Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3824
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3824, 2554 aa
1>>>pF1KE3824 2554 - 2554 aa - 2554 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4119+/-0.000432; mu= 22.6052+/- 0.027
mean_var=124.0968+/-25.522, 0's: 0 Z-trim(114.8): 193 B-trim: 826 in 1/52
Lambda= 0.115131
statistics sampled from 24660 (24870) to 24660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 20.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001034680 (OMIM: 300072,300919,300968) probable (2554) 17316 2889.3 0
XP_005272733 (OMIM: 300072,300919,300968) PREDICTE (2559) 17296 2886.0 0
NP_001034679 (OMIM: 300072,300919,300968) probable (2570) 16777 2799.8 0
XP_005272732 (OMIM: 300072,300919,300968) PREDICTE (2575) 16757 2796.5 0
NP_004645 (OMIM: 400005,415000) probable ubiquitin (2555) 16001 2670.9 0
XP_016885567 (OMIM: 400005,415000) PREDICTED: prob (2560) 15981 2667.6 0
XP_005270747 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2025) 1164 206.4 3.3e-51
XP_016856323 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2445) 1164 206.5 3.8e-51
XP_016856322 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2465) 1164 206.5 3.8e-51
NP_056121 (OMIM: 610569) ubiquitin carboxyl-termin (2620) 1164 206.5 4e-51
XP_016856321 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2639) 1164 206.5 4e-51
XP_016856320 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2640) 1164 206.5 4e-51
NP_055524 (OMIM: 615295) ubiquitin carboxyl-termin (3546) 595 112.1 1.4e-22
XP_016856326 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (1345) 446 87.0 1.9e-15
XP_016856325 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (1649) 446 87.1 2.2e-15
XP_016856324 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (1658) 446 87.1 2.2e-15
XP_016873442 (OMIM: 614460) PREDICTED: ubiquitin c (1275) 296 62.0 5.9e-08
NP_060414 (OMIM: 614460) ubiquitin carboxyl-termin (1287) 296 62.0 5.9e-08
NP_001269588 (OMIM: 614460) ubiquitin carboxyl-ter (1355) 296 62.1 6.1e-08
NP_001317137 (OMIM: 614460) ubiquitin carboxyl-ter (1375) 296 62.1 6.2e-08
XP_011509703 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c ( 807) 290 60.9 8.3e-08
XP_011509700 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c (1165) 290 61.0 1.1e-07
XP_016859915 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c (1236) 290 61.0 1.1e-07
XP_011509699 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c (1240) 290 61.0 1.1e-07
NP_060688 (OMIM: 610570) ubiquitin carboxyl-termin (1247) 290 61.0 1.1e-07
XP_006712675 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c (1248) 290 61.0 1.1e-07
XP_011509698 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c (1252) 290 61.0 1.2e-07
XP_011509702 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c (1112) 281 59.5 3e-07
XP_016878210 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c ( 928) 269 57.4 1e-06
XP_016878211 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c ( 928) 269 57.4 1e-06
NP_001269978 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-ter (1012) 269 57.5 1.1e-06
XP_016878208 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 269 57.5 1.2e-06
XP_016878209 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 269 57.5 1.2e-06
XP_016878207 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 269 57.5 1.2e-06
XP_006720825 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 269 57.5 1.2e-06
XP_006720824 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1118) 269 57.5 1.2e-06
NP_005145 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-termin (1118) 269 57.5 1.2e-06
NP_001122082 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-ter (1118) 269 57.5 1.2e-06
XP_011520495 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1118) 269 57.5 1.2e-06
NP_001273387 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-ter (1003) 258 55.6 3.9e-06
NP_001308787 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-ter (1044) 258 55.7 4e-06
XP_016879142 (OMIM: 602519) PREDICTED: ubiquitin c (1097) 258 55.7 4.2e-06
NP_003461 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-termin (1102) 258 55.7 4.2e-06
XP_016879141 (OMIM: 602519) PREDICTED: ubiquitin c (1113) 258 55.7 4.2e-06
XP_011523373 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 739) 253 54.7 5.5e-06
NP_001273386 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-ter (1086) 255 55.2 5.8e-06
XP_011523371 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 925) 253 54.8 6.5e-06
XP_011523370 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 959) 253 54.8 6.7e-06
XP_016880390 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1044) 253 54.8 7.1e-06
XP_005257600 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1123) 253 54.9 7.5e-06
>>NP_001034680 (OMIM: 300072,300919,300968) probable ubi (2554 aa)
initn: 17316 init1: 17316 opt: 17316 Z-score: 15538.3 bits: 2889.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 17316; 100.0% identity (100.0% similar) in 2554 aa overlap (1-2554:1-2554)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 FINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 IKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSC
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NP_001 KKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLNF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDFF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQ
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NP_001 ESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSV
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NP_001 SNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
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910 920 930 940 950 960
pF1KE3 DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKSL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 ITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISF
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NP_001 ITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 LWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLF
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NP_001 LWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 FGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNAD
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NP_001 FGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNAD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 METRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
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NP_001 METRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFSP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 NEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 LHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLR
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NP_001 LHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 HLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAF
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NP_001 HLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAF
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 QTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
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NP_001 QTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 NAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 PQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 REQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 NVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
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NP_001 NVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGS
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NP_001 DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 TKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQC
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NP_001 TKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQC
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 FGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 IIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEI
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NP_001 IIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEI
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE3 TMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 RVVIQSNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 DKDSVNCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 GRQVDDLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 KDKSLITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDKSLITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHP
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pF1KE3 RYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 LPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 VVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQ
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pF1KE3 LVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 IIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDY
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pF1KE3 FTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 ELLAFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELLAFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSP
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pF1KE3 PTINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PTINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKG
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pF1KE3 FVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRD
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pF1KE3 DVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWG
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pF1KE3 EPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEE
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pF1KE3 SFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAI
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pF1KE3 QLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 ETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEE
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pF1KE3 MKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLP
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pF1KE3 EAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YLDLLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SNCPVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGY
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pF1KE3 FLERSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLERSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHG
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pF1KE3 QPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
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XP_005 QPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
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>>NP_001034679 (OMIM: 300072,300919,300968) probable ubi (2570 aa)
initn: 16746 init1: 16746 opt: 16777 Z-score: 15054.4 bits: 2799.8 E(85289): 0
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pF1KE3 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQL
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pF1KE3 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFF
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pF1KE3 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNP
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pF1KE3 HCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 RYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 LDSLFFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDSLFFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 LPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQA
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XP_005 LPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 VVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQ
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XP_005 VVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 LVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE3 IIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDY
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XP_005 IIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 FTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE3 ELLAFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELLAFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE3 PTINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PTINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKG
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE3 FVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE3 DVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWG
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 EPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 SFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAI
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XP_005 SFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAI
1750 1760 1770 1780 1790 1800
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pF1KE3 QLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSES
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XP_005 QLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQSES
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE3 ETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEE
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XP_005 ETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE3 MKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAIT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KE3 TRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLP
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XP_005 TRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLP
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2040 2050 2060 2070 2080 2090
pF1KE3 EAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFN
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XP_005 EAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFN
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2100 2110 2120 2130 2140 2150
