FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9450, 1584 aa 1>>>pF1KE9450 1584 - 1584 aa - 1584 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2823+/-0.00134; mu= -19.8505+/- 0.081 mean_var=718.6383+/-143.904, 0's: 0 Z-trim(115.5): 86 B-trim: 59 in 1/54 Lambda= 0.047843 statistics sampled from 16019 (16099) to 16019 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.495), width: 16 Scan time: 6.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 11053 779.6 0 CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 3511 259.0 8.3e-68 CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 1897 147.6 2.9e-34 CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 1407 113.8 4.5e-24 >>CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584 aa) initn: 11053 init1: 11053 opt: 11053 Z-score: 4144.0 bits: 779.6 E(32554): 0 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CCDS49 CRSVLHKDIGPCRAATITGTLSRISLNDDEEEKGTNPEG--LSYSTLPGNVISKVIIQ-Q 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE9 PRYPGGPLP--DFPNHSLTLKRDKAPKSSFVGDGDIFKKLDSELSRAQEKALDTSYVILP : :. .. : : . .. .. .. : .. : .. . ::. ....:...: CCDS49 PTGLHMPMSMNELSNPCLKKENSELRRTVYLCTDDNLRGADMDIVHPQERMMESDYIVMP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE9 TATATLRPKPKEEPKYSIHIDQMPQTRLIHLSTAPEASLPARSPPSRQPPSGGPPEAPPA .... .:. ::: :..: .. .:. ::.: .. :: .. .:: . . . CCDS49 RSSVNNQPSMKEESKMNIGMETLPHERLLHYKVNPEFNM---NPPVMDQFNMNL------ 1320 1330 1340 1350 1360 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE9 QPPPPPPPPPPPPQQPLPPPPNLEPAP--PSLGDPGEPAAHPGPSTGPSTKNENVATLSV .: : : ... : : . . :.. ..: : ..:. .:.:. CCDS49 -------------EQHLAPQEHMQNLPFEPRTAVKNFMASELDDNAGLS-RSETGSTISM 1370 1380 1390 1400 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE9 SSLERRKSRYAELDFEKIMHTRKRHQDMFQDLNRKLQHAAEKDKEVLGPDSKPEKQQTPN ::::::::::..:::::.:::::::...::.::.:.: . .. ... :... .. .:: CCDS49 SSLERRKSRYSDLDFEKVMHTRKRHMELFQELNQKFQ-TLDRFRDI--PNTSSMENPAPN 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE9 KRPWESLRKAHGTPTWVKKE-LEPLQPSPLELRSVEWERSGATIPLVGQDIIDLQTEV : ::..... : .. . :. . :::: .:::. ..:: :. :.:::: CCDS49 KNPWDTFKNPSEYPHYTTINVLDTEAKDALELRPAEWEKC-LNLPLDVQEG-DFQTEV 1470 1480 1490 1500 1510 1520 >>CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551 aa) initn: 3490 init1: 1664 opt: 1897 Z-score: 728.7 bits: 147.6 E(32554): 2.9e-34 Smith-Waterman score: 4110; 42.3% identity (64.5% similar) in 1658 aa overlap (16-1584:18-1551) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRGQAAAPGPVWILAPLLLLLLLLGRRARAAAGADAGPGPEPCATLVQGKFFGYFSAA :::: ..: : :.. : :.: :..:..: ..: :: CCDS72 MENTGWMGKGHRMTPACPLLLSVIL---SLRLATAFD--PAPSACSALASGVLYGAFSLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 