB0 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF .: .:. : ..: .. :. :. : : . . :.:: : : .:: .:. : . CCDS34 TGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEV-------ETNECASA 470 480 490 500 510 520 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB0 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI : : :.: .: : ::::..: .::. .: . : .: CCDS34 PCLNHADCHDLLNGFQCICLPGFSGTRCEE-------------DIDECRSSPCANGG--- 530 540 550 560 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KB0 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRG-RVRASYDTG-SHPASAIYSVETINDGNFHIVELL ... : . : . ..: : .. : : : . : . . : . CCDS34 QCQDQPGAFHCK------CLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSG 570 580 590 600 610 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KB0 ALDQSLSLSVDGGN---PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTS : . . . : :: : . .:... : : : :: . : .: : CCDS34 FTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKA-NCLCP---DGSPGCA-------PPEDNCTC 620 630 640 650 660 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KB0 FHG-CIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEP----CHKKVCAHG-TCQPSSQAGFTCE :: : :. : . : :: : :: : . :::: :: :. .:..: CCDS34 HHGHCQRS----SCVCDVG----WTG--PECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQP-SGYNCT 670 680 690 700 710 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KB0 CQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHG-TCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPC : :. :: :... . : .. :..: .: : . .: : : .: : :. : : CCDS34 CPTGYTGPTCSEEMT-ACHSGPCLNGGSCNP-SPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDY---C 720 730 740 750 760 770 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB0 QAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREI--SCRGERIRDYYQKQQGYAACQTT . : .: .. : : :. :. : :. .. :: :. :.:: . CCDS34 VSAPCFNGGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNR-------ATCQDS 780 790 800 810 820 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KB0 KKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS . : : : .::.: CCDS34 PQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLS 830 840 850 860 870 880 >-- initn: 582 init1: 308 opt: 614 Z-score: 362.9 bits: 80.3 E(32554): 6.8e-14 Smith-Waterman score: 614; 31.5% identity (55.8% similar) in 292 aa overlap (886-1156:848-1125) 860 870 880 890 900 910 pF1KB0 IGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG-PGEMADKLLLTTPSKKFTC----QGP :: : .. : : :: . : :: CCDS34 RATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGP 820 830 840 850 860 870 920 930 940 950 960 pF1KB0 VDVNILAKCNPC-------LSNPCKNDGTC-NSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACI . :..:. .:. :.: : : .: : : : :: ::.:. :. .. : CCDS34 LCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLCHNGGLCVDSGPSYF--CHCPPGFQGSLCQDHVNPCE 880 890 900 910 920 930 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB0 SNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTC : ::..:.:: .. .:. : :: :..:.:: ..: :... :.:..::. ... : CCDS34 SRPCQNGATCM---AQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTPKPGGFHC 940 950 960 970 980 990 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB0 LCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHD--SKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC ::: ..: :: .: : .. ::. . : ..: :.: ::..:. :....: : CCDS34 ACPPGFVGLRCEGDVDECLDQ--PCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHTGQWCEVEIDPC 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB0 QDNKCKNGAHCTDAVN---GYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCI ... : .:. : ... :. : ::.:. : : : : :..:. :. CCDS34 HSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAP-------SCGFHHCHHGGLCL 1060 1070 1080 1090 1100 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB0 VRINE---PICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDS . : : :: :: : : CCDS34 PSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRCSCPH 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321 aa) initn: 700 init1: 521 opt: 767 Z-score: 447.3 bits: 96.1 E(32554): 1.4e-18 Smith-Waterman score: 976; 30.6% identity (51.4% similar) in 671 aa overlap (864-1524:116-683) 840 850 860 870 880 890 pF1KB0 GNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCA-GPGEM ::. : : : : :::. :: CCDS12 PCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCS---LPDPCLSSPCAHG-ARCSVGPD-- 90 100 110 120 130 900 910 920 930 940 950 pF1KB0 ADKLLLTTPS--KKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFK ..: . : . .:.. :: .: ...::.. ::: . : .: :: :: :. CCDS12 -GRFLCSCPPGYQGRSCRSDVD-----ECR--VGEPCRHGGTCLNTPGSF-RCQCPAGYT 140 150 160 170 180 190 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB0 GQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENN : :. : : .::..:::: ... . . : : ::::.::::::::: . : :. CCDS12 GPLCENPAVPCAPSPCRNGGTC--RQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLNG 200 210 220 230 240 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB0 STCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVG .:::::.:.:.: ::::.::..: : .: : . : :.. . :. : : .: :. :..: CCDS12 GTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWTG 250 260 270 280 290 300 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB0 EHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDC : :. ..::: : .:: : : : .. : :: : .::.:... : ..:: CCDS12 ESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACV---SNPC----- 310 320 330 340 350 360 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB0 QNGAQCIVR-IN-EPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI .. : : . .: . :: : ::. : :.. : .. : : .. .: .. CCDS12 HEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDV-----DECSIGANPCEHLGRCVNTQGSF 370 380 390 400 410 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KB0 ATDEDSGILLYKGDKDHIAV-ELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLA . : : : . . : : : : . :. . . :.: . . . CCDS12 LCQCGRG---YTGPRCETDVNECLSGPCR-------NQATCLDRI-----GQFTCICMAG 420 430 440 450 460 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KB0 LDQSLS-LSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHG . . ...: :: :: ::. :. : :: : CCDS12 FTGTYCEVDID----------ECQS-----SPCVNGGV-CKDRV---------NGFS--- 470 480 490 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KB0 CIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPL : . . :. : . . : . : .:. .. :. :.: ::. : : CCDS12 C-------TCPSGFSGSTCQLDV----DECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTL 500 510 520 530 540 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB0 CDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHG-K :: :. : : . : :: :. : :.:: : :. :. :. . : :.. :.:: : CCDS12 CD-RNVDDCSPDPCHHGRCVDGIA-SFSCACAPGYTGTRCESQVD---ECRSQPCRHGGK 550 560 570 580 590 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KB0 CRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGG : :. . . :.: :: :: .: :.. : : .. ...:. ..: .: CCDS12 C-LDLVDKYLCRCPSGTTGVNC--EVN-----IDDCASNPCTFGVCRDG--INRYDCV-- 600 610 620 630 640 1490 1500 1510 1520 pF1KB0 CAGGQCCGPLRSKR--RKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS : : ::: . . . : : .:.: :: :. .: : CCDS12 CQPG-FTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDG-ENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHE 650 660 670 680 690 700 CCDS12 PCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPP 710 720 730 740 750 760 >-- initn: 580 init1: 327 opt: 655 Z-score: 385.1 bits: 84.6 E(32554): 3.9e-15 Smith-Waterman score: 872; 28.2% identity (49.5% similar) in 652 aa overlap (909-1527:726-1298) 880 890 900 910 920 930 pF1KB0 KEPGIARCAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPV :: . ::. . : :.::. :::.:: . CCDS12 SHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLAR-DACESQPCRAGGTCSSDGM 700 710 720 730 740 750 940 950 960 970 980 990 pF1KB0 DFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVN :. :::: : .:..:.. . : :::.::: :. :. : : .:..: :. . CCDS12 GFH-CTCPPGVQGRQCEL-LSPCTPNPCEHGGRCESAPGQLP--VCSCPQGWQGPRCQQD 760 770 780 790 800 810 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB0 VDDCED-NDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTP ::.: : .. :.. ....: : ::: :.. .. : : ::: . ..: CCDS12 VDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDC--DPNPCLNGGSCQDGV 820 830 840 850 860 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB0 KGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPM .:.:.: ::..: .: : :.: .: : :. ::: : ..:: :: ::.:. :: . CCDS12 GSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT-CTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQD--- 870 880 890 900 910 920 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB0 VLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAK :: :: . : ::. :. .: : : ::: : .:.. .. : . CCDS12 -LPDCSPSS---CFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEAD------------PCLS 930 940 950 960 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB0 VRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETIND :: :. : :. ::. .:... CCDS12 -RPC----------------------------LHGGVCSAA-----HPGFRCTCLESFTG 970 980 990 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KB0 GNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASL--RQ . . . .: ..:. . :. . . : . : . .. :: :. CCDS12 PQCQTL----VDWCSRQPCQNGGRCVQTG-----AYCLCPPGWSGRL---CDIRSLPCRE 1000 1010 1020 1030 1040 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KB0 APGQNGTSFHG-C-IRNLYINSELQDFQKVPM-QTGILPGCE----PCHKKVCAHG-TCQ : .: :. .. : . .. . . . : .:: :: :: . : :: ::. CCDS12 AAAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTG--SHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCR 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KB0 PSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHG-TCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLC . ..:. ::: :. : :.. . : : .. : :: .:. . : : :.: : :::: CCDS12 -GYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDV-DECASQPCQHGGSCIDLVA-RYLCSCPPGTLGVLC 1110 1120 1130 1140 1150 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KB0 DEEEDLFNPCQAI----KCKH-GKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREIS------CRG . .:: .: . .: : : : .. .: : : :::: :. .:. :.. CCDS12 EINEDDCGPGPPLDSGPRCLHNGTC-VDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHA 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KB0 ERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECR---GGCAGGQC-----CGPLRSKRRKYSFECT . :: : : : : .:. . : . : : : . .: : CCDS12 AHTRDCLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCH 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1510 1520 pF1KB0 DGSSFVD-EVEKVVK-CGCTRCVS .. : . :.:.. : .: CCDS12 CAQPFWGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASN 1280 1290 1300 1310 1320 1330 >>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 (723 aa) initn: 650 init1: 258 opt: 740 Z-score: 436.6 bits: 92.4 E(32554): 5.3e-18 Smith-Waterman score: 740; 35.4% identity (58.8% similar) in 294 aa overlap (880-1160:239-520) 850 860 870 880 890 900 pF1KB0 ALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARC-AG-PGEMADKLLLTTPSKKFTC .:: .: .: :.. :. . . :: CCDS53 EKVCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTC 210 220 230 240 250 260 910 920 930 940 950 pF1KB0 QGPVDVNILAK-----CNPCLS-----NPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVP : : . : :: :. .:::: .::.. : :.: :. : :.. CCDS53 QQPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELG 270 280 290 300 310 320 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB0 IHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGI : : .:::.::.: :... : : :: :. ::... : :. : :.. : :. CCDS53 IDECDPSPCKNGGSC---TDLENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSP 330 340 350 360 370 380 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB0 NN-YTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDID .. :.: :: :.: ::.:.:.:.. .::.. .::. .. : : :. :.::: . CCDS53 DGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSS--SPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDN 390 400 410 420 430 440 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB0 FDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQC ::: .. : ::. : :.:: ..: :: ::.: : : :. : :.. :.::: : CCDS53 VDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNC--SAPV-----SRCEHAPCHNGATC 450 460 470 480 490 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB0 IVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGI : .. .:.: :: : .:. :. CCDS53 HERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVL 500 510 520 530 540 550 1529 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 16:38:02 2016 done: Mon Nov 7 16:38:03 2016 Total Scan time: 5.090 Total Display time: 0.790 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]