pF1KE3 VSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDH
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2160 2170 2180 2190 2200 2210
pF1KE3 LLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPG
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2220 2230 2240 2250 2260 2270
pF1KE3 PPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2280 2290 2300 2310 2320 2330
pF1KE3 ADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRP
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2340 2350 2360 2370 2380 2390
pF1KE3 YLDLLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YLDLLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALF
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2400 2410 2420 2430 2440 2450
pF1KE3 SNCPVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SNCPVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGY
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2460 2470 2480 2490
pF1KE3 FLERSHSARMTLAKACELCPEE----------------EPDDQDAPDEHESPPPEDAPLY
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
XP_005 FLERSHSARMTLAKACELCPEEVKKATSVQQIEMEESKEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLY
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2500 2510 2520 2530 2540 2550
pF1KE3 PHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ
2530 2540 2550 2560 2570
>>NP_004645 (OMIM: 400005,415000) probable ubiquitin car (2555 aa)
initn: 10829 init1: 10829 opt: 16001 Z-score: 14357.9 bits: 2670.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 16001; 91.6% identity (97.3% similar) in 2556 aa overlap (1-2554:1-2555)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPP-DEQGQGDAPPQ
::: :.::::::::.:::. ::::: .::::::::::::::: :::: .::::::::::
NP_004 MTAITHGSPVGGNDSQGQVLDGQSQHLFQQNQTSSPDSSNENSVATPPPEEQGQGDAPPQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRF
::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_004 HEDEEPAFPHTELANLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSVKGLDVKSEACQRF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 FRDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FRDGLTISFTKILMDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PHCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHD
::::::::::::::: .::..::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::
NP_004 PHCKFHIYNGTRPCELISSNAQLPEDELFARSSDPRSPKGWLVDLINKFGTLNGFQILHD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RFINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAK
::.::::::.:::::::::::::::::. ::.::::.:.::.::..::::::::::::::
NP_004 RFFNGSALNIQIIAALIKPFGQCYEFLSQHTLKKYFIPVIEIVPHLLENLTDEELKKEAK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 NEAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVN
:::::::::::::::::::::. ::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_004 NEAKNDALSMIIKSLKNLASRISGQDETIKNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEIN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 KVISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLRDSLHQPQYVEKLEKILRF
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_004 KVISSVSYYTHRHSNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVLQDSLHQPQYVEKLEKILRF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
NP_004 VIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPGQLDHLFDCFKASWTNA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 SKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
NP_004 SKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAQSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 CSQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYR
::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:::
NP_004 CSQDRDAQKIQWIDHFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEASQNLSQTQRSPHIFYR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 HDLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLN
::::::::.::::::::::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HDLINQLQQNHALVTLVAENLATYMNSIRLYAGDHEDYDPQTVRLGSRYSHVQEVQERLN
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 FLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKDF
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 FESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVI
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.:::::::::::::::::::
NP_004 FESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCRERKLIAKRRSYMMDDLELIGLDYLWRVVI
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 QSNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDS
::.:.::.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::.::::.:
NP_004 QSSDEIANRAIDLLKEIYTNLGPRLKANQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVFDGDKNS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 VNCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQV
.:::::::.::::::::..:::::::::::.:: ::::::::::::::..::::::::::
NP_004 INCARQEAIRMVRVLTVIKEYINECDSDYHKERMILPMSRAFRGKHLSLIVRFPNQGRQV
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 DDLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLIGQLNLKDKS
:.:..:::::::::::::::.::::::::: :::::::::::: :::::::::::::::
NP_004 DELDIWSHTNDTIGSVRRCIVNRIKANVAHKKIELFVGGELIDSEDDRKLIGQLNLKDKS
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 LITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYIS
:::::::::. ::::::::::::::.::::: :::.:::: ::::::::::::.::::::
NP_004 LITAKLTQINFNMPSSPDSSSDSSTASPGNHRNHYNDGPNLEVESCLPGVIMSVHPRYIS
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 FLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSL
::::::::::.:::::::::::::::::::: :..:::::.:::::::::..::: ::::
NP_004 FLWQVADLGSNLNMPPLRDGARVLMKLMPPDRTAVEKLRAVCLDHAKLGEGKLSPPLDSL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 FFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNA
::::::::::::::::::::::::.::.: ::::: ::::::::::::::: :::::::.
NP_004 FFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGVPLTDGSSDFQVHFLKSGGLPLVLSMLIRNNFLPNT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 DMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:.:::::::::::::::
NP_004 DMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPVVDGTDPITQINQVTHDQAVVLQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 SALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSLQLVFS
:::::::::::::.::: :. :::.::.::::::::::::::::::::::.::.: ::::
NP_004 SALQSIPNPSSECVLRNESILLAQEISNEASRYMPDICVIRAIQKIIWASACGALGLVFS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 PNEEITKIYE-KTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIID
:::::::::. ::..:. ..:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_004 PNEEITKIYQMTTNGSNKLEVEDEQVCCEALEVMTLCFALLPTALDALSKEKAWQTFIID
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE3 LLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTL
::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..:.:::::::
NP_004 LLLHCPSKTVRQLAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTILGSTAREKGKYSGDYFTL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 LRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELL
::::::::::.:::.::::::: .::::::::::.:: :::::.:: :::::::::::::
