Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3339, 976 aa
1>>>pF1KE3339 976 - 976 aa - 976 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6985+/-0.00107; mu= 5.6671+/- 0.062
mean_var=315.9015+/-69.205, 0's: 0 Z-trim(111.5): 606 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.072160
statistics sampled from 11704 (12440) to 11704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.382), width: 16
Scan time: 5.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 6767 719.7 6.7e-207
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 2938 321.1 6.7e-87
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 2765 303.1 1.8e-81
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 2748 301.4 6.2e-81
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 2684 294.7 6.1e-79
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 2600 285.9 2.7e-76
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 2581 284.0 1.1e-75
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 2487 274.2 9.2e-73
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 2335 258.3 5.3e-68
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 2193 243.6 1.5e-63
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 2193 243.6 1.6e-63
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 1680 190.2 1.8e-47
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 1594 181.2 8.9e-45
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 1429 164.1 1.4e-39
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 1429 164.1 1.4e-39
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 1337 154.5 1e-36
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 1321 152.5 2.2e-36
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 1311 151.8 6.6e-36
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 (1008) 1174 137.5 1.3e-31
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 ( 495) 1154 135.0 3.5e-31
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3 (1130) 1043 123.9 1.8e-27
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 ( 729) 837 102.2 3.9e-21
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 (1022) 837 102.4 4.8e-21
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 279) 815 99.4 1e-20
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 ( 295) 807 98.6 1.9e-20
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 792 97.8 1.3e-19
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 792 97.8 1.3e-19
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 762 94.2 6.4e-19
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 762 94.5 9.4e-19
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 743 92.4 3.3e-18
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 743 92.5 3.5e-18
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 743 92.5 3.5e-18
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 743 92.5 3.7e-18
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 724 90.3 1.1e-17
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 720 89.9 1.5e-17
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 719 89.8 1.6e-17
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 710 88.8 3e-17
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (1210) 713 89.6 4.1e-17
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 705 88.3 4.2e-17
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 704 88.2 4.5e-17
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 704 88.2 4.5e-17
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 704 88.2 4.6e-17
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 704 88.2 4.6e-17
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 697 87.5 7.5e-17
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 693 87.0 9.8e-17
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 693 87.1 1e-16
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 692 87.0 1.1e-16
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 688 86.4 1.3e-16
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 688 86.5 1.4e-16
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 687 86.4 1.6e-16
>>CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 (976 aa)
initn: 6767 init1: 6767 opt: 6767 Z-score: 3828.0 bits: 719.7 E(32554): 6.7e-207
Smith-Waterman score: 6767; 99.8% identity (100.0% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTRRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS58 TFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLVSGSVKLNVERCSLGRLTRRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGPAGLVEVAGTCLPHARASPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGPAGLVEVAGTCLPHARASPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 STAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPPADTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 STAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPPADTGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANYTFNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANYTFNVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSPGANLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSPGANLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 YELHVLNQDEERYQMVLEPRVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YELHVLNQDEERYQMVLEPRVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RGLTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVDREDKLWLKPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGLTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVDREDKLWLKPYV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKTVAIKTLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKTVAIKTLKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDDFDGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDDFDGT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 YETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 DGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 DGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 TLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITL
910 920 930 940 950 960
970
pF1KE3 PGHQKRILCSIQGFKD
::::::::::::::::
CCDS58 PGHQKRILCSIQGFKD
970
>>CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 (976 aa)
initn: 2394 init1: 916 opt: 2938 Z-score: 1673.6 bits: 321.1 E(32554): 6.7e-87
Smith-Waterman score: 3179; 50.8% identity (73.4% similar) in 977 aa overlap (16-976:16-967)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCA-PLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILN
:: .:..:::.:.: . : :::::: : ::. .:.:.:
CCDS16 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GTPLYMYQDCP-MQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGC
:.:::. : :.: : :.:::.::.:::: : :. .::.::::::.::::::. .:
CCDS16 DMPIYMYSVCNVMSG--DQDNWLRTNWVYRGE-AERIFIELKFTVRDCNSFPGGAS--SC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTR
:::::: : ::: : : .... :: :. :.: :. . :. . ::::::. :.: :::
CCDS16 KETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGP--AGLVEVAGTCLPHAR
.:.::::.. ::::::.::::.:..::: :.:::.::.:. : .:. :::::. ::
CCDS16 KGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHA-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ASPRPSGA-PRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCL
. : :.: :::::. :::::::.:.: :. :::. .:: :: : .... . ::
CCDS16 VVP-PGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEK--VEDACQACSPGFFKFEASESPCL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 TCPQQSTAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPP
::... :::: : :: : .::: . .. :: :::::. :. . :... ::: ::
CCDS16 ECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 ADTGGRQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANY
:.:::.:. ::: : :: ..: : :: ..:..: .::: .: :. :::. ::
CCDS16 QDSGGREDIVYSVTCEQCW---PESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNY
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 TFNVEAQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSP
::.:::.:::::: .: .. ..:.:....: ..:: . .: ..:. :..
