FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3723, 778 aa 1>>>pF1KE3723 778 - 778 aa - 778 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3569+/-0.00139; mu= -7.7632+/- 0.082 mean_var=369.0158+/-79.120, 0's: 0 Z-trim(109.9): 697 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.066765 statistics sampled from 10464 (11219) to 10464 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16 Scan time: 4.020 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 4895 486.5 6.6e-137 CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 4212 420.8 4.4e-117 CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 3306 333.5 7.5e-91 CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 3306 333.5 7.6e-91 CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 3294 332.3 1.7e-90 CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 2889 293.3 1e-78 CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 2372 243.5 9.9e-64 CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 2327 239.2 2e-62 CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 2277 234.3 5.3e-61 CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 2277 234.4 5.3e-61 CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 2277 234.4 5.4e-61 CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 2251 231.9 3.1e-60 CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 2140 221.1 4.9e-57 CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 2024 210.0 1.1e-53 CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 2017 209.3 1.9e-53 CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 1266 137.2 1.7e-31 CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 1255 136.1 3.4e-31 CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 1222 132.8 2.2e-30 CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 1222 132.8 2.2e-30 CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 1183 129.1 3.3e-29 CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 941 105.6 2.7e-22 CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 941 105.6 2.7e-22 CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 942 105.8 2.8e-22 CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 941 105.7 2.9e-22 CCDS45167.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 659) 917 103.3 1.3e-21 CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 911 102.7 1.7e-21 CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 909 102.6 2.5e-21 CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 886 100.3 9.2e-21 CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 885 100.2 1.1e-20 CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 879 99.7 1.9e-20 CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 862 97.9 3.8e-20 CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 857 97.5 6.9e-20 CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 858 97.6 6.9e-20 CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 843 96.2 1.8e-19 CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 804 92.4 2.4e-18 CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 740 86.3 1.9e-16 CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 711 83.4 1.2e-15 CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 645 76.9 6.6e-14 CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 643 76.9 1.1e-13 CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 634 75.7 1.1e-13 CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 624 74.9 2.6e-13 CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 580) 620 74.7 4.9e-13 CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 601 72.7 1.2e-12 CCDS5483.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 666) 604 73.2 1.6e-12 CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 596 72.2 1.6e-12 CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19 ( 273) 591 71.6 1.9e-12 CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 594 72.1 2.4e-12 CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 594 72.1 2.5e-12 CCDS5485.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 518) 591 71.8 3.1e-12 CCDS58191.1 CHEK1 gene_id:1111|Hs108|chr11 ( 442) 589 71.6 3.2e-12 >>CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (745 aa) initn: 4895 init1: 4895 opt: 4895 Z-score: 2571.4 bits: 486.5 E(32554): 6.6e-137 Smith-Waterman score: 4895; 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93.1% identity (93.1% similar) in 778 aa overlap (1-778:1-724) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 KGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 TEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 TEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAEN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 LLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 LLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 YTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 YTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 DRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 DRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 LGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAIPTSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 LGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAIPTSN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 SYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 SYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTN 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 RSRNSPLLERASLGQASIQNGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARPRQHQKSMSASVHPN :::::::::::::::::::::::: CCDS80 RSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS------------------------------------ 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 KASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 ------------------TAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQ 510 520 530 540 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 LRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 LRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRP 550 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 HVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 HVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEK 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 