Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2231
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2231, 516 aa
1>>>pF1KE2231 516 - 516 aa - 516 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6100+/-0.00143; mu= 14.3637+/- 0.085
mean_var=284.5642+/-56.056, 0's: 0 Z-trim(110.4): 864 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.076030
statistics sampled from 10599 (11611) to 10599 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 2.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43436.2 ZFP57 gene_id:346171|Hs108|chr6 ( 536) 3605 409.7 4.2e-114
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CCDS42485.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 430) 579 77.6 3.1e-14
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 566 76.5 1.1e-13
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 543 74.5 8.3e-13
CCDS33132.2 ZNF749 gene_id:388567|Hs108|chr19 ( 778) 502 69.6 1.5e-11
CCDS43712.1 ZNF705D gene_id:728957|Hs108|chr8 ( 300) 495 68.1 1.5e-11
CCDS31089.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 289) 491 67.7 2.1e-11
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 497 69.0 2.1e-11
CCDS55194.1 ZNF705B gene_id:100132396|Hs108|chr8 ( 300) 486 67.2 3.1e-11
>>CCDS43436.2 ZFP57 gene_id:346171|Hs108|chr6 (536 aa)
initn: 3659 init1: 3603 opt: 3605 Z-score: 2162.0 bits: 409.7 E(32554): 4.2e-114
Smith-Waterman score: 3623; 96.3% identity (96.3% similar) in 536 aa overlap (1-516:1-536)
10 20 30 40
pF1KE2 MFEQLKPIEP--------------------RDCWREARVKKKPVTFEDVAVNFTQEEWDC
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CCDS43 MFEQLKPIEPVQKTLPWVGEVAATLQEAMKRDCWREARVKKKPVTFEDVAVNFTQEEWDC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LDASQRVLYQDVMSETFKNLTSVARIFLHKPELITKLEQEEEQWREFVHLPNTEGLSEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LDASQRVLYQDVMSETFKNLTSVARIFLHKPELITKLEQEEEQWREFVHLPNTEGLSEGK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KKELREQHPSLRDEGTSDDKVFLACRGAGQCPLSAPAGTMDRTRVLQASQAGPPFFCYTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KKELREQHPSLRDEGTSDDKVFLACRGAGQCPLSAPAGTMDRTRVLQASQAGPPFFCYTC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 GKCFSRRSYLYSHQFVHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLGERPFCCTLCDKTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GKCFSRRSYLYSHQFVHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLGERPFCCTLCDKTY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 CDASGLSRHRRVHLGYRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPVDGNQECTLRIPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CDASGLSRHRRVHLGYRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPVDGNQECTLRIPGT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 QAEFQTPIARSQRSIQGLLDVNHAPVARSQEPIFRTEGPMAQNQASVLKNQAPVTRTQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QAEFQTPIARSQRSIQGLLDVNHAPVARSQEPIFRTEGPMAQNQASVLKNQAPVTRTQAP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ITGTLCQDARSNSHPVKPSRLNVFCCPHCSLTFSKKSYLSRHQKAHLTEPPNYCFHCSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITGTLCQDARSNSHPVKPSRLNVFCCPHCSLTFSKKSYLSRHQKAHLTEPPNYCFHCSKS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 FSSFSRLVRHQQTHWKQKSYLCPICDLSFGEKEGLMDHWRGYKGKDLCQSSHHKCRVILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSSFSRLVRHQQTHWKQKSYLCPICDLSFGEKEGLMDHWRGYKGKDLCQSSHHKCRVILG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KE2 QWLGFSHDVPTMAGEEWKHGGDQSPPRIHTPRRRGLREKACKGDKTKEAVSILKHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QWLGFSHDVPTMAGEEWKHGGDQSPPRIHTPRRRGLREKACKGDKTKEAVSILKHK
490 500 510 520 530
>>CCDS42183.1 ZFP90 gene_id:146198|Hs108|chr16 (636 aa)
initn: 1066 init1: 360 opt: 601 Z-score: 380.5 bits: 80.3 E(32554): 7.1e-15
Smith-Waterman score: 601; 28.7% identity (56.2% similar) in 397 aa overlap (65-445:218-606)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 QEEWDCLDASQRVLYQDVMSETFKNLTSVARIFLHKPELITKLEQEEEQWREFVHLPN--
. :.:. : :: :. .. : ::
CCDS42 LGSNLGHNADLLNENNILAKKKPYKCDKCRKAFIHRSSL-TKHEKTHKGEGAF---PNGT
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140
pF1KE2 TEGLSEGKKK-ELREQHPSL--RDEGTSDDKVFLACRGAGQCPLSAPAGTMDRT--RVLQ
.:. :::. : . .. . . : ... . . .: . . : . . . .
