Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5724, 774 aa
1>>>pF1KE5724 774 - 774 aa - 774 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0128+/-0.00102; mu= 1.2589+/- 0.062
mean_var=281.7722+/-57.113, 0's: 0 Z-trim(114.2): 35 B-trim: 159 in 1/53
Lambda= 0.076406
statistics sampled from 14960 (14990) to 14960 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.449), width: 16
Scan time: 2.010
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs109|chr1 ( 774) 5227 589.9 5.4e-168
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs109|chr15 (1203) 3180 364.4 6.4e-100
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs109|chr19 ( 889) 3083 353.6 8.3e-97
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs109|chr5 ( 890) 2947 338.6 2.7e-92
CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2 ( 676) 550 74.3 7.6e-13
CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2 ( 694) 550 74.3 7.8e-13
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs109|chr14 ( 988) 548 74.2 1.2e-12
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs109|chr17 ( 994) 548 74.2 1.2e-12
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs109|chr1 ( 962) 547 74.1 1.3e-12
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs109|chr17 ( 958) 534 72.6 3.4e-12
CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs109|chr4 ( 690) 519 70.9 8.3e-12
CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs109|chr4 ( 759) 519 70.9 8.9e-12
CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs109|chr3 (1107) 510 70.0 2.4e-11
CCDS14701.1 CNGA2 gene_id:1260|Hs109|chrX ( 664) 493 68.0 5.8e-11
CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs109|chr14 ( 611) 492 67.9 5.9e-11
CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs109|chr7 ( 819) 489 67.6 9.3e-11
>>CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs109|chr1 (774 aa)
initn: 5227 init1: 5227 opt: 5227 Z-score: 3129.7 bits: 589.9 E(33420): 5.4e-168
Smith-Waterman score: 5227; 100.0% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 RDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 RAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE5 QRATGDGSPGRKGSGSERLPPSGLLAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QRATGDGSPGRKGSGSERLPPSGLLAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM
730 740 750 760 770
>>CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs109|chr15 (1203 aa)
initn: 2485 init1: 2227 opt: 3180 Z-score: 1907.6 bits: 364.4 E(33420): 6.4e-100
Smith-Waterman score: 3254; 64.9% identity (79.4% similar) in 812 aa overlap (1-758:148-946)
10 20
pF1KE5 MEAE-QRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPP
. :: .::.:.:. .:.: :: ::
CCDS10 SHGHLHDSAEERRLIAEGDASPGEDRTPPGLAAEPERPGASAQPAASPP----PPQQPPQ
120 130 140 150 160 170
30 40 50 60
pF1KE5 ATAASGPIP--------KSG--------PEPK---------RRHLGTLLQPTVNKFSLRV
..:: : ..: :: . .:..:..::: :::::::.
CCDS10 PASASCEQPSVDTAIKVEGGAAAGDQILPEAEVRLGQAGFMQRQFGAMLQPGVNKFSLRM
180 190 200 210 220 230
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSP
:::.:::: ::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::..::::::::.::.
CCDS10 FGSQKAVEREQERVKSAGFWIIHPYSDFRFYWDLTMLLLMVGNLIIIPVGITFFKDENTT
240 250 260 270 280 290
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 PWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVD
:::::::.::::::.:::::::::::::...::.: :. :. .::..::.::.:::::::
CCDS10 PWIVFNVVSDTFFLIDLVLNFRTGIVVEDNTEIILDPQRIKMKYLKSWFMVDFISSIPVD
300 310 320 330 340 350
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL
::::.:: :.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YIFLIVET--RIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL
360 370 380 390 400 410
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHALFK
::::::: ::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::.:::.:::.::::
CCDS10 ASAVVRIVNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPDDCWVSINNMVNNSWGKQYSYALFK
420 430 440 450 460 470
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 AMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
:::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AMSHMLCIGYGRQAPVGMSDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
480 490 500 510 520 530
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVA
::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::
CCDS10 KQVEQYMSFHKLPPDTRQRIHDYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFNCRKLVA
540 550 560 570 580 590
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 HMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTR
:::::.:::.:::..::::::::::::: ..:::..:.::::::::..:::..: ..:.