pF1KE3 YMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 YMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL 670 680 690 700 710 720 >>CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (719 aa) initn: 4095 init1: 2716 opt: 3294 Z-score: 1738.2 bits: 332.3 E(32554): 1.7e-90 Smith-Waterman score: 4525; 91.4% identity (91.8% similar) in 779 aa overlap (1-778:1-719) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 TEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 TEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAEN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 LLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 YTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 DRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 LGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSDQA-GPAIPTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: CCDS53 LGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSDQAAGPAIPTS 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 NSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 NSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTST 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARPRQHQKSMSASVHP ::::::::::::::::::::::::: CCDS53 NRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS----------------------------------- 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 NKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 -------------------TAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAG 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 QLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .. : CCDS53 QLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLSFRFAR------R 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 PHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 PHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHE 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 KYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL 670 680 690 700 710 >>CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (780 aa) initn: 3170 init1: 1957 opt: 2889 Z-score: 1526.9 bits: 293.3 E(32554): 1e-78 Smith-Waterman score: 3369; 68.0% identity (83.5% similar) in 807 aa overlap (3-778:2-780) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSSARTPLPTLNERDTEQPTL--GHLD-----SKPSSKSNMIRGRNSATSA-DEQPHIGN ::::::::.::::::. : :. . .: ::..:. : ::: ::: :::::::: CCDS73 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNI ::: ::::::::::::::::.:::.::::::::::::: .:::::::::::::.:::::: CCDS73 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS73 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD ::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: :: CCDS73 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYN :.:::::::::::::::..:::::.:: ::..: .: ..::.::..:.::.:.:..:.:. CCDS73 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 EVMATYLLLGYKSSELEGD------TITLKPRPSADLTNSSAPSPSH-KVQRSVSANPKQ ::::::.::: : :.:: .. . :::.::.::. ::.: :::::.::: :: CCDS73 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE3 RRFSDQAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEE-DRESGRKASST-----AKVPASPLPG :::::.:::.:: . ::.:. :.:..:... :: :.. .:: .:: ... :::: : CCDS73 RRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVG 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS-LT-MPGSRASTASA ::::.. :: :.: : .. ::. . ::.. ...:::::: :: : : :.:.. CCDS73 PERKKSSTIPS-NNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGS 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 S--AAVSAARPRQHQKSMSASVHPNKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNIS : .:: .:::: ::::::.: :: :.. :: ... :. ::.:. ::::.::::::.:: CCDS73 SVASAVPSARPR-HQKSMSTSGHPIKVT-LPTIKDGSEAYRPGTT-QRVPAASPSAHSIS 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 SSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQG-----RRGAS .. .:::: :::: :::::::. :::. : .. :. ::::: : : :::.: CCDS73 TA--TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERR---SVAYNGPPASPS-HETGAFAHARRGTS 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 pF1KE3 GSIFSKFTSKFVRRNLN-EPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSM .:.::.:::::::. . ::. .: ::: ...::::::::::: CCDS73 TGIISKITSKFVRRSTSGEPKERD------------------KEEGKDSKPRSLRFTWSM 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 KTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLS ::::::.::.::::::::::::.:. : .:...:.:.:: ....:::::::::::::: CCDS73 KTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLS 700 710 720 730 740 750 750 760 770 pF1KE3 LNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL :::::::::::::.::::::::::::::: CCDS73 LNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL 760 770 780 >>CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (795 aa) initn: 3134 init1: 1957 opt: 2372 Z-score: 1257.7 bits: 243.5 E(32554): 9.9e-64 Smith-Waterman score: 3415; 68.6% identity (84.8% similar) in 808 aa overlap (3-778:2-795) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSSARTPLPTLNERDTEQPTL--GHLD-----SKPSSKSNMIRGRNSATSA-DEQPHIGN ::::::::.::::::. : :. . .: ::..:. : ::: ::: :::::::: CCDS31 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNI ::: ::::::::::::::::.:::.::::::::::::: .:::::::::::::.:::::: CCDS31 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS31 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD ::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: :: CCDS31 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYN :.:::::::::::::::..:::::.:: ::..: .: ..::.::..:.::.:.:..:.:. CCDS31 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 EVMATYLLLGYKSSELEGD------TITLKPRPSADLTNSSAPSPSH-KVQRSVSANPKQ ::::::.::: : :.:: .. . :::.::.::. ::.: :::::.::: :: CCDS31 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE3 RRFSDQAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEE-DRESGRKASST-----AKVPASPLPG :::::.:::.:: . ::.:. :.:..:... :: :.. .:: .:: ... :::: : CCDS31 RRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVG 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS-LT-MPGSRASTASA ::::.. :: :.: : .. ::. . ::.. ...:::::: :: : : :.:.. 