CCDS42 DQGIYPGKKHHECTDCGKTFLWKTQLTEHQRIHTGEK-PFECNVCGKAFRHSSSLGQHEN
250 260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 ASQAGPPFFCYTCGKCFSRRSYLYSHQFVHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLG
: . :. : ::: :.: : : .:: .:. . :. ::. :: ::. :. : :
CCDS42 AHTGEKPYQCSLCGKAFQRSSSLVQHQRIHTGEKPYRCNLCGRSFRHGTSLTQHEVTHSG
310 320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 ERPFCCTLCDKTYCDASGLSRHRRVHLGYRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPV
:.:: : : :.. :.: .:.:.: : .: ::.::..: .. : .:..::. .:
CCDS42 EKPFQCKECGKAFSRCSSLVQHERTHTGEKPFECSICGRAFGQSPSLYKHMRIHKRGKPY
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 DGNQ---ECTLRIPGTQAEFQTPIARSQRSIQGLLDVNHAPVARSQEPIFRTEGPMAQNQ
.... . :: : ..: . . : .: ... : .:.:. .:
CCDS42 QSSNYSIDFKHSTSLTQDESTLTEVKSYHCNDCGEDFSHITDFTDHQRIHTAENPYDCEQ
430 440 450 460 470 480
330 340 350 360 370
pF1KE2 ASVLKNQAPVTRTQAPITGTLCQDA--RSNSHPVKPSRLNV----FCCPHCSLTFSKKSY
: ...:: . : ..: : ::.: .. :... . : .:. .::..:
CCDS42 A--FSQQAISHPGEKPYQCNVCGKAFKRSTSF-IEHHRIHTGEKPYECNECGEAFSRRSS
490 500 510 520 530
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 LSRHQKAHLTEPPNYCFHCSKSFSSFSRLVRHQQTHWKQKSYLCPICDLSFGEKEGLMDH
:..:...: : : :. :.:.::. : :..:..:: .: : : : .: .: .: ::
CCDS42 LTQHERTHTGEKPYECIDCGKAFSQSSSLIQHERTHTGEKPYECNECGRAFRKKTNLHDH
540 550 560 570 580 590
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 WRGYKGKDLCQSSHHKCRVILGQWLGFSHDVPTMAGEEWKHGGDQSPPRIHTPRRRGLRE
: . :.
CCDS42 QRIHTGEKPYSCKECGKNFSRSSALTKHQRIHTRNKL
600 610 620 630
>>CCDS45945.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 (423 aa)
initn: 1546 init1: 379 opt: 579 Z-score: 369.1 bits: 77.6 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 680; 32.4% identity (58.2% similar) in 411 aa overlap (24-417:36-422)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MFEQLKPIEPRDCWREARVKKKPVTFEDVAVNFTQEEWDCLDASQRVLYQDVM
::::::::.:::::: :: .::.::.:::
CCDS45 LPPTAASQREGHTEGGELVNELLKSWLKGLVTFEDVAVEFTQEEWALLDPAQRTLYRDVM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 SETFKNLTSVARIFLHKPELITKLEQEEEQWREFVHL-----PNTEGLSEGKKKELREQH
:. .::.:.. . ::.::..::::.. : . :..: . : : : .
CCDS45 LENCRNLASLGNQ-VDKPRLISQLEQEDKVMTEERGILSGTCPDVE--NPFKAKGLTPKL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PSLRDEGTSDDKVFLACRGA-----GQC-PLSAPAGTMDRTRVLQASQAGPPFFCYTCGK
.: : . . :. :: .:: . . ... : : ..... :. : :::
CCDS45 HVFRKEQSRNMKMERNHLGATLNECNQCFKVFSTKSSLTRHRKIHTGER--PYGCSECGK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 CFSRRSYLYSHQFVHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLGERPFCCTLCDKTYCD
.: :::: :. .:: . :..::: : : . :. :.:.: ::.:. :. : ::. .