CCDS10 SMPLFANADPNFVTSMLTKLRFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKETK
600 610 620 630 640 650
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 LTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRL
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::.:::::::::::.:::
CCDS10 LADGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVALDRL
660 670 680 690 700 710
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIME----QHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
::::::::: .: .. .. . .: :..:::::.::. .. ...: . :
CCDS10 DRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNYQENEIIQQIVQHDREMAHCAHRVQAAASATPTPTP
720 730 740 750 760 770
610 620 630 640 650
pF1KE5 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQ-RGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASP---
:.: ::..:::::::.:..:::::::. : : . :.. :. . :. .:
CCDS10 VIWTPLIQAPLQAAAATTSVAIALTHHPRLPAAIFRPPPGSGLG-----NLGAGQTPRHL
780 790 800 810 820
660 670 680 690 700
pF1KE5 -----LVPVRAG---PWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGP--PPGGGGRRLG
:.: : : .: :.. .: . ..: . . :: : . :.: : .... :
CCDS10 KRLQSLIPSALGSASPASSPSQVDTPSSSSFHIQ-QLAGFSAPAGLSPLLPSSSSSPPPG
830 840 850 860 870 880
710 720 730 740 750
pF1KE5 PRGRPLSASQPSLPQRAT---GDGSPGRKGSGSERLPPSGLL------AKPPRTAQP-PR
: : :: :: :: : : . .:: : :: :. :..::: :
CCDS10 ACGSP-SAPTPSAGVAATTIAGFGHFHKALGGSLSSSDSPLLTPLQPGARSPQAAQPSPA
890 900 910 920 930 940
760 770
pF1KE5 PPVPEPATPRGLQLSANM
::
CCDS10 PPGARGGLGLPEHFLPPPPSSRSPSSSPGQLGQPPGELSLGLATGPLSTPETPPRQPEPP
950 960 970 980 990 1000
>>CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs109|chr19 (889 aa)
initn: 2322 init1: 2127 opt: 3083 Z-score: 1851.6 bits: 353.6 E(33420): 8.3e-97
Smith-Waterman score: 3098; 64.6% identity (80.0% similar) in 771 aa overlap (10-765:129-869)
10 20 30
pF1KE5 MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPI--
::. : .:: : : .. .::
CCDS12 NGECGRGEPQCSPAGPEGPARGPKVSFSCRGAASGPAPG----PGPAEEAGSEEAGPAGE
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 PKSGPEP-KRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW
:... .:..:.:::: :::::::.:::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 DLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAE
:. :::.::::::..::::::::.:.. :::::::.::::::.:::::::::::.:...:
CCDS12 DFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTE
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 ILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKIL
:.: :. :. .::::::.::..::::::::::.: : .:.::::::::::::::::::
CCDS12 IILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIV--EKGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::
CCDS12 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 DFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGA
::: .:::::: ::::::.. :: :::::::::::::::.::: .: :.:::::::::::
CCDS12 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::::::
CCDS12 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 FDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVV
:::.::::::. ::::::.::.:: ::: :::::.:::.::::.::::.:::::::: ..
CCDS12 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 REGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
:::..:.::::::::..:::..: .. .:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 LSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRK-RSEPSPG---SSGGIMEQ
::::.:: ::::.:::::::::::.::: ::::::::: .: . . . : .. . . :
CCDS12 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620
pF1KE5 HLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTS---NVAIALTHQRG
..:..::.:.. :.:. . :. : : ..:... .:... : .
CCDS12 EIVKYDREMVQQ---------AELGQRVGLFPPPPPPPQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVA
700 710 720 730 740
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 -PL--PLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRA
:: ::. :: :. : : . ::: : : :: :: : :. ..: .
CCDS12 RPLVGPLALGSP-RLVRRPPPGPAPAAASPGPP----PPASPPGAPASP-RAPRTS-PYG
750 760 770 780 790
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 GRSQVSLLGPP-PGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLPQRATGDGSPGRKGSGSE-RLPPSGL
: . : :: :. :::. .:::::::::::. : : .. : .:.: :: :.
CCDS12 GLPAAPLAGPALPA---RRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRPASSSTPRLGPT--
800 810 820 830 840 850
750 760 770
pF1KE5 LAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM
: : : : . :.:
CCDS12 ---PAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL
860 870 880
>>CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs109|chr5 (890 aa)
initn: 2281 init1: 2151 opt: 2947 Z-score: 1770.6 bits: 338.6 E(33420): 2.7e-92
Smith-Waterman score: 2967; 61.5% identity (79.1% similar) in 769 aa overlap (33-764:84-840)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 AEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSL
: :: . : .:.. ..::: ::::::
CCDS39 GNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQYGFM--QRQFTSMLQPGVNKFSL
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEEN
:.:::.:::: ::::::.:: ::::::::::::::::::..:::::...::::::: :..
