FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3334, 968 aa 1>>>pF1KE3334 968 - 968 aa - 968 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7198+/-0.000568; mu= -37.2629+/- 0.035 mean_var=897.3025+/-187.343, 0's: 0 Z-trim(120.5): 1627 B-trim: 0 in 0/61 Lambda= 0.042816 statistics sampled from 34000 (35910) to 34000 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.421), width: 16 Scan time: 14.640 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005981 (OMIM: 603919) serine/threonine-protein ( 968) 6338 408.2 1.1e-112 XP_016865277 (OMIM: 603919) PREDICTED: serine/thre ( 860) 5630 364.4 1.4e-99 NP_055535 (OMIM: 616563) STE20-like serine/threoni (1235) 2020 141.6 2.5e-32 XP_011538703 (OMIM: 616563) PREDICTED: STE20-like ( 783) 1907 134.4 2.2e-30 NP_001291672 (OMIM: 616563) STE20-like serine/thre (1204) 1690 121.2 3.3e-26 XP_016869247 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 456) 896 71.8 9.3e-12 NP_006272 (OMIM: 605030) serine/threonine-protein ( 491) 896 71.8 9.8e-12 NP_001243241 (OMIM: 605030) serine/threonine-prote ( 519) 896 71.8 1e-11 XP_011515553 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 522) 896 71.8 1e-11 XP_016869246 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 524) 896 71.8 1e-11 XP_011515550 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 576) 896 71.9 1.1e-11 XP_016869245 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 580) 896 71.9 1.1e-11 XP_005260588 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 478) 889 71.4 1.3e-11 XP_005260587 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 503) 889 71.4 1.4e-11 XP_011527322 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 404) 884 71.0 1.4e-11 XP_005260590 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 462) 886 71.2 1.4e-11 NP_006273 (OMIM: 604965,614868) serine/threonine-p ( 487) 886 71.2 1.5e-11 XP_016883522 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 388) 881 70.8 1.6e-11 XP_011534679 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 845) 863 70.0 6.1e-11 NP_942089 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 863 70.0 6.1e-11 NP_006566 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 863 70.0 6.1e-11 XP_006720076 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 846) 863 70.0 6.1e-11 NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein ( 894) 853 69.4 9.8e-11 XP_011508795 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 376) 835 67.9 1.1e-10 NP_001258907 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 835 68.0 1.2e-10 NP_006365 (OMIM: 602255) serine/threonine-protein ( 426) 835 68.0 1.2e-10 NP_001258906 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 835 68.0 1.2e-10 XP_016858657 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 831 67.7 1.3e-10 XP_016858658 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 831 67.7 1.3e-10 XP_011508798 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 334) 828 67.5 1.3e-10 XP_005260589 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 474) 834 68.0 1.4e-10 XP_016883518 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 474) 834 68.0 1.4e-10 XP_016883520 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 474) 834 68.0 1.4e-10 XP_016883519 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 474) 834 68.0 1.4e-10 XP_016883521 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 458) 833 67.9 1.4e-10 NP_001027467 (OMIM: 604984) serine/threonine-prote ( 431) 829 67.6 1.6e-10 XP_016876283 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 517) 832 67.9 1.6e-10 NP_003567 (OMIM: 604984) serine/threonine-protein ( 443) 829 67.6 1.6e-10 XP_016876284 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 474) 829 67.7 1.7e-10 NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated prot ( 873) 836 68.3 2e-10 XP_016874898 (OMIM: 616711) PREDICTED: serine/thre ( 907) 832 68.1 2.4e-10 XP_006719508 (OMIM: 616711) PREDICTED: serine/thre ( 907) 832 68.1 2.4e-10 XP_011536739 (OMIM: 616711) PREDICTED: serine/thre ( 907) 832 68.1 2.4e-10 NP_001333416 (OMIM: 616711) serine/threonine-prote ( 907) 832 68.1 2.4e-10 XP_016874899 (OMIM: 616711) PREDICTED: serine/thre ( 907) 832 68.1 2.4e-10 XP_016874897 (OMIM: 616711) PREDICTED: serine/thre ( 907) 832 68.1 2.4e-10 XP_005253955 (OMIM: 616711) PREDICTED: serine/thre ( 907) 832 68.1 2.4e-10 NP_001036065 (OMIM: 601983) mitogen-activated prot ( 821) 829 67.8 2.6e-10 NP_009112 (OMIM: 601983) mitogen-activated protein ( 833) 829 67.9 2.6e-10 XP_016873585 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 584) 820 67.2 2.9e-10 >>NP_005981 (OMIM: 603919) serine/threonine-protein kina (968 aa) initn: 6338 init1: 6338 opt: 6338 Z-score: 2144.4 bits: 408.2 E(85289): 1.1e-112 Smith-Waterman score: 6338; 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NP_006 ILRDLITEAMEIKAKRHEEQQRELEEEEENSDEDELDSHTMVKTSVESVGTMRATSTMSE 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 --KPLEESPSTPLAPSQSQDSVN-EPCSQPSGDRSLQTTSPPVVAPGNENGLAVPVPLRK . . : :: : . . .: : . .: . ..::: : : NP_006 GAQTMIEHNSTMLESDLGTMVINSEDEEEEDGTMKRNATSPQVQRPSFMDYFDKQDFKNK 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 SRPVSMDARIQVAQEKQVAEQGGDLSPAANRSQKASQSRPNSSALETLGGEKLANGSLEP NP_006 SHENCNQNMHEPFPMSKNVFPDNWKVPQDGDFDFLKNLSLEELQMRLKALDPMMEREIEE 410 420 430 440 450 460 >>NP_001243241 (OMIM: 605030) serine/threonine-protein k (519 aa) initn: 863 init1: 441 opt: 896 Z-score: 331.3 bits: 71.8 E(85289): 1e-11 Smith-Waterman score: 896; 38.8% identity (68.1% similar) in 376 aa overlap (32-398:51-419) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 AFANFRRILRLSTFEKRKSREYEHVRRDLDPNEVWEIVGELGDGAFGKVYKAKNKETGAL :.::.... .::.:..:.:.:: .::.: . 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