Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2301
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2301, 2177 aa
1>>>pF1KE2301 2177 - 2177 aa - 2177 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.1335+/-0.000515; mu= -10.2568+/- 0.032
mean_var=601.7232+/-127.506, 0's: 0 Z-trim(120.6): 237 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.052285
statistics sampled from 35753 (36014) to 35753 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 20.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005111 (OMIM: 300188,300895,305450,309520) medi (2177) 14683 1125.0 0
XP_011510701 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (1223) 3330 268.3 3.8e-70
XP_016861169 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2103) 2276 189.1 4.7e-46
XP_016861168 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2107) 2276 189.1 4.7e-46
XP_016861166 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2196) 2276 189.1 4.9e-46
XP_016861165 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2197) 2276 189.1 4.9e-46
XP_016861167 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2150) 2240 186.4 3.1e-45
XP_016861170 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (1309) 2175 181.2 6.7e-44
XP_011510692 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2145) 2175 181.5 9.4e-44
NP_443728 (OMIM: 611318) mediator of RNA polymeras (2145) 2175 181.5 9.4e-44
XP_006713550 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (2180) 2175 181.5 9.5e-44
XP_011510696 (OMIM: 611318) PREDICTED: mediator of (1946) 1996 167.9 1e-39
XP_011541326 (OMIM: 607537) PREDICTED: mastermind- ( 928) 536 57.5 8.7e-07
XP_011541327 (OMIM: 607537) PREDICTED: mastermind- ( 735) 532 57.1 9.1e-07
XP_011541325 (OMIM: 607537) PREDICTED: mastermind- (1009) 536 57.5 9.2e-07
NP_115803 (OMIM: 607537) mastermind-like protein 2 (1156) 536 57.6 1e-06
XP_011537078 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5525) 529 57.7 4.3e-06
XP_006719679 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5536) 529 57.7 4.3e-06
XP_005269219 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5537) 529 57.7 4.3e-06
NP_003473 (OMIM: 147920,602113) histone-lysine N-m (5537) 529 57.7 4.3e-06
XP_006719677 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5540) 529 57.7 4.3e-06
XP_011537076 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5549) 529 57.7 4.3e-06
XP_011537075 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5552) 529 57.7 4.3e-06
XP_011537074 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5553) 529 57.7 4.3e-06
XP_011537073 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5555) 529 57.7 4.3e-06
XP_011537072 (OMIM: 147920,602113) PREDICTED: hist (5556) 529 57.7 4.3e-06
NP_683697 (OMIM: 602081,605317) forkhead box prote ( 432) 465 51.8 2.1e-05
NP_055306 (OMIM: 602081,605317) forkhead box prote ( 715) 465 52.0 3e-05
NP_001166238 (OMIM: 602081,605317) forkhead box pr ( 457) 458 51.3 3.2e-05
NP_683696 (OMIM: 602081,605317) forkhead box prote ( 740) 458 51.5 4.4e-05
XP_016868290 (OMIM: 602081,605317) PREDICTED: fork ( 740) 458 51.5 4.4e-05
NP_001166237 (OMIM: 602081,605317) forkhead box pr ( 714) 449 50.8 6.9e-05
XP_016884311 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 406) 425 48.7 0.00016
XP_011528521 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 406) 425 48.7 0.00016
XP_011528522 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 406) 425 48.7 0.00016
XP_011528520 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 411) 425 48.7 0.00016
XP_016884310 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 520) 425 48.8 0.00019
XP_016884309 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 667) 425 48.9 0.00023
XP_006724327 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 707) 425 49.0 0.00024
XP_016884308 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 707) 425 49.0 0.00024
XP_016884307 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 707) 425 49.0 0.00024
NP_001280164 (OMIM: 607372) mediator of RNA polyme ( 722) 425 49.0 0.00024
NP_001280166 (OMIM: 607372) mediator of RNA polyme ( 722) 425 49.0 0.00024
NP_001280163 (OMIM: 607372) mediator of RNA polyme ( 731) 425 49.0 0.00024
XP_011528517 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 741) 425 49.0 0.00025
NP_056973 (OMIM: 607372) mediator of RNA polymeras ( 748) 425 49.0 0.00025
XP_016884306 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 749) 425 49.0 0.00025
XP_011528516 (OMIM: 607372) PREDICTED: mediator of ( 762) 425 49.0 0.00025
NP_001003891 (OMIM: 607372) mediator of RNA polyme ( 788) 425 49.0 0.00026
NP_001280165 (OMIM: 607372) mediator of RNA polyme ( 677) 406 47.5 0.00063
>>NP_005111 (OMIM: 300188,300895,305450,309520) mediator (2177 aa)
