FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2302, 2174 aa 1>>>pF1KE2302 2174 - 2174 aa - 2174 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0340+/-0.000432; mu= 3.2100+/- 0.027 mean_var=233.0949+/-47.689, 0's: 0 Z-trim(117.9): 9 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.084006 statistics sampled from 30253 (30262) to 30253 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16 Scan time: 23.150 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005112 (OMIM: 603808) mediator of RNA polymeras (2174) 14845 1813.9 0 XP_011523854 (OMIM: 603808) PREDICTED: mediator of (1992) 13544 1656.2 0 XP_011523855 (OMIM: 603808) PREDICTED: mediator of (1951) 13259 1621.7 0 XP_011523853 (OMIM: 603808) PREDICTED: mediator of (2121) 12797 1565.7 0 XP_016874579 (OMIM: 608771,608808,616789) PREDICTE (2209) 4253 530.2 1e-148 NP_056150 (OMIM: 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