Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4412, 425 aa
  1>>>pF1KE4412 425 - 425 aa - 425 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6676+/-0.00109; mu= 14.7995+/- 0.066
 mean_var=61.3324+/-12.135, 0's: 0 Z-trim(101.7): 41  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.163768
 statistics sampled from 6593 (6626) to 6593 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.204), width:  16
 Scan time:  2.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19        ( 425) 2744 657.3 7.9e-189
CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19        ( 423) 2709 649.0 2.4e-186
CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19         ( 423) 2273 546.0 2.5e-155
CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19         ( 435) 1321 321.1 1.3e-87
CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3          ( 433) 1116 272.7   5e-73
CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3          ( 435)  769 190.7 2.4e-48
CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3          ( 460)  769 190.7 2.5e-48
CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10         ( 418)  525 133.0 5.2e-31
CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8          ( 418)  490 124.8 1.6e-28
CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7           ( 453)  273 73.5 4.7e-13


>>CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19             (425 aa)
 initn: 2744 init1: 2744 opt: 2744  Z-score: 3503.5  bits: 657.3 E(32554): 7.9e-189
Smith-Waterman score: 2744; 99.8% identity (99.8% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 LLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGSKNKSVELEDVKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGSKNKSVELEDVKF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 HQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 GQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 HFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPWVRYITQSGDY
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPWVRYITQSGDY
              370       380       390       400       410       420

            
pF1KE4 QLRTS
       :::::
CCDS77 QLRTS
            

>>CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19             (423 aa)
 initn: 1430 init1: 1430 opt: 2709  Z-score: 3458.9  bits: 649.0 E(32554): 2.4e-186
Smith-Waterman score: 2709; 99.1% identity (99.1% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-423)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 LLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGSKNKSVELEDVKF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :  ::::::::::::
CCDS45 LLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGRS--KNKSVELEDVKF
              190       200       210       220         230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 HQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAK
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 GQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRA
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 HFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPWVRYITQSGDY
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPWVRYITQSGDY
      360       370       380       390       400       410        

            
pF1KE4 QLRTS
       :::::
CCDS45 QLRTS
      420   

>>CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19              (423 aa)
 initn: 1175 init1: 1175 opt: 2273  Z-score: 2902.1  bits: 546.0 E(32554): 2.5e-155
Smith-Waterman score: 2273; 79.0% identity (94.3% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
       ::::::..::.::: :: :::.::: ::..:::::.:...:::: :.:.:.:: :.:.::
CCDS12 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
       ::.:::::::..::: .:::.:::::...:: :::::::::::::::::.::::::::::
CCDS12 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
       :.:::::::::::::::...:::::  : : :::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS12 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 LLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGSKNKSVELEDVKF
       :::.:::.:: :::::.::..:::::::::::::::.:::. :: .  :.::::::::::
CCDS12 LLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRG--KSKSVELEDVKF
              190       200       210       220         230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 HQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAK
       :::::::::.::::::::::::.::::::::.:.::::::::::::: ::::.: :.:::
CCDS12 HQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAK
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 GQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRA
       .:::..:.::.::: .:::.:::::.:::.:::.:.::: . ..::::::::::::::::
CCDS12 SQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRA
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 HFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPWVRYITQSGDY
       ::::: :: :. ::.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::.:::
CCDS12 HFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDY
      360       370       380       390       400       410        

            
pF1KE4 QLRTS
       :::: 
CCDS12 QLRTQ
      420   

>>CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19              (435 aa)
 initn: 2064 init1: 1125 opt: 1321  Z-score: 1686.3  bits: 321.1 E(32554): 1.3e-87
Smith-Waterman score: 2239; 76.8% identity (91.7% similar) in 436 aa overlap (1-424:1-434)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
       ::::::..::.::: :: :::.::: ::..:::::.:...:::: :.:.:.:: :.:.::
CCDS46 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
       ::.:::::::..::: .:::.:::::...:: :::::::::::::::::.::::::::::
CCDS46 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
       :.:::::::::::::::...:::::  : : :::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS46 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
              130       140       150       160       170       180

                          190       200       210       220        
pF1KE4 LL------------VNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGS
       ::            :.:::.:: :::::.::..:::::::::::::::.:::. :: .  
CCDS46 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRG--
              190       200       210       220       230          

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE4 KNKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKF
       :.:::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:.::::::::::::: 
CCDS46 KSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKH
      240       250       260       270       280       290        

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE4 SHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIK
       ::::.: :.:::.:::..:.::.::: .:::.:::::.:::.:::.:.::: . ..::::
CCDS46 SHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIK
      300       310       320       330       340       350        