CCDS16 TFTVEARNGVSGLVTS-RSFRTASVSINQTEP---PKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 GANLTYELHVLNQ-DEERYQMVLEP--RVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHE
. ::. .. : . :.. : : .: :::::.:.:. :: : : : ::
CCDS16 RV-WKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHE
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KE3 FRTSPPVSRG---LTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVD
:.: : . : . :: :.:.. :.:.. .:... : :. :: ::. . ::
CCDS16 FQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAG---VGFFIHRRRKNQRARQSPE-----DVY
530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 REDKLWLKP---YVDLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLP
. ::: ::: ..:::: :..: :: :. :. . . ::: :::::::.: :.
CCDS16 FSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTS
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 SQDCKT-VAIKTLKDTSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFM
: .. ::::::: : .:: :: ::::::: .:..::::..: ::.:::::.:
CCDS16 SGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYM
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 ENGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKV
:::::: ::::.. .. :::.::.:::.::.::.: :::::::::::::::.:: :::
CCDS16 ENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKV
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 SDFGLTRLL-DDFDGTYETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGD
:::::.:.: :: ..:: :.::::::::::::::..: ::.::::::::::::::...:.
CCDS16 SDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGE
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 KPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLL
.:: :.::.::::.:.::.::: :.:::. .:.:: .:: .:::::.: . . :..:.
CCDS16 RPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLI
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 ANPHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMEC
: ::.:.:.:::::..:::: :::.:.:.::::::::::.:..: :: .:: ..:
CCDS16 RAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEK
880 890 900 910 920 930
950 960 970
pF1KE3 VLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD
:...: .:. ..:. :::::::: :. :.::
CCDS16 VVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
940 950 960 970
>>CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 (986 aa)
initn: 2671 init1: 784 opt: 2765 Z-score: 1576.3 bits: 303.1 E(32554): 1.8e-81
Smith-Waterman score: 2765; 45.6% identity (72.2% similar) in 962 aa overlap (25-975:28-973)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQI
:.::::.:. ..::::::. .: . :: :. .:
CCDS24 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGW-EEVSI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LN--GTPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGP
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CCDS24 MDEKNTPIRTYQVCNVM-EPSQNNWLRTDWITR-EGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGT
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 LGCKETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGR
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CCDS24 --CKETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGP
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pF1KE3 LTRRGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGP--AGLVEVAGTCLP
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... . .:.:.:. :::::::.: : :. :.:: ::: : :: : :.
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: .::::::. :.: :..: : : . :.::: :::..: :: : : .. : ..
CCDS24 SPQNTGGRQDISYNVVCKKCG--AGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHT
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::::.. : :::: . . :.::... ..: :...: .:. : .. :.: .:
CCDS24 NYTFEIWAVNGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAP-SSIALVQAKEVTRYSVALAWL--EP
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: :. : ::.. ..:. :: ... . :. :.: :.:. .:: : : : :
CCDS24 DRPNGVILEYEVKYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDF
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... . .. ::: .:::: :.. .:..:.: . . .. ::: :::::: : :..:.
CCDS24 EEKHLNQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPG
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CCDS24 KREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMEN
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CCDS24 FGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERP
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CCDS24 YWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRN
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pF1KE3 PHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVL
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CCDS24 PNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVV
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CCDS24 HVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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10 20 30
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CCDS35 ADESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVR
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:.: ..:. ..: : : : :: ::.:.: . . ..: .. .. .:. ::
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CCDS35 VVIGVLL-SGRRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAK
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CCDS35 AIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALY
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CCDS35 QLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYR
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CCDS35 SVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKV
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CCDS35 QLVNGMVPL
1010
>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 (983 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS29 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWI-SYPSHGWEEIS
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CCDS29 GVDEHYTPIRTYQVCNVMDH-SQNNWLRTNWVPRNS-AQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLG
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CCDS29 T--CKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVG
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CCDS29 PVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVN
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... : :::.:: .::::::.:.: :. :::: : : :: : :. . .