CCDS45 SYSSRSYLAVHKRIHNGEKPYECNDCGKTFSSRSYLTVHKRIHNGEKPYECSDCGKTFSN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ASGLSRHRRVHLGYRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPVDGNQECTLRIPGTQA
.: : : :.: : .:..:. : . :: :: . ::...: .. :: : . ::..
CCDS45 SSYLRPHLRIHTGEKPYKCNQCFREFRTQSIFTRHKRVHTGEGHYVCNQ-CG-KAFGTRS
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 EFQTPIARSQRSIQ-GLLDVNHAPVARSQEPIFRTEGPMAQNQASVLKNQAPVTRTQAPI
.. :. ::. : . .:. :: .. ..:. ..... . :
CCDS45 SLS-----SHYSIHTGEYPYECHDCGRT----FRRRSNLTQH----IRTHT----GEKPY
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE2 TGTLCQDARSNSHPVKPSRL-----NVFCCPHCSLTFSKKSYLSRHQKAHLTEPPNYCFH
: . : . .:: . : . . : :. .:. : ...:...: . : : .
CCDS45 TCNECGKSFTNSFSLTIHRRIHNGEKSYECSDCGKSFNVLSSVKKHMRTHTGKKPYECNY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 CSKSFSSFSRLVRHQQTHWKQKSYLCPICDLSFGEKEGLMDHWRGYKGKDLCQSSHHKCR
:.:::.: : : : . : .:
CCDS45 CGKSFTSNSYLSVHTRMHNRQM
410 420
>>CCDS42485.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 1546 init1: 379 opt: 579 Z-score: 369.0 bits: 77.6 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 680; 32.4% identity (58.2% similar) in 411 aa overlap (24-417:43-429)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MFEQLKPIEPRDCWREARVKKKPVTFEDVAVNFTQEEWDCLDASQRVLYQDVM
::::::::.:::::: :: .::.::.:::
CCDS42 SSLFPASQREGHTEGGELVNELLKSWLKGLVTFEDVAVEFTQEEWALLDPAQRTLYRDVM
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100
pF1KE2 SETFKNLTSVARIFLHKPELITKLEQEEEQWREFVHL-----PNTEGLSEGKKKELREQH
:. .::.:.. . ::.::..::::.. : . :..: . : : : .
CCDS42 LENCRNLASLGNQ-VDKPRLISQLEQEDKVMTEERGILSGTCPDVE--NPFKAKGLTPKL
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PSLRDEGTSDDKVFLACRGA-----GQC-PLSAPAGTMDRTRVLQASQAGPPFFCYTCGK
.: : . . :. :: .:: . . ... : : ..... :. : :::
CCDS42 HVFRKEQSRNMKMERNHLGATLNECNQCFKVFSTKSSLTRHRKIHTGER--PYGCSECGK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 CFSRRSYLYSHQFVHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLGERPFCCTLCDKTYCD
.: :::: :. .:: . :..::: : : . :. :.:.: ::.:. :. : ::. .
CCDS42 SYSSRSYLAVHKRIHNGEKPYECNDCGKTFSSRSYLTVHKRIHNGEKPYECSDCGKTFSN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ASGLSRHRRVHLGYRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPVDGNQECTLRIPGTQA
.: : : :.: : .:..:. : . :: :: . ::...: .. :: : . ::..
CCDS42 SSYLRPHLRIHTGEKPYKCNQCFREFRTQSIFTRHKRVHTGEGHYVCNQ-CG-KAFGTRS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 EFQTPIARSQRSIQ-GLLDVNHAPVARSQEPIFRTEGPMAQNQASVLKNQAPVTRTQAPI
.. :. ::. : . .:. :: .. ..:. ..... . :
CCDS42 SLS-----SHYSIHTGEYPYECHDCGRT----FRRRSNLTQH----IRTHT----GEKPY
310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE2 TGTLCQDARSNSHPVKPSRL-----NVFCCPHCSLTFSKKSYLSRHQKAHLTEPPNYCFH
: . : . .:: . : . . : :. .:. : ...:...: . : : .
