FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2371, 790 aa 1>>>pF1KE2371 790 - 790 aa - 790 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6576+/-0.00116; mu= 14.7992+/- 0.070 mean_var=112.0496+/-22.196, 0's: 0 Z-trim(105.4): 52 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.121163 statistics sampled from 8379 (8419) to 8379 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16 Scan time: 3.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11029.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 ( 790) 5208 922.0 0 CCDS58500.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 ( 791) 5196 919.9 0 CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs108|chr17 ( 839) 1383 253.5 1.1e-66 CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 ( 764) 1151 212.9 1.6e-54 CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs108|chr7 ( 729) 665 127.9 5.9e-29 CCDS53827.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 764) 520 102.6 2.6e-21 CCDS9135.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 811) 520 102.6 2.7e-21 CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 824) 520 102.6 2.8e-21 CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 837) 520 102.6 2.8e-21 CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 871) 520 102.6 2.9e-21 >>CCDS11029.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 (790 aa) initn: 5208 init1: 5208 opt: 5208 Z-score: 4924.6 bits: 922.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5208; 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41.3% identity (69.8% similar) in 782 aa overlap (10-759:15-773) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAP-SGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNP ::. : .:.: : ... .:. ...: . .. : : CCDS45 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 TVAKTSPPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRR . . : .:: : . . . . . : : : : . .. : ... : CCDS45 V----DCPHEEGELDS----CPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 KKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMK :: :: ::... ..: ::. ::. ..: : ... .::::::.: CCDS45 YDRR---SIFEAVAQNNCQDLESLLLFLQK--SKKHLTD------NEFKDPETGKTCLLK 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 ALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALL :.::.. . . . .:: .:...: : ...:: ::. :.:::::.::::::. ...:: CCDS45 AMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 IAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHE-QT-DITSR . ::::.: :.: ::. . :::::: ::.::::::: ::..:... :: ::..: CCDS45 VENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISAR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE2 DSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNW----ELETTRNNDGLTPLQLA :: ::..::::: ::.. .. :: ::. ::. ... .:: :. :.::: :: CCDS45 DSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALA 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 AKMGKAEILKYILSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITV : :: .: :::.:::.: . : ::::::.:::::: ::::::. .:: :::::. . CCDS45 AGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIA 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 YNTN-IDNRHEMLTLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEE :... :::.:: .:::. ::. :: .:.:..:...: : .: : .:...:::: . CCDS45 YSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVD-- 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 AIPHPLALTHKMGWLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFF ..: :. . . .... :... .. .. . . :: :: : ...... :.. ...:: CCDS45 GLP-PFKMEKTGDYFRVTGEILSVLGGVYFFFR-GIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFF 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 IQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDV .:..... .: ::. :::.: .:...::::.::::::::::.::.:.:::.:.::.:. CCDS45 LQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDL 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 pF1KE2 LKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCPKDN------------KDC----SSYGSFSDAVLE .:.:::::::.::..:...::: .:. : :::.:. .. :: CCDS45 CRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLE 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 LFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERI :::.:::.:::.. .: . .:..::..:::::..::::::::::::::.....::. : CCDS45 LFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFIILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNI 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 WRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVA-----EDDFRLCLRINEVKWTEWKTHV :.:::: :::. :: . . .:. :: :.: .:. .::.: :.:..::.:: :.:.: CCDS45 WKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNV 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 pF1KE2 SFLNEDPGP---VRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV ...::::: :.:: CCDS45 GIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQ 760 770 780 790 800 810 >>CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 (764 aa) initn: 685 init1: 434 opt: 1151 Z-score: 1092.2 bits: 212.9 E(32554): 1.6e-54 Smith-Waterman score: 1473; 40.5% identity (68.2% similar) in 692 aa overlap (112-767:68-741) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 DMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVE : .: . :.: :::.: :.:. : CCDS32 PMESQFQGEDRKFAPQIRVNLNYRKGTGASQPDPNRFDRDRLFNAVSRGVPEDLAGLPEY 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILG :.. . : . : ..:::::::::.::.. ... . :: . ... CCDS32 LSKTSKYLTDSEY--------TEGSTGKTCLMKAVLNLKDGVNACILPLLQIDRDSGNPQ 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 RFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYF ..::. :.. :.:..::.::::.:. . . ::. ::.:.:.: : ::. : : ::: CCDS32 PLVNAQCTDDYYRGHSALHIAIEKRSLQCVKLLVENGANVHARACGRFFQ-KGQGTCFYF 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 pF1KE2 GETPLALAACTNQPEIVQLLME--HEQTDITSRDSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKR :: ::.:::::.: ..:. :.: :. ... . ::.::..::::: .... . .: CCDS32 GELPLSLAACTKQWDVVSYLLENPHQPASLQATDSQGNTVLHALVMISDNSAENIALVTS 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 MYDMILLRSG-----NWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYILSREIKEKRLRSLS ::: ::..: . .:: :: . ::::.:::: :: ::...::.::.. : :: CCDS32 MYDG-LLQAGARLCPTVQLEDIRNLQDLTPLKLAAKEGKIEIFRHILQREFSG--LSHLS 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 RKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEMLTLEPLHTLLHMKWK ::::.: :::: :::::..::. .:::::: ... . .::.:..::::. ::. :: CCDS32 RKFTEWCYGPVRVSLYDLASVDSCEENSVLEIIAFHCKSPHRHRMVVLEPLNKLLQAKWD 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 KFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPR-EEEAIPHPLALTHKMGWLQLL-GRMFVLI . . :::.: ..: . .: :.:..: ...: :: : ..: .:: :....:. CCDS32 LLIPK-FFLNFLCNLIYMFIFTAVAYHQPTLKKQAAPH---LKAEVGNSMLLTGHILILL 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 WAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLV .. . : . . : : . . :..:...:..::.:...: : ..: . :: :: CCDS32 GGIYLLVGQ-LWYFWRRHVFIWISFIDSYFEILFLFQALLTVVSQVLCFLAIEWYLPLLV 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 LAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKC :..::: :.:::::::: :.::::::::::.:.:.::..:.:::.::.:::.:: .. CCDS32 SALVLGWLNLLYYTRGFQHTGIYSVMIQKVILRDLLRFLLIYLVFLFGFAVALVSLSQEA 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 pF1KE2 --PK------------------DNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPI :. :. . ..: .. .: :::::.:::.:.: .:.. .. CCDS32 WRPEAPTGPNATESVQPMEGQEDEGNGAQYRGILEASLELFKFTIGMGELAFQEQLHFRG 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 LFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLR . :.::..::.::..::::::::::.:::..:. .: ::.::.: ..::.:. : : CCDS32 MVLLLLLAYVLLTYILLLNMLIALMSETVNSVATDSWSIWKLQKAISVLEMENGY-WWCR 630 640 650 660 670 720 730 740 750 760 pF1KE2 SRFRMGELCKVAED-----DFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGP--VRRTDFNKIQ .. : : . :. : : :.:..::.:. :. . : :::. : :: : . CCDS32 KKQRAGVMLTVGTKPDGSPDERWCFRVEEVNWASWEQTLPTLCEDPSGAGVPRTLENPVL 680 690 700 710 720 730 770 780 790 pF1KE2 DSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV : CCDS32 ASPPKEDEDGASEENYVPVQLLQSN 740 750 760 >>CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs108|chr7 (729 aa) initn: 744 init1: 219 opt: 665 Z-score: 633.3 bits: 127.9 E(32554): 5.9e-29 Smith-Waterman score: 828; 30.4% identity (63.9% similar) in 552 aa overlap (209-734:111-633) 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 INPNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAG : ::. :::::.::. .. ... :.. CCDS58 TALHIAALYDNLEAALVLMEAAPELVFEPTTCEAFAGQTALHIAVVNQNVNLVRALLTRR 90 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 ADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNN :.:.:.: :. : . .. .:::: ::..:::.:. :::.::.:: .:: ..:: ::. CCDS58 ASVSARATGTAFRHSPRNL-IYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEH-GADIRAQDSLGNT 150 160 170 180 190 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ILHALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWE----LETTRNNDGLTPLQLAAKMGKA .:: :. .. .. :. .::...: .:. . :. . :..::::..::. :.. CCDS58 VLHILI-----LQPNKTFACQMYNLLLSYDGHGDHLQPLDLVPNHQGLTPFKLAGVEGNT 200 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EILKYILSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDN-SVLEITVYNTNI ........ :. .:.:::..: :::::..:. .. : ::..: . . CCDS58 VMFQHLMQK-----------RRHIQWTYGPLTSILYDLTEIDSWGEELSFLELVVSSDKR 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 pF1KE2 DNRHEMLTLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRP---------- . : ..: :.. :. .::.:... .: . .:..: : .: ::: CCDS58 EAR-QILEQTPVKELVSFKWNKYGRPYFCILAALYLLYMICFTTCCVYRPLKFRGGNRTH 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 pF1KE2 -REEEAIPHPL---ALTHKMGWLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDL--QSIL :. . . : : . ..:.:.. .. :. : . : :: . : ..:: CCDS58 SRDITILQQKLLQEAYETREDIIRLVGELVSIVGAVIILLLEIPDIFRVGASRYFGKTIL 370 380 390 400 410 420 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 SDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSV . :: ... : ::.... . : . .. . .:..::: ...:.::::: .: ... CCDS58 GGP-FHVIIITYASLVLVTMVMRLTNTNGEVVPMSFALVLGWCSVMYFTRGFQMLGPFTI 430 440 450 460 470 480 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 MIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSD---AVLELFK ::::.:. :...: ... : .:::. :. ... ..: .: :.: : :.. :. CCDS58 MIQKMIFGDLMRFCWLMAVVILGFASAFYIIFQ-----TEDPTSLGQFYDYPMALFTTFE 490 500 510 520 530 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 LTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRL : . . : . . :..: .. ....:.. .:.::..::.::.: :..: ...:: CCDS58 LFLTVIDAPANYDVDLPFMFSIVNFAFTIIATLLMLNLFIAMMGDTHWRVAQERDELWRA 540 550 560 570 580 590 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 QRARTILEFEKMLPE--WLRSRFRMGELCKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNED : . : . .:. ::. : :: . : :. . : : ::. CCDS58 QVVATTVMLERKLPRCLWPRSGI-CG--CEFGLGD-RWFLRVENHNDQNPLRVLRYVEVF 600 610 620 630 640 650 760 770 780 790 pF1KE2 PGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFEEVEEFPETSV CCDS58 KNSDKEDDQEHPSEKQPSGAESGTLARASLALPTSSLSRTASQSSSHRGWEILRQNTLGH 660 670 680 690 700 710 >>CCDS53827.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (764 aa) initn: 1233 init1: 402 opt: 520 Z-score: 496.1 bits: 102.6 E(32554): 2.6e-21 Smith-Waterman score: 1230; 33.9% identity (59.7% similar) in 772 aa overlap (20-754:46-693) 10 20 30 40 pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEG : .:. .::: : .. ....: CCDS53 AELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPA--GPGDGRPNLRMKFQG 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 pF1KE2 -FE---PNP------TVAKTS--PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETP :. ::: :. ..: : . :::: . . . . :. . . . . : CCDS53 AFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDS-LFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQP 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 SNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDF ..:..:. : . .: . .: ::.: . .: :: : .: ::. 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CCDS53 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 ELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYILSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYD .::.. :::::.::..::: :: CCDS53 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGK-------------------------------------- 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 LTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEMLTLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFY : ::::::..::.. ::. ::.::. :... :. CCDS53 ---------------------IGNRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCA 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 NITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMGWLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPS . .::..::.: : :.: : . .:.: :....:. .. . . .:. . CCDS53 MVIFTLTAYYQPLEGTP-PYPYRTT--VDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCP 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 DLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQS ..:.. :. :....:: .::::.:. ::: . . ::: .:.:..::: : ::.:::.. 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CCDS91 GVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKL 480 490 500 510 520 530 580 590 600 610 620 pF1KE2 MGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCP------KDNKDCS--SYG : ::.::::....:...::.::..:..:.. ::.::.. : .:. .:. .: CCDS91 TGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYP 540 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 pF1KE2 S------FSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALM : :: .:.:::::::.:::.. ...:::..:..::.::.::::::::::::::: CCDS91 SCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALM 600 610 620 630 640 650 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 GETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVAED-----DFRLCL :::: .:::::..::.:: : :::..:. .: .::. :: ::. :... : : :. 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CCDS53 QSPKAPAPQ-PPPILKVFNRPI---LFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRLTDEE---- 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LMHKLTASDTGKTCLMKALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQT . .:::::: :::::.. . .. . .:: .::.. . .:::. . CCDS53 ----FREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFR-------- 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 ALNIAIERRQGDIAALLIAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEI :: .: :: ::.::::::::.: CCDS53 -----------DI----------------------------YYRGELPLSLAACTNQPHI 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VQLLME--HEQTDITSRDSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSG----NW :. : : :...:. .:::::..:::::..:.. . .. :: .:::..::. . . 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