CCDS29 NSKEED-P---PRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEE--RGFMCQACRPGFYKALDGNMK
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: :: .:... .:. : ::....:: . :..::: :::.:::. . . :.. : :
CCDS29 CAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWS
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CCDS29 WPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQ---CEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHT
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CCDS29 NYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSW--QEPE
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CCDS29 HPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNS
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::.::: : ...: ...: . .. .. :: .. : . .... .. :
CCDS29 RKFEFETSPD-SFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKR
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pF1KE3 ATDVDREDKL-WLKPYVDLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTL
. . :: :. ::: ..::::.:.. .:..::: . . .: :.: :::::: : :
CCDS29 LHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRL
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pF1KE3 RLPSQDCKTVAIKTLKDTSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITE
.:::. .::::::: : .:: ::.:::::.::.:..::::::: ::.::.::
CCDS29 KLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTE
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pF1KE3 FMENGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCC
.::::.::.:::... :.. :::.::.::::::.:::. .::::::::::::.:.:: :
CCDS29 YMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVC
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CCDS29 KVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSY
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pF1KE3 GDKPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQ
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CCDS29 GERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDK
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pF1KE3 LLANPHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTM
:. :: ::. :.. : . : . :. : .::...::... . : .. ..
CCDS29 LIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSC
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pF1KE3 ECVLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD
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CCDS29 DTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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10 20 30 40
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPK
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CCDS32 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWT-SHPE
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pF1KE3 DGWSE---QQQILNGTPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRD
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CCDS32 SGWEEVSGYDEAMN--PIRTYQVCNVR-ESSQNNWLRTGFIWR-RDVQRVYVELKFTVRD
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 CKSFPGGAGPLGCKETFNLLYMESDQDVG-----IQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLA
:.:.:. : .:::::::.:.:.:.::. . .. : . :: :.: :.::. :
CCDS32 CNSIPNIPG--SCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENP-YVKVDTIAPDESFSRLD--
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 SGSVKLNVERCSLGRLTRRGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPG
.: :. .:. :.: :.. :.::::.. :::..:.:::.::..: : :.: ::.:: :
CCDS32 AGRVNTKVR--SFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTG
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE3 --PAGLVEVAGTCLPHARASPRPSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACV
:..:: . :::.:.: : ...:. ::::.:::: : : :.: ... :
CCDS32 AEPTSLVIAPGTCIPNAVEVSVPL---KLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCR
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280 290 300 310 320 330
pF1KE3 ACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQSTAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRN
:: :::. . :: :: .: . : .:.::::... ::: ... . ::: :: ::.
CCDS32 PCPPGSYKAKQGEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRG
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pF1KE3 LSFSASGTQLSLRWEPPADTGGRQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARG
. ... :.: :.: : : :::.:. :.: :..:.: : .. :. : .:.: : :
CCDS32 VISNVNETSLILEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHG-AGGASACSRCDDNVEFVPRQLG
350 360 370 380 390 400
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:: ::.. : .. :::.:.: ::::: . ..:.:. ..: .::: ..
CCDS32 LTERRVHISHLLAHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSS
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.: :.:: :. : :. : ::.. ....: . : : : :.::. :.:.
CCDS32 SGSSLTLSWAP--PERPNGVILDYEMKYFEKSEGIASTVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQ
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:: : : : .: ::.:. :: .:.. . . :..:.: ......:.
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..::. . . . ... .: :.: .:::: ... .:..:.: . . .. ::
CCDS32 VCLRKQRHGSDSEYTEKLQQYIAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVI
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: :::::: :: :. :.. ::::::: : .:: ::.:::::.::.:..:::
CCDS32 GAGEFGEVCRGRLKQPGRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEG
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pF1KE3 VVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDL
:::: .:.::.:::::: :::.::: . :.. :::.::.:::.::.:::. :::::::
CCDS32 VVTKSRPVMILTEFMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDL
700 710 720 730 740 750
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pF1KE3 AARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDD--FDGTYETQ-GGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTAS
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CCDS32 AARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSAS
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pF1KE3 DVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDR
::::.:::::::.:.:..:: .::::.:....:. ::::::.:::. :..:: .::. ::
CCDS32 DVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDR
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pF1KE3 ARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRM
::.:... :..:. : ::..::. . .. : . . : . ::..::..:.:
CCDS32 NLRPKFSQIVNTLDKLIRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKM
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:: : :::. ... : ..::::: ..:.:: ::::.:: ::: ..
