FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3562, 450 aa 1>>>pF1KE3562 450 - 450 aa - 450 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2288+/-0.00115; mu= 15.0338+/- 0.069 mean_var=169.2565+/-35.685, 0's: 0 Z-trim(107.4): 136 B-trim: 2 in 1/49 Lambda= 0.098583 statistics sampled from 9427 (9572) to 9427 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 2.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 3135 458.6 6e-129 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 1473 222.2 8.6e-58 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 1234 188.2 1.5e-47 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 1222 186.5 4.8e-47 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 1218 185.9 7.2e-47 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 1218 185.9 7.2e-47 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 1208 184.5 1.9e-46 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 1204 183.9 2.8e-46 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 1174 179.7 5.5e-45 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 686 110.3 4.4e-24 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 681 109.6 7.2e-24 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 648 104.9 1.9e-22 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 622 101.2 2.4e-21 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 580 95.2 1.6e-19 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 555 91.6 1.8e-18 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 510 85.2 1.5e-16 CCDS7947.2 TRIM48 gene_id:79097|Hs108|chr11 ( 224) 487 81.6 9.3e-16 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 476 80.4 4.4e-15 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 476 80.7 6.2e-15 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 436 74.7 2.2e-13 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 406 70.5 4.5e-12 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 397 69.0 8.6e-12 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 397 69.2 1.1e-11 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 394 68.5 1.1e-11 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 394 68.6 1.2e-11 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 394 68.8 1.4e-11 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 391 68.4 2e-11 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 383 67.2 4.5e-11 >>CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 (450 aa) initn: 3135 init1: 3135 opt: 3135 Z-score: 2428.4 bits: 458.6 E(32554): 6e-129 Smith-Waterman score: 3135; 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48.1% identity (73.2% similar) in 451 aa overlap (1-450:1-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : : ... .:::: :: .::.::::::::: :: ::::: ::.. .: ::.::: : CCDS20 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR .: :: :. .. : .:.. :. :: :: :.. :...:. :.::::.:::.: . CCDS20 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS :..:::. .:: : .:.::: ::. .::: :.::::: .: :. . ::..:: CCDS20 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA :: :. :..::..:.: : .: . :::::.:: ..: . . :.:::..: :: : CCDS20 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK ::.: :::::.. :.: . : :::::::.:.: :::. ::: ::: :.. .. .::. CCDS20 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEV-TNHN 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE3 L-LFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR . ::::.: . : ..: ..:::...: ::::::.:: .::.:..:.: CCDS20 IRLFEDVRSWMFRRGPL----NSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS ..: ..:. ..:: ::::::::::.::.:..:::..:::: .: : .:::::.: : :: CCDS20 NSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK :.::..:::: :. . . ::.:::. : . CCDS20 FLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR 420 430 440 >>CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1201 init1: 955 opt: 1234 Z-score: 967.2 bits: 188.2 E(32554): 1.5e-47 Smith-Waterman score: 1234; 44.2% identity (68.8% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : :.: : :: : :: .:. ::::: ::: :: ::. : :.:. : : . . CCDS55 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDSPFLVQCSECTKSTG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR :. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: . CCDS55 QINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS : :.: . : : ...::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :. ..::: : CCDS55 HRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA ::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: :::.:.:: : CCDS55 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK ::.: : .::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. .. CCDS55 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE .: : :: . . : :. .. . .:::: ..:::.:::: : :: ::..:.: CCDS55 FLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 AWTKRN-DMRLDSE-GIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV : ..: . ..:.: :.::: :.: : . :::.::::: .::::: . .:.::: : : CCDS55 YWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLLLQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK :::.: ::::: .. . : ::::..: CCDS55 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 (450 aa) initn: 1215 init1: 1072 opt: 1222 Z-score: 958.0 bits: 186.5 E(32554): 4.8e-47 Smith-Waterman score: 1222; 40.8% identity (69.0% similar) in 449 aa overlap (1-448:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : : . .:: : ::..:. :::: : : :: ::::: :. .: ::.::.::. CCDS73 MDSDTLRVFQNELICCICVNYFIDPVTTDCVHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPLCRKISE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR . :. . .: . .:.. : ...:: :: :.: :.:.::.:. ::: ::.::. CCDS73 KPNFNTNVALKKLASLARQTRPQNINSSDN-ICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 HATHKHY-MTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMI : .:.: . :.: .::. .: .:: .:..: :::.::. . . ...::...: CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECRVQKLIKEMDYLWKINQETQNNLNQETSKFCSLVDYVSLRKVII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCK . .: :. .: ::::.:...: ::.. .::::. ::.::.. ...::..: : CCDS73 TIQYQKMHIFLDEEEQRHLQALEREAKELFQQLQDSQVRMTQHLEGMKDMYRELWETYHM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNH ::.: ::.:.. :... .. ::::::.:..: :::: . :: ::: .:. .. . CCDS73 PDVELLQDVGNISARTDLAQMPKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDNALSTEMTPCY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 KLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR : ::.:.. . : . .: ... . : :: ..:::::::::: : ::..:.:: CCDS73 ISLSEDVRRVIFGDDHRSAPMDPQGVESFAVWCAQAFTSGKHYWEVDVTHSSNWILGVCR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS .. : ... .::. :. . :...:.:: ..:: : .:. :: ::.::::::. : :: CCDS73 DSRTADTNIVIDSDKTFFSISSKTSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGWVGVFLDYDNGSVS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK : .:...::: .: : :::::.: : CCDS73 FFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 450 >>CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1223 init1: 960 opt: 1218 Z-score: 954.9 bits: 185.9 E(32554): 7.2e-47 Smith-Waterman score: 1218; 43.3% identity (69.0% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : :.: : .:: : .: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: : : . .. CCDS53 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR :. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: . CCDS53 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS : :.: . : : .:.::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :. ..::: : CCDS53 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA ::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: :::.:.:: : CCDS53 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK ::.: : .::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. .. CCDS53 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE .:.: :: . . : :. .. . .::.: ..:::.:::: : :: ::..:.: CCDS53 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 AWTKRN-DMRLDS-EGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV ..: . ..:. ::.::: :.: : . :::.::::. .:::.: . .:.::: : : CCDS53 YRKEKNQNEKIDGKEGLFLLGCIKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK :::.: ::::: .. . : ::::..: CCDS53 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1212 init1: 966 opt: 1218 Z-score: 954.9 bits: 185.9 E(32554): 7.2e-47 Smith-Waterman score: 1218; 43.3% identity (69.0% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : :.: : .:: : .: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: : : . .. CCDS82 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR :. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: . CCDS82 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS : :.: . : : .:.::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :. ..::: : CCDS82 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA ::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: :::.:.:: : CCDS82 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK ::.: : .::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. .: CCDS82 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE .:.: :: . . : :. .. . .::.: ..:::.:::: : :: ::..:.: CCDS82 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 AWTKRN-DMRLDSE-GIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV ..: . ..:.. :.::: :.: : . :::.::::. .:::.: . .:.::: : : CCDS82 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK :::.: ::::: .. . : ::::..: CCDS82 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 1205 init1: 962 opt: 1208 Z-score: 947.3 bits: 184.5 E(32554): 1.9e-46 Smith-Waterman score: 1208; 41.2% identity (69.0% similar) in 449 aa overlap (1-448:1-447) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : : : .:: : ::..:. ::::: ::: :: ::::: :. .: :: ::.::. 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CCDS73 ISLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS .. : .. .::. :.:. : ..:.:: ..:: : .:. :: : .::::::. : :: CCDS73 DSRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGQVGVFLDYDNGSVS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK : .:...::: .: : :::::.: : CCDS73 FFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 >>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 1201 init1: 966 opt: 1204 Z-score: 944.2 bits: 183.9 E(32554): 2.8e-46 Smith-Waterman score: 1204; 41.1% identity (68.1% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-447) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : : : .:: : ::..:. ::::: ::: :: ::::: :. .: :: ::. :. CCDS53 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR . :. . .: .:.. : ...:: :: :.: :.:.::.:. ::: ::.::. CCDS53 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQNINSSDN-ICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS : .:.: : : :.::. .: .:. .:... :::.::. . . . ....:. .:. CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA .: :. .: ::::.:...: ::.. .::::. ::.::.. ...::..: : CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK :: : ::. .: :... .. ::::::.:..: :::: . :: ::: .:. .. . CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE : ::.:.. . : . .: ... . :::: ..:::::::::: : ::..:.::. CCDS53 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 AWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSF . : .. .::. :.:. : ..:.:: ..:: : .:. :: : .::::::. : ::: CCDS53 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSVSF 360 370 380 390 400 410 430 440 450 pF1KE3 VNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK .:...::: .: : :::::.: : CCDS53 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 >>CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1176 init1: 938 opt: 1174 Z-score: 921.1 bits: 179.7 E(32554): 5.5e-45 Smith-Waterman score: 1174; 43.2% identity (67.4% similar) in 451 aa overlap (1-446:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ : :.:.: :::: :: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: . : : . .: CCDS60 MNSGISQVFQRELTCPICLNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPILTQCFECLKTTQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR : .: : .:.. .:.. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: . 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CCDS60 FRRGDLRSICIGCDRQNAPHITATPTSFL---AWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 CREAW--TKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYEC : . : :..: ::.: : :.: : . :::.:::: .:.::: . .:.::: : CCDS60 CNKYWKGTNQNGNIHGEEGLFSLGCVKNDIQCSLFTTSPLTLQYVPRPTNHVGLFLDCEA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 GIVSFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK ::::.: ::: : .. . : ::::..: CCDS60 RTVSFVDVNQSSPIHTIPNCSFSPPLRPIFCCVHL 420 430 440 450 >>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa) initn: 536 init1: 197 opt: 686 Z-score: 545.8 bits: 110.3 E(32554): 4.4e-24 Smith-Waterman score: 686; 31.0% identity (59.0% similar) in 461 aa overlap (1-448:1-449) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MASAITQCST-SELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREIS :::: :.:: :: : ...::.: ::: ::. :. . . . ::::: CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKG--GGSVCPVCR--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 QQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLI-----CRRHQEIKNLICETDRSLLCFL : .. . . ..:. ... ..:. : : : : .:.:: : . ::.. CCDS44 -QRFLLKNLRPNRQLANMVNNLK-EISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 CSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNII-GTWEVFIN :.:: .: : .:: . :..:: . . . ..::. ..:. : : . :. .. 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