NP_004 LRHLLNYAYNGNINIPNAEVLLVSEIDWLKRIRDNVKNTGETGVEEPILEGHLGVTKELL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE3 AFQTSEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTI
::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::.:: ::
NP_004 AFQTSEKKYHFGCEKGGANLIKELIDDFIFPASKVYLQYLRSGELPAEQAIPVCSSPVTI
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE3 NAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVG
:::::::::::.::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NAGFELLVALAIGCVRNLKQIVDCLTEMYYMGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVG
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE3 LKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVF
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::. ::: ::::::.:::::::::::
NP_004 LKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNSILAIEGTGSDLHDDMFGDEKQDSESNVDPRDDVF
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE3 GYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPV
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_004 GYPHQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASQLQYYVPRGFWKQFRLWGEPV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 NLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFT
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAILSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFT
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
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NP_004 TLNVDIRNHQNLLDSLEQYIKGDLLEGANAYHCEKCDKKVDTVKRLLIKKLPRVLAIQLK
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:::::::::::::::::::::::::: ::::::::.:: :::: :..::.:.:::..:::
NP_004 RFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMGPYTVAGVANLERDNVNSENELIEQKEQSDNETA
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:.::::::::::::::::::::::::::::: : . ..::::::::::::::::::::::
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NP_004 QCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYEQMDMIDEDDEMIRYISELTIA-RP
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1980 1990 2000 2010 2020 2030
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NP_004 TGPAAHHLNNPQKTGQRTQENYEGNEEVSSPQMKDQ
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:::::::::::::::::::::. ::.::.:::::::::::::::::::::::::::::.:
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XP_016 VIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPGQLDHLFDCFKASWTNA
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::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::: :::: ::::::
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:.:::::::::::.::::::::::::::::.:.:::: ::::::::::::::::::::::
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XP_016 QERLNFLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPD
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:::.:.:::::::.::::::::..:::::::::::.:: ::::::::::::::..:::::
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::::::.:..:::::::::::::::.::::::::: :::::::::::: ::::::::::
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::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:.::::::::::
XP_016 FLPNTDMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPVVDGTDPITQINQVTHDQ
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pF1KE3 AVVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGSL
::::::::::::::::::.::: :. :::.::.::::::::::::::::::::::.::.:
XP_016 AVVLQSALQSIPNPSSECVLRNESILLAQEISNEASRYMPDICVIRAIQKIIWASACGAL
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pF1KE3 QLVFSPNEEITKIYE-KTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQ
:::::::::::::. ::..:. ..:::::::::::::::::::.::::::::::::::
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pF1KE3 TFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSG
:::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..:.::
XP_016 TFIIDLLLHCPSKTVRQLAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTILGSTAREKGKYSG
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:::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::.
XP_016 TKELLAFQTSEKKYHFGCEKGGANLIKELIDDFIFPASKVYLQYLRSGELPAEQAIPVCS
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XP_016 SPVTINAGFELLVALAIGCVRNLKQIVDCLTEMYYMGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPP
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XP_016 KGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNSILAIEGTGSDLHDDMFGDEKQDSESNVDP
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XP_016 RDDVFGYPHQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASQLQYYVPRGFWKQFRL
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pF1KE3 WGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYEC
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XP_016 WGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAILSKVLGGSFADQKICQGCPHRYEC
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pF1KE3 EESFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVL
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XP_016 EESFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYIKGDLLEGANAYHCEKCDKKVDTVKRLLIKKLPRVL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
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pF1KE3 AIQLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQSEQS
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XP_016 AIQLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMGPYTVAGVANLERDNVNSENELIEQKEQS
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pF1KE3 ESETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDD
..::::.::::::::::::::::::::::::::::: : . ..:::::::::::::::::
XP_016 DNETAGGTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGKDDQTDHWYKFDDGDVTECKMDDD
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KE3 EEMKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::.:::.:::::::.
XP_016 EEMKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYEQMDMIDEDDEMIRYISELT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KE3 ITTRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHL
:. ::::::: :::::::::::.:::::.:::.:::::.::::::::::::: ::::.:
XP_016 IA-RPHQIIMSPAIERSVRKQNVKFMHNRLQYSLEYFQFVKKLLTCNGVYLNPAPGQDYL
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pF1KE3 LPEAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVL
::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::.::::::::::::.::::
XP_016 LPEAEEITMISIQLAARFLFTTGFHTKKIVRGPASDWYDALCVLLRHSKNVRFWFTHNVL
2040 2050 2060 2070 2080 2090
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pF1KE3 FNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLS
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XP_016 FNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGSCPSPFASPGPSSQACDNLSLS
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XP_016 PGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSTMQSSINGNPPLPNPFGDLNLSQPIMPIQQ
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XP_016 NVLDILFVRTSYVKKIIEDCSNSEDTIKLLRFCSWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYEL
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XP_016 SDLDDVDP
2460
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