CCDS42 TCNECGKSFTNSFSLTIHRRIHNGEKSYECSDCGKSFNVLSSVKKHMRTHTGKKPYECNY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 CSKSFSSFSRLVRHQQTHWKQKSYLCPICDLSFGEKEGLMDHWRGYKGKDLCQSSHHKCR
:.:::.: : : : . : .:
CCDS42 CGKSFTSNSYLSVHTRMHNRQM
410 420 430
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 3236 init1: 378 opt: 566 Z-score: 359.4 bits: 76.5 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 726; 31.1% identity (57.1% similar) in 450 aa overlap (21-445:3-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFEQLKPIEPRDCWREARVKKKPVTFEDVAVNFTQEEWDCLDASQRVLYQDVMSETFKNL
.: : :.:::..:.::::.:::..:: ::.::: :...::
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE2 TSV---ARIFLH--KPELITKLEQEEEQWREFVHLPNTEGLSEGKKKELREQHPSLRDEG
.:. .: . .:: : : : ::. .: : . : :..... : . ... .
CCDS12 VSLDLPSRCASKDLSPEKNT-YETELSQWEMSDRLENCD-LEESNSRDYLEAKGKMEKQQ
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TSDDKVFLACRGAGQCPLSAPAGTMDRTRVLQASQAGP---PFFCYTCGKCFSRRSYLYS
.. . : : :. . . ..: . : :. :. : ::: : : :.: .
CCDS12 ENQKEYF---R-QGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQ
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 HQFVHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLGERPFCCTLCDKTYCDASGLSRHRRV
:: .:. . :.:::: : ..:: :.:.: ::.:. : : :.. ..: : :.:.
CCDS12 HQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE2 HLGYRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPVDGNQEC----------TL--RIPGT
: : .:..: :::.: .:.: ::::.: ...: . .:: :: :.
CCDS12 HTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYE-CKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 QAEFQTPIARSQRSIQGLLDVNHAPVARSQEPIFRTEGPMAQNQASVLKNQAPVTRTQAP
. .. :. . . : . : . ...: : : .: :... . . :
CCDS12 EKLYECKECRKVFTQLSQL-ILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKP
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE2 ITGTLCQDAR-SNSHPVKPSRLNV----FCCPHCSLTFSKKSYLSRHQKAHLTEPPNYCF
: : .: .. .:... . : .:. .: . : :..::. : .: : :
CCDS12 YECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECK
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 HCSKSFSSFSRLVRHQQTHWKQKSYLCPICDLSFGEKEGLMDHWRGYKGKDLCQSSHHKC
.:.: :: :.:..::. : .: : : : .:.. : : : . :.
CCDS12 ECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGK
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 RVILGQWLGFSHDVPTMAGEEWKHGGDQSPPRIHTPRRRGLREKACKGDKTKEAVSILKH
CCDS12 TFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQ
460 470 480 490 500 510
>>CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280 aa)
initn: 2352 init1: 354 opt: 543 Z-score: 343.4 bits: 74.5 E(32554): 8.3e-13
Smith-Waterman score: 543; 28.5% identity (56.3% similar) in 316 aa overlap (147-456:332-640)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SDDKVFLACRGAGQCPLSAPAGTMDRTRVLQASQAGP-PFFCYTCGKCFSRRSYLYSHQF
.: .:: :. : ::: ::. : : .:.
CCDS54 THKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKV
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VHNPKLTNSCSQCGKLFRSPKSLSYHRRMHLGERPFCCTLCDKTYCDASGLSRHRRVHLG
.:. . .: .::: .. :..::::...: ::.:. : : : . : :..:. .: :
CCDS54 IHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTG
370 380 390 400 410 420
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 YRPHSCSVCGKSFRDQSELKRHQKIHQNQEPVDGNQECTLRIPGTQAEFQTPIARSQRSI
.:..: :::.: .:.: .:.::: .. : .:: . . . . .. ..
CCDS54 EKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYK-CEECGKGFSMFSILTKHKVIHNGEKP
430 440 450 460 470 480
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CCDS43 IIHIGEKPHACLLCGKAFSLSSDLR
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CCDS31 KPYECKHCGKAFRYSNCLHYHERTHTGEKPYVCMECGKAFSCLSSLQGHIKAHAGEEPYP
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CCDS12 SSQDQKIYSGEKSY-ECAEFGKSFTWKSQFKVHLKVPTGEKLYVCIECGRAFVQKPEFIT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]