FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2371, 790 aa 1>>>pF1KE2371 790 - 790 aa - 790 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6582+/-0.000497; mu= 15.0906+/- 0.031 mean_var=128.5652+/-24.993, 0's: 0 Z-trim(112.4): 83 B-trim: 316 in 1/51 Lambda= 0.113113 statistics sampled from 21218 (21299) to 21218 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16 Scan time: 12.500 The best scores are: opt bits E(85289) NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient r ( 790) 5208 862.3 0 NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transien ( 791) 5196 860.3 0 NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61 NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61 NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61 NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61 XP_011536936 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 793) 1336 230.4 2.4e-59 XP_011536937 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 695) 1307 225.6 5.7e-58 XP_006721606 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 680) 1151 200.1 2.6e-50 XP_011522224 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 719) 1151 200.2 2.7e-50 XP_006721604 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 733) 1151 200.2 2.7e-50 NP_057197 (OMIM: 606676) transient receptor potent ( 764) 1151 200.2 2.8e-50 XP_016880219 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 679) 1131 196.9 2.5e-49 XP_005256733 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 763) 1131 196.9 2.7e-49 XP_016880220 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 629) 1038 181.7 8.6e-45 XP_005256735 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 548) 1036 181.3 9.7e-45 XP_011522225 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 531) 1031 180.5 1.7e-44 XP_016880221 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 585) 1031 180.5 1.8e-44 XP_005256734 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 630) 1031 180.5 1.9e-44 XP_011536938 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 603) 1020 178.7 6.4e-44 NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potent ( 729) 665 120.9 2e-26 NP_001170904 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 764) 520 97.2 2.8e-19 NP_671737 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 811) 520 97.2 2.9e-19 XP_011536935 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 815) 520 97.2 2.9e-19 NP_001170899 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 824) 520 97.2 3e-19 NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 837) 520 97.3 3e-19 XP_011536934 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 862) 520 97.3 3.1e-19 NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 871) 520 97.3 3.1e-19 XP_016875263 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 520 97.3 3.1e-19 XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 520 97.3 3.1e-19 XP_011536933 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 875) 520 97.3 3.1e-19 XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 922) 520 97.3 3.2e-19 XP_011522227 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 334) 354 69.8 2.1e-11 NP_061116 (OMIM: 606680) transient receptor potent ( 765) 246 52.5 8.1e-06 NP_001245377 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 602) 185 42.5 0.0067 >>NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient recep (790 aa) initn: 5208 init1: 5208 opt: 5208 Z-score: 4601.5 bits: 862.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5208; 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