Result of FASTA (ccds) for pFN21AB0120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0120, 1529 aa
  1>>>pF1KB0120 1529 - 1529 aa - 1529 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6270+/-0.00199; mu= 19.5586+/- 0.119
 mean_var=324.1708+/-63.460, 0's: 0 Z-trim(105.1): 306  B-trim: 49 in 1/49
 Lambda= 0.071234
 statistics sampled from 7915 (8237) to 7915 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.253), width:  16
 Scan time:  5.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529) 10738 1120.5       0
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521) 10657 1112.2       0
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525) 10639 1110.3       0
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530) 7465 784.1       0
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534) 7433 780.9       0
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523) 6289 663.3 1.6e-189
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20           (1218)  940 113.4 4.4e-24
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6         (2003)  868 106.4 9.5e-22
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19        (2321)  767 96.1 1.4e-18
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6           ( 723)  740 92.4 5.3e-18
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1           (2471)  741 93.5 8.9e-18
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9         (2555)  731 92.5 1.8e-17
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          ( 870)  712 89.7 4.3e-17
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15         ( 685)  699 88.2 9.6e-17
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  634 81.4 9.1e-15
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  634 81.4 9.2e-15
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  634 82.8 2.2e-14
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9          (1285)  620 80.6 3.6e-14
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1200)  566 75.0 1.6e-12
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1238)  566 75.0 1.7e-12
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 587)  561 73.9 1.7e-12
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 618)  561 73.9 1.7e-12
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2         (1413)  556 74.0 3.6e-12
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1          (4391)  533 72.5 3.2e-11
CCDS75461.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6          ( 377)  507 68.0 6.3e-11
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6           ( 383)  502 67.5 9.1e-11
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4           (4981)  518 71.1 9.8e-11


>>CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4                (1529 aa)
 initn: 10738 init1: 10738 opt: 10738  Z-score: 5986.8  bits: 1120.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10738; 100.0% identity (100.0% similar) in 1529 aa overlap (1-1529:1-1529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 KEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB0 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB0 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB0 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB0 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB0 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB0 QKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKC
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB0 VHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB0 GYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRR
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520         
pF1KB0 KYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
             1510      1520         

>>CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4               (1521 aa)
 initn: 7459 init1: 7459 opt: 10657  Z-score: 5941.9  bits: 1112.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10657; 99.5% identity (99.5% similar) in 1529 aa overlap (1-1529:1-1521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
              190       200       210       220       230       240

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
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pF1KB0 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
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pF1KB0 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
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pF1KB0 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS75 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCS-
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pF1KB0 KEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 -------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
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pF1KB0 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
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pF1KB0 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
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pF1KB0 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
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pF1KB0 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
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pF1KB0 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
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pF1KB0 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
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pF1KB0 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
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pF1KB0 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
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pF1KB0 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
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pF1KB0 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
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pF1KB0 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
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pF1KB0 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
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pF1KB0 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
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pF1KB0 QKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKC
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pF1KB0 VHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSS
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pF1KB0 GYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRR
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             1510      1520         
pF1KB0 KYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
           1500      1510      1520 

>>CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4               (1525 aa)
 initn: 9183 init1: 7459 opt: 10639  Z-score: 5931.9  bits: 1110.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10639; 99.2% identity (99.2% similar) in 1533 aa overlap (1-1529:1-1525)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB0 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB0 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB0 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
              190       200       210       220       230       240

              250           260       270       280       290      
pF1KB0 HLRGHNVAEVQKREFVCS----GHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPT
       ::::::::::::::::::    ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPT
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB0 NLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLY
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB0 GNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTF
              370       380       390       400       410       420

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB0 SPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKF
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB0 RCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTA
       :::        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTA
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pF1KB0 ELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLEN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 INNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDID
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLR
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5               (1530 aa)
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       ::.:::::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
CCDS64 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
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pF1KB0 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
       ::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
CCDS64 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB0 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
       ::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.:::::::::::::::::  :: .:
CCDS64 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB0 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRGKGLT
        ::.: :::: :::.:::.:.:: . .:   :::..  . ::. ::::::::::::::: 
CCDS64 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHS-EPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLM
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pF1KB0 EIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNS
       :::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.::.:
CCDS64 EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB0 LVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIA
       ::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::.
CCDS64 LVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTIS
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pF1KB0 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK
       :: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
CCDS64 KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK
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pF1KB0 SKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIP
       :::::::        :.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:
CCDS64 SKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLP
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pF1KB0 QYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSN
       .:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:
CCDS64 EYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGN
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pF1KB0 RLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDT
       .::.:. ..:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: :
CCDS64 QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTT
             600       610       620       630       640       650 

