Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9280
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9280, 579 aa
  1>>>pF1KB9280 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0742+/-0.00109; mu= 8.2759+/- 0.066
 mean_var=221.4945+/-46.673, 0's: 0 Z-trim(110.2): 39  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.086177
 statistics sampled from 11414 (11441) to 11414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.351), width:  16
 Scan time:  3.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5           ( 579) 3747 479.1 6.4e-135
CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1          ( 731) 2561 331.8 1.8e-90
CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19         ( 543) 2343 304.6 2.1e-82
CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1           ( 426) 2199 286.5 4.4e-77
CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5          ( 231) 1472 195.9 4.7e-50
CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1          ( 746) 1386 185.7 1.8e-46
CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19         ( 427) 1131 153.8 4.2e-37


>>CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5                (579 aa)
 initn: 3747 init1: 3747 opt: 3747  Z-score: 2535.8  bits: 479.1 E(32554): 6.4e-135
Smith-Waterman score: 3747; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 SSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTII
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTAR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 VMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 NAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 DLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570         
pF1KB9 EAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
              550       560       570         

>>CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1               (731 aa)
 initn: 2689 init1: 2525 opt: 2561  Z-score: 1737.6  bits: 331.8 E(32554): 1.8e-90
Smith-Waterman score: 2687; 73.7% identity (86.7% similar) in 579 aa overlap (1-579:175-728)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSE
                                     ::::.:.::::.::: :::::::: : ..:
CCDS30 ATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAETE
          150       160       170       180       190       200    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 AQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGST
       .::::            :::           . ::::.:. : :....  :.  ..  . 
CCDS30 GQPLQ----------LFSPS-----------NPPEIVISSREDNHAHQTLLHHPNATHNH
                    210                  220       230       240   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 GGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
         .:    .  .:..  :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QHAG----TTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
               250       260       270       280       290         

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
       :::::::: :.: :..::::::::::::::::::::.::.::.:::..::::::::::::
CCDS30 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT
     300       310       320       330       340       350         

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 YERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIA
       ::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . :::::::::::::::::::
CCDS30 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEADVDIILSIPMFLRLYLIA
     360       370       380       390       400       410         

              280       290       300       310       320       330
pF1KB9 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
     420       430       440       450       460       470         

              340       350       360       370       380       390
pF1KB9 ACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVV
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS30 VCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVV
     480       490       500       510       520       530         

              400       410       420       430       440       450
pF1KB9 AVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.::::::::::
CCDS30 AVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWLIYKHTKLLKKIDHAKVRK
     540       550       560       570       580       590         

              460       470       480       490       500       510
pF1KB9 HQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTL
       ::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::.:..::.::::.::.: .:
CCDS30 HQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDLITELNDRSEDLEKQIGSL
     600       610       620       630       640       650         

              520       530       540       550       560       570
pF1KB9 ETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSST
       :.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:.    :. .. ..  :.     :::
CCDS30 ESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVAVGTTHTPISDSPIGVSST
     660       670       680       690       700       710         

                   
pF1KB9 APPTSSESS   
       . ::   ::   
CCDS30 SFPTPYTSSSSC
     720       730 

>>CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19              (543 aa)
 initn: 2082 init1: 2031 opt: 2343  Z-score: 1592.7  bits: 304.6 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 2362; 70.3% identity (85.1% similar) in 538 aa overlap (1-533:1-508)

               10         20        30         40        50        
pF1KB9 MSSCRYNGGVMRPL-SNLSASRRNLHEMDSEA-QPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAA
       :.:  :::.: ::: :. .:  :.    : :: .: ::: : :      .  .: .  : 
CCDS67 MNSHSYNGSVGRPLGSGPGALGRD--PPDPEAGHPPQPPHSPG-----LQVVVAKSEPAR
               10        20          30        40             50   

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB9 VSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIG
        : ..:.   ..:. .....                    . . . .: . .. : .:.:
CCDS67 PSPGSPR---GQPQDQDDDE--------------------DDEEDEAGRQRASGKPSNVG
            60           70                            80        90

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 YKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLST
       ..:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.: : ::::.::::::::::
CCDS67 HRLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVTETELSWGVYTKESLYSFALKCLISLST
              100       110       120       130       140       150