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE4 SFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQAL
       ::::::::::::::::: :: :. ::.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::
CCDS46 SFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQAL
      360       370       380       390       400       410        

      410       420     
pF1KE4 PWVRYITQSGDYQLRTS
       ::::::::.::::::: 
CCDS46 PWVRYITQNGDYQLRTQ
      420       430     

>>CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3               (433 aa)
 initn: 1064 init1: 380 opt: 1116  Z-score: 1424.6  bits: 272.7 E(32554): 5e-73
Smith-Waterman score: 1116; 39.2% identity (74.5% similar) in 431 aa overlap (6-423:5-432)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
            .:: . ::. :::: :. :.. . .. :   ... ... . .:. . ... :. .
CCDS43  MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV
                10        20        30        40         50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
       :.::..:.:.:..:.::..:. ::::  .:.  :: .. ::.:..:::..::::::..::
CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF
       60        70        80        90       100       110        

              130       140         150       160       170        
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETG--KSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIES
       :.::....  :. .::::. : .:   .:..   ::. ..:: :::::..::.:.::.::
CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLES
      120       130       140       150       160       170        

      180       190       200       210       220             230  
pF1KE4 VNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTG------LSGSKNKS
       ::::.. .:.:: ... : . .: .:::::: ..:.::....:  :       : : ..:
CCDS43 VNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQS
      180       190       200       210       220       230        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE4 VELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSR
       . ..:  ::::::::.::..:.::::::::.:::: :: . ..   . .  .... ....
CCDS43 IAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTK
      240       250       260       270       280       290        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE4 VEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPG
       .:. :  :..:: . .:. .:. .:.: .... .     :.:::   .:...:.:: . :
CCDS43 LEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAG
      300       310       320       330       340       350        

            360        370       380       390       400           
pF1KE4 GKEYLMRAHFGL-PRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEK----SGYQA
        ::  . :.. : :  .:..  .::::...::.: :. ::..:::.:..:     : ...
CCDS43 MKESQISAEIELLPTNDKKKW-ARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDV
      360       370        380       390        400       410      

       410       420     
pF1KE4 LPWVRYITQSGDYQLRTS
       . ::::: .:: :. :  
CCDS43 IKWVRYIGRSGIYETRC 
        420       430    

>>CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3               (435 aa)
 initn: 1087 init1: 380 opt: 769  Z-score: 981.5  bits: 190.7 E(32554): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 1106; 38.8% identity (73.9% similar) in 433 aa overlap (6-423:5-434)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
            .:: . ::. :::: :. :.. . .. :   ... ... . .:. . ... :. .
CCDS43  MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV
                10        20        30        40         50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
       :.::..:.:.:..:.::..:. ::::  .:.  :: .. ::.:..:::..::::::..::
CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF
       60        70        80        90       100       110        

              130       140           150       160       170      
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQSNK----LETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVI
       :.::....  :. .::::. :     .  .:..   ::. ..:: :::::..::.:.::.
CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVL
      120       130       140       150       160       170        

        180       190       200       210       220             230
pF1KE4 ESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTG------LSGSKN
       ::::::.. .:.:: ... : . .: .:::::: ..:.::....:  :       : : .
CCDS43 ESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGK
      180       190       200       210       220       230        

              240       250       260       270       280       290
pF1KE4 KSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSH
       .:. ..:  ::::::::.::..:.::::::::.:::: :: . ..   . .  .... ..
CCDS43 QSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGR
      240       250       260       270       280       290        

              300       310       320       330       340       350
pF1KE4 SRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSF
       ...:. :  :..:: . .:. .:. .:.: .... .     :.:::   .:...:.:: .
CCDS43 TKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRM
      300       310       320       330       340       350        

              360        370       380       390       400         
pF1KE4 PGGKEYLMRAHFGL-PRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEK----SGY
        : ::  . :.. : :  .:..  .::::...::.: :. ::..:::.:..:     : .
CCDS43 AGMKESQISAEIELLPTNDKKKW-ARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDH
      360       370       380        390        400       410      

         410       420     
pF1KE4 QALPWVRYITQSGDYQLRTS
       ... ::::: .:: :. :  
CCDS43 DVIKWVRYIGRSGIYETRC 
        420       430      