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pF1KB0 LHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTC
       : ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS64 LVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTC
             660       670       680       690       700       710 

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pF1KB0 DDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKE
       : ::...::.   ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.:
CCDS64 D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE
              720       730       740       750       760       770

            780       790       800       810       820       830  
pF1KB0 LSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSL
       ::  .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.:
CCDS64 LSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTL
              780       790       800       810       820       830

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pF1KB0 HGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEM
       :::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..:  :
CCDS64 HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM
              840       850       860       870       880       890

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pF1KB0 ADKLLLTTPSKKFTCQ-------GPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTC
       ::.::::::...: :.       ::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:
CCDS64 ADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCAC
              900       910       920       930       940       950

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pF1KB0 PYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDN
       ::..::.:: :::..::.:::.:::::::.....::: : :  ::::. ::.: ::::::
CCDS64 PYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDN
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       ..:.:.:.: :: :.:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::.  .   .::
CCDS64 VTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFH
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       :::... ::.:::::. .: :. :. :::. :   :: :: :.   . . .:::. :: :
CCDS64 GCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTG
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CCDS64 GC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS 
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CCDS74 NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
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CCDS74 NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
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CCDS74 EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
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CCDS74 VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
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CCDS74 YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
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pF1KB0 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
       . :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::..   : .::....: ::.:. :: 
CCDS74 DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
      1380      1390      1400      1410      1420      1430       

            1440      1450      1460      1470      1480      1490 
pF1KB0 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
          .: :. :..:. :..:  :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :  :
CCDS74 KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
      1440      1450      1460      1470      1480      1490       

            1500      1510      1520         
pF1KB0 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
       :  :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :  
CCDS74 CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA 
      1500      1510      1520      1530     

>>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5                (1523 aa)
 initn: 6253 init1: 3023 opt: 6289  Z-score: 3515.8  bits: 663.3 E(32554): 1.6e-189
Smith-Waterman score: 7489; 66.6% identity (88.0% similar) in 1530 aa overlap (3-1527:7-1522)

                   10          20        30        40        50    
pF1KB0     MRGVGWQMLS-LSLGLVLA-ILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
             :::  . . :.:.:.:: .:.     :::..:.::...::::::.::.:::.::
CCDS43 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB0 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
       ::.:::::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
CCDS43 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB0 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
       ::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
CCDS43 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB0 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
       ::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.:::::::::::::::::  :: .:
CCDS43 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270         280       290  
pF1KB0 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRGKGLT
        ::.: :::: :::.:::.:.:: . .:   :::..  . ::. ::::::::::::::: 
CCDS43 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHS-EPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLM
              250       260        270       280       290         

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB0 EIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNS
       :::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.::.:
CCDS43 EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS
     300       310       320       330       340       350         

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB0 LVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIA
       ::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::.
CCDS43 LVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTIS
     360       370       380       390       400       410         

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB0 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK
       :: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
CCDS43 KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK
     420       430       440       450       460       470         

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB0 SKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIP
       :::::::        :.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:
CCDS43 SKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLP
     480               490       500       510       520       530 

            540       550       560       570       580       590  
pF1KB0 QYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSN
       .:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:
CCDS43 EYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGN
             540       550       560       570       580       590 

            600       610       620       630       640       650  
pF1KB0 RLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDT
       .::.:. ..:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: :
CCDS43 QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTT
             600       610       620       630       640       650 

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pF1KB0 LHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTC
       : ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS43 LVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTC
             660       670       680       690       700       710 

            720       730       740       750       760       770  
pF1KB0 DDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKE
       : ::...::.   ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.:
CCDS43 D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE
              720       730       740       750       760       770

            780       790       800       810       820       830  
pF1KB0 LSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSL
       ::  .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.:
CCDS43 LSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTL
              780       790       800       810       820       830

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pF1KB0 HGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEM
       :::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..:  :
CCDS43 HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM
              840       850       860       870       880       890

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pF1KB0 ADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQ
       ::.::::::...: :.::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:::..::.
CCDS43 ADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGK
              900       910       920       930       940       950

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KB0 DCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNST
       :: :::..::.:::.:::::::.....::: : :  ::::. ::.: :::::::::::.:
CCDS43 DCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNAT
              960       970       980       990      1000      1010