AVFPANASRCSWTLRNPDPRRYTLYMKVAKAPVPCS--GPGRVRTYQFDSFL-------- .::. :: :::::.:::: .:.::.. . :. .: : .: .: CCDS72 DLFPTIASGCSWTLENPDPTKYSLYLRFNRQEQVCAHFAP---RLLPLDHYLVNFTCLRP 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE9 ------ESTRTYLGVESFDEV-----LRLCDPSAPLAFLQASKQFLQMRRQQPPQHDGLR .... .: .:. :.::. :.:..::. .:.:.:. . :.. CCDS72 SPEEAVAQAESEVGRPEEEEAEAAAGLELCSGSGPFTFLHFDKNFVQLCLSAEPSEA--- 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 PRAGPPGPTDDFSVEYLVVGNRNPSRAACQMLCRWLDACLAGSRSSHPCGIMQTPCACLG :: :. :: :...: : :. .: .:::: . : : ... ::. : :.: CCDS72 PRLLAPAALAFRFVEVLLINNNNSSQFTCGVLCRWSEEC--GRAAGRACGFAQPGCSC-P 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 GEAGGPAAGPLAPRGDVCLRDAVAGGPENCLTSLTQDRGGHGATGGWKLWSLWGECTRDC ::::. .. .: : : : . :: CCDS72 GEAGAGSTTTTSP-----------GPPAAHTLSNALVPGG-------------------- 230 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 GGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCEGVLEEGRQCN-REACGPAGRTSSRSQSLRSTDARRRE ::: .:. : .. . : . : . . ..: ::.: CCDS72 ------------PAPPAEADLHSGSSNDLFTTEMRYGEEPEEEPKVKTQWPRSAD----- 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 ELGDELQQFGFPAPQTGDPAAEEWSPWSVCSSTCGEGWQTRTRFCVSSSYSTQCSGPLRE . :. ::::::::::::::::: :::.: :.::: :::: :.: ::::::: CCDS72 -------EPGLYMAQTGDPAAEEWSPWSVCSLTCGQGLQVRTRSCVSSPYGTLCSGPLRE 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 QRLCNNSAVCPVHGAWDEWSPWSLCSSTCGRGFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKFC : :::::.:::::.:.::. ::::: .:::: :.: ::: ::: ::. ::::: :::.: CCDS72 TRPCNNSATCPVHGVWEEWGSWSLCSRSCGRGSRSRMRTCVPPQHGGKACEGPELQTKLC 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 NIALCPGRAVDGNWNEWSSWSACSASCSQGRQQRTRECN--GPSYGGAECQGHWVETRDC ..: :: :.:.: ::. :. ::.::..: :::.:.:. ::.. : : : ..::.: CCDS72 SMAACP---VEGQWLEWGPWGPCSTSCANGTQQRSRKCSVAGPAW--ATCTGALTDTREC 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KE9 FLQQCPV-DGKWQAWASWGSCSVTCGAGSQRRERVCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGTQR .::. :.:: : .:. :: :: .: ::: :.:.. : :.: .: . :. .: CCDS72 SNLECPATDSKWGPWNAWSLCSKTCDTGWQRRFRMCQATGTQGYPCEGTGEEVKPCSEKR 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 pF1KE9 CPEPHEICDEDNFGAVIWKETPAGEVAAVRCPRNATGLILRRCELDEEGIAYWEPPTYIR :: ::.: .. . ::.. :::. .:: ::.: ::: :. .:.::: :.. : CCDS72 CPAFHEMCRDEYVMLMTWKKAAAGEIIYNKCPPNASGSASRRCLLSAQGVAYWGLPSFAR 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 690 pF1KE9 CVSIDYRNIQMMTREHLAKAQRGLPGEGVSEVIQTLVEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNM :.: .:: . . ::::::.:: : :::.:.:...: :. : :::::: ..:.:::. 