FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4412, 425 aa 1>>>pF1KE4412 425 - 425 aa - 425 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6676+/-0.00109; mu= 14.7995+/- 0.066 mean_var=61.3324+/-12.135, 0's: 0 Z-trim(101.7): 41 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.163768 statistics sampled from 6593 (6626) to 6593 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16 Scan time: 2.400 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 425) 2744 657.3 7.9e-189 CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 423) 2709 649.0 2.4e-186 CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 423) 2273 546.0 2.5e-155 CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 435) 1321 321.1 1.3e-87 CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 433) 1116 272.7 5e-73 CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 435) 769 190.7 2.4e-48 CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 460) 769 190.7 2.5e-48 CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 ( 418) 525 133.0 5.2e-31 CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 ( 418) 490 124.8 1.6e-28 CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 ( 453) 273 73.5 4.7e-13 >>CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 (425 aa) initn: 2744 init1: 2744 opt: 2744 Z-score: 3503.5 bits: 657.3 E(32554): 7.9e-189 Smith-Waterman score: 2744; 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CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF :.::..:.:.:..:.::..:. :::: .:. :: .. ::.:..:::..::::::..:: CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETG--KSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIES :.::.... :. .::::. : .: .:.. ::. ..:: :::::..::.:.::.:: CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLES 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTG------LSGSKNKS ::::.. .:.:: ... : . .: .:::::: ..:.::....: : : : ..: CCDS43 VNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSR . ..: ::::::::.::..:.::::::::.:::: :: . .. . . .... .... CCDS43 IAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 VEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPG .:. : :..:: . .:. .:. .:.: .... . :.::: .:...:.:: . : CCDS43 LEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 GKEYLMRAHFGL-PRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEK----SGYQA :: . :.. : : .:.. .::::...::.: :. ::..:::.:..: : ... CCDS43 MKESQISAEIELLPTNDKKKW-ARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDV 360 370 380 390 400 410 410 420 pF1KE4 LPWVRYITQSGDYQLRTS . ::::: .:: :. : CCDS43 IKWVRYIGRSGIYETRC 420 430 >>CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (435 aa) initn: 1087 init1: 380 opt: 769 Z-score: 981.5 bits: 190.7 E(32554): 2.4e-48 Smith-Waterman score: 1106; 38.8% identity (73.9% similar) in 433 aa overlap (6-423:5-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI .:: . ::. :::: :. :.. . .. : ... ... . .:. . ... :. . CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF :.::..:.:.:..:.::..:. :::: .:. :: .. ::.:..:::..::::::..:: CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNK----LETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVI :.::.... :. .::::. : . .:.. ::. ..:: :::::..::.:.::. CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTG------LSGSKN ::::::.. .:.:: ... : . .: .:::::: ..:.::....: : : : . CCDS43 ESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 KSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSH .:. ..: ::::::::.::..:.::::::::.:::: :: . .. . . .... .. CCDS43 QSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSF ...:. : :..:: . .:. .:. .:.: .... . :.::: .:...:.:: . CCDS43 TKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRM 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 PGGKEYLMRAHFGL-PRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEK----SGY : :: . :.. : : .:.. .::::...::.: :. ::..:::.:..: : . CCDS43 AGMKESQISAEIELLPTNDKKKW-ARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDH 360 370 380 390 400 410 410 420 pF1KE4 QALPWVRYITQSGDYQLRTS ... ::::: .:: :. : CCDS43 DVIKWVRYIGRSGIYETRC 420 430 >>CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (460 aa) initn: 1077 init1: 380 opt: 769 Z-score: 981.1 bits: 190.7 E(32554): 2.5e-48 Smith-Waterman score: 1048; 40.1% identity (74.7% similar) in 392 aa overlap (47-423:70-459) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 ISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWIKHSNLYLVATTSKNAN .:. . ... :. .:.::..:.:.:..:.: CCDS82 PFPGEWLEANRRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVN 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 ASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDFGFPQTTDSKILQEYIT :..:. :::: .:. :: .. ::.:..:::..::::::..:::.::.... :. .:: CCDS82 AAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFIT 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 QQSNK----LETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVNLLVNANGSVLLS ::. : . .:.. ::. ..:: :::::..::.:.::.::::::.. .:.:: . CCDS82 QQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQVLSA 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 pF1KE4 EIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTG------LSGSKNKSVELEDVKFHQCVRL .. : . .: .:::::: ..:.::....: : : : ..:. ..: ::::::: CCDS82 HVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRL 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 SRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQ :.::..:.::::::::.:::: :: . .. . . .... .....:. : :..:: . CCDS82 SKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPS 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRAHFGL-P .:. .:. .:.: .... . :.::: .:...:.:: . : :: . :.. : : CCDS82 LLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLP 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 RVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEK----SGYQALPWVRYITQSGDYQ .:.. .::::...::.: :. ::..:::.:..: : .... ::::: .:: :. CCDS82 TNDKKKW-ARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYE 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LRTS : CCDS82 TRC 460 >>CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 (418 aa) initn: 522 init1: 190 opt: 525 Z-score: 670.2 bits: 133.0 E(32554): 5.2e-31 Smith-Waterman score: 697; 29.5% identity (64.2% similar) in 441 aa overlap (5-424:4-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI ..:... .: .. ...:. :..: ..:. . . . :..: . ... : CCDS73 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF ...:..:.. . .. .: ::... ..: .:: : : .:.:: :::::::.:..: CCDS73 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE ::: .:.:.::.: : . :.. ::.: : : . . :: :.:: .:: CCDS73 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSI-TGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGLSGSK ...::.: .. ... .::....:: :.: . :::::.: :. .: :.: CCDS73 AYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLL---------- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 NKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI-- .::.:: :.:..:....:..:::::::.:.:.:::.:.: : .... : CCDS73 ------DDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 -EKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVI :. : .: .: . : .. : . .:. ..: .:. . . . . :: . : .:. CCDS73 KENSSCGRFDITIGPKQNMGK--TIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLT 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 WSI-----KSFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKI :.. ...:. : :. . : :. :.. : ....:.: ...::..: . . CCDS73 WDVGKITPQKLPSLKG-LVNLQSGAPKPEEN-----PSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDM 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 IEKSGYQALPWVRYITQSGDYQLRTS .. :. . :.:.:..: .:.:: CCDS73 YGEK-YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 400 410 >>CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 (418 aa) initn: 506 init1: 182 opt: 490 Z-score: 625.5 bits: 124.8 E(32554): 1.6e-28 Smith-Waterman score: 655; 28.7% identity (62.6% similar) in 436 aa overlap (5-424:4-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI ..:... .: .. ...:. :. : ..:. . : . :.. . ..: . CCDS61 MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF . ....::. . .. .: ::......: .:: : :.:: :.:::.:.:..: CCDS61 YRHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE ::: .:.:.::.: : . : . ::.. : : ..: :: :.:: .:: CCDS61 GFPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTI-TGSTNVGDQLPTGQLSVVPWRRTGVKYTNNE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGLSGSK ...:::: .. ... .::.. .:: :.: : :.:::.: :. .: :.: CCDS61 AYFDVIEEIDAIIDKSGSTITAEIQGVIDACVKLTGMPDLTLSFMNPRLL---------- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 NKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI-- .::.:: :::..:....: .:::::::.:.:.::..:.: : .... : CCDS61 ------DDVSFHPCVRFKRWESERILSFIPPDGNFRLLSYHVSAQNLVAIPVYVKHNISF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 -EKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVI .. : .: :: : : . : . .:: .. .:. . . . : :. . : ... CCDS61 RDSSSLGRFEITVGPKQTMGK--TIEGVTVTSQMPKGVLNMSLTPSQGTHTFDPVTKMLS 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 WSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSG :.. .. : ... ..: .. :. : :...:.: ...::..: . . .. CCDS61 WDVGKINPQKLPSLKGTMSLQAGASKPDEN-PTINLQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK- 350 360 370 380 390 410 420 pF1KE4 YQALPWVRYITQSGDYQLRTS :. . ..:.:..: .:.:: CCDS61 YKPFKGIKYMTKAGKFQVRT 400 410 >>CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 (453 aa) initn: 600 init1: 260 opt: 273 Z-score: 347.8 bits: 73.5 E(32554): 4.7e-13 Smith-Waterman score: 637; 29.5% identity (60.8% similar) in 454 aa overlap (4-423:3-452) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKI-EHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLW : :::. :: ::: ....:: . . : :. :. . . . . ::. ::. CCDS56 MISQFFILSSKGDPLIYKDFRGDSGGRDVAELFYRKLTGLPGDESPVVMHHHGR-HFIH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 IKHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMD :.::.::::.:::.:.. . .: . .. .: : : .: : ..:::::::..: CCDS56 IRHSGLYLVVTTSENVSPFSLLELLSRLATLLGDYCGSLGEGTISRNVALVYELLDEVLD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FGFPQTTDSKILQEYITQQS--NK--------------LETGKSRVPPTVTNA---VSWR .:. :::....:...: .. .: :: .:.: :. . . .: : CCDS56 YGYVQTTSTEMLRNFIQTEAVVSKPFSLFDLSSVGLFGAETQQSKVAPSSAASRPVLSSR 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 SEGIKYKKNEVFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLF :. . .:::::.::.: ...:. .:::.: .. : :.:: :: . :.:.::... CCDS56 SD--QSQKNEVFLDVVERLSVLIASNGSLLKVDVQGEIRLKSFLPSGSEMRIGLTEEFCV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE4 ELTGLSGSKNKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVK---P . : : . ......:.::. : :..:.. : . . ::.:.. .: :.:: .. : CCDS56 GKSELRGY-GPGIRVDEVSFHSSVNLDEFESHRILRLQPPQGELTVMRYQLSDDLPSPLP 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 LIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYV . . :: . .:.....: . .. ..: : .:.. .:.: . : . : : CCDS56 FRLFPSVQWDRGSGRLQVYLKLRCDLLSKSQALNVRLHLPLPRGVVSLSQELSSPEQKAE 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 pF1KE4 PERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEG-----RP----PIGVKFEIPYFT .... :.. ::.. .. .: .: : : ...::.: : CCDS56 LAEGALRWDLPRVQGGSQLSGLFQMDVPGPPGPPSHGLSTSASPLGLGPASLSFELPRHT 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 pF1KE4 VSGIQVRYMKIIEKSGYQALP--WVRYITQSGDYQLRTS ::.:::.... . .: : :::....: : .: CCDS56 CSGLQVRFLRLAFRPCGNANPHKWVRHLSHSDAYVIRI 420 430 440 450 425 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:16:48 2016 done: Sun Nov 6 01:16:49 2016 Total Scan time: 2.400 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]