           1020      1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KB0 CVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEH
       ::::::::.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..:::   :::.:.:.::: :. 
CCDS43 CVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKL
             1020      1030      1040      1050      1060      1070

           1080      1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KB0 CDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQN
       :. : :::  .::..::.:.:..::::: ::.:.:: :::  ::::: .:::::...:::
CCDS43 CETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQN
             1080      1090      1100      1110      1120      1130

           1140      1150      1160      1170      1180      1190  
pF1KB0 GAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDE
       ::::::  .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::.
CCDS43 GAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDK
             1140      1150      1160      1170      1180      1190

           1200      1210      1220      1230      1240      1250  
pF1KB0 DSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSL
       :.::::::::.: .:.:::.:.::  ::. : : ...:::::.:::.:: :::..:.:.:
CCDS43 DNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTL
             1200      1210      1220      1230      1240      1250

           1260      1270      1280      1290      1300      1310  
pF1KB0 SLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLY
       .: :: :.:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::.  .   .:::::... 
CCDS43 NLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVR
             1260      1270      1280      1290      1300      1310

           1320       1330      1340      1350      1360      1370 
pF1KB0 INSELQDFQKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
       ::.:::::. .: :. :. :::. :   :: :: :.   . . .:::. :: ::::::..
CCDS43 INNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEA
             1320      1330        1340      1350      1360        

            1380      1390      1400      1410      1420      1430 
pF1KB0 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
        :::::..: :: :.  .. :: ::: ::.:: :::...:  : :.:.::.::.:..:  
CCDS43 RDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQ
     1370      1380       1390      1400      1410      1420       

            1440      1450      1460      1470      1480      1490 
pF1KB0 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
       :.::: :. :..:. :..:  : :. .:.  ..:.:::.: :..::  .:::::: : ::
CCDS43 GEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQC
      1430      1440      1450      1460      1470      1480       

            1500      1510      1520         
pF1KB0 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
       : : ::::::: :.::::::::.:::. ..:::  :  
CCDS43 CQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS 
       1490      1500      1510      1520    

>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20                (1218 aa)
 initn: 406 init1: 294 opt: 940  Z-score: 545.8  bits: 113.4 E(32554): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 979; 27.6% identity (50.4% similar) in 744 aa overlap (860-1529:248-938)

     830       840       850       860       870       880         
pF1KB0 LSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIAR--CA
                                     :  : :.. : . .  .   .:: ..  : 
CCDS13 KTCMEGWMGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICN
       220       230       240       250       260       270       

       890       900       910       920       930       940       
pF1KB0 GPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPY
        :     . :  :      :.   :.:  .  .:::     : :::..   : :.:.:: 
CCDS13 EPW----QCLCETNWGGQLCDK--DLNYCGTHQPCL-----NGGTCSNTGPDKYQCSCPE
       280           290         300            310       320      

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KB0 GFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDC
       :..: .:..  :::.:.::.. :.:  ::    :: : :. :. : .: .:.:::  :.:
CCDS13 GYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSC--KETSL-GFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNC
        330       340       350          360       370       380   