initn: 14683 init1: 14683 opt: 14683 Z-score: 6005.5 bits: 1125.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 14683; 100.0% identity (100.0% similar) in 2177 aa overlap (1-2177:1-2177)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVSFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NVSFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 MFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CTRRLALQLDGVSSHSSHVISAQSTSTLPTTPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CTRRLALQLDGVSSHSSHVISAQSTSTLPTTPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 CNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 CGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 CELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDPEHKEAEGSSSSKLEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDPEHKEAEGSSSSKLEDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKPPPKEKIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKPPPKEKIEG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 QHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 SVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 RSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 LLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 SSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 RRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 MQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNSLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNSLLE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 NIAKATIEVFQRSAETGSSSGSTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NIAKATIEVFQQSAETGSSSGSTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 GHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 TSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAML
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 LLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLAKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLAKKL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 QKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 TKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 PLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPEPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPEPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTE
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 DYGMGPGRSGPYGVTVPPDLLHHPNPGSITHLNYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DYGMGPGRSGPYGVTVPPDLLHHPNPGSITHLNYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 VRLPMQKLPTRPTYPGVLPTTMTGVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VRLPMQKLPTRPTYPGVLPTTMTGVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQG
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 MLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPST
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 NPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTSTQRFSHQTLQQTPMISTMTPMSAQGVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTSTQRFSHQTLQQTPMISTMTPMSAQGVQA
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
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NP_005 QQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQAAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQ
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NP_005 QLSNTQPQPSTNIFGRY
2170
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..:::. ... : . . :.. ::: : :: :.:: . :. . .... :
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1930 1940 1950 1960 1970 1980
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1940 1950 1960 1970 1980
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1990 2000 2010 2020 2030
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: : ::..:.:.: : .: :: :: : :::::::::::::::::::::.
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::::::::::::::::::::::::::: .::.::..:::...: :: : .:.:::::.::
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XP_016 NLVGQPQQPGFFLQNQSLTPGGSRLDPAGSF-VPTN---TKQALSNMLQRR-SGAM-MQP
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XP_016 PGLQQAQTMPQGYTMYGTQMPLQQTSQQQAGSVVLSPSYNSRAYPAAH--SNPVLMERLR
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XP_016 SQSQSQTLGLQAMQ------PQ---QPLFPRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQKQLSSNQPQ
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XP_016 QGVTPYGHPSHF
1300
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.:::::.. :.:::::.::.:::::::::::::.::: ::.:::::::::: : :.:.:
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XP_011 VMPANSNLRWDPDFMMDFIENPSARSINYSMLGKILSDNAANRYSFVCNTLMNVCMGHQD
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XP_011 AGRINDIANFSSELTACCTVLSSEWLGVLKALCCSSNH-VWGFNDVLCTVDVSDLSFHDS
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XP_011 LATFIAILIARQCFSLEDVVQHVALPSLLAAACGDADAEPGARMTCRLLLHLFRAPQACF
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XP_011 LPQATGKPFPGIRSSCDRHLLAAAHNSIEVGAVFAVLKAIMMLGDAKIGNNSVSSLKNDD
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XP_011 FTMRGLRCDGNADDIWTASQNPKSCGKSISIETANLREYARYVLRTICQQEWVGEHCLKE
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.: :.: : ::: :: ::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
XP_011 NSIGSADTSSTRQNGIKTFLSSSERRGVWLVAPLIARLPTSVQGRVLKAAGEELEKGQHL
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::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::.::..:::..
XP_011 GSSSKKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLQNQVNQILSNWREE
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XP_011 LFTTVLDMLGVLINGTLASDLSNASPGGSEENKRAYMNLVKKLKKELGDKRSESIDKVRQ
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:::.:. : .:. . .:.:.:: :::.:: .. ......: .. : :
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. ...:::. ... : . . :.. ::: : :: :.:: .: . :.