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CCDS73 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 EVMATYLLLGYKSSELEGD------TITLKPRPSADLTNSSAPSPSH-KVQRSVSANPKQ ::::::.::: : :.:: .. . :::.::.::. ::.: :::::.::: :: CCDS73 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE3 RRFSDQAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEE-DRESGRKASST-----AKVPASPLPG :::::.:::.:: . ::.:. :.:..:... :: :.. .:: .:: ... :::: : CCDS73 RRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVG 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS-LT-MPGSRASTASA ::::.. :: :.: : .. ::. . ::.. ...:::::: :: : : :.:.. CCDS73 PERKKSSTIPS-NNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGS 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 S--AAVSAARPRQHQKSMSASVHPNKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNIS : .:: .:::: ::::::.: :: :.. :: ... :. ::... ::::.::::::.:: CCDS73 SVASAVPSARPR-HQKSMSTSGHPIKVT-LPTIKDGSEAYRPGSTTQRVPAASPSAHSIS 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 SSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQG-----RRGAS .. .:::: :::: :::::::. :::. : .. :. ::::: : : :::.: CCDS73 TA--TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERR---SVAYNGPPASPS-HETGAFAHARRGTS 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 pF1KE3 GSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKE--KEEFREAKPRSLRFTWS .:.::.:::::::. .: :.. :..: : ...:. :: ::: ...:::::::::: CCDS73 TGIISKITSKFVRRDPSEGEASGRTDTSR----STSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWS 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 MKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRL :::::::.::.::::::::::::.:. : .:...:.:.:: ....::::::::::::: CCDS73 MKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRL 710 720 730 740 750 760 750 760 770 pF1KE3 SLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL ::::::::::::::.::::::::::::::: CCDS73 SLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL 770 780 790 >>CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (729 aa) initn: 2899 init1: 1928 opt: 2277 Z-score: 1208.7 bits: 234.3 E(32554): 5.3e-61 Smith-Waterman score: 2962; 63.1% identity (79.2% similar) in 797 aa overlap (3-778:2-729) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKP--SSKSNM--IRGRNS-ATSADEQPHIGNYRL :.::::::.::::::. : .: :.. .:... : ::: :. :::::::::::: CCDS41 MSTRTPLPTVNERDTENHT-SHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKL :::::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::::::.::::::::: CCDS41 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 FEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRD ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::::: CCDS41 FEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWS :::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 LKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::: CCDS41 LGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 EQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVM ::::::::.:.:::.:::::.::: : .: .: ..::.:::..::::.:: ..:.:. CCDS41 EQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEIT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 ATYLLLGYKSSELEGD------TITL-KPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRF ::::::: :::::... ...: : :::.::.::.. :: ::::::::.. ::::. CCDS41 ATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRY 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SDQAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPT ::.::::::. .: :..:...:.. .:: :.::.:..: . : : .:. CCDS41 SDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDL-KEDGISSRKSSGSA------VGG---KGIAPA 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 PSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDSLTMPG-SRASTASASAAVSAARPR ::.: :.:: : : .: ...::. .: ..:.. : CCDS41 ----------------SPML-----GNASNPNKAD---IPERKKSSTVPSSNTASGGMTR 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 QHQKSMSASVHPNKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFP .. : . .. : . . : .: ::.::: :.:.:::.. .::: :: CCDS41 RNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIP-----DQRTPVA--STHSISSAA-TPDRIRFP 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 RGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPS-GH-----SQGRRGASGSIFSKFTSKF ::..::::::. : :.... :. ::::: .: :: : .: ..:::.:::. CCDS41 RGTASRSTFHG----QPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKL 560 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 VR-RNLNEPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEM .: ::.. ..:.: .:::::::::::::::::::.:..: CCDS41 TRSRNVSA---------------------EQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDM 620 630 640 650 710 720 730 740 750 pF1KE3 MREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGH-EDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRIS :::::::::::.:. : .:...:.:.:: :: :..:::::::::::::::::::::::: CCDS41 MREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGD-GHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRIS 660 670 680 690 700 710 760 770 pF1KE3 GTSMAFKNIASKIANELKL :::.::::::::::::::: CCDS41 GTSIAFKNIASKIANELKL 720 >>CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (744 aa) initn: 2944 init1: 1928 opt: 2277 Z-score: 1208.6 bits: 234.4 E(32554): 5.3e-61 Smith-Waterman score: 3006; 63.8% identity (79.9% similar) in 798 aa overlap (3-778:2-744) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKP--SSKSNM--IRGRNS-ATSADEQPHIGNYRL :.::::::.::::::. : .: :.. .:... : ::: :. :::::::::::: CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHT-SHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKL :::::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::::::.::::::::: CCDS45 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 FEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRD ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::::: CCDS45 FEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWS :::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 LKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::: CCDS45 LGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 EQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVM ::::::::.:.:::.:::::.::: : .: .: ..::.:::..::::.:: ..:.:. 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