CCDS32 GRYKESFVSAGFASFDLVAQMTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
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10 20 30
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40 50 60 70 80
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.:. ..:.:::. ::.:: : .. : .:.. :: : .. ... ..:: ..:: .
CCDS75 LDSRTVMGDLGWIA-FPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVM-EQNQNNWLLTSWI-SN
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::.::: ::.. .:::.: ..: :...:.::::.. :::.:::::::.:..:: ..
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210 220 230 240 250 260
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:: ::::. : . :.::.:.:. :. .. .: :.:::: .::::::.:.: :. :
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::: .. .: .: : .. . : :: .: .. :..: :.::. ..: .. : .
CCDS75 YEEKNG--TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTM
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CCDS75 GHVRYLPRQSGLKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAP
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... : .. :.: ..: : : : ::.. ...:.: : .. .. .:
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:.: ..:. ..: : : : :: ::.:.: :. . ..: .. .. .:. ::
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CCDS75 EAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAAL
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CCDS75 YQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAY
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:.:.::::.:.: :: : : ..:. : ..: ::: ..:.:: ::::.:. :.: .:
CCDS75 RSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMK
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CCDS75 VQLVNGMVPL
1010
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CCDS57 EEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPR-RGAVHVYATLRFTMLECLSLPR-AGR-S
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:::::...:.::: :.. : . : . :: ::::.. : : .. :.::.
CCDS57 CKETFTVFYYESDADTATALTPAWMENP-YIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLR
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:: :.. :.::::.. :::.::.:...::..: . .:..::.:.: .: :::.:.
CCDS57 LGPLSKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVPREL-VVPVAGSCV
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: .: :: : ..: ::.: :: : : ::.: . .. : :: .:...
CCDS57 VDAVPAPGPS--PSLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGE
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: :: .: ... :...: :. :..:: . . :: ::::::.. .:..: :.
CCDS57 GSCQPCPANSHSNTIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLE
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: : ..:::.:. :..:: .:. :: : ::: . :.:: : :. : : : ::.:
CCDS57 WSAPLESGGREDLTYALRCRECR----PGGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRP
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.:::.: : ::::.:... :... . . ..:.... : .: :.::
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CCDS57 PRAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYG
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CCDS57 PFGQEHHSQTQLDESEGWR--EQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEY
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. :.. . . : :.: .:::: ... .:..:.: ... .. ::: :::::: :
CCDS57 S---DKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCR
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CCDS57 GRLKAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMI
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pF1KE3 ITEFMENGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQN
.::::::::::.::: . :.. :::.::.:::::: ::.. .::::::::::::::.:
CCDS57 LTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSN
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: ::::::::.:.:.. : :: .. ::::::::::::::: : ::.:::.::.:::::
CCDS57 LVCKVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMW
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pF1KE3 EVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQ
::.:::..:: .::::.:...::. :::::: :::. :..:: .:: :: ::.: ..
CCDS57 EVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVV
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pF1KE3 AHLEQLLANPHSLRTIANFD-----PRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYIL
. :.... :: ::. .: . : . : : :. . .:.:::..:.: ::
CCDS57 SALDKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSA-----FGSVGEWLRAIKMGRYEE
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pF1KE3 HFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD
: .::. ..: : ...:::: ..:.:: ::::.:: :.: .:
CCDS57 SFAAAGFGSFELVSQISAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQ
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CCDS57 Y
>>CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 (984 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQI-LN
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CCDS46 MALDYLLLLL--LASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPAS-GWEEVSGYDEN
10 20 30 40 50
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pF1KE3 GTPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCK
. . :: : . . . ..:: ...: : . : :...:..::::::.:.:. : .::
CCDS46 LNTIRTYQVCNVF-EPNQNNWLLTTFINR-RGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPG--SCK
60 70 80 90 100
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pF1KE3 ETFNLLYMESDQDVGIQ----LRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGR
::::: :.:.:. .. . . . :: :.:::.::. :... .:.:.: :.:
CCDS46 ETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGP
110 120 130 140 150 160
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