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CCDS72 DALKAFQSSLIVTDNLVISIQREPVSAVSSDITFPMRGRRGMKDWVRHSEDRLFLPKEVL 710 720 730 740 750 760 820 830 pF1KE9 S---------TGLT--------------------------EADEASVFVVGTVLYRNLGS : .: . . ::.: ::.:.::::.:: CCDS72 SLSSPGKPATSGAAGSPGRGRGPGTVPPGPGHSHQRLLPADPDESSYFVIGAVLYRTLGL 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 FLALQRNTTVLNSKVISVTVKPPPRSLRTPL-EIEFAHMYNGTTNQTCILWDETDVPSSS .: : ...:.:..:::.:: . :: .:.... ::::. : :: . . .:: CCDS72 ILPPPRPPLAVTSRVMTVTVRPPTQPPAEPLITVELSYIINGTTDPHCASWDYSRADASS 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 APPQLGPWSWRGCRTVPLDALRTRCLCDRLSTFAILAQLSADANMEKATLPSVTLIVGCG : :. ..:.:. .: .::: :..:::::.::: : ..: : ::: :..::. 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CCDS72 ANPVYMCGEGGL-RQLDLTWLRPTEPGSEGDYMVLPRRTLSLQPGGGGGGGEDAPRARPE 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE9 YSIHIDQMPQTRLIHLSTAPEASLPARSPPSRQPPSGGPPEAPPAQPPPPPPPPPPPPQQ . . . : : . : . :. : . : .. :::: : : CCDS72 GT---PRRAAKTVAHTEGYP-SFLSVDHSGLGLGPAYGSLQNPYGMTFQPPPPTPSARQV 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE9 PLPPPPNLEPAPPSLGDPGEPAAHPGPSTGPSTKNENVATLSVSSLERRKSRYAELDFEK : .::: .. : : :.. :....::::.: ::..:::: CCDS72 P---------------EPGE-RSRTMPRTVPGS------TMKMGSLERKKLRYSDLDFE- 1410 1420 1430 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE9 IMHTRKRHQDMFQDLNRKL--------QHAAEKDKE-VLGPDSKPEK-----QQTPNKRP .:::::::......::.:. : .:...:. .. . :. . .:..:: CCDS72 VMHTRKRHSELYHELNQKFHTFDRYRSQSTAKREKRWSVSSGGAAERSVCTDKPSPGERP 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE9 WESLRKAHGTPTWVKK-ELEPLQPSPLELRSVEWERSGATIPLVGQDIIDLQTEV : .. : . . :. : : :.: : . .:..: : : :.:::: CCDS72 SLSQHRRHQSWSTFKSMTLGSLPPKPRE--RLTLHRAAAWEPTEPPDG-DFQTEV 1500 1510 1520 1530 1540 1550 >>CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584 aa) initn: 2802 init1: 1107 opt: 1407 Z-score: 545.7 bits: 113.8 E(32554): 4.5e-24 Smith-Waterman score: 4034; 41.5% identity (63.3% similar) in 1691 aa overlap (16-1584:18-1584) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRGQAAAPGPVWILAPLLLLLLLLGRRARAAAGADAGPGPEPCATLVQGKFFGYFSAA :::: ..: : :.. : :.: :..:..: ..: :: CCDS72 MENTGWMGKGHRMTPACPLLLSVIL---SLRLATAFD--PAPSACSALASGVLYGAFSLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 AVFPANASRCSWTLRNPDPRRYTLYMKVAKAPVPCS--GPGRVRTYQFDSFL-------- .::. :: :::::.:::: .:.::.. . :. .: : .: .: CCDS72 DLFPTIASGCSWTLENPDPTKYSLYLRFNRQEQVCAHFAP---RLLPLDHYLVNFTCLRP 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE9 ------ESTRTYLGVESFDEV-----LRLCDPSAPLAFLQASKQFLQMRRQQPPQHDGLR .... .: .:. :.::. :.:..::. .:.:.:. . :.. CCDS72 SPEEAVAQAESEVGRPEEEEAEAAAGLELCSGSGPFTFLHFDKNFVQLCLSAEPSEA--- 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 