FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4414, 427 aa 1>>>pF1KE4414 427 - 427 aa - 427 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0397+/-0.000877; mu= 14.3731+/- 0.052 mean_var=88.7961+/-17.809, 0's: 0 Z-trim(108.2): 55 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.136106 statistics sampled from 9992 (10044) to 9992 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16 Scan time: 3.160 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19 ( 427) 2835 566.7 1.5e-161 CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 731) 1154 236.7 5.5e-62 CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 579) 1131 232.2 1e-60 CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 ( 543) 1120 230.0 4.4e-60 CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 426) 1080 222.1 8.4e-58 CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 746) 654 138.6 2e-32 CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 231) 615 130.6 1.6e-30 >>CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19 (427 aa) initn: 2835 init1: 2835 opt: 2835 Z-score: 3013.6 bits: 566.7 E(32554): 1.5e-161 Smith-Waterman score: 2835; 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44.8% identity (73.0% similar) in 426 aa overlap (12-422:93-515) 10 20 30 40 pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV : .:. :.:..: :. .::... :: .:: CCDS67 PQDQDDDEDDEEDEAGRQRASGKPSNVGHRLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT ..:. : . .:: : .:: ::.:: .:: :.: .::.:.::::.::: :::.:.: CCDS67 TETELSWGVYTKESLYSFALKCLISLSTAILLGLVVLYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY ... : :::.::..::.: . : .:. . . ..:::. :.:::: CCDS67 CERVFLISLELAVCAIHPVPGHYRFTWTARLAFTYAPSVAEADV---DVLLSIPMFLRLY 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW :. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. :: .:: .... :. .:: CCDS67 LLGRVMLLHSKIFTDASSRSIGALNKITFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISSWIIAAW 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 pF1KE4 VLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTA .. : :: . ..:... ..::: ::::.:::::.:: :. :: ::: ::.::. ::: CCDS67 TVRVCERYHDKQEVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTA 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 LLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR--RKESHA- :.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:.:..::::: .: ..: CCDS67 LVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKHTRLVKKPDQAR 360 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 ARRHQRKLLAAINA---FRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALE .:.::::.: ::. .:.:.... :: .:.:...:..: . ..::: ..: ..:. :: CCDS67 VRKHQRKFLQAIHQAQKLRSVKIEQGKLNDQANTLTDLAKTQTVMYDLVSELHAQHEELE 420 430 440 450 460 470 400 410 420 pF1KE4 KQIDTLAGKLDALTE-------LLSTALGPRQLPEPNQQSK .. :: ..:::: :.. :. : : : CCDS67 ARLATLESRLDALGASLQALPGLIAQAIRPPPPPLPPRPGPGPQDQAARSSPCRWTPVAP 480 490 500 510 520 530 CCDS67 SDCG 540 >>CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (426 aa) initn: 1095 init1: 425 opt: 1080 Z-score: 1151.2 bits: 222.1 E(32554): 8.4e-58 Smith-Waterman score: 1080; 48.3% identity (76.5% similar) in 358 aa overlap (55-407:8-362) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 LAGWALVLAGTGIGLMVLHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEV ... . .:: ::.::..:: ::.:.:..:: CCDS10 MERPIKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREV 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 QLFMTDNGLRDWRVALTGRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGF :::. ::: :::.:.: .. : ::..::..:: : . : .:. . CCDS10 QLFVIDNGADDWRIAMTYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEA- 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 LGQGEALLSLAMLLRLYLVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHP . . .::. :.:::::. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. : CCDS10 --DVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICP 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 GRLLLGLTLGLWLTTAWVLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMW : .:: ....::. .::.. : :: . ..:... ..::: ::::.:::::.:: :. CCDS10 GTVLLVFSISLWIIAAWTVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYC 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GKIVCLCTGVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEA :: ::: ::.::. ::::.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:. CCDS10 GKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRET 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 pF1KE4 WMFYKHTR--RKESHA-ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILY :..::::. .: .:: .:.::::.: ::. .:.:....::: .:.:..::.:::. ..: CCDS10 WLIYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMY 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 pF1KE4 DLQQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPNQQSK :: .:.. . ::::: .: .::. :: CCDS10 DLITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVS 340 350 360 370 380 390 >>CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (746 aa) initn: 1164 init1: 425 opt: 654 Z-score: 695.6 bits: 138.6 E(32554): 2e-32 Smith-Waterman score: 1117; 45.0% identity (72.4% similar) in 416 aa overlap (12-407:270-682) 10 20 30 40 pF1KE4 MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV : .:. :.:..: :. .::... :: .:: CCDS72 THNHQHAGTTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV 240 250 260 270 280 290 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT ...:. : . ... . .:: ::.::..:: ::.:.:..:::::. ::: :::.:.: CCDS72 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT 300 310 320 330 340 350 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY .. : ::..::..:: : . : .:. . . . .::. :.:::: CCDS72 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEA---DVDIILSIPMFLRLY 360 370 380 390 400 410 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW :. :..::.: .. .:: :::::::.. : :: : :. :: .:: ....::. .:: CCDS72 LIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAW 420 430 440 450 460 470 230 240 250 260 pF1KE4 VLSVAERQAVNA-----------------TGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGK .. : : : :... ..::: ::::.:::::.:: :. :: CCDS72 TVRVCESPESPAQPSGSSLPAWYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGK 480 490 500 510 520 530 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 IVCLCTGVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWM ::: ::.::. ::::.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:.:. CCDS72 GVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWL 540 550 560 570 580 590 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 FYKHTR--RKESHA-ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDL .::::. .: .:: .:.::::.: ::. .:.:....::: .:.:..::.:::. ..::: CCDS72 IYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDL 600 610 620 630 640 650 390 400 410 420 pF1KE4 QQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPNQQSK .:.. . ::::: .: .::. :: CCDS72 ITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVA 660 670 680 690 700 710 >>CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (231 aa) initn: 666 init1: 417 opt: 615 Z-score: 661.7 bits: 130.6 E(32554): 1.6e-30 Smith-Waterman score: 615; 56.2% identity (85.2% similar) in 169 aa overlap (241-406:1-169) 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LTLGLWLTTAWVLSVAERQAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCT .::: ::::.:::::.::.:. :: ::: : CCDS43 MWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT 10 20 30 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 GVMGVCCTALLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR :.::. ::::.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:.:..::.:. 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