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. ..: .:.: ..: : .. . .:: . : ::: .: : .::. :
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:... : :: . ::: .: ::: : ... ::: . ::..: :::.:
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. : ..: .::.:.. :..::.:::::.::: : . ::..::..::.:::.:...
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:..: . :. :: :. .. .: : .::::. :
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:.:: :: : :: : ::..:.:.: : .: :: :: : :::::::::::
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::::::::::.:::..::: ... .:
XP_011 QTAALVRQLQKQLSSNQPQQGVTPYGHPSHF
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:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .:::::::.
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pF1KE2 NVSFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDL
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NP_443 NIVINPSKIGAYFSSILAEKLKLNTFQDTGKKKPQVNAKDNYWLVTARSQSAIHSWFSDL
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::.:::. :::::::.::::.::.:::::.::..::.::::::::::.::::.:.:::..
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NP_443 AFHMFQEGMLEKHEYLTWILDVLEKIRPMDDDLLKLLLPLMLQYSDEFVQSAYLSRRLAY
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::.:::.: :. ...:: :.. . ..:.. . .:.: : : . :::.: : :
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NP_443 HGPLVYGLSCMLQTVTLCCPSALVWNYSTNENKSANPGSPLDLLQVAPSSLPMPGGNTAF
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:: :.: : . :: ::.::::::::: .:: ::::::: ..:.::::.::.:
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:: .:::::::::.::.:.:.:: :..::: :.:. :.::: :
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: :..::.:: :.::.: .:::.:....:. ::: ::.: :::::::::.::.::.::.:
NP_443 VMPANSNLRWDPDFMMDFIENPSARSINYSMLGKILSDNAANRYSFVCNTLMNVCMGHQD
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. .:: :::::::::::::..: : :::::::::...::::. ::..
NP_443 LPQATGKPFPGIRSSCDRHLLAAAHNSIEVGAVFAVLKAIMMLGDAKIGNNSVSSLKNDD
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::. : . .. .: . .. :..::.:::.: ::.::::.:::::::::.:::
NP_443 FTMRGLRCDGNADDIWTASQNPKSCGKSISIETANLREYARYVLRTICQQEWVGEHCLKE
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pF1KE2 ---LCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTM
:: :.. . :::::. :::.:.::::::: . . .:.: :::.::::::::.:::.
NP_443 PERLCTDKELILDPVLSNMQAQKLLQLICYPHGIKECTEGDNLQRQHIKRILQNLEQWTL
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pF1KE2 RQSSLELQLMIKQT---PNN----EMNSLLENIAKATIEVFQRSAETGSSSGSTASNM-P
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NP_443 RQSWLELQLMIKQCLKDPGSGSVAEMNNLLDNIAKATIEVFQQSADLNNSSNSGMSLFNP
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pF1KE2 SS------SKT-----KPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHL
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NP_443 NSIGSADTSSTRQNGIKTFLSSSERRGVWLVAPLIARLPTSVQGRVLKAAGEELEKGQHL
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pF1KE2 APLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEE--PPAPT
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NP_443 APLSWAWFGTVRVDRRVIKYEEQHHLLLYHTHPMPKPRSYYLQPLPLPPEEEEEEPTSPV
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NP_443 SQEPERKSAE--LSDQ---GKTTTDEEKK--TKGRKRKTKSSSRVDEYPQSNIYRVPPNY
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. ...:::. ... : . . :.. ::: : :: :.:: .: . :.
NP_443 SPISSQMMHHPQ-STLWGYNLVGQPQQPGFFLQNQSLTPGGSRLDPAGSF-VPTN---TK
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pF1KE2 PTYPGVLPTTMTGVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVP-----QGQRLRQQLQQ---SQGMLG
. ..: .:.: ..: : .. . .:: . : ::: .: : .::. :
NP_443 QALSNMLQRR-SGAM-MQPPSLHAITSQQQLIQMKLLQQQQQQRLLRQAQTRPFQQGQPG
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1910 1920 1930 1940 1950 1960
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NP_443 RAYPAAH--SNPVLMERLRQIQQQPSGYVQQQASPYLQPLTGSQRLNHQALQQSPLVGG-
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:..: . :. :: :. .. .: : .::::. :
NP_443 ------GIDAVLTSAHPNLPSVPLPQDPMRPRQPQ--------------VRQQQR---LL
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NP_443 QTAALVRQLQKQLSSNQPQQGVTPYGHPSHF
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2177 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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