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB9 IILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWT
        :::::...::::::::::::::::::::::: ::.:.: ::. ::::::.::.: ::::
CCDS67 AILLGLVVLYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTCERVFLISLELAVCAIHPVPGHYRFTWT
              160       170       180       190       200       210

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB9 ARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNT
       :::::.::::.. ::::..:::::::::::..::::::::.:::::::::::::::.:::
CCDS67 ARLAFTYAPSVAEADVDVLLSIPMFLRLYLLGRVMLLHSKIFTDASSRSIGALNKITFNT
              220       230       240       250       260       270

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 RFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLS
       :::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::.:.::::::::::::::::::
CCDS67 RFVMKTLMTICPGTVLLVFSISSWIIAAWTVRVCERYHDKQEVTSNFLGAMWLISITFLS
              280       290       300       310       320       330

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB9 IGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKR
       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKR
              340       350       360       370       380       390

      420       430       440       450       460          470     
pF1KB9 VKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQ---LRSVKMEQRKLNDQ
       :::::::::::::::::.:.:::: :.:.::::::::::::::   :::::.:: :::::
CCDS67 VKNAAANVLRETWLIYKHTRLVKKPDQARVRKHQRKFLQAIHQAQKLRSVKIEQGKLNDQ
              400       410       420       430       440       450

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB9 ANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQ
       ::::.::::::..:::..:.:. . :..: :..:::..:..: .:..::::::.:.::  
CCDS67 ANTLTDLAKTQTVMYDLVSELHAQHEELEARLATLESRLDALGASLQALPGLIAQAIRPP
              460       470       480       490       500       510

         540       550       560       570         
pF1KB9 QRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
                                                   
CCDS67 PPPLPPRPGPGPQDQAARSSPCRWTPVAPSDCG           
              520       530       540              

>>CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1                (426 aa)
 initn: 2199 init1: 2199 opt: 2199  Z-score: 1497.3  bits: 286.5 E(32554): 4.4e-77
Smith-Waterman score: 2199; 81.1% identity (92.8% similar) in 418 aa overlap (162-579:6-423)

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB9 KRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAR
                                     : :..::::::::::::::::::::.::.:
CCDS10                          MERPIKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTR
                                        10        20        30     

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB9 EIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTT
       :.:::..::::::::::::::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . 
CCDS10 EVQLFVIDNGADDWRIAMTYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAE
          40        50        60        70        80        90     

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 ADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPG
         100       110       120       130       140       150     

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 TVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCG
       :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS10 TVLLVFSISLWIIAAWTVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCG
         160       170       180       190       200       210     

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 KGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETW
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS10 KGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETW
         220       230       240       250       260       270     

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 LIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYD
       ::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::
CCDS10 LIYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYD
         280       290       300       310       320       330     

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB9 MISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHV
       .:..::.::::.::.: .::.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:.    :
CCDS10 LITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSV
         340       350       360       370       380       390     

             560       570            
pF1KB9 TYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS   
       . .. ..  :.     :::. ::   ::   
CCDS10 AVGTTHTPISDSPIGVSSTSFPTPYTSSSSC
         400       410       420      

>>CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5               (231 aa)
 initn: 1472 init1: 1472 opt: 1472  Z-score: 1012.1  bits: 195.9 E(32554): 4.7e-50
Smith-Waterman score: 1472; 100.0% identity (100.0% similar) in 231 aa overlap (349-579:1-231)

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB9 ISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43                               MWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT
                                             10        20        30

      380       390       400       410       420       430        
pF1KB9 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
               40        50        60        70        80        90

      440       450       460       470       480       490        
pF1KB9 LVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNE
              100       110       120       130       140       150

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB9 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
              160       170       180       190       200       210

      560       570         
pF1KB9 RSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
       :::::::::::::::::::::
CCDS43 RSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
              220       230 