CCDS39 RMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQT
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIP
. :::.::: ::: :::::..::::: : :...::.: :..:. ::..::.::.:::::
CCDS39 TTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIP
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
::::::.: : .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VDYIFLIV--EKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHAL
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:.::: :::.:::.::
CCDS39 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYAL
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQE
::::::::::::: ::::.: :.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS39 FKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQE
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGL
::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.::::.::.::..::::::.::.:: :
CCDS39 KYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKL
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 VAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARD
:: :::::.:::.::::.:.::::::::::: ..:::.::.::::::::. .:.......
CCDS39 VATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKE
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 TRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMD
.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:: ::::.:::::::::::.:
CCDS39 MKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAID
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KE5 RLLRIGKKNSIL-QRKRSEPSPG----SSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQ--
:: ::::::::: :. ... . : . . :..: .:.:::.:.... :: . :
CCDS39 RLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQ-IVKHDREMVQAI---APINYPQMT
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 -LSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPD-SPATLLARSAWRSA-GS
:.. : . :. : . .... .. ..: : . .:...:. .. .: :
CCDS39 TLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCS
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700
pF1KE5 PA--SPLVPVR---AGPWAST-SRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLG
: :::. :.: :: : . : . .. :. ..: . .: : :
CCDS39 PPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQ--SQPPQTQPQQPSPQPQTPGSST-
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740
pF1KE5 PRG------------------RPLSASQPSLPQRATGDGSPGRKGSGSERLP--PSGLLA
:.. :::::::::::.... : . : : : :. . :
CCDS39 PKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVSTLISRPHPTVG-ESLASIPQPVTA
770 780 790 800 810 820
750 760 770
pF1KE5 KPPRTAQPP-RPPVPEPATPRGLQLSANM
: : : ::. .:
CCDS39 VPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDA
830 840 850 860 870 880
>>CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2 (676 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 AAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFS--LRVF
: : :. : :. :. . .. :
CCDS42 FTGQGIARLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPD---RFRGAELKEVSSQESNAQANV
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GSHKAVEI-EQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITF--FKEEN
::.. .. .....:. : .. : :.. . : . : . : .: : .. :
CCDS42 GSQEPADRGRRKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEY
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIP
:.:.. .:....::... :::.. :.: . . : . : : .:..: .:
CCDS42 LMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFL-EQGLMVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVP
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
.: .: :.. :::. :::..:::.... . : :
CCDS42 TDLAYL-------------KVGTNYPEVRFN------RLLKFSRLFEFFDRTE-----TR
250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMV-NHS-WGRQYSH
. :: ::. ..:.. ::..:. : . . : : :: : . .:. .:.: .
CCDS42 TNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIY
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQY
.:. . . :: :: . .......::. .: ..:.. ..:.....:: ..
CCDS42 SLYWSTLTLTTIGE-TPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEF
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410
pF1KE5 QEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGK-MFDEESILGELSEPLREEIINFTC
: : ...:::.:.:. : . :. ..... . .: ::. .: : . :. :: .
CCDS42 QAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVH
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 RGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLAR-
. .. .: . .... .. ::: ::.::: . ..:..:..::.:..: :.:.:
CCDS42 LDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADD
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 GARD-TRLTDGSYFGEICLLT-RG-----RRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPM
:. . . :.:::::::: .:. .: ::::..:. : :. :: : . .: :.:
CCDS42 GVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPE
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 MRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPS
..:.: . . :.. . . : : ..:. .:: . : ..: .: :
CCDS42 AKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEK--VEQLGSSLDTLQTRFARLLAEY
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 TGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAG
...:.. : :
CCDS42 NATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
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>>CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2 (694 aa)
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Smith-Waterman score: 661; 26.8% identity (58.5% similar) in 542 aa overlap (74-602:149-662)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 PKRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLL
:....:. : .. : :.. . : . :
CCDS20 ANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALP
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110 120 130 140 150 160
pF1KE5 MVGNLIVLPVGITF--FKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAP
. : .: : .. : :.:.. .:....::... :::.. :.: . .
