FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2116, 875 aa 1>>>pF1KE2116 875 - 875 aa - 875 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1025+/-0.00121; mu= 17.2727+/- 0.073 mean_var=86.1773+/-16.836, 0's: 0 Z-trim(103.3): 55 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.138159 statistics sampled from 7290 (7343) to 7290 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 3.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 5775 1161.9 0 CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 5695 1146.0 0 CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 5607 1128.4 0 CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049) 1029 216.0 2.9e-55 CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057) 1022 214.6 7.6e-55 CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 960 202.2 4e-51 CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022) 802 170.7 1.2e-41 CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024) 801 170.5 1.3e-41 CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 ( 986) 752 160.8 1.1e-38 CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 732 156.6 8.9e-38 CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 732 156.7 1.4e-37 CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 732 156.7 1.6e-37 CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 717 153.7 1.2e-36 CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 717 153.8 1.3e-36 CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 717 153.8 1.3e-36 CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 717 153.8 1.4e-36 CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 717 153.8 1.4e-36 CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 717 153.8 1.4e-36 CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 717 153.8 1.4e-36 CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 710 152.3 3e-36 CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 710 152.4 3.4e-36 CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 710 152.4 3.5e-36 CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 700 150.4 1.4e-35 CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 696 149.5 2e-35 CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 696 149.5 2.1e-35 CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 693 149.0 3.6e-35 CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 701 150.9 4.6e-35 CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 693 149.1 4.8e-35 CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 693 149.1 5e-35 CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 693 149.1 5e-35 CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 681 146.5 1.6e-34 CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 670 144.5 1.1e-33 CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 670 144.5 1.4e-33 CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 656 141.6 6.1e-33 CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 656 141.6 7.1e-33 CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 643 139.1 5.8e-32 CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 643 139.1 5.9e-32 CCDS60541.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 ( 979) 553 121.1 9.8e-27 CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 479 106.3 2.2e-22 CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 479 106.3 2.2e-22 CCDS63145.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (1722) 453 101.3 1.6e-20 CCDS33391.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (1992) 453 101.3 1.8e-20 CCDS63146.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (2040) 453 101.3 1.8e-20 CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15 (4861) 409 92.8 1.7e-17 CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834) 405 92.0 2.9e-17 CCDS41939.1 HECTD1 gene_id:25831|Hs108|chr14 (2610) 396 90.0 5.9e-17 CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14 ( 823) 377 86.0 3.1e-16 CCDS64946.1 UBR5 gene_id:51366|Hs108|chr8 (2798) 359 82.7 1e-14 CCDS34933.1 UBR5 gene_id:51366|Hs108|chr8 (2799) 359 82.7 1e-14 CCDS41318.1 HECTD3 gene_id:79654|Hs108|chr1 ( 861) 312 73.0 2.5e-12 >>CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (875 aa) initn: 5775 init1: 5775 opt: 5775 Z-score: 6219.4 bits: 1161.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5775; 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100.0% identity (100.0% similar) in 852 aa overlap (24-875:1-852) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MEKLHQCYWKSGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS 760 770 780 790 800 810 850 860 870 pF1KE2 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML 820 830 840 850 >>CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049 aa) initn: 957 init1: 521 opt: 1029 Z-score: 1105.7 bits: 216.0 E(32554): 2.9e-55 Smith-Waterman score: 1029; 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CCDS72 PCLILVVRRENIVGDA---MEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMR 700 710 720 730 740 750 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 EIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRK :...: ::: : :...:.::. ..:: : :::.. :::::: :.:.:::...:.: CCDS72 ELLDPKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKK 760 770 780 790 800 810 650 660 670 680 690 pF1KE2 LMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEY-EGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKEN :. :: .. :: . : . .:...::.: : ..:. . ..: :. .. :: . .: : CCDS72 LLKKKPSLDDLKELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTIT-VENFGATEVKELVLN 820 830 840 850 860 870 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 GDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLI : ....::.:::. : :::.:::: . : ::. ::: : . . : ::.:.:.. .. CCDS72 GADTAVNKQNRQEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVL-LLFQPNELQAMV 880 890 900 910 920 930 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 CGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGG :. : :.. ::..::: : : . :. :::. : . :.:. :: : ::.:: :. : CCDS72 IGNTNYDWKELEKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILG 940 950 960 970 980 990 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 LGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML . .::..: ..: : ::.::::::.: ::.:. :: :. .:..:: . .::... CCDS72 MKSLKLVIQSTGGGEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057 aa) initn: 957 init1: 521 opt: 1022 Z-score: 1098.1 bits: 214.6 E(32554): 7.6e-55 Smith-Waterman score: 1022; 38.6% identity (68.5% similar) in 435 aa overlap (448-875:630-1057) 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 RNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSF ..:: ... :: .. . .. .. .. CCDS41 LHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMDVNHGLTEL-ADIPVTI 600 610 620 630 640 650 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 MTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRMY-----SERR-ITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDH : ::...: .:. : : ..: ..:. .. :. : ...:: : : :::.. CCDS41 CTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF-LPVIESVNPCLILVVRREN 660 670 680 690 700 710 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 IIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFT :. ::. :.. . : :: : : : ::..:: ::: :::: :...:...: ::: CCDS41 IVGDAM---EVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFR 720 730 740 750 760 770 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 YDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDL : :...:.::. ..:: : :::.. :::::: :.:.:::...:.::. :: .. :: CCDS41 YYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKKKPSLDDL 780 790 800 810 820 830 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 GDSHPVLYQSLKDLLEY-EGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENR . : . .:...::.: : ..:. . ..: :. .. :: . .: :: ....:: CCDS41 KELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTIT-VENFGATEVKELVLNGADTAVNKQNR 840 850 860 870 880 890 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 KEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQAL .:::. : :::.:::: . : ::. ::: : . . : ::.:.:.. .. :. : :.. : CCDS41 QEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVL-LLFQPNELQAMVIGNTNYDWKEL 900 910 920 930 940 950 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 EETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKN :..::: : : . :. :::. : . :.:. :: : ::.:: :. :. .::..: .. CCDS41 EKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQST 960 970 980 990 1000 1010 840 850 860 870 pF1KE2 GPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML : : ::.::::::.: ::.:. :: :. .:..:: . .::... CCDS41 GGGEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI 1020 1030 1040 1050 >>CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050 aa) initn: 898 init1: 507 opt: 960 Z-score: 1031.4 bits: 202.2 E(32554): 4e-51 Smith-Waterman score: 966; 30.5% identity (59.3% similar) in 659 aa overlap (226-874:450-1049) 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 AACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIRRVYTRLLSNEKIETA : .: ..:... : .. .:.... .. CCDS34 ANTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQ--HSM 420 430 440 450 460 470 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 FLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLH-SPEYLEMALPLFCKAMS .:. . :. : . . : . . ...:. : :. : :. ...:: :. CCDS34 ILEQI--LNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPL-AMAIL 480 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 KLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNE-FNSRNLVNDDDAIVAASK .: . : ::. . .... .. . : . . . : : :. :.:: : CCDS34 RLDTNPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPVLFNN--YITAALK 540 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 CLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELT-LQELLGEERRNKKGPRVDPLETEL :. .: .: . ..: : : ::: :.:. .:: : : : CCDS34 LLEKLYKVN-----LKVKHVEYDTFY-IPEISNLVDIQE--------------DYLMWFL 600 610 620 630 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 GVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLG . : .: .. .. . :::..: .:. CCDS34 HQAGMKARPSII---------------------------QDTVTLCSYPFIFDAQAKTKM 640 650 660 500 510 520 530 540 pF1KE2 LYYDNRIRMY------SERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAME : : ...: . . . .: .: .:.: :.:::.... ::: .: ... CCDS34 LQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALREL---SIH 670 680 690 700 710 720 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 NPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSF . :::: : : :.::..:: :::.:::: :...:..:: ::::: ....:.::. . : CCDS34 SDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCF 730 740 750 760 770 780 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 ETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLL .. : ::::. ::::::. ..:.:::...:.::.. : ..:: . :. .::..:: CCDS34 VEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELL 790 800 810 820 830 840 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 EYEG-NVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKS .: : .::. . ..: : . . .: . : .::.. . ..::.:::. : .:... : CCDS34 DYPGEDVEETFCLNFTICR-ESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQIS 850 860 870 880 890 900 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 VEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSV :.. . :: :: : . . :. ::.: :.. .. :. : ... ::::. : : :. CCDS34 VHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLE-LFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP 910 920 930 940 950 960 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 LIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFN .. ::: : : :.:. :: : ::.:: :. :...:...: ... : ::..:::.: CCDS34 TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYN 970 980 990 1000 1010 1020 850 860 870 pF1KE2 VLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML .: ::.::::: :. :: .:. .::.. CCDS34 LLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA 1030 1040 1050 >>CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022 aa) initn: 501 init1: 262 opt: 802 Z-score: 861.4 bits: 170.7 E(32554): 1.2e-41 Smith-Waterman score: 804; 33.3% identity (64.6% similar) in 457 aa overlap (434-872:572-1014) 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLE--MD :. .:: : :. ::: :...:. .: CCDS47 IISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFN--INE-LSNLLNFYID 550 560 570 580 590 470 480 490 500 510 pF1KE2 KDYTFFK------VETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRM-YSERRITVLY--S . .:. .:: . : :::.:...: : :..:.: .::.. .:. . CCDS47 RGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHET 600 610 620 630 640 650 520 530 540 550 560 pF1KE2 LVQGQQL---NPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGG ..: .. .: . :.:::.... ::: .: .. . .:. : : ::: .: . :: CCDS47 ILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQL---SQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGG 660 670 680 690 700 710 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCIL ::.:::. . ::. .:. ::: : : . .:: . . .. :.:.. ::...: . CCDS47 VSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVA 720 730 740 750 760 770 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 DVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGN-VEDDMMITFQI--SQTD .. ::...:.::. .: ...:: . : : .::...:. .. . : . : :.: .:.: CCDS47 NLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQND 780 790 800 810 820 830 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 LFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPL . :: :: .::. . :....:. : :::.: ::. .. :.:::. : .. : CCDS47 V-------DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL 840 850 860 870 880 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 KYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFL .. : :::. : :. . :.. .:....:. :: .. :. ::. :..: ..:. :: CCDS47 RH-FYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFL 890 900 910 920 930 940 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 QFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTER-LPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKA : :: :: . :. :..... .:: ::: :: :.: ::.::. :...: : : CCDS47 FFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVA 950 960 970 980 990 1000 870 pF1KE2 ITYAKGFGML :. .:: CCDS47 INNNRGFVSPMLTQS 1010 1020 >>CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024 aa) initn: 485 init1: 305 opt: 801 Z-score: 860.3 bits: 170.5 E(32554): 1.3e-41 Smith-Waterman score: 815; 33.0% identity (66.3% similar) in 460 aa overlap (434-873:580-1024) 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKP--LIPFEEFINEPLNEVLEMD :. . :. : .. .:.... :: .:. CCDS36 VICQLDYWDESAEENGNVQALLEMLKKLHRVNQVKCQLPESIFQVDELLHR-LNFFVEVC 550 560 570 580 590 600 470 480 490 500 510 pF1KE2 KDYTFFKVETENKFSFMTC------PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQ . : ..:. .. . . . : :::.: ..: :. :. ... :... . : : . CCDS36 RRY-LWKMTVDASENVQCCVIFSHFPFIFNNLSKIKLLHTDTLLKIESKKHKAYLRSAAI 610 620 630 640 650 660 520 530 540 550 560 pF1KE2 GQQ------LNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGG .. : : . : :::.:.:.:.: .: .. : ::.:.:.: : :: : : :: CCDS36 EEERESEFALRPTFDLTVRRNHLIEDVLNQLSQFENE---DLRKELWVSFSGEIGYDLGG 670 680 690 700 710 720 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWF--NPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNC :.:::: . :...:. ::: : :... .:: .:. :: . : ..:.. ::...: CCDS36 VKKEFFYCLFAEMIQPEYGMFMYPEGASCMWFPVKPK-FEKKRYF-FFGVLCGLSLFNCN 730 740 750 760 770 780 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 ILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEG-NVEDDMMITFQI--SQ . .. ::.....::. . ...:: . : : ..:. ::. :: : :. ..: :.. .. CCDS36 VANLPFPLALFKKLLDQMPSLEDLKELSPDLGKNLQTLLDDEGDNFEEVFYIHFNVHWDR 790 800 810 820 830 840 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 TDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNES .: .: ::..: ... :....:. : .::.: ::. .. :::::. . .:. CCDS36 