PRAGPPGPTDDFSVEYLVVGNRNPSRAACQMLCRWLDACLAGSRSSHPCGIMQTPCACLG :: :. :: :...: : :. .: .:::: . : : ... ::. : :.: CCDS72 PRLLAPAALAFRFVEVLLINNNNSSQFTCGVLCRWSEEC--GRAAGRACGFAQPGCSC-P 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 GEAGGPAAGPLAPRGDVCLRDAVAGGPENCLTSLTQDRGGHGATGGWKLWSLWGECTRDC ::::. .. .: : : : . :: CCDS72 GEAGAGSTTTTSP-----------GPPAAHTLSNALVPGG-------------------- 230 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 GGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCEGVLEEGRQCN-REACGPAGRTSSRSQSLRSTDARRRE ::: .:. : .. . : . : . . ..: ::.: CCDS72 ------------PAPPAEADLHSGSSNDLFTTEMRYGEEPEEEPKVKTQWPRSAD----- 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 ELGDELQQFGFPAPQTGDPAAEEWSPWSVCSSTCGEGWQTRTRFCVSSSYSTQCSGPLRE . :. ::::::::::::::::: :::.: :.::: :::: :.: ::::::: CCDS72 -------EPGLYMAQTGDPAAEEWSPWSVCSLTCGQGLQVRTRSCVSSPYGTLCSGPLRE 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 QRLCNNSAVCPVHGAWDEWSPWSLCSSTCGRGFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKFC : :::::.:::::.:.::. ::::: .:::: :.: ::: ::: ::. ::::: :::.: CCDS72 TRPCNNSATCPVHGVWEEWGSWSLCSRSCGRGSRSRMRTCVPPQHGGKACEGPELQTKLC 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 NIALCPGRAVDGNWNEWSSWSACSASCSQGRQQRTRECN--GPSYGGAECQGHWVETRDC ..: :: :.:.: ::. :. ::.::..: :::.:.:. ::.. : : : ..::.: CCDS72 SMAACP---VEGQWLEWGPWGPCSTSCANGTQQRSRKCSVAGPAW--ATCTGALTDTREC 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KE9 FLQQCPV-DGKWQAWASWGSCSVTCGAGSQRRERVCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGTQR .::. :.:: : .:. :: :: .: ::: :.:.. : :.: .: . :. .: CCDS72 SNLECPATDSKWGPWNAWSLCSKTCDTGWQRRFRMCQATGTQGYPCEGTGEEVKPCSEKR 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 pF1KE9 CPEPHEICDEDNFGAVIWKETPAGEVAAVRCPRNATGLILRRCELDEEGIAYWEPPTYIR :: ::.: .. . ::.. :::. .:: ::.: ::: :. .:.::: :.. : CCDS72 CPAFHEMCRDEYVMLMTWKKAAAGEIIYNKCPPNASGSASRRCLLSAQGVAYWGLPSFAR 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 690 pF1KE9 CVSIDYRNIQMMTREHLAKAQRGLPGEGVSEVIQTLVEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNM :.: .:: . . ::::::.:: : :::.:.:...: :. : :::::: ..:.:::. CCDS72 CISHEYRYLYLSLREHLAKGQRMLAGEGMSQVVRSLQELLARRTYYSGDLLFSVDILRNV 590 600 610 620 630 640 700 710 720 730 740 750 pF1KE9 TEIFRRAYYSPTPGDVQNFVQILSNLLAEENRDKWEEAQLAGPNAKELFRLVEDFVDVIG :. :.:: : :. ::: : :..: .. ::..::..:: ..:.. .:.:.::::. ..: CCDS72 TDTFKRATYVPSADDVQRFFQVVSFMVDAENKEKWDDAQQVSPGSVHLLRVVEDFIHLVG 650 660 670 680 690 700 760 770 780 790 800 810 pF1KE9 FRMKDLRDAYQVTDNLVLSIHKLPASG-ATDISFPMKGWRATGDWAKVPEDRVTVSKSVF .: .... ::::::.::.. :.:. ..::.:::.: :. ::.. :::. . : :. 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