CCDS20 VFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFL-EQGLMVSDTN
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRL
: . : : .:..: .:.: .: :.. :::. ::
CCDS20 RLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYL-------------KVGTNYPEVRFN------RL
240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPD
:..:::.... . : : . :: ::. ..:.. ::..:. : . . : :
CCDS20 LKFSRLFEFFDRTE-----TRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTD
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330
pF1KE5 CWVSINHMV-NHS-WGRQYSHALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCY
:: : . .:. .:.: ..:. . . :: :: . .......::. .
CCDS20 SWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGE-TPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIF
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 AMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGK-MFD
: ..:.. ..:.....:: ..: : ...:::.:.:. : . :. ..... . .: :
CCDS20 ATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVD
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 EESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVRE
:. .: : . :. :: . . .. .: . .... .. ::: ::.::: . ..
CCDS20 EKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKK
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 GSVGRKMYFIQHGLLSVLAR-GARD-TRLTDGSYFGEICLLT-RG-----RRTASVRADT
:..:..::.:..: :.:.: :. . . :.:::::::: .:. .: ::::..:.
CCDS20 GDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIG
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 YCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIM
: :. :: : . .: :.: ..:.: . . :.. . . : : ..:. .
CCDS20 YSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEK--V
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 EQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGP
:: . : ..: .: : ...:.. : :
CCDS20 EQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTE
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 LPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQ
CCDS20 DKQQ
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.:: . .:: :. :.: : :.
CCDS97 TNSRSVLQQLTPMNKTEVVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILH-YCAFKT
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100 110 120 130 140 150
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:: ..:.: . :..: ...: ..:. :.:.. . :..::.:.::::.: .: :
CCDS97 TWDWVILILTFYTAIMVPYNVSFKTKQNNIAWLVLDSVVDVIFLVDIVLNFHTTFV-GPG
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 AEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTK
.:.. :. :: ::.:::..::.: .: : ... .: . . .:..::
CCDS97 GEVISDPKLIRMNYLKTWFVIDLLSCLPYD----IINAFENVDEGISSLFSSLKVVR---
280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLV--
::::.:. : . .. : : : :. :. .. :. :: .:. . .
CCDS97 ------LLRLGRVARKLDHYLE-----YGAAVLVL----LVCVFGLVAHWLACIWYSIGD
330 340 350 360 370
280 290 300 310
pF1KE5 -----PMLQDFPPDCWV-----SIN--HMVNHSWG---------RQYSHALFKAMSHMLC
. . . : :. ::. . : : : : .:. .:. .
CCDS97 YEVIDEVTNTIQIDSWLYQLALSIGTPYRYNTSAGIWEGGPSKDSLYVSSLYFTMTSLTT
380 390 400 410 420 430
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 IGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYM
::.:. ::. . ... :.::. :: ..:..:...:.. .. .:.: ..:....
CCDS97 IGFGNIAPTTDVEKMFSVAMMMVGSLLYATIFGNVTTIFQQMYANTNRYHEMLNNVRDFL
440 450 460 470 480 490
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 SFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQ-GKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFA
.....: .:. .: .. .: .: :..:. . .: .: : . . : :
CCDS97 KLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSKGIDTEKVLSICPKDMRADICVHLNRKVFNEHPAFR
500 510 520 530 540 550
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 HADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGSY
:. . . :. .... ::::. . : . :. : : :. . : :.
CCDS97 LASDGCLRALAVEFQTIHCAPGDLIYHAGESVDALCFVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGDV
560 570 580 590 600 610
500 510 520 530 540
pF1KE5 FGEICL--LTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIG
::.: : .. :.::: ::: :. .. . . ::. . . .: . . : .
CCDS97 FGDIFWKETTLAHACANVRALTYCDLHIIKREALLKVLDFYTAFANSF---SRNLTLTCN
620 630 640 650 660
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pF1KE5 KKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVH
.. :. :: :.
