FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1253, 530 aa 1>>>pF1KE1253 530 - 530 aa - 530 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8189+/-0.000383; mu= 16.6182+/- 0.024 mean_var=90.3838+/-19.201, 0's: 0 Z-trim(114.8): 204 B-trim: 1069 in 1/50 Lambda= 0.134905 statistics sampled from 24671 (24926) to 24671 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 7.960 The best scores are: opt bits E(85289) NP_958804 (OMIM: 610186) ubiquitin carboxyl-termin ( 530) 3533 698.0 1.8e-200 XP_011523373 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 739) 1243 252.4 3.5e-66 XP_011523371 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 925) 1243 252.5 4.2e-66 XP_016880389 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1123) 1243 252.5 4.9e-66 XP_005257600 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1123) 1243 252.5 4.9e-66 NP_001308220 (OMIM: 612543) ubiquitin carboxyl-ter (1123) 1243 252.5 4.9e-66 XP_005257599 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1123) 1243 252.5 4.9e-66 XP_011523369 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1124) 1243 252.5 4.9e-66 XP_011523367 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1124) 1243 252.5 4.9e-66 XP_011523368 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1124) 1243 252.5 4.9e-66 XP_016880390 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c (1044) 1236 251.1 1.2e-65 XP_011523370 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 959) 956 196.6 2.8e-49 XP_011523372 (OMIM: 612543) PREDICTED: ubiquitin c ( 914) 761 158.6 7.2e-38 NP_001014443 (OMIM: 604729) ubiquitin carboxyl-ter ( 565) 319 72.5 3.9e-12 NP_036607 (OMIM: 604729) ubiquitin carboxyl-termin ( 565) 319 72.5 3.9e-12 NP_001306776 (OMIM: 604729) ubiquitin carboxyl-ter ( 594) 319 72.5 4e-12 XP_016856529 (OMIM: 604729) PREDICTED: ubiquitin c ( 594) 319 72.5 4e-12 XP_016874028 (OMIM: 604725) PREDICTED: ubiquitin c ( 352) 314 71.4 5.3e-12 NP_001230688 (OMIM: 604725) ubiquitin carboxyl-ter ( 362) 314 71.4 5.4e-12 NP_741994 (OMIM: 604725) ubiquitin carboxyl-termin ( 396) 314 71.4 5.8e-12 NP_004196 (OMIM: 604725) ubiquitin carboxyl-termin ( 605) 314 71.5 8.1e-12 XP_005271779 (OMIM: 604725) PREDICTED: ubiquitin c ( 605) 314 71.5 8.1e-12 XP_005271778 (OMIM: 604725) PREDICTED: ubiquitin c ( 605) 314 71.5 8.1e-12 NP_001273387 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-ter (1003) 311 71.1 1.8e-11 NP_001308787 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-ter (1044) 311 71.1 1.9e-11 XP_016879142 (OMIM: 602519) PREDICTED: ubiquitin c (1097) 311 71.1 1.9e-11 NP_003461 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-termin (1102) 311 71.1 1.9e-11 XP_016879141 (OMIM: 602519) PREDICTED: ubiquitin c (1113) 311 71.1 1.9e-11 NP_001273696 (OMIM: 612849) ubiquitin carboxyl-ter ( 354) 296 67.9 6e-11 NP_001127695 (OMIM: 612849) ubiquitin carboxyl-ter ( 359) 296 67.9 6.1e-11 NP_073743 (OMIM: 612849) ubiquitin carboxyl-termin ( 366) 296 67.9 6.2e-11 NP_001273386 (OMIM: 602519) ubiquitin carboxyl-ter (1086) 302 69.4 6.4e-11 XP_016873442 (OMIM: 614460) PREDICTED: ubiquitin c (1275) 300 69.0 9.6e-11 NP_060414 (OMIM: 614460) ubiquitin carboxyl-termin (1287) 300 69.0 9.6e-11 XP_011509703 (OMIM: 610570) PREDICTED: ubiquitin c ( 807) 297 68.3 1e-10 NP_001269588 (OMIM: 614460) ubiquitin carboxyl-ter (1355) 300 69.0 1e-10 NP_001317137 (OMIM: 614460) ubiquitin carboxyl-ter (1375) 300 69.1 1e-10 NP_001273697 (OMIM: 612849) ubiquitin carboxyl-ter ( 225) 279 64.4 4.2e-10 XP_016864046 (OMIM: 612849) PREDICTED: ubiquitin c ( 341) 279 64.5 5.8e-10 XP_005269318 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 648) 282 65.3 6.4e-10 XP_016875774 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 860) 282 65.4 8e-10 XP_016875773 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 860) 282 65.4 8e-10 NP_006304 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-termin ( 952) 282 65.4 8.6e-10 NP_001239007 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-ter ( 981) 282 65.4 8.8e-10 XP_005270747 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2025) 271 63.5 6.9e-09 XP_016856323 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2445) 271 63.6 8e-09 XP_016856322 (OMIM: 610569) PREDICTED: ubiquitin c (2465) 271 63.6 8e-09 XP_016856216 (OMIM: 615146) PREDICTED: ubiquitin c ( 763) 264 61.9 8.2e-09 XP_016856217 (OMIM: 615146) PREDICTED: ubiquitin c ( 763) 264 61.9 8.2e-09 NP_056121 (OMIM: 610569) ubiquitin carboxyl-termin (2620) 271 63.6 8.4e-09 >>NP_958804 (OMIM: 610186) ubiquitin carboxyl-terminal h (530 aa) initn: 3533 init1: 3533 opt: 3533 Z-score: 3719.9 bits: 698.0 E(85289): 1.8e-200 Smith-Waterman score: 3533; 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