NDT-------NLIPNGSSITVNQTNKRDYVSKYINYIFNDSVKAVYEEFRRGFYKMCDED 850 860 870 880 890 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 PLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRL .: ::.:::.. .: :. . :....:....:. ::. . : ::. :..: :.:. CCDS36 IIK-LFHPEELKDVIVGNTDYDWKTFEKNARYEPGYNSSHPTIVMFWKAFHKLTLEEKKK 900 910 920 930 940 950 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 FLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPT-SHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLL :: : ::::: . :...:. . .:: : . :::.::.::.::. : ..: : CCDS36 FLVFLTGTDRLQMKDLNNMKITFCCPESWNERDPIRALTCFSVLFLPKYSTMETVEEALQ 960 970 980 990 1000 1010 870 pF1KE2 KAITYAKGFGML .::. .::: CCDS36 EAINNNRGFG 1020 >>CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (986 aa) initn: 501 init1: 262 opt: 752 Z-score: 807.8 bits: 160.8 E(32554): 1.1e-38 Smith-Waterman score: 752; 33.1% identity (65.2% similar) in 411 aa overlap (472-872:581-978) 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 PLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILN-AVTKNLGLYYDNRIR :: :.. .:: . .. :. :: . CCDS54 KTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDN--H 560 570 580 590 600 510 520 530 540 550 pF1KE2 MYSERRITVLY--SLVQGQQL---NPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQL ..::.. .:. ...: .. .: . :.:::.... ::: .: .. . .:. : : CCDS54 LMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQL---SQAEATDFCKVL 610 620 630 640 650 660 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 YVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLI ::: .: . ::::.:::. . ::. .:. ::: : : . .:: . . .. :. CCDS54 VVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLF 670 680 690 700 710 720 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 GIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGN-VED :.. ::...: . .. ::...:.::. .: ...:: . : : .::...:. .. . : CCDS54 GMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGD 730 740 750 760 770 780 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 DMMITFQI--SQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKA . : :.: .:.:. :: :: .::. . :....:. : :::.: ::. .. CCDS54 ALCIRFSIHWDQNDV-------DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEE 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 FRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWE :.:::. : .. :.. : :::. : :. . :.. .:....:. :: .. :. ::. CCDS54 FQRGFYRVCEKEILRH-FYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWK 840 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 IVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTER-LPTSHTCFNVLLLPE :..: ..:. :: : :: :: . :. :..... .:: ::: :: :.: ::. CCDS54 AFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPK 900 910 920 930 940 950 860 870 pF1KE2 YSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML ::. :...: : ::. .:: CCDS54 YSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS 960 970 980 >>CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 (431 aa) initn: 560 init1: 150 opt: 732 Z-score: 791.7 bits: 156.6 E(32554): 8.9e-38 Smith-Waterman score: 732; 33.8% identity (68.5% similar) in 391 aa overlap (495-873:52-429) 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 TFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRM-YSERRITVLYSLVQGQQLNPYL :: .: : . :. : ... : .. CCDS58 YFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRF-----LCHSNALPSHV 30 40 50 60 70 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 RLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIF ...: :. ...:.. ..: .: ::...::. ..::.:.: ::...:.: :. .:.. CCDS58 KISVSRQTLFEDSF---QQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVL 80 90 100 110 120 130 590 600 610 620 630 pF1KE2 NPDIGMFTY-DESTKLFWFNPSSFETEGQ---FTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYR :: .: : ... . .::.: . . : .:: ...:.:.. ..:. : . :. CCDS58 NPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYK 140 150 160 170 180 190 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 KLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKEN ....:. :..:: . : .:.:. . :.:.:. . . :.. ...:. ..:::. CCDS58 RMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSI--VWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEG 200 210 220 230 240 250 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 GDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLI :..: .:.::..:.. : .:. ....::.: ::: ::. :. :.: : .:.::.. CCDS58 GESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRY-FDEKELELML 260 270 280 290 300 310 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 CGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGG :: ...:.. ...: : ::..: :. ::..:. . .:.. .:::.::: : :::: CCDS58 CGMQEIDMSDWQKSTIYRH-YTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGG 320 330 340 350 360 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 LGKL-------KMIIAKNGPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGF ...: :. : : : .: :: :::::: : :: :.: :.:.:.:: :: ..:: CCDS58 FAELIGSNGPQKFCIDKVGKETW-LPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGF 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 GML : CCDS58 GQE 430 875 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 16:34:36 2016 done: Mon Nov 7 16:34:36 2016 Total Scan time: 3.510 Total Display time: 0.240 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]