      1010      1020      1030      1040                           
pF1KB0 ENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQ-------------------------
        ...:: : .:.. :.:::..::. :.   . :                           
CCDS13 SHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWM
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pF1KB0 ----DLN------PCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCT
           :.:       ::.:..:    .:..: : :::.:.::. :.:.: .: : ::.:: 
CCDS13 GQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQ
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pF1KB0 DAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQ
       . .: . :.:: :.:: .:...  .       :.   :::::::  : .. .:.:   :.
CCDS13 NEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDY-------CEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYE
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pF1KB0 GEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIAT-DEDSGILLYKGD--KDHIAVE
       :..: .:       :.     :   .    . :. .:. :   :.   ...    :   .
CCDS13 GKNCSHL-------KDHCRTTPCEVI---DSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCK
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pF1KB0 LYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVE-----LLALDQSLSLSVDGGNPKI-
          :  . . :  ..  .. :  :.::: . .  .     . ....   .  :: .    
CCDS13 SQSGG-KFTCDC-NKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYC
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pF1KB0 ---ITNLSKQSTLN------FDSPLYV---GGMPGK---SNVASLRQAPGQNGTSFHG--
          :.. :..   :      . . .:    .:  ::   :  ..  .:  .:: . .   
CCDS13 ETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEG
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pF1KB0 -CIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGP
         .. .  ..      ..  ... ::.  :::.     :::  .... ::: :.::: ::
CCDS13 DAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPN--PCHNG----GTCVVNGES-FTCVCKEGWEGP
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pF1KB0 LCDQRTNDPCLGNKCVH-GTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHG
       .: : ::: :  . : . :::.  . . : :.:  : .:  :  .   .: ::.  :  :
CCDS13 ICAQNTND-CSPHPCYNSGTCVDGDNW-YRCECAPGFAGPDCRIN---INECQSSPCAFG
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pF1KB0 KCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCR-----GERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSR
          .. ..   : :  :..: .: .:.: :     :  : :  . ..   .::       
CCDS13 ATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKC-QEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQC------
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pF1KB0 LECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFV---DEVEKVVKC-GCTRCVS      
       :. : .:.   : ::     .:   :: .:.: .   :.   :  : :  .: :      
CCDS13 LNGRIACSKVWC-GPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPV
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CCDS13 KTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEP
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                                     :.  ::  : :: :   . :   .   :..
CCDS34 CVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGETCQFPDPCQNAQLCQN
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       :.. ..  :    :   :.       ::::   :  ::. :     : ..   :   .. 
CCDS34 GGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLEDPCPPSFCSKRGRCHIQ
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        .:  : . .:   ..  .:   :. .      .:   .. . : :    : ...:  : 
CCDS34 ASGRPQCSCMPGWTGEQCQLR--DFCS------ANPCVNGGVCLAT----YPQIQCHCPP
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pF1KB0 TFDGLKSLRLLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYK
        :.:    : ..   .: .  :.:.        : ..:.  . : : .   ..  . : .
CCDS34 GFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTS------CHNTLGS--FQCLCPVG--QEGPRCELR
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pF1KB0 E-PGIAR-CAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKC--NP--CLSNPCKNDGTC
         :   : :.. :    .:.    :    :  :    :   :  ::  :.:. :.: :::
CCDS34 AGPCPPRGCSNGGTC--QLMPEKDSTFHLCLCPPGF-IGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTC
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pF1KB0 NSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHAC-ISNP--CKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGF
       . : .: : : ::  . : ::.  .  :  ..:  :..::::. . :   .: :.:..:.
CCDS34 Q-DGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAG---SFHCVCVSGW
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pF1KB0 EGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCE-EKLDF----------
        : .:: :.:::    :  .:::.: .....:::::  :: ::. : . .          
CCDS34 GGTSCEENLDDCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQC
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pF1KB0 ---------------------CAQDLN----------PCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY
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CCDS34 STNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGY
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pF1KB0 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
       .: .:. : ..: .. :. :. : : .  . :.:: :  : .::        .:. : . 
CCDS34 TGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEV-------ETNECASA
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pF1KB0 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
        : : :.:   .:   : ::::..: .::.             .:   .  : .:     
CCDS34 PCLNHADCHDLLNGFQCICLPGFSGTRCEE-------------DIDECRSSPCANGG---
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pF1KB0 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRG-RVRASYDTG-SHPASAIYSVETINDGNFHIVELL
         ... : .  :       .  ..: : ..  :   : :  .  :   .  . : .    
CCDS34 QCQDQPGAFHCK------CLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSG
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pF1KB0 ALDQSLSLSVDGGN---PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTS
          :   . . . :   :: : . .:... :   :    : :: .        : .: : 
CCDS34 FTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKA-NCLCP---DGSPGCA-------PPEDNCTC
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pF1KB0 FHG-CIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEP----CHKKVCAHG-TCQPSSQAGFTCE
        :: : :.    : . :       ::  : ::     : .  :::: :: :.  .:..: 
CCDS34 HHGHCQRS----SCVCDVG----WTG--PECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQP-SGYNCT
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pF1KB0 CQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHG-TCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPC
       :  :. :: :... .  : .. :..: .: : .  .: : :  .: :  :.   :    :
CCDS34 CPTGYTGPTCSEEMT-ACHSGPCLNGGSCNP-SPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDY---C
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pF1KB0 QAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREI--SCRGERIRDYYQKQQGYAACQTT
        .  : .:   ..  :   : :. :. :  :. ..  ::     :.        :.:: .
CCDS34 VSAPCFNGGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNR-------ATCQDS
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pF1KB0 KKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS     
        .  :  :  : .::.:                                           
CCDS34 PQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLS
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>--
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CCDS34 RATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGP
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pF1KB0 VDVNILAKCNPC-------LSNPCKNDGTC-NSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACI
       .    :..:.         .:. :.: : : .: :  :  : :: ::.:. :.  .. : 
CCDS34 LCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLCHNGGLCVDSGPSYF--CHCPPGFQGSLCQDHVNPCE
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pF1KB0 SNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTC
       : ::..:.::    .. .:. : :: :..:.::  ..: :... :.:..::.   ... :
CCDS34 SRPCQNGATCM---AQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTPKPGGFHC
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pF1KB0 LCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHD--SKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
        ::: ..:  ::  .: : ..  ::.    . :    ..: :.: ::..:. :....: :
CCDS34 ACPPGFVGLRCEGDVDECLDQ--PCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHTGQWCEVEIDPC
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pF1KB0 QDNKCKNGAHCTDAVN---GYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCI
       ... : .:. :  ...   :. : ::.:. :  :    :        :    :..:. :.
CCDS34 HSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAP-------SCGFHHCHHGGLCL
             1060      1070      1080             1090      1100   