CCDS97 LRKRIIFRKISDVKKEEEERLRQKNEVTLSIPVDHPVRKLFQKFKQQKELRNQGSTQGDP
670 680 690 700 710 720
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Smith-Waterman score: 645; 24.8% identity (52.5% similar) in 824 aa overlap (35-769:165-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 QRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVN--KFSL
:: : .: . : : .. . : :.: .:.:
CCDS11 LLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTG-RGKYRTISQIPQFTLNFVEFNL
140 150 160 170 180 190
70 80 90
pF1KE5 R-----------VFGSHKAVEIEQ---ERVK---SAGA---------------WIIHPYS
. ... ::.:: : :.: : :: : : ::
CCDS11 EKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYS
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130
pF1KE5 DFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFF---KEENS--------PPWIVFNVLSDTFFLL
:. :: ..:::.. . . : . .:. ..:. : : ... : .:..
CCDS11 PFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSPLTVVDLIVDIMFVV
260 270 280 290 300 310
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 DLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAE
:.:.:::: :. . :.. :: : ..:.. :::.:....:: : .
CCDS11 DIVINFRT-TYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-------------
320 330 340 350
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 VYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMML
...:. . : ...::. :: ::.: .. .. :. .:.: .: :. .
CCDS11 IFRTGSD----ETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDR-----YSEYGAAV-LFLLMCTFA
360 370 380 390 400
260 270 280 290 300
pF1KE5 LLCHWDGCLQFLV-----PMLQD---FPPDCWVSINHMVNHS-------WGRQYSHALFK
:. :: .:. . . :.:. . . :.... : : .: ::.
CCDS11 LIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKIGWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYF
410 420 430 440 450 460
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..: . .:.:. .: . ... :..:. :: ..:...:.:: : :. .:. ..
CCDS11 TFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQM
470 480 490 500 510 520
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pF1KE5 KQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQ-GKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLV
.:.... ::..: :::..::..: .. . .: ...: . : :. .: :.:.
CCDS11 LRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALL
530 540 550 560 570 580
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 AHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDT
: : :. : . . :. .:.. ::: .:. :.: .:::..: . .: . .
CCDS11 QHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVA
590 600 610 620 630 640
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pF1KE5 RLTDGSYFGE-ICLLTR-GRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFET-VA
: .. ::: . : .. :. .:.::: ::: :.... . ::. .: . ..: . .
CCDS11 ILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKLE
650 660 670 680 690 700
550 560 570 580 590
pF1KE5 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIM---EQHLVQHDRDMARGVRGRA---PSTGA
. :: ... . :. :. . :.. .: :. .: . :..
CCDS11 VTFNLR-DAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFFLSDNQSGSPHELGPQFPSKGYSLLGPGSQN
710 720 730 740 750 760
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pF1KE5 QLSGKPVL-WEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSP
.... : .: . ::. . . :.. : :. : ::.:: . : .
CCDS11 SMGAGPCAPGHPDAAPPLSISDA-SGLWPELL-QEMPPRHSPQSPQE--DPDCW--PLKL
770 780 790 800 810 820
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.: : ..: ::. . .: :. . ....: . :... : : . .
CCDS11 GSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIASETT
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720 730 740 750
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. : ::: . :: :: ...: : :.: .. :: . ::
CCDS11 SPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNS-SPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGL
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760 770
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CCDS11 WPPLASPLHPLEVQGLICGPCFSSLPEHLGSVPKQLDFQRHGSDPGFAGSWGH
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CCDS31 YEIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGTPYQFNGSGSGKWEGGPSKNSVYISSLYFTMTSLT
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CCDS31 SVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGSLLYATIFGNVTTIFQQMYANTNRYHEMLNSVRDF
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CCDS31 LKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSRGIDTEKVLQICPKDMRADICVHLNRKVFKEHPAF
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CCDS31 RLASDGCLRALAMEFQTVHCAPGDLIYHAGESVDSLCFVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGD
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CCDS31 VFGDVFWKEATLAQSCANVRALTYCDLHVIKRDALQKVLEFYTAFSHSF---SRNLILTY
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. .. :. :: :.
CCDS31 NLRKRIVFRKISDVKREEEERMKRKNEAPLILPPDHPVRRLFQRFRQQKEARLAAERGGR
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CCDS62 EKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYS
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CCDS62 PFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSPLTVVDLIVDIMFVV
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CCDS62 DIVINFRT-TYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-------------
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CCDS62 IFRTGSD----ETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDR-----YSEYGAAV-LFLLMCTFA
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CCDS62 LIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKIGWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYF
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CCDS62 TFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQM
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CCDS62 LRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALL
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CCDS62 QHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVA
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