Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4231
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4231, 1849 aa
1>>>pF1KB4231 1849 - 1849 aa - 1849 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4868+/-0.000985; mu= 19.3048+/- 0.060
mean_var=91.7658+/-17.792, 0's: 0 Z-trim(105.9): 36 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.133886
statistics sampled from 8750 (8779) to 8750 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs109|chr8 (1849) 12156 2359.3 0
CCDS13411.1 ARFGEF2 gene_id:10564|Hs109|chr20 (1785) 6550 1276.5 0
CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17 ( 397) 655 137.5 9.7e-32
CCDS42392.3 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17 ( 398) 655 137.5 9.7e-32
CCDS86644.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs109|chr17 ( 339) 646 135.8 2.8e-31
CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs109|chr7 ( 399) 635 133.7 1.4e-30
CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19 ( 399) 617 130.2 1.6e-29
CCDS86786.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19 ( 400) 617 130.2 1.6e-29
CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs109|chr22 ( 394) 603 127.5 1e-28
CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs109|chrX ( 949) 537 114.9 1.5e-24
CCDS87048.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs109|chr3 ( 814) 536 114.7 1.5e-24
CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs109|chr3 ( 963) 536 114.7 1.7e-24
CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs109|chr3 (1114) 536 114.7 2e-24
CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs109|chrX (1488) 537 115.0 2.2e-24
CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs109|chr12 ( 759) 510 109.7 4.6e-23
CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs109|chr12 (1182) 510 109.7 6.8e-23
CCDS7533.1 GBF1 gene_id:8729|Hs109|chr10 (1859) 505 108.9 2e-22
CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs109|chr8 ( 513) 332 75.2 7.3e-13
CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs109|chr8 (1047) 332 75.3 1.4e-12
CCDS3820.1 FBXO8 gene_id:26269|Hs109|chr4 ( 319) 324 73.6 1.4e-12
CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs109|chr2 (1056) 319 72.8 7.8e-12
CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs109|chr5 ( 771) 313 71.6 1.3e-11
>>CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs109|chr8 (1849 aa)
initn: 12156 init1: 12156 opt: 12156 Z-score: 12679.0 bits: 2359.3 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 12156; 100.0% identity (100.0% similar) in 1849 aa overlap (1-1849:1-1849)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MYEGKKTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKAETEKQSPPHGEAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MYEGKKTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKAETEKQSPPHGEAKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGNAPDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGNAPDST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQHHHLLQSPVSHHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQHHHLLQSPVSHHE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PESPQLRYLPPQTVDHISQEHEGDLDLHTNDVDKSLQDDTEPENGSDISSAENEQTEADQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PESPQLRYLPPQTVDHISQEHEGDLDLHTNDVDKSLQDDTEPENGSDISSAENEQTEADQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ATAAETLSKNEVLYDGENHDCEEKPQDIVQNIVEEMVNIVVGDMGEGTTINASADGNIGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ATAAETLSKNEVLYDGENHDCEEKPQDIVQNIVEEMVNIVVGDMGEGTTINASADGNIGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 IEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQESGNSSGPSPGAKFSHILQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQESGNSSGPSPGAKFSHILQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 KDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSLQLLLSILQNAGPIFRTNEMFINA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSLQLLLSILQNAGPIFRTNEMFINA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 IKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQIEVFFKEIFLYILETSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQIEVFFKEIFLYILETSTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRGSQELGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRGSQELGM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETIN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 RYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPKRGIQYL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 QEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSGKDFVSA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 LRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 PQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPTKSSKQN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 VASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWTPFLAAF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 SVGLQDCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFSIQLERDAYVQALARFTLLTVSSGITEMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SVGLQDCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFSIQLERDAYVQALARFTLLTVSSGITEMKQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 KNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKPRYISGTVRGREGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKPRYISGTVRGREGSL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 TGTKDQAPDEFVGLGLVGGNVDWKQIASIQESIGETSSQSVVVAVDRIFTGSTRLDGNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TGTKDQAPDEFVGLGLVGGNVDWKQIASIQESIGETSSQSVVVAVDRIFTGSTRLDGNAI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 VDFVRWLCAVSMDELLSTTHPRMFSLQKIVEISYYNMGRIRLQWSRIWEVIGDHFNKVGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VDFVRWLCAVSMDELLSTTHPRMFSLQKIVEISYYNMGRIRLQWSRIWEVIGDHFNKVGC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 NPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKRNRSPTIRDMVVRCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKRNRSPTIRDMVVRCI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 AQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQTTGHIVTLVFEKHFPATIDSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQTTGHIVTLVFEKHFPATIDSF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 QDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEYTSDDMNVAPEDRVWVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEYTSDDMNVAPEDRVWVR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 GWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKTYGHTYEKHWWQDLFRIVFRIFDNMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKTYGHTYEKHWWQDLFRIVFRIFDNMKL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 PEQQTEKAEWMTTTCNHALYAICDVFTQYLEVLSDVLLDDIFAQLYWCVQQDNEQLARSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PEQQTEKAEWMTTTCNHALYAICDVFTQYLEVLSDVLLDDIFAQLYWCVQQDNEQLARSG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB4 TNCLENVVILNGEKFTLEIWDKTCNCTLDIFKTTIPHALLTWRPNSGETAPPPPSPVSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TNCLENVVILNGEKFTLEIWDKTCNCTLDIFKTTIPHALLTWRPNSGETAPPPPSPVSEK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB4 PLDTISQKSVDIHDSIQPRSVDNRPQAPLVSASAVNEEVSKIKSTAKFPEQKLFAALLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PLDTISQKSVDIHDSIQPRSVDNRPQAPLVSASAVNEEVSKIKSTAKFPEQKLFAALLIK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB4 CVVQLELIQTIDNIVFFPATSKKEDAENLAAAQRDAVDFDVRVDTQDQGMYRFLTSQQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CVVQLELIQTIDNIVFFPATSKKEDAENLAAAQRDAVDFDVRVDTQDQGMYRFLTSQQLF
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB4 KLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGLRILFRMYMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGLRILFRMYMD
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB4 ESRVSAWEEVQQRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKISDNRFKAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ESRVSAWEEVQQRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKISDNRFKAHA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840
pF1KB4 SFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQ
1810 1820 1830 1840
>>CCDS13411.1 ARFGEF2 gene_id:10564|Hs109|chr20 (1785 aa)
initn: 7416 init1: 2745 opt: 6550 Z-score: 6827.1 bits: 1276.5 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 8862; 75.0% identity (87.9% similar) in 1845 aa overlap (6-1841:5-1773)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MYEGKKTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKAETEKQSPPHGEAKA
.::.::..:::::::::::::. .:::::.::.:::.::::: ::: .
CCDS13 MQESQTKSMFVSRALEKILADKEVKRPQHSQLRRACQVALDEIKAEIEKQ-------RL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGNAPDST
:... :: :.::::::::::::::::::: ::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS13 GTAA-PP---KANFIEADKYFLPFELACQSKSPRVVSTSLDCLQKLIAYGHITGNAPDSG
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYN
.:::.:::::.::::.::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::.::::::
CCDS13 APGKRLIDRIVETICSCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSPHIEIHEGTILQTVRTCYN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQHHHLLQSPVSHHE
::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::...:: . . :::: .
CCDS13 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFTRMENQVLQEARELEKPIQSKP----QSPVIQAA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PESPQLRYLPPQTVDHISQEHEGDLDLHTNDVDKSLQDDTEPENGSDISSAENEQTEADQ
::.. : :.. .: : ::. .:....:. .... .
CCDS13 AVSPKFVRLK-----------------HSQAQSKP----TTPEK-TDLTNGEHARSDSGK
230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KB4 ATAAETLSKNEVLYDGENHDCEEKPQDIVQNIVEEMVNIVVGDMGE--GTTINASADGNI
... . . : . . : . :..:..:.:..:. .. . .: : : . :..
CCDS13 VSTENGDAPRERGSSLSGTD--DGAQEVVKDILEDVVTSAIKEAAEKHGLTEPERVLGEL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 G----TIEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQESGNSSGPSPGAK
.: : : :: :.::: ::: :.:: :. :: ...: . .:.
CCDS13 ECQECAIPPGVD-ENSQTNGIA-------------DDRQSLSSADNLES-DAQGHQVAAR
330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 FSHILQKDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSLQLLLSILQNAGPIFRTN
:::.::::::::::::::::::::..:::::::::::::..:::::::.::::::.:::.
CCDS13 FSHVLQKDAFLVFRSLCKLSMKPLGEGPPDPKSHELRSKVVSLQLLLSVLQNAGPVFRTH
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 EMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQIEVFFKEIFLYI
::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::: ::::::::::::::: :
CCDS13 EMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPDVFELSLAIFLTLLSNFKMHLKMQIEVFFKEIFLNI
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 LETSTSSFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRG
::::::::.:.::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS13 LETSTSSFEHRWMVIQTLTRICADAQCVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRS
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 SQELGMSNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIK
..::::. .:::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::. ..::... :
CCDS13 GHELGMTPLQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNHQTSLGQERLTDQEIGDGK
550 560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 HPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPK
. . : :..:.::: ::: :: . :.::::::.::::::::.::.:::::::
CCDS13 GLD-MARRCSVTSMESTVSSG-----TQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPK
610 620 630 640 650
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 RGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSG
::::.:::::::::. :::::::::::::::::::.::::. .:::::::::::: ::
CCDS13 RGIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSARFNKEVMYAYVDQLDFCE
660 670 680 690 700 710
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 KDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIML
:.:::::: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KEFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIML
720 730 740 750 760 770
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 TTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:: ::::.::::::::: :
CCDS13 TTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIAT
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::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::::::::.::
CCDS13 KSTKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWT
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:.:::.:.:::.::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::.::.
CCDS13 PLLAAYSIGLQNCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFGMQLERDAYVQALARFSLLTASSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::. :
CCDS13 ITEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKTRYLSGSGR
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::::: : . : .::.:::: :.:.:: .:.::.:::.::::::::::::::::::
CCDS13 EREGSLKG-HTLAGEEFMGLGLGNLVSGGVDKRQMASFQESVGETSSQSVVVAVDRIFTG
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:::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::::::::.::::::::::.::
CCDS13 STRLDGNAIVDFVRWLCAVSMDELASPHHPRMFSLQKIVEISYYNMNRIRLQWSRIWHVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS13 GDHFNKVGCNPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKKNRSPT
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::::..::::::::::::::::::::::.::: ::::.: .::::::::: :::: .:..
CCDS13 IRDMAIRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFAVFHQAASDHDGNIVELAFQTTCHIVTTIFQH
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:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
CCDS13 APGDRVWVRGWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKSYGHTFEKHWWQDLFRIV
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:::::::::::: .::.::::::::::::::::::::. :.:..:::.:.:::: :::.:
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CCDS13 DNEQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPEVWDETCNCMLDIFKTTIPHVLLTWRPVGMEEDS
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::: :: ::. : . :.:. :. . : ... .. . . .:
CCDS13 ------SEKHLD------VDL-DRQSLSSIDKNPSE--RGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQ
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::::.::::::::::::::::::::.::::::::::...:::.:..: :....:.:::::
CCDS13 KLFASLLIKCVVQLELIQTIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDADIHIETEDQGMY
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pF1KB4 RFLTSQQLFKLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGL
....::.:::::::: ::: :.:::::: ::::.::.::::::::::::::::::::: :
CCDS13 KYMSSQHLFKLLDCLQESHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCL
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pF1KB4 RILFRMYMDESRVSAWEEVQQRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKI
:::::::.::.: ..:::.:::::.::::::.::.:..:::::::::.::::.:::.:::
CCDS13 RILFRMYVDENRRDSWEEIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKI
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pF1KB4 SDNRFKAHASFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQ
.:..::::::.::: ::::::::::::::::::.::::::::..: : :
CCDS13 NDEKFKAHASMYYPYLCEIMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWIPEEPSQVPAALSP
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CCDS13 VW
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CCDS32 KTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQV
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pF1KB4 CLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETINRYGS--LNSLESTS
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CCDS42 DE-IAEVANEIENLGSTEERKNMQRNKQVA-MGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCED
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: :::::::. ::::: : .:. : .. ... :
CCDS42 IAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGR
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CCDS42 VKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQ
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CCDS86 KNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLW
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CCDS86 KLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYI
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CCDS53 EEREELLDIRRRKKELIDDIERLKYEIAEVMTEIDNLTSVEESKTTQRNKQIAMGRKKFN
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CCDS53 MDPKKGIQFLIENDLLQSSPEDVAQFLYKGEGLNKTVIGDYLGERDEFNIKVLQAFVELH
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CCDS53 EFADLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFASRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFA
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CCDS53 IIMLNTSLHNHNVRDKPTAERFIAMNRGINEGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGN
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pF1KB4 TIPTKSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFK
CCDS53 DLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIR
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pF1KB4 SEIKHPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFN
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CCDS12 ERMELENIRRRKQELLVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMA-MGRKKFN
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::.:::.: :. .: .:::.::.::.. : :..: .:..::. ...: :..:.:: :
CCDS12 MDPKKGIQFLVENELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAVLHAFVDLH
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CCDS12 EFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFA
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pF1KB4 IIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKEL
.:::.:.::.:.:..: :... ::::::.. ::::: : .:. : .. ... :
CCDS12 VIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGN
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pF1KB4 TIPTKSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFK
CCDS12 DLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIR
260 270 280 290 300 310
>>CCDS86786.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs109|chr19 (400 aa)
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Smith-Waterman score: 617; 45.1% identity (77.2% similar) in 206 aa overlap (681-886:45-247)
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pF1KB4 SEIKHPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFN
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CCDS86 ERMELENIRRRKQELLVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMA-MGRKKFN
20 30 40 50 60 70
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pF1KB4 KKPKRGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQH
::.:::.: :. .: .:::.::.::.. : :..: .:..::. ...: :..:.:: :
CCDS86 MDPKKGIQFLVENELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAVLHAFVDLH
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pF1KB4 DFSGKDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYS
.:. ..:.:::.:: .::::::::::::.:: :: :: :: : .: :.:: :::...
CCDS86 EFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFA
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pF1KB4 IIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKEL
.:::.:.::.:.:..: :... ::::::.. ::::: : .:. : .. ... :
CCDS86 VIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGN
200 210 220 230 240 250
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pF1KB4 TIPTKSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFK
CCDS86 DLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSI
260 270 280 290 300 310
>>CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs109|chr22 (394 aa)
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Smith-Waterman score: 603; 40.2% identity (73.1% similar) in 249 aa overlap (640-886:3-247)
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pF1KB4 KKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIKHPETI--NRYGSLNS
: . .:.: .: .. . : .: :..
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