>>CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1               (746 aa)
 initn: 2668 init1: 1332 opt: 1386  Z-score: 948.0  bits: 185.7 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 2639; 71.7% identity (84.3% similar) in 594 aa overlap (1-579:175-743)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSE
                                     ::::.:.::::.::: :::::::: : ..:
CCDS72 ATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAETE
          150       160       170       180       190       200    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 AQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGST
       .::::            :::           . ::::.:. : :....  :.  ..  . 
CCDS72 GQPLQ----------LFSPS-----------NPPEIVISSREDNHAHQTLLHHPNATHNH
                    210                  220       230       240   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 GGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
         .:    .  .:..  :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QHAG----TTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
               250       260       270       280       290         

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
       :::::::: :.: :..::::::::::::::::::::.::.::.:::..::::::::::::
CCDS72 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT
     300       310       320       330       340       350         

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 YERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIA
       ::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . :::::::::::::::::::
CCDS72 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEADVDIILSIPMFLRLYLIA
     360       370       380       390       400       410         

              280       290       300       310       320       330
pF1KB9 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
     420       430       440       450       460       470         

                             340       350       360       370     
pF1KB9 ACER---------------YHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVC
       .::                ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS72 VCESPESPAQPSGSSLPAWYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVC
     480       490       500       510       520       530         

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB9 LLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS72 LLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWLIYK
     540       550       560       570       580       590         

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB9 NTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISD
       .:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::.:..
CCDS72 HTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDLITE
     600       610       620       630       640       650         

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB9 LNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNA
       ::.::::.::.: .::.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:.    :. ..
CCDS72 LNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVAVGT
     660       670       680       690       700       710         

         560       570            
pF1KB9 ERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS   
        ..  :.     :::. ::   ::   
CCDS72 THTPISDSPIGVSSTSFPTPYTSSSSC
     720       730       740      

>>CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19              (427 aa)
 initn: 1110 init1: 417 opt: 1131  Z-score: 779.7  bits: 153.8 E(32554): 4.2e-37
Smith-Waterman score: 1131; 46.0% identity (76.0% similar) in 400 aa overlap (121-517:12-406)

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 GGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
                                     : .:. :.:..: :. .::...  :: .::
CCDS12                    MGGDLVLGLGALRRRKRLLEQEKSLAGWALVLAGTGIGLMV
                                  10        20        30        40 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
       ...:. : .  . .:: . .:: ::.::..:: ::...::.:.::::.:::  :::.:.:
CCDS12 LHAEMLWFGGCSWALYLFLVKCTISISTFLLLCLIVAFHAKEVQLFMTDNGLRDWRVALT
              50        60        70        80        90       100 

              220       230         240        250       260       
pF1KB9 YERIFFICLEILVCAIHPIP--GNYTFTWTARLAFSYAP-STTTADVDIILSIPMFLRLY
        ..   : ::..::..:: :  :       .    :  :     .. . .::. :.::::
CCDS12 GRQAAQIVLELVVCGLHPAPVRGPPCVQDLGAPLTSPQPWPGFLGQGEALLSLAMLLRLY
             110       120       130       140       150       160 

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB9 LIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAW
       :. :..::.: .. .:: :::::::.. :   :: :  :.  :: .:: ....::. .::
CCDS12 LVPRAVLLRSGVLLNASYRSIGALNQVRFRHWFVAKLYMNTHPGRLLLGLTLGLWLTTAW
             170       180       190       200       210       220 

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB9 TVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTA
       .. . ::  .  ..:...  ..::: ::::.:::::.::.:. :: ::: ::.::. :::
CCDS12 VLSVAER--QAVNATGHLSDTLWLIPITFLTIGYGDVVPGTMWGKIVCLCTGVMGVCCTA
               230       240       250       260       270         

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB9 LVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAK
       :.:::::::::..:::::::::::: : ::..:..:: ::.:.:..::.:.  .: .:: 
CCDS12 LLVAVVARKLEFNKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTR--RKESHA-
     280       290       300       310       320       330         

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB9 VRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRI
       .:.::::.: ::. .:.:....::: .:.:..::..: . :.::. ..:.   . .::.:
CCDS12 ARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALEKQI
        340       350       360       370       380       390      

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB9 VTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRS
        ::  ::..:                                                  
CCDS12 DTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPSQQSK                             
        400       410       420                                    




579 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 19:41:01 2016 done: Sun Nov  6 19:41:02 2016
 Total Scan time:  3.620 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com