      1140         1150      1160      1170      1180      1190    
pF1KB0 VRINE---PICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDS
          .    : : :: :: :  :                                      
CCDS34 PSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRCSCPH
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

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                                     ::.   : :   :     : :::. ::   
CCDS12 PCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCS---LPDPCLSSPCAHG-ARCSVGPD--
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pF1KB0 ADKLLLTTPS--KKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFK
         ..: . :   .  .:.. ::     .:   ...::.. ::: . : .: :: :: :. 
CCDS12 -GRFLCSCPPGYQGRSCRSDVD-----ECR--VGEPCRHGGTCLNTPGSF-RCQCPAGYT
      140       150       160              170       180        190

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pF1KB0 GQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENN
       :  :. :   :  .::..::::  ... .  . : :  ::::.:::::::::  . : :.
CCDS12 GPLCENPAVPCAPSPCRNGGTC--RQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLNG
              200       210         220       230       240        

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pF1KB0 STCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVG
       .:::::.:.:.: ::::.::..: : .: :  . : :.. . :. :  : .: :. :..:
CCDS12 GTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWTG
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pF1KB0 EHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDC
       : :. ..:::    : .:: : : : .. : :: : .::.:...   :   ..::     
CCDS12 ESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACV---SNPC-----
      310       320       330       340       350          360     

              1140       1150      1160      1170      1180        
pF1KB0 QNGAQCIVR-IN-EPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
       .. : : .  .: . :: : ::. :  :.. :     .. :    :  ..   .:   ..
CCDS12 HEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDV-----DECSIGANPCEHLGRCVNTQGSF
              370       380       390            400       410     

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pF1KB0 ATDEDSGILLYKGDKDHIAV-ELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLA
         .   :   : : . .  : :   :  :       . :. .  .     :.:  . . .
CCDS12 LCQCGRG---YTGPRCETDVNECLSGPCR-------NQATCLDRI-----GQFTCICMAG
         420          430       440              450            460