>>CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3               (460 aa)
 initn: 1077 init1: 380 opt: 769  Z-score: 981.1  bits: 190.7 E(32554): 2.5e-48
Smith-Waterman score: 1048; 40.1% identity (74.7% similar) in 392 aa overlap (47-423:70-459)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE4 ISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWIKHSNLYLVATTSKNAN
                                     .:. . ... :. .:.::..:.:.:..:.:
CCDS82 PFPGEWLEANRRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVN
      40        50        60        70        80        90         

         80        90       100       110       120       130      
pF1KE4 ASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDFGFPQTTDSKILQEYIT
       :..:. ::::  .:.  :: .. ::.:..:::..::::::..:::.::....  :. .::
CCDS82 AAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFIT
     100       110       120       130       140       150         

        140           150       160       170       180       190  
pF1KE4 QQSNK----LETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVNLLVNANGSVLLS
       ::. :     .  .:..   ::. ..:: :::::..::.:.::.::::::.. .:.:: .
CCDS82 QQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQVLSA
     160       170       180       190       200       210         

            200       210       220             230       240      
pF1KE4 EIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTG------LSGSKNKSVELEDVKFHQCVRL
       .. : . .: .:::::: ..:.::....:  :       : : ..:. ..:  :::::::
CCDS82 HVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRL
     220       230       240       250       260       270         

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE4 SRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQ
       :.::..:.::::::::.:::: :: . ..   . .  .... .....:. :  :..:: .
CCDS82 SKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPS
     280       290       300       310       320       330         

        310       320       330       340       350       360      
pF1KE4 SVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRAHFGL-P
        .:. .:. .:.: .... .     :.:::   .:...:.:: . : ::  . :.. : :
CCDS82 LLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLP
     340       350       360       370       380       390         

         370       380       390       400           410       420 
pF1KE4 RVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEK----SGYQALPWVRYITQSGDYQ
         .:..  .::::...::.: :. ::..:::.:..:     : .... ::::: .:: :.
CCDS82 TNDKKKW-ARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYE
     400        410        420       430       440       450       

           
pF1KE4 LRTS
        :  
CCDS82 TRC 
       460 

>>CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10              (418 aa)
 initn: 522 init1: 190 opt: 525  Z-score: 670.2  bits: 133.0 E(32554): 5.2e-31
Smith-Waterman score: 697; 29.5% identity (64.2% similar) in 441 aa overlap (5-424:4-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
           ..:... .:  .. ...:. :..:  ..:.    .  .   . :..:  . ... :
CCDS73  MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
        ...:..:.. . ..   .:  ::... ..: .:: :  : .:.:: :::::::.:..: 
CCDS73 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN
      60        70        80        90       100       110         

              130             140           150       160       170
pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE
       ::: .:.:.::.: :   .      :.. ::.: :    :    . . ::  :.:: .::
CCDS73 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSI-TGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNE
     120       130       140        150       160       170        

              180       190       200       210        220         
pF1KE4 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGLSGSK
       ...::.: .. ... .::....:: :.:   . :::::.: :. .: :.:          
CCDS73 AYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLL----------
      180       190       200       210       220                  

     230       240       250       260       270         280       
pF1KE4 NKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI--
             .::.:: :.:..:....:..:::::::.:.:.:::.:.:  :   ....  :  
CCDS73 ------DDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISF
            230       240       250       260       270       280  

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE4 -EKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVI
        :. : .: .: .  : .. :  . .:. ..: .:. . .  .  . ::  . :  .:. 
CCDS73 KENSSCGRFDITIGPKQNMGK--TIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLT
            290       300         310       320       330       340

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pF1KE4 WSI-----KSFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKI
       :..     ...:. :  :.  . : :. :..     : ....:.:  ...::..:  . .
CCDS73 WDVGKITPQKLPSLKG-LVNLQSGAPKPEEN-----PSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDM
              350        360       370            380       390    

     400       410       420     
pF1KE4 IEKSGYQALPWVRYITQSGDYQLRTS
         .. :. .  :.:.:..: .:.:: 
CCDS73 YGEK-YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 
           400       410         

>>CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8               (418 aa)
 initn: 506 init1: 182 opt: 490  Z-score: 625.5  bits: 124.8 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 655; 28.7% identity (62.6% similar) in 436 aa overlap (5-424:4-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
           ..:... .:  .. ...:. :. :  ..:.    .  :   . :..   . ..: .
CCDS61  MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSV
                10        20        30        40        50         

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pF1KE4 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
        . ....::. . ..   .:  ::......: .::    :  :.:: :.:::.:.:..: 
CCDS61 YRHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDN
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KE4 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE
       ::: .:.:.::.: :   .      : . ::.. :    :    ..: ::  :.:: .::
CCDS61 GFPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTI-TGSTNVGDQLPTGQLSVVPWRRTGVKYTNNE
     120       130       140        150       160       170        