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pF1KB0 LDQSLS-LSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHG
       .  .   ...:            ::     ::   ::.  :. :         :: :   
CCDS12 FTGTYCEVDID----------ECQS-----SPCVNGGV-CKDRV---------NGFS---
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       1310      1320      1330      1340      1350      1360      
pF1KB0 CIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPL
       :       .  . :.    :  .    . : .  : .:.   ..  :. :.: ::. : :
CCDS12 C-------TCPSGFSGSTCQLDV----DECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTL
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       1370      1380      1390      1400      1410      1420      
pF1KB0 CDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHG-K
       :: :. : :  . : :: :.   : :.:: :  :. :. :. . :    :..  :.:: :
CCDS12 CD-RNVDDCSPDPCHHGRCVDGIA-SFSCACAPGYTGTRCESQVD---ECRSQPCRHGGK
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pF1KB0 CRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGG
       : :. . .  :.: :: :: .:  :..     : :  ..   ...:.    ..: .:   
CCDS12 C-LDLVDKYLCRCPSGTTGVNC--EVN-----IDDCASNPCTFGVCRDG--INRYDCV--
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pF1KB0 CAGGQCCGPLRSKR--RKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS              
       :  :   ::: . .  .  :  : .:.: ::  :.  .: :                   
CCDS12 CQPG-FTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDG-ENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHE
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CCDS12 PCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPP
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>--
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pF1KB0 KEPGIARCAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPV
                                     ::   . ::. . : :.::.  :::.:: .
CCDS12 SHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLAR-DACESQPCRAGGTCSSDGM
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pF1KB0 DFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVN
        :. :::: : .:..:.. .  :  :::.::: :.   :.     : : .:..:  :. .
CCDS12 GFH-CTCPPGVQGRQCEL-LSPCTPNPCEHGGRCESAPGQLP--VCSCPQGWQGPRCQQD
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pF1KB0 VDDCED-NDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTP
       ::.:     :  .. :..  ....: :   :::  :.. .. :  : ::: . ..:    
CCDS12 VDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDC--DPNPCLNGGSCQDGV
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pF1KB0 KGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPM
        .:.:.: ::..: .:  : :.: .: :  :. ::: : ..:: :: ::.:. :: .   
CCDS12 GSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT-CTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQD---
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      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KB0 VLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAK
        ::  :: .   : ::. :.  .:   : : ::: : .:.. ..            :  .
CCDS12 -LPDCSPSS---CFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEAD------------PCLS
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      1180      1190      1200      1210      1220      1230       
pF1KB0 VRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETIND
        ::                             :. :   :.     ::.     .:... 
CCDS12 -RPC----------------------------LHGGVCSAA-----HPGFRCTCLESFTG
       970                                   980            990    

      1240      1250      1260      1270      1280      1290       
pF1KB0 GNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASL--RQ
        . . .    .:       ..:.  . :.     .  .  : . : .    .. ::  :.
CCDS12 PQCQTL----VDWCSRQPCQNGGRCVQTG-----AYCLCPPGWSGRL---CDIRSLPCRE
         1000          1010           1020      1030         1040  

        1300        1310      1320       1330          1340        
pF1KB0 APGQNGTSFHG-C-IRNLYINSELQDFQKVPM-QTGILPGCE----PCHKKVCAHG-TCQ
       : .: :. ..  :   .  .. . . .   :  .::    ::    ::  . : :: ::.
CCDS12 AAAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTG--SHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCR
           1050      1060      1070        1080      1090      1100

      1350      1360      1370      1380       1390      1400      
pF1KB0 PSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHG-TCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLC
        . ..:. :::  :. :  :.. . : : .. : :: .:. . :  : :.:  :  ::::
CCDS12 -GYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDV-DECASQPCQHGGSCIDLVA-RYLCSCPPGTLGVLC
              1110      1120       1130      1140       1150       

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pF1KB0 DEEEDLFNPCQAI----KCKH-GKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREIS------CRG
       . .::  .:   .    .: : : : .. .:   : :  ::::  :. .:.      :..
CCDS12 EINEDDCGPGPPLDSGPRCLHNGTC-VDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHA
      1160      1170      1180       1190      1200      1210      

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pF1KB0 ERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECR---GGCAGGQC-----CGPLRSKRRKYSFECT
        . ::  :   :   :      :  .:.   . : .  :     : :  .     .: : 
CCDS12 AHTRDCLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCH
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      1510       1520                                              
pF1KB0 DGSSFVD-EVEKVVK-CGCTRCVS                                    
        .. :   . :.:.. :   .:                                      
CCDS12 CAQPFWGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASN
       1280      1290      1300      1310      1320      1330      

>>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6                (723 aa)
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Smith-Waterman score: 740; 35.4% identity (58.8% similar) in 294 aa overlap (880-1160:239-520)

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pF1KB0 ALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARC-AG-PGEMADKLLLTTPSKKFTC
                                     .::  .: .:  :.. :. .      . ::
CCDS53 EKVCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTC
      210       220       230       240       250       260        

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pF1KB0 QGPVDVNILAK-----CNPCLS-----NPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVP
       : : . :         ::  :.     .:::: .::..     : :.:  :. :  :.. 
CCDS53 QQPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELG
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pF1KB0 IHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGI
       :  :  .:::.::.:      :... : :  :: :. ::...  : :. : :.. : :. 
CCDS53 IDECDPSPCKNGGSC---TDLENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSP
      330       340          350       360       370       380     

       1020      1030      1040      1050      1060      1070      
pF1KB0 NN-YTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDID
       .. :.: ::  :.:  ::.:.:.:..  .::.. .::.    .. : :  :. :.::: .
CCDS53 DGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSS--SPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDN
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