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pF1KE4 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGLSGSK
       ...:::: .. ... .::.. .:: :.:   : :.:::.: :. .: :.:          
CCDS61 AYFDVIEEIDAIIDKSGSTITAEIQGVIDACVKLTGMPDLTLSFMNPRLL----------
      180       190       200       210       220                  

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pF1KE4 NKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI--
             .::.:: :::..:....: .:::::::.:.:.::..:.:  :   ....  :  
CCDS61 ------DDVSFHPCVRFKRWESERILSFIPPDGNFRLLSYHVSAQNLVAIPVYVKHNISF
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pF1KE4 -EKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVI
        .. : .: :: :  :  . :  . .:: ..  .:. . .  .  : :.  . :  ... 
CCDS61 RDSSSLGRFEITVGPKQTMGK--TIEGVTVTSQMPKGVLNMSLTPSQGTHTFDPVTKMLS
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pF1KE4 WSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSG
       :.. ..   :   ... ..:    ..  :. : :...:.:  ...::..:  . .  .. 
CCDS61 WDVGKINPQKLPSLKGTMSLQAGASKPDEN-PTINLQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK-
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          410       420     
pF1KE4 YQALPWVRYITQSGDYQLRTS
       :. .  ..:.:..: .:.:: 
CCDS61 YKPFKGIKYMTKAGKFQVRT 
      400       410         

>>CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7                (453 aa)
 initn: 600 init1: 260 opt: 273  Z-score: 347.8  bits: 73.5 E(32554): 4.7e-13
Smith-Waterman score: 637; 29.5% identity (60.8% similar) in 454 aa overlap (4-423:3-452)

               10        20        30         40        50         
pF1KE4 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKI-EHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLW
          :  :::. :: ::: ....:: .   . : :.  :.    . . . .  ::. ::. 
CCDS56  MISQFFILSSKGDPLIYKDFRGDSGGRDVAELFYRKLTGLPGDESPVVMHHHGR-HFIH
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pF1KE4 IKHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMD
       :.::.::::.:::.:..   .  .: .   .. .:   : : .:  : ..:::::::..:
CCDS56 IRHSGLYLVVTTSENVSPFSLLELLSRLATLLGDYCGSLGEGTISRNVALVYELLDEVLD
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pF1KE4 FGFPQTTDSKILQEYITQQS--NK--------------LETGKSRVPPTVTNA---VSWR
       .:. :::....:...:  ..  .:               :: .:.: :. . .   .: :
CCDS56 YGYVQTTSTEMLRNFIQTEAVVSKPFSLFDLSSVGLFGAETQQSKVAPSSAASRPVLSSR
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pF1KE4 SEGIKYKKNEVFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLF
       :.  . .:::::.::.: ...:. .:::.:  .. : :.:: :: .  :.:.::...   
CCDS56 SD--QSQKNEVFLDVVERLSVLIASNGSLLKVDVQGEIRLKSFLPSGSEMRIGLTEEFCV
      180         190       200       210       220       230      

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pF1KE4 ELTGLSGSKNKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVK---P
         . : :  . ......:.::. : :..:.. : . . ::.:.. .: :.:: ..    :
CCDS56 GKSELRGY-GPGIRVDEVSFHSSVNLDEFESHRILRLQPPQGELTVMRYQLSDDLPSPLP
        240        250       260       270       280       290     

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pF1KE4 LIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYV
       .  . ::    . .:.....: . .. ..: : .:.. .:.:  . :   . :    :  
CCDS56 FRLFPSVQWDRGSGRLQVYLKLRCDLLSKSQALNVRLHLPLPRGVVSLSQELSSPEQKAE
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pF1KE4 PERNVVIWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPRVEKEEVEG-----RP----PIGVKFEIPYFT
         .... :..    ::..     .. .:       .:      :    : ...::.:  :
CCDS56 LAEGALRWDLPRVQGGSQLSGLFQMDVPGPPGPPSHGLSTSASPLGLGPASLSFELPRHT
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pF1KE4 VSGIQVRYMKIIEKSGYQALP--WVRYITQSGDYQLRTS
        ::.:::....  .   .: :  :::....:  : .:  
CCDS56 CSGLQVRFLRLAFRPCGNANPHKWVRHLSHSDAYVIRI 
         420       430       440       450    




425 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Sun Nov  6 01:16:48 2016 done: Sun Nov  6 01:16:49 2